微滴单分子测序仪:设备成本仅1万美金
今年年初,以剑桥大学为依托的Base4公司宣布他们成功利用微滴中包裹的核苷酸荧光级联反应技术清楚的分辨出每个碱基的类型。 每一个核苷酸包裹在一个微滴中,每个微滴按照顺序放在每个小的微孔中,大大的增加微孔的数量,即可进行大规模测序。去年该公司和日立公司进行合作,通过固态的纳米系统直接读取碱基产生的信号,而不是读取碱基通过纳米孔是发射的电子信号。 微滴方法使用一个焦磷酸水解酶可以使DNA单链上的核苷酸水解下来并包裹在微滴中。微滴将通过一个微米级的管道,通过管道时级联反应促使每一个碱基产生自己特有的信号。 Base4的创始人兼CEO Frayling 说:“在实验室里,团队对每一步都做了很多处理,现在我们正在致力于把每一步结合起来做成一个独立的测序系统。每个微滴都要单独的孵育,所以找到合适的芯片来确定微滴的顺序是关键。我们已经把所有的步骤放在同一张芯片上了,并且已经开始测试,估计2到6个月内第一批测序结果就会产生。” 除了......阅读全文
王建斌/黄岩谊合作组比较液滴超高通量单细胞RNA测序
自2009年汤富酬研究员首次报道其开创性工作【1】以来,单细胞RNA测序技术已经逐渐成为生物医学研究的重要方法,其在发育生物学和干细胞领域展现出强大的应用前景。随着单细胞转录组扩增方法的不断优化,以及测序通量的持续提升,研究人员已经不再满足于几十甚至几百个单细胞所提供的信息量。2015年以来,一
新一代测序技术(下)SOLiD-(ABI)
【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代
2012生命科学十大创新产品揭晓
新产品,代表着商品化的创新技术,正不断突破研究的障碍和上下极限。这种“有偿分享”推动了新技术的普及,带来了科学研究突破的新希望,也引导科研的新方向。新的技术平台让研究手段提升到更高层次和新的境界,您当然有更多“机会”抢先一步发现原来“因技术所限”尚未知的新发现!站得高,看得更远;也因看得更远,更
新型微流控芯片可提高单细胞转录组测序效率
近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl
成都今是科技取得基于-PCB-的基因测序微流道专利
2024年12月9日消息,国家知识产权局信息显示,成都今是科技有限公司取得一项名为“一种基于PCB的基因测序微流道”的专利,授权公告号CN 222111875 U,申请日期为2024年4月。 专利摘要显示,本实用新型涉及一种基于PCB的基因测序微流道,包括由下至上依次贴合的衬底、薄膜层、硅基层
我所实现水油微液滴界面“接触起电”产氢反应的活性调控
近日,我所生物能源研究部生物能源化学品研究组(DNL0603组)王峰研究员、贾秀全副研究员团队与斯坦福大学Richard N. Zare院士团队合作,在微液滴化学研究方面取得新进展,实现了雾化过程中水-油微界面“接触起电”产氢反应的活性调控。研究团队基于微液滴的破碎起电效应,以及水-油界面存在的自发
深圳先进院在微液滴生成和高密度颗粒阵列研究取得进展
体外诊断是疾病早期筛查和预后评估的重要方法,随着医学和检测手段不断发展,体外诊断的精准性、灵敏性不断提高,但仍有众多痕量核酸和蛋白对高灵敏检测方法提出严苛要求,例如重大精神疾病诊断、肿瘤早筛、病原筛查、伴随诊断等。近年来以数字PCR(dPCR)和数字ELISA(dELISA)为代表的单分子计数带
我所揭示海洋中微液滴对火成惰性碳的降解与沉降作用
近日,我所生物能源研究部生物能源化学品研究组(DNL0603组)王峰研究员、贾秀全副研究员团队与中国海洋大学海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室包锐教授团队、我所仪器分析化学研究室质谱与快速检测研究中心(102组群)李海洋研究员团队合作,在微液滴化学研究方面取得新进展,揭示了在海洋中,微液滴对火成
方群教授:基于顺序操作液滴阵列技术的微流控分析和筛选
2014年4月21日下午,第十届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会大会报告在威海盛大召开。来自浙江大学的方群教授给我们带来了题为《基于顺序操作液滴阵列技术的微流控分析和筛选》的报告。浙江大学 方群教授 方群教授首先讲到多相微流控技术是指利用多相微流体的物理化学特性和尺度效应,在微流
基于微液滴可裂解的电离质谱成像表征功能生物大分子
近日,斯坦福大学化学系Richard N.Zare教授课题组在Angewandte Chemie上发表了题为“Immuno-Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry Imaging Identifies Functional Mac
揭示昆虫绿僵菌通过微自噬途径调控附着胞脂滴降解机制
6月16日,Autophagy在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心王成树研究组完成的研究论文Activation of microlipophagy during early infection of insect hosts by Metarhizium robertsii。该研究揭示
细胞化学基础兆碱基
兆碱基megabase (Mb)定义:DNA片段长度单位,相当于1百万个核苷,大约等于1M。
