NatCommun：老化细胞中DNA甲基化扮演关键角色
尽管在每个人的一生中其机体的DNA会一直保持不变，但是科学家们却知道机体DNA在不同年龄阶段的行使的功能却并不相同。随着个体年龄增加，机体DNA的甲基化模式会发生剧烈变化，DNA的甲基化模式被认为是机体DNA的第二种遗传密码，可以控制基因的开启或关闭，然而这些改变引发的后果却依然是一个谜。 近日，刊登在国际杂志Nature Communications上的一篇研究论文中，来自美国威克森林浸信医学中心（Wake Forest Baptist Medical Center）的研究人员进行了一项多种族研究，包括对1264名年龄在55岁至94岁间的个体红细胞中的甲基化模式进行研究，结果显示，在横跨基因组的45万个位点检测中，在DNA甲基化中年龄相关的差异占到了8%，大部分的改变被认为不会影响细胞中基因的开启或关闭。 然而研究人员却发现了年龄相关的DNA甲基化改变的小亚群，即45万个位点中有1794个位点发生了改变，这些甲基化改变......阅读全文
无嘌呤嘧啶位点的概念
所有细胞中都带有不同细胞类型，能识别受损核酸位点的糖苷水解酶，它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键，在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点，统称为AP位点。
土壤现状监测点位如何选择
根据土壤导则要求污染影响型建设项目，二级要求监测柱状样和表层样，三级要求监测表层样。如果建设项目场地已经硬底化，该如何如何选取监测点？是需要把已经硬底化的场地破坏还是另外选取监测点？ 根据建设项目实际情况，如果项目场地已经做了防腐防渗（包括硬化）处理无法取样，可不取样监测，但需要详细说明
如何寻找转录起始位点？
一、引物延伸分析（primer extension analysis）引物延伸分析用于定量mRNA的量，测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端， 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域，随后用RNA作为模板，用反转录酶延伸引物得到cDNA，用变
大脑RNA编辑位点“辞典”发布
美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目，在这些位点中，RNA在整个人类生命周期中被修饰，这个过程被称为腺苷到肌苷（A-to-I）编辑，其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中，研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如
细胞化学词汇无嘌呤位点
中文名称：无嘌呤位点英文名称：apurinic site定 义：核酸中脱去嘌呤碱的部位。产生的醛基，易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
精确转录因子结合位点绘图
“掌握转录因子活动控制高等生物发育的基本原理非常有用，”纽约大学生物学系教授Stephen Small说。“更具体地讲，这项机理的发现为由于转录因子受到干扰的突变基因导致胚胎发育深层破坏和一系列疾病提供了一个潜在的治疗途径。” 这项研究发表于《Genes & Development》，参与研究
酶的活性位点的定义
酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙，底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合，如：氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如，底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上，也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上，或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合
土壤现状监测点位如何选择
根据土壤导则要求污染影响型建设项目，二级要求监测柱状样和表层样，三级要求监测表层样。如果建设项目场地已经硬底化，该如何如何选取监测点？是需要把已经硬底化的场地破坏还是另外选取监测点？ 根据建设项目实际情况，如果项目场地已经做了防腐防渗（包括硬化）处理无法取样，可不取样监测，但需要详细说明
如何寻找转录起始位点
一、引物延伸分析（primer extension analysis） 引物延伸分析用于定量mRNA的量，测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端， 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域，随后用RNA作为模板，用反转录酶延伸引物得到cDNA，
转录因子定义和结合位点
定义人类金属巯基因调节区转录因子(transcription factor)是一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合，从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。结合位点转录因子的结合位点（transcription factor binding site，TFBS）是转录因子
酶的活性位点的作用
酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙，底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合，如：氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如，底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上，也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上，或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合
序列标签位点图的定义
中文名称序列标签位点图英文名称sequence tagged site map定 义标明序列标签位点在基因组上位置的物理图。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
细胞化学词汇进入位点
中文名称：进入位点英文名称：entry site定 义：特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
度量衰老，科学家创建中国人复合DNA甲基化时钟
