NatCommun:老化细胞中DNA甲基化扮演关键角色
尽管在每个人的一生中其机体的DNA会一直保持不变,但是科学家们却知道机体DNA在不同年龄阶段的行使的功能却并不相同。随着个体年龄增加,机体DNA的甲基化模式会发生剧烈变化,DNA的甲基化模式被认为是机体DNA的第二种遗传密码,可以控制基因的开启或关闭,然而这些改变引发的后果却依然是一个谜。 近日,刊登在国际杂志Nature Communications上的一篇研究论文中,来自美国威克森林浸信医学中心(Wake Forest Baptist Medical Center)的研究人员进行了一项多种族研究,包括对1264名年龄在55岁至94岁间的个体红细胞中的甲基化模式进行研究,结果显示,在横跨基因组的45万个位点检测中,在DNA甲基化中年龄相关的差异占到了8%,大部分的改变被认为不会影响细胞中基因的开启或关闭。 然而研究人员却发现了年龄相关的DNA甲基化改变的小亚群,即45万个位点中有1794个位点发生了改变,这些甲基化改变......阅读全文
多克隆位点的常见载体
常见的基因工程载体都具有多克隆位点,有些载体,如λEMBL4、Charon40等甚至有两个。
细胞化学词汇无嘌呤嘧啶位点
所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。AP位点所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位
蛋白质结合位点的定义
分子中能与配体形成稳定相互作用的特定部位。蛋白质的结合位点通常是由多肽链上的一些相互分离的氨基酸残基通过肽链折叠在空间上聚集到一起,形成特定的空间排布方式。
DNA-酶-I-超敏感位点作图
DNA 酶 I 超敏感位点作图法经常用于定位真核基因的调控区。由于还未被理解的原因,基因带有对 DNA 酶 I 切割敏感的分开的序列,而且这些所谓超敏感位点图谱是随基因的激活状态而变化的(Weintrauband Gmudine1976)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J.
DNA-酶-I-超敏感位点作图
实验材料 真核细胞 试剂、试剂盒 缓冲液 A EDTA 乙醇 裂解缓冲液
核酶切割-RNA-专一位点
实验材料 合成的核酶分子切割底物RNA试剂、试剂盒 Tris-HClMgCl2实验步骤 一、材料与设备1)500 mmol/LTris-HCl(pH7.4)2)100 mmol/LMgCl23) 合成的核酶分子4) 切割底物 RNA二、操作方法1) 制备切割混合构:不超过 l0 pmol 底物 RN
核糖体结合位点的定义
核糖体结合位点(ribosomebinding site,简称RBS),是指mRNA的起始AUG上游约8~13核苷酸处,存在一段由4~9个核苷酸组成的共有序列-AGGAGG-,可被16SrRNA通过碱基互补精确识别的序列。
位点特异重组的重组机制介绍
位点特异性重组本质上是两个重组位点的四股DNA发生两次切割和两次连接的过程,所需的关键成分是重组酶( recombinase),此外还需要一些蛋白因子。这里以入噬菌体DNA与大肠杆菌DNA整合而进入溶原状态为例,介绍位点特异性重组机制(图2-33)。 1.第一次切割重组酶(又称入噬菌体整合酶,
染色体整合位点的概念
中文名称染色体整合位点英文名称chromosomal integration site定 义染色体上能接纳外源遗传物质的位点。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)
核糖体结合位点的形成
真核细胞的大小亚基是在核中形成的,在核仁部位rDNA转录出45SrRNA,是rRNA的前体分子,与胞质运来的蛋白质结合,再进行加工,经酶裂解成28S,18S和5.8S的rRNA,而5SrRNA则在核仁外合成28S,5.8S及5SrRNA与蛋白质结合,形成RNP分子团。为大亚基前体,分散在核仁颗粒区,
