Science:华大参与三种鳄鱼基因组测序

最近,德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组,测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。 生物学副教授David Ray指出,通过测定这些基因组序列,科学家们可以更好地了解鸟类的进化,它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组,可以说真正完成了鳄鱼基因组的“全家福”。这项研究主要由美国国家科学基金会资助,于12月12日发表在国际权威杂志《Science》。 Ray说:“这项研究的一个主要发现是,与鸟类相比,鳄鱼基因组变化很缓慢。我们把鸟类、鳄鱼与乌龟进行比较,乌龟是包括鸟类、鳄鱼的这个群组的最近亲缘种。我们发现,它们也进化的很缓慢。对此最好的解释是,所有这三个物种的共同祖先是一个”缓慢的进化者“,反过来这又表明,在鸟类中,快速进化是独立演变的事情。” 从2009年开始,研究人员尝试仅测定1%的鳄鱼DNA序列。然而,不久之后,每测定一百万个碱基的价格从1000美元下......阅读全文

我国首次完成寨卡病毒全基因组序列测定

  2月22日,记者从军事医学科学院获悉,该院与广州市第八人民医院、出入境检验检疫系统相关单位密切合作,在获得从委内瑞拉归国患者临床标本后,采用高通量测序技术,于2月21日直接从尿液中获得病毒全基因组序列。  寨卡病毒属黄病毒科,是一种主要由伊蚊传播的虫媒病毒。1947年首次在乌干达寨卡丛林中的恒河

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

  类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的

我国自主完成首个果树作物基因组序列图谱

  华中农业大学今天透露,该校科研人员经过一年多努力,已绘制完成甜橙的全基因组序列图谱。这是我国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱。这一农业科技基础研究成果,将对加快我国柑橘品种改良,改变柑橘品种大量依赖进口的状况,提升我国柑橘产业的核心竞争力起到重要作用。  据悉,柑橘是世界栽培面积

我国完成世界首张-西瓜基因组序列图谱

  由北京市农林科学院蔬菜平台牵头,联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位,共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译,获得了高质量的西瓜基因组序列图谱,成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

  人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学

我国首获濒危物种白头叶猴全基因组序列

  广西林业局11日提供的信息显示,中国首次获得濒危物种白头叶猴全基因组序列,揭示了白头叶猴能够在富含矿物离子的高碱性喀斯特山地长久生存的基因组遗传特征秘密。  白头叶猴是中国特有的生物物种,其体毛以黑色为主,与黑叶猴不同的是头部高耸着一撮直立的白毛。白头叶猴仅分布在广西崇左左江和明江间不足200平

蚂蚁基因组序列被破译-有助探究人类衰老根源

  美国科学家8月30日表示,他们首次绘制出了两种蚂蚁的全基因组序列图。此举可为科学家更好地了解人类衰老以及行为表现提供帮助。  该研究项目的负责人、纽约大学兰贡医疗中心的生化学教授丹尼·赖因伯格说:“蚂蚁是绝对的社会动物,蚂蚁个体的生存要依靠蚂蚁群体,这与我们人类非常相似。无论是工蚁、兵

益生乳酸菌全基因组序列测定完成

内蒙古农业大学正式公布,益生乳酸菌的全基因组序列测定分析全部完成,这是我国第一个完成的乳酸菌基因全序列测定。 由内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生乳酸菌的全基因组序列测定Lb.casei Zhang科技项目是经过6年分离、筛选,并进行系统研究开发的具有完全自主知识产

我国完成世界首张西瓜基因组序列图谱

  我国主导完成世界首张西瓜基因组序列图谱的绘制与破译,相关研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》上在线发表。   西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果,但就是这样一种常见的水果,人们却始终未能从内到外了解它。过去,各国科学家虽然知道栽培西瓜遗传多样性狭窄是制约西瓜

新算法TRFill解决生物基因组重复序列组装难题

  近日,中国农业科学院农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队开发出了一种新算法——TRFill,解决了现有工具无法完全填补基因组间隙的难题,显著提升了基因组质量。相关研究成果发表在《基因组生物学》(Genome Biology)上。  动植物基因组的许多区域存在大量高度重复的DNA片段

遗传发育所等解析盐芥全基因组序列

  盐芥是十字花科盐芥属的一种盐生植物,与双子叶植物研究中所常用的模式植物拟南芥亲缘关系较近。盐芥具有作为模式植物的一系列良好特征,如个体较小、生活周期短、自花授粉、种子量大、基因组较小,而且易于转化。最重要的是,盐芥具有对高盐、干旱和低温等非生物胁迫极高的耐受能力,这使其成为研究植物耐受非生物胁迫

《自然》:2种疟疾寄生虫基因组序列测定

疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax,其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体,而P. vivax则会致人极度虚弱,

关于真核基因组的高度重复序列的介绍

  1、真核基因组的高度重复序列— 简介  高度重复序列在基因组中重复频率高,可达10^3以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。  2、真核基因组的高度重复序列—倒位重复序列  这种重复顺序复性速度极快,即

鳄鱼能感知人类婴儿的痛苦

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507154.shtm如果婴儿的哭叫声听起来很痛苦,尼罗河鳄鱼会迅速做出反应 。图片来源:Blickwinkel/Alamy鳄鱼能够清晰分辨人类婴儿和其他类人猿幼崽的叫声,甚至可能比人类更能识别自己的痛苦。