碱基比的定义
中文名称碱基比英文名称base ratio定 义碱基在核酸分子中的比例。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学基础千碱基
中文名称:千碱基英文名称:kilobase;kb定 义:描述多核苷酸链的长度单位,相当于单链核酸中1000个碱基。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
碱基配对的依据
碱基配对是DNA双螺旋结构和RNA(单链)的基础,也是复制、转录和翻译作用的依据。
混合碱基符号的定义
中文名称混合碱基符号英文名称symbols for mix-bases定 义两种或多种碱基(核苷)混合物的表示符号,或未完全确定可能属于某两种或多种碱基(核苷)的符号:R表示A+G;Y表示C+T;M表示A+C;K表示G+T;S表示C+G;W表示A+T;H表示A+C+T;B表示C+G+T;V表示A+
碱基比的定义
中文名称碱基比英文名称base ratio定 义碱基在核酸分子中的比例。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成
碱基切除修复的用途
碱基切除修复(base-excision repair, BER)研究发现,所有细胞中都带有不同类型、能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能够特异性切除受损核苷酸上的N-β-糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。
碱基比的定义
中文名称碱基比英文名称base ratio定 义碱基在核酸分子中的比例。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学基础稀有碱基
又称修饰碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。
碱基配对的结构
核酸链间腺嘌呤和尿嘧啶(RNA)或胸腺嘧啶(DNA)以及鸟嘌呤和胞嘧啶的专一氢链结合。分子杂交技术就是根据碱基配对的原理设计的。碱基配对后形成碱基对(basepair,bp),常用作DNA分子的量度,如人类的线粒体DNA为16569bp。配对的碱基互称互补碱基(complementary base)
细胞化学基础合成碱基
在医学中,几种核苷类似物用作抗癌剂和抗病毒剂。病毒聚合酶将这些化合物与非主要碱基结合。病人服用的核苷类似物进入体内被转化为核苷酸而在细胞中被激活。
碱基互补配对的原则
碱基互补配对是指核酸分子中各核苷酸残基的碱基按A与T、A与U和G与C的对应关系互相以氢键相连的现象。它是沃森和克里克首先在DNA双螺旋结构模型中提出来的,后来发现,不仅在DNA复制中有这种规律,在转录过程DNA和RNA关系中也有类似的规律。甚至单链RNA中凡在空间靠近、可以氢键互相结合的碱基,也能这
碱基的研究与发展
生物体中常见的碱基有5种,分别是腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U) ,2019年又人工合成了4种碱基,美国科学家StevenA. Benner将这4个新成员分别命名为“Z”“P”“S”“B”(顾名思义,前5种碱基中,腺嘌呤和鸟嘌呤属于嘌呤族(缩写作R),它们具有双
什么是碱基对?
碱基对,是一对相互匹配的碱基(即A—T, G—C,A—U相互作用)被氢键连接起来。它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。 碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T
混合碱基符号的概念
中文名称混合碱基符号英文名称symbols for mix-bases定 义两种或多种碱基(核苷)混合物的表示符号,或未完全确定可能属于某两种或多种碱基(核苷)的符号:R表示A+G;Y表示C+T;M表示A+C;K表示G+T;S表示C+G;W表示A+T;H表示A+C+T;B表示C+G+T;V表示A+
兆碱基接头的定义
中文名称兆碱基接头英文名称megalinker定 义一种人工合成的具有特定限制酶识别位点的双链寡核苷酸。具有的限制性核酸内切酶切位点在DNA中出现的概率为百万分之一,在基因工程中可用于获得大片段的DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学基础互补碱基
互补碱基,碱基间的一一对应的关系叫做碱基互补配对原则就是Adenine(A,腺嘌呤)一定与Thymine(T,胸腺嘧啶)配对,Guanine(G,鸟嘌呤)一定与Cytosine(C,胞嘧啶)配对,反之亦然。碱基指嘌呤和嘧啶的衍生物,是核酸、核苷、核苷酸的成分。DNA和RNA的主要碱基略有不同,其重要
基因突变碱基变化
基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两大类。 碱基置换突变——也称为点突变,指DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。点突变分转换和颠换两种形式。如果一种嘌呤被另一种嘌呤取代或一种嘧啶被另一种嘧啶取代则称为转换嘌呤取代嘧啶或嘧啶取代嘌呤的突变则称为颠换(transversi