核糖体结合位点生物合成
抗体是由核糖体合成细胞内定位核糖体的功能就是将mRNA上的遗传密码(核苷酸顺序)翻译成多肽链上的氨基酸顺序。因此,它是肽链的装配机,即细胞内蛋白质合成的场所,细胞合成的蛋白质可分为两类:外输性蛋白和内源性蛋白。1.外输性蛋白:主要在固着核糖体上合成,分泌到细胞外发挥作用,如抗体蛋白、蛋白类激素、酶原
治癌症不可忽视-非肿瘤位点
瑞典卡罗琳医学院和中国研究人员日前发布最新研究成果,揭示了肿瘤如何对身体多个器官功能造成系统性影响,表明治疗癌症不能只关注抑制肿瘤本身的生长,还需针对其他器官的症状进行综合治疗。 这一成果发表在美国期刊《细胞报告》上。研究小组成员、瑞典卡罗琳医学院华人教授曹义海10日接受新华社记者采访时说,这
位点特异性重组的简介
位点特异性重组(site-specific recombination)是遗传重组的一类。这类重组依赖于小范围同源序列的联会,重组也只发生在同源的短序列的范围之内,需要位点特异性的蛋白质分子参与催化,重组的蛋白不是rec 系统而是int 等,如噬菌体l 的定点插入。重组时发生精确的切割、连接反应
骨桥蛋白的结合位点的介绍
OPN分布广泛并受多种因素的调控,能与许多物质结合。 (1)结合多种整合素受体:已发现αvβ1、αvβ3、αvβ5、α5β1、α8β1、α4β1和α9β1等7种整合素能与OPN结合,2个α4β1整合素结合部位位于OPN的N-末端凝血酶片酸的38 aa结构域上,α9β1能结合凝血酶断裂的OPN
DNA-酶-I-超敏感位点作图
实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 缓冲液 AEDTA乙醇裂解缓冲液磷酸盐缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I 稀释缓冲液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 缓冲液TE仪器、耗材 Sorvall H1000B 转头或等价物带螺帽的试管振荡水浴锅实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓
核糖体结合位点的形成
真核细胞的大小亚基是在核中形成的,在核仁部位rDNA转录出45SrRNA,是rRNA的前体分子,与胞质运来的蛋白质结合,再进行加工,经酶裂解成28S,18S和5.8S的rRNA,而5SrRNA则在核仁外合成28S,5.8S及5SrRNA与蛋白质结合,形成RNP分子团。为大亚基前体,分散在核仁颗粒
凝血酶切割位点的定义
中文名称凝血酶切割位点英文名称thrombin cleavage site定 义基因工程表达系统中融合蛋白常用的连接序列,凝血酶处理可将融合蛋白中目的蛋白与非目的蛋白的肽段分离,最适切割位点是:P4-P3-P2-Arg↓-P1′-P2′,式中P4和P3为疏水氨基酸,P1′和P2′为非酸性氨基酸,↓
核糖体结合位点理化特性
核糖体的主要成份为蛋白质和rRNA,二者比例在原核细胞中为1.5:1,在真核细胞中为1:1,每个亚基中,以一条或二条高度折叠的rRNA为骨架,将几十种蛋白质组织起来,紧密结合,使rRNA大部分围在内部,小部分露在表面。由于RNA的磷酸基带负电荷超过了蛋白质带的正电荷/负电性,易与阳离子和碱性染料结合
载体多克隆位点(MCS)改造
加、减、换一个载体 的MCS的位点 (给一个表达 载体加、减、换小表达标签,如His6, His10,strep II等,和MCS改造是一样的),其实技术 不是问题,问题在于位点的选择 ,因为载体设计 时应该设计者也考虑过mcs的问题,应该给使用者越多的选择越好,但为什么有的载体只给有
核糖体结合位点的简介