生物学术语基因组当量的概念

基因组当量是基因组文库容量的度量单位。基因组文库容量的度量单位,指文库中所有载体的插入片段总长度相当于基因组的总长度。

生物学术语基因组扫描的概念

中文名称基因组扫描英文名称genome scanning定  义从全基因组的遗传标记中寻找与特定性状或基因紧密连锁的标记,并在染色体上定位相关基因的方法。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

大规模基因比较助力系谱图研究

Emily和Alan Lemmon希望生物学家可以利用他们的技术绘制系谱图。   Emily Moriarty Lemmon永远不会忘记她在读研究生时,为建立青蛙系谱图而付出的努力。为了了解不同种类青蛙之间如何彼此相关,她需要评估尽可能多的DNA差异,但是时间和资金大大限制了她可以确定和测试的

中科院等完成橡胶草基因组序列解析

   中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋研究组与中国农业科学院、中国热带农业科学院等合作,在橡胶草基因组序列解析方面取得重要进展,标志着以橡胶草作为模式植物进行天然橡胶合成研究进入后基因组时代。研究成果近日在线发表在权威学术期刊《国家科学评论》(National Science Review)杂

新技术90分钟完成全基因组序列分析

  美国国家儿童医院(Nationwide Children's Hospital)的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件,表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。  第一个人类基因组测序完成耗时大约13年,耗费30亿美元,而现在技术测序技术的

我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱

  12月25日,由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成,这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱,也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。   藏羚羊是我国青藏高原特有的物种,其生存环境高寒、缺氧,自然条件极为严酷。在喜

蔬菜中心:绘成世界首张西瓜基因组序列图谱

  我国是世界第一西瓜生产与消费大国,但是人们却始终未能从外到内了解它,直到2013年1月,国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱(影响因子35.532),标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新,为高效培育兼具优质、高产、抗

Nature-Methods:De-Novo基因组序列组装的新方法

  对于de novo人类基因组序列组装而言,短读长简直意味着不可能的任务。不过,加州大学旧金山分校、BioNano Genomics和10X Genomics的研究人员近日开发出一种新的组装方法,它将short-read测序与10X的linked-read测序相结合。这项成果于近日发表在《Natu

基因组学突破性成果:斑马鱼序列解析

  人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2,报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴

猴痘基因组研究公布:14种序列皆来源这里

  对来自正在进行的全球爆发的猴痘病毒 (MPXV) 基因组的分析发现,这些样本聚集在一起,表明它们的来源单一。  根据世界卫生组织的数据,从今年年初到 6 月中旬,已有 2100 多例经实验室确诊的猴痘病例,其中大部分是自 5 月初以来报告的。其中 80% 以上的病例出现在欧洲,12% 出现在美洲

全球首例!科学家记录鳄鱼“孤雌生殖”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503627.shtm在鸟类、蜥蜴和蛇当中,科学家曾经发现了“孤雌生殖”的案例,即在没有雄性基因贡献的情况下产下胎儿。最近,弗吉尼亚理工大学的科学家记录了首例鳄鱼“孤雌生殖”案例,这条鳄鱼在哥斯达黎加的一个

清热化痰-推荐川贝南北杏炖鳄鱼

   推荐:广东省中医院临床营养科  主要功效:清热、化痰、润肺、止咳  推荐人群:平素体质虚弱,容易咳嗽、咳痰、哮喘等人群,小孩亦可。  材料:川贝粉1g(或川贝粒3g)、南北杏各3g、枸杞3g、鳄鱼200g、生姜适量(1~2人量)  烹调方法:鳄鱼洗净汆水去掉血污,在炖盅中放入0.5~1L清水,

仿生电子皮肤像鳄鱼皮般柔韧

  开发具有多种感官的电子皮肤对于康复、医疗保健、假肢和机器人技术等诸多领域都至关重要。这项技术的关键之一是可拉伸压力传感器,它可检测各种类型的触摸和压力。最近,韩国浦项科技大学和蔚山大学的联合团队受鳄鱼皮启发,创造出一种全方位可拉伸压力传感器。研究结果以封面论文形式发表在最近的《Small》杂志上

最新研究称鳄鱼曾为早期人类健脑食品

肯尼亚博物馆展出的一具史前鳄鱼头骨  北京时间6月9日消息,据美国《国家地理》网站报道,最新一项研究显示,鳄鱼和哺乳动物曾经是早期人类的美餐,而以富含脂肪的鳄鱼肉为食可能帮助早期人类进化出体积更大的大脑。  这一研究结论基于在一个史前“厨房”发现的骸骨和人工制品,它们构成了人类以水生

鳄鱼外皮感觉器有多种感知功能

  100多年前人们就发现,鳄鱼和短吻鳄的头部、颚部、嘴里和齿间有许多突起的小黑点,并称之为外皮感觉器官(ISOs)。但这些器官究竟有何功用,至今知之甚少。据物理学家组织网近日报道,日内瓦大学科学家进一步研究认为,鳄鱼的外皮感觉器官与其它脊椎动物感觉器官完全不同,把触觉、冷热和化学刺激探测结合在了一

推进后基因组时代物理生物学探索

  5月7日~8日,科学与技术前沿论坛在中科院学术会堂召开,此次论坛的主题为“后基因组时代的物理生物学”。欧阳钟灿、郝柏林、陈润生、欧阳颀等多名来自全国各大高校和科研院所的院士和学者出席了此次论坛,并发表了主题演讲。  本次论坛召集人中科院院士杨玉良表示,上世纪末以来,生命科学获得了飞速发展,积累了