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The scientist杂志盘点了近期各大杂志上最热门的基因组测序成果，让我们看看科学家们又从测序中获得了什么新知识吧。 种属：家猫（Felis catus） 基因组：3.1 billion bp 家猫会患上白血病也会受到免疫缺陷病毒的感染。为了更好的理解相关疾病，一个跨国科研团队测序了三只家猫的基因组并且进行了注释。这项研究为人们提供了一个新的猫科基因组浏览器——Genome Annotation Resource Fields（GARfield），其中包括血细胞的甲基化模式，以及两万一千多个基因组注释。相关论文发表在八月五日的GigaScience杂志上。 Nova Southeastern大学的Stephen O’Brien等人使用三种不同的方法对三只家猫进行测序和分析。虽然此前人们发布过家猫的基因组，不过之前的鸟枪测序法覆盖度太低，这项研究有助于填补之前留下的缺口。此外，这项研究也有一些新发现，比如发现了新......阅读全文
1.1.3.2 模板制备程序完全的体外大规模模板制备工作是达成高通量、低价格测序技术的前提。已广泛使用的乳液PCR扩增技术就是一种很好的方法。不过，由于很难在热循环测序反应中保证乳液微滴的稳定性，因此最开始实验的模板扩增方法是恒温扩增法（isothermal）。乳液PCR不需要借助细菌的帮助就能扩增
以色列急性瘫痪病毒让蜜蜂难辨归途 前些日子，一场“蜂群衰竭失调”（Colony Collapse Disorder，简称CCD）风暴席卷了美国半数以上的养蜂场，蜜蜂离奇失踪案闹得沸沸扬扬。从手机辐射到气候变化，从寄生虫到杀虫剂，科学家和养蜂人怀疑了所有可能的原因。9月6日在线发表于《科学》杂志上的
有些蜜蜂是独居的，有些聚集形成小群体，还有些生活在数千个成员的大社群中。科学家们发现，基因调控能力的提高是社会性增加的关键。 华大基因、犹他州立大学、伊利诺斯大学等机构的研究团队，对代表三种生活方式的十种蜜蜂进行了研究，揭示了群居生活的遗传学特征。这项研究发表在本周的Science杂志上，文章
The scientist杂志集中盘点了近期最受关注的一些基因组测序成果，中国学者的草鱼基因组测序格外引人注目。 种属：猛犸象（Mammuthus primigenius） 基因组：~4 billion bp 研究人员从距今四万多年的猛犸象残骸提取DNA， 测序并组装了迄今为止最完整的两个
中国科学院动物研究所的研究人员在昆虫特有蛋白的鉴定中取得突破性进展。他们通过分析完全变态与不完全变态昆虫的基因组信息，并与其他真核生物的基因组信息进行比较，鉴定出51种昆虫特有蛋白，包括与环境胁迫和感受刺激相关的蛋白、表皮蛋白和气味结合蛋白等，揭示了昆虫在环境适应与信息交流方面的独特特征。相关论文发
近日，中国农业科学院蜜蜂研究所蜜蜂遗传与育种创新团队针对中华蜜蜂群体基因组学开展了研究，系统揭示了中华蜜蜂的群体结构、进化与适应。相关研究成果在线发表在《分子生物与进化》上。 中华蜜蜂（以下简称中蜂）是我国重要的遗传资源，其分布广泛，涵盖多种气候区和地形。但目前群体多样性受到严重影响，亟待保护
李国杰 “当前，大数据已成为社会热潮。这股热潮的主要驱动力来自网络服务公司，各地政府投资大数据的主要目的则是增加GDP，但其实发展大数据的意义不仅仅体现在经济上。”日前，在清华大学举行的大数据时代高端论坛上，中国工程院院士李国杰表示，发展大数据技术的另一个重要意义是促进社会公平正义，促进国家治理的
RNA干涉（RNAi）是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象，是在线虫中发现的，在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。过去几年中，科研工作者已明确转录后基因沉默现象普遍存在于动、植物中，在机体防御病毒入侵和转座子沉默效应中起着重要作用。近年来的研究表明，将与mRNA对应的正义RNA和反义