时间如梭，衰老是自然界不可抗拒的规律，但衰老的步伐并非一成不变——即使在同龄人之间，生理功能的衰退和器官老化的程度也存在显著差异。这些差异性说明个体的生物学年龄，即生理状态所反映的年龄，可能与其实际年龄并不完全吻合。我们有多老、衰老速度有多快、距离疾病有多远，取决于人的生物学年龄。因此，开发精确
度量衰老，科学家创建中国人复合DNA甲基化时钟
时间如梭，衰老是自然界不可抗拒的规律，但衰老的步伐并非一成不变——即使在同龄人之间，生理功能的衰退和器官老化的程度也存在显著差异。这些差异性说明个体的生物学年龄，即生理状态所反映的年龄，可能与其实际年龄并不完全吻合。我们有多老、衰老速度有多快、距离疾病有多远，取决于人的生物学年龄。因此，开发精确评估
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸。其中，丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点，因为其结构末端含有羟基，羟基很活泼，可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说，蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话，很大程度上就是磷酸化位点。
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸。其中，丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点，因为其结构末端含有羟基，羟基很活泼，可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说，蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话，很大程度上就是磷酸化位点。
研究揭示植物SUVH6酶催化位点特异H3K9甲基化的分子基础
2022年12月29日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心段成国研究组与南方科技大学杜嘉木研究组合作完成的题为Molecular Basis of Locus-specific H3K9 Methylation Catalyzed by SUVH6 i
研究揭示植物SUVH6酶催化位点特异H3K9甲基化的分子基础
《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心段成国研究组与南方科技大学杜嘉木研究组合作完成的题为Molecular Basis of Locus-specific H3K9 Methylation Catalyzed by SUVH6 in Plants的研究论
RISPR标记基因位点，揭示人类细胞染色体空间组织
在真核细胞的细胞核中，基因组会被核小体包裹形成染色质[1]，而染色质在空间上的分布是否有一定的规律是长期以来科学家们在努力研究的问题。了解其分布规律有利于增强对于细胞核的组织结构以及一些重要细胞活动的理解[2-4]。本研究利用改良的CRISPR/Cas9系统在二倍体活细胞中对随机选中的基因组位点
敲除这个基因位点，我们就不会患上心血管疾病？
在过去的十年中，科学家们在数十亿人的DNA中发现了一种神秘的“基因幽灵”，无论采用什么饮食，增加运动或者医疗手段，都会增加人体患上心脏病，动脉瘤或中风的风险。 近期，来自Scripps研究所的研究人员通过精确切割基因组中的DNA罪魁祸首，揭开了这一医学之谜，取得了重大突破，防止与这些破坏性疾病
李平华团队开发出高通量研究玉米基因位点新技术
李平华（左二）和研究生查看模式植物长势 山东农大供图 10月9日，《自然—通讯》在线发表了山东农业大学农学院教授李平华等中外科学家合作研究成果。他们探索出高通量研究玉米转录因子调控位点的新技术，利用大规模转录因子数据重新构建了玉米叶片基因表达调控网络，使玉米基因编辑不再“大海捞针”。 玉米是世界
北京基因组所法医鉴定合作研究获进展
年龄推断是法医学领域研究的重要课题之一，尤其是涉及青少年犯罪以及推断高度腐败甚至白骨化无名尸的年龄，可为尸源的查找提供侦查范围和线索。另外，根据现场遗留生物物证推断嫌疑人年龄在法医学实践中也具有重要的应用价值。传统的个体年龄的评估主要是依据骨骼、牙齿等组织以及组织中各类物质的物理和化学特性等随年
Nature子刊：衰老对你的身体做了些什么
从古至今人类从未停止过对长生不老的追求，现在科学家们正在逐步揭开衰老的秘密，在分子机制中寻求延长寿命和治疗衰老相关疾病的线索。Exeter大学的一项大规模研究，揭示了人类衰老过程中机体所发生的分子改变。这项研究发表在十月二十二日的Nature Communications杂志上。 在人生的最后
再扩增VH基因文库添加3‘限制性位点并克隆创建VH基因节...
再扩增VH基因文库添加3‘限制性位点并克隆创建VH基因节段文库[器材和试剂]● PCR试剂和设备● Wlzard PCR纯化试剂盒（Promega）● PVHlOR2引物： 5'-GAG TCA TTC TCG ACT TGC GGC CGC TCG CGC GCA GTA ATA CAC
衰老如何改变我们的基因
衰老对身体产生的可见影响有时与基因活动的无形变化有关。DNA甲基化的表观遗传过程会随着年龄增长而变得不再精确，造成基因表达的变化。而这种变化与随着年龄增长而出现的器官功能衰退和疾病易感性增加有关。如今，一项针对整个成年生命周期中17种人体组织的表观遗传变化进行的荟萃分析，提供了迄今为止关于衰老如何修
BRAF突变诱导老年和异常甲基化的肠上皮快速癌变
无柄锯齿状病变(SSLs)在各个年龄段都很常见，但BRAF突变癌症主要发生在老年人。年轻患者SSL中DNA甲基化异常并不常见。在这里，作者探讨了衰老和DNA甲基化在SSL启动和进展中的作用。作者使用BRAF突变的诱导性模型将致癌的BRAF V637E等位基因定向重组到小鼠肠道。经过一段时间的衰老
HRM甲基化位点检测的灵敏性（二）
两个不同的病人的CpG位点见下表图4：miR-195 CpG岛的150bp扩增区 图5：从4个CLL患者中克隆miR-195可能调控区，使用Qiagen EpiTect Kit进行重亚硫酸盐处理，之后PCR扩增，Lightscanner检测，测序。不同的患者采取不同的甲基化模式扩增（0-8
HRM甲基化位点检测的灵敏性（一）
引言DNA甲基化是一种重要的表观遗传CpG二核苷酸修饰形式，异常的DNA甲基化模式发生在许多基因启动子的CpG岛，这会增加患癌症的风险。CpG岛高甲基化常导致基因沉默，与癌症、老化、基因印记、X-染色体失活密切相关，此外，全基因组CpG高甲基化中也证实了发生在肿瘤形成的早期。传统的检测甲基化位点的方
科学家发现感知年龄的新基因
为何有些人看上去更显老，而有些人却能一直都长着娃娃脸？日前，中科院北京基因组研究所、荷兰伊拉斯姆斯大学、英国联合利华集团联合其他国家的研究人员，合作进行了一项皮肤感知年龄遗传因子的大型科研，首次从基因层面揭示了为什么有些人看起来与实际年龄差别很大的原因。相关成果发布于《现代生物学》。 项目中科