核糖体结合位点是指起始密码子AUG上游的一段富含嘌呤的非翻译区。包含SD(Shine-Dalgarno)序列。 RBS序列(生物):所谓RBS,是指起始密码子AUG上游的一段非翻译区.在RBS中有SD(Shine-Dalg-arno)序列,长度一般为5个核苷酸,富含 G,A,该序列与核糖体16
核酶切割-RNA-专一位点
核酶切割 RNA 专一位点 实验材料 合成的核酶分子 切割底物RNA 试剂、试剂盒
α微管蛋白:新的药物结合位点
微管(Microtubule)是抗肿瘤药物研发的重要靶点。微管是“细胞的骨架”主要成分之一,在许多细胞重要事件中起着关键作用。微管是由α-和β-微管蛋白(Tubulin)异二聚体可逆地组装成而成的线性管装结构(图1)。 图1:微管蛋白已知的六个结合位点及微管蛋白组装形成微管示意图 目前,微管
多克隆位点的应用特点
多克隆位点(multiple cloning site, MCS),是包含多个(最多20个)限制性酶切位点(restriction site)的一段很短的DNA序列。也称为多位点接头(polylinker),是基因工程中常用到的载体质粒的标准配置序列。MCS中,每个限制性酶切位点通常是唯一的,即它们
饮食改变衰老过程的表观遗传学修饰
表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。研究人员对185位志愿者(84位男性和101位女性)的直肠组织切片进行了研究,发现人体内基因的表观遗传学修饰主要受衰老的驱动,不过日常饮食也会对表观遗传学修饰产生重要影响。该研究发表在十二月六日的Aging Cell杂志上。 研
科学家发现感知年龄的新基因
为何有些人看上去更显老,而有些人却能一直都长着娃娃脸?日前,中科院北京基因组研究所、荷兰伊拉斯姆斯大学、英国联合利华集团联合其他国家的研究人员,合作进行了一项皮肤感知年龄遗传因子的大型科研,首次从基因层面揭示了为什么有些人看起来与实际年龄差别很大的原因。相关成果发布于《现代生物学》。 项目中科
我国科学家首次实现前列腺癌无创性体液检测
前列腺癌是男性中最常见的恶性肿瘤之一,目前前列腺癌的传统诊断方法是检测血清中特异性抗原(PSA)浓度,对PSA偏高的患者进行穿刺活检最终确诊。然而,该方法的主要缺陷是PSA的特异性较差(PSA 4-10ng/ml时,特异性只有25%-40%),其它如前列腺炎、前列腺增生等前列腺疾病也能引起PSA
美发现急性侧索硬化症(ALS)相关的10个基因位点
本研究有助于在急性侧索硬化症(ALS)的进展中发现新生物学途径,Methodist医院神经学系主任和休斯敦Methodist神经病学研究所的创始人Stanley Appe博士认为:ALS最有可能是环境和基因共同作用的结果,该研究使我们更好地了解了基因作用。 分散的(非遗传)ALS占ALS人
揭示新的药物靶点:KRAS蛋白的构象控制位点
控制KRAS:揭示关键癌症蛋白的变构位点研究人员在基因组调控中心和威康萨克研究所利用深度突变扫描技术全面识别了蛋白质KRAS中的变构控制位点,该蛋白质是许多类型的癌症中最常见的突变基因之一。科学家们使用深度突变扫描技术来量化超过26,000个突变对KRAS的折叠和其与六个相互作用伙伴结合的影响。KR
北京基因组所等首次实现前列腺癌的无创性体液检测
前列腺癌是男性中最常见的恶性肿瘤之一,目前前列腺癌的传统诊断方法是检测血清中特异性抗原(PSA)浓度,对PSA偏高的患者进行穿刺活检最终确诊。然而,该方法的主要缺陷是PSA的特异性较差(PSA 4-10ng/ml时,特异性只有25%-40%),其它如前列腺炎、前列腺增生等前列腺疾病也能引起PSA
中国人群阿尔兹海默症全基因组测序发现新风险基因位点
香港科技大学深圳研究院“分子神经科学和药物创新研究孔雀”团队在阿尔茨海默症研究领域取得突破性进展,针对中国的患病人群首次进行全基因组测序研究,发现了与疾病发生发展有密切关系的新风险基因位点,揭示了人体免疫系统失调与阿尔茨海默症病变的关系。该项重要成果于2018年2月5日在《美国国家科学院院刊》