三、新一代DNA测序技术DNA测序技术已广泛应用于生物学研究的各个领域，很多生物学问题都可以借助高通量DNA测序技术予以解决。过去三年，大规模平行 测序平台（massively parallel DNA sequencing platform）已经发展为主流的测序技术，这项测序技术的出现不仅
5 RNAi技术的应用5.1 功能基因组和遗传学应用随着各种模式生物和人类基因组测序的完成，基因功能的研究远远落后于大量序列所提供的信息，研究和发现基因功能成为越来越紧迫的任务。长期以来，破坏基因结构或抑制基因表达是研究基因功能的重要方法，如常用的基因敲除技术( gene knock out) 。基
由罗氏454生命科学公司分别与伊利诺斯大学香槟分校，以及耶鲁大学分子生物物理学与生物化学系，奥地利维也纳大学，英国韦尔科姆基金会桑格学院（Wellcome Trust Sanger Institute）等处的研究人员合作完成的两篇报道近期都公布在著名的科学杂志《Science》上，分别揭示了黄蜂（W
继启动万种动物线粒体基因组计划（MT10K, https://www.mt10k.org）之后，深圳国家基因库成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法（mitochondrial metagenomics，以下简称“全线粒体混合多样性分析法”）。此方法高效、准确且可
摘要：综述了RAPD技术的一些理论性问题，包括RAPD与其它分子标记技术相比的优点，影响结果重复性的因素，显性标记产生的原因，条带取舍的标准等。提出在实验中解决这些问题的一些方法：严格控制反应条件，采用单倍体和单剂量标记，系统学研究中要结合其它方法进行分析，定位基因时要选用合适的群体等。
人类基因组计划的成功实施，我们已初步掌握了自身的遗传信息。但阐明人类基因组整体功能的功能基因组学仍任重而道远。蛋白质作为生命活动的"执行者"，自然成为生命科学研究的新"宠儿"。几乎在所有生命科学领域内，科学研究工作者都需要对细胞、组织或完整生物体的蛋白进行定性描述或定量检测。对一种细胞、组织或完
为了弄清为什么突变速度在基因组内是有差异的，Laurence Hurst及同事采用一个亲子测序方法对拟南芥、水稻和蜜蜂的突变速度在基因组内的差异直接进行了研究。他们发现，突变速度在杂合子中和在接近交叉事件的地方较高。突变在杂合区域要比在纯合区域出现得更为频繁(频繁程度不成比例)，正在进行纯化选
来自葡萄牙的研究人员在奥克雷萨河（Ocreza River）发现了一种稀有的杂交鱼，它的基因组与其父亲的基因组完全匹配。虽然之前的研究曾在一些非脊椎动物中发了无雌性遗传成分的雄性生殖，但是5月24日发表在Royal Society Open Science上一篇文章第一次报道了脊椎动物出现这种繁
封面故事: 英国花蜜资源的全国性评估 本期封面所示为英国什罗浦郡的枞枝欧石楠花和停在花上的一只有银色斑点的蓝色成年蝴蝶。人们对蜜蜂、蝴蝶和其他昆虫授粉者数量最近的下降普遍担心。花的减少已被认为是一个关键原因，但这一观点此前还没有被充分验证。Mathilde Baude等人提供了对授粉者依赖的
金小蜂是一类寄生性昆虫，靶向许多人类疾病传播的载体（如家蝇等），在害虫生物防治上具有重要地位。作为一个新的模式昆虫，近期公布的丽蝇蛹集金小蜂（Nasonia vitripennis）全基因组序列为研究寄生性昆虫天然免疫的分子和进化机制奠定了基础。 运用进化基因组学的
什么是模式生物？ 在生命科学、人类医药和健康研究领域，实验动物在生命活动中的生理和病理过程，与人类或异种动物都有很多相似之处，并可互为参照，可以用各种方法把一些需要研究的生理或病理活动相对稳定地显现在标准化的实验动物身上，供实验研究之用。这些标准化的实验动物就称之为模式动物。经典的模式生物中植
在佛罗里达木蚁中，大工蚁（majors）和小工蚁（minors）属于两个完全不同的阶级，它们的社会性行为存在很大差异。宾夕法尼亚大学领导的研究团队发现， 这些阶级特异性的社会行为并非一成不变，可以人为地进行表观遗传学重编程。这一重要成果发表在本期的Science杂志上。 表观遗传学修饰可以在不
促进肠道微生物群从而减少小鼠的结肠炎 一项研究说，与对照组的小鼠相比，缺乏tmf1基因的小鼠在肠道产生了更厚、更健壮的粘液层，促进了益生菌的定植和生长，并且增加了对诱导产生的结肠炎的抵抗，这些小鼠可以把这种抵抗传给拥有这种基因的其他小鼠。 东亚亚热带森林和全球碳循环 一项研究发
DNA甲基化是基因组中重要的表观遗传学标志，在大多数生物的生命周期中基因组的甲基化模式都相对稳定。然而近期发表在Genome Biology杂志上的两篇文章显示，有的生物在一生中不断累积着甲基化，有的生物则可能通过甲基化去除大量DNA。 吉林大学刘明远教授所领导的研究团队首次在线虫中发
来自中科院动物所研究员的研究人员以皮肤真菌犬小孢子菌为对象，利用生物信息学和实验生物学方法鉴定了一个新型的真菌来源的防御素(命名为孢子霉素)，首次表明皮肤真菌为一种新的抗感染药物资源，为治疗耐药性细菌引起的感染带来了新的希望，这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文
在一项新的研究中，来自中国西安交通大学、上海海洋大学；英国约克大学、威康基金会桑格研究所；澳大利亚太阳制药私人有限公司的研究人员破译出罂粟（opium poppy）基因组的DNA密码，揭示出这种植物产生用于制造重要药物的药用化合物的关键步骤。这一发现可能为科学家们提高这种药用植物的产量和抗病性铺
生活中常常遇到这样的情况：冰箱里还剩下一块蛋糕，而你的舍友都不在，你是独吞这块蛋糕，还是留着和大家分享呢?中国科学院昆明动物研究所Douglas Yu研究组与美国哈佛大学共同提出了一套揭示合作行为如何出现及何时出现的研究计划。 蜜蜂，是人们最为熟悉的一种高度社会化的物种。一只脱离了蜂群
大约5-6千万年前，具有两列对称花的显花植物金鱼草的“祖先”出现了。 经历数千万年的进化，今日所见的金鱼草诞生了，其花色愈发多样，“颜值”越来越高。绽放之时，花瓣“裂”为上下两唇，上唇为对称的两裂，下唇3裂，酷似一条金鱼，也因此得名为“金鱼草”。 金鱼草因何“降生”在这个世界？金鱼草花体变
本周来自瑞士和美国的研究人员指出，目前一般认为DNA甲基化之间的差异会决定社会性昆虫是成为繁殖蚁（也就是蚁后），还是工蚁的这种观点并不可靠，他们认为DNA甲基化作用并未得到已有数据的充分支持。这一研究成果公布在Current Biology杂志上。 “这一发现表明，并没有证据证明甲基化会造成两
白蚁的蚁王具有长久的生殖能力，与蚁后拥有同等的特殊地位，其他社会性昆虫却没有王。因此，白蚁是研究社会性进化重要的昆虫。近日，《自然·通讯》在线发表的文章中，中、美、德等国科学家宣布完成了首个白蚁(内华达古白蚁)基因组测序和分析，在揭示白蚁复杂社会性的分子基础方面获新发现。 白蚁与蚂蚁和蜜蜂一样
实验方法原理常规聚丙烯酰胺凝胶电泳后的检测，对于不同的目的，应采用不同的检测方法。由于这种电泳方法不破坏蛋白质的生物活性，所以可选用的检测方法很多。试剂、试剂盒丙烯酰胺单体贮液Tris-甘氨酸缓冲液贮液电极缓冲液样品缓冲液过硫醆铵浓缩胶缓冲液贮液分离胶缓冲液贮液实验步骤一、早期染色方法用染料和生物大
生物学一个经久不衰的谜题是一些动物——从人类到蜜蜂——是如何变得很会社交的。如今，一项研究表明，在不起眼的汗蜂中，一个单独基因的表达发生改变或许决定了哪些汗蜂是独居者，哪些擅长社交。这个此前同人类自闭症联系在一起的基因，还同诸如小鼠、蝗虫等动物的社交行为存在关联。最新发现使科学家朝展示社会行为的