科学家发明少量细胞多层次图谱绘制新方法
解析正常和病态生理过程的有力工具是全基因组分子遗传和表观遗传图谱。其中获得细胞机能完整图谱最主要的挑战之一，就是开发出一种能够描述少量细胞多层次图谱特征的技术。最新一期《自然―方法学》(Nature Methods)发表的两篇文章解决了这个问题。 在过去的15年里，出现了许多研究基因组图谱的方法，包括从生物芯片到最新的单分子测序平台。但是，由于每个器官由不同类型的细胞组成，而其中许多类型的细胞数量很少，这使得对细胞在表观组和转录组水平图谱的研究变得缓慢。 美国Helicos生物科学公司的Fatih Ozsolak及其同事发明了一种名为“少量数码基因表达"(LQ-DGE)的新方法。作者利用该方法对少至250个的细胞不用扩增就可以得到其mRNA图谱。他们通过改善Helicos的DGE方法，即从poly(dT)包裹的流动细胞上捕获poly(A)+ mRNA，并直接在细胞表面完成cDNA合成与测序，减少了样品操作......阅读全文
科学家绘制高精度类人猿基因组图谱
一个国际科研团队宣布，他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是，这次没有参照人类基因组图谱，因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法，美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱，对人与类人猿基因组
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前，复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队，首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划，“DNA元件百科全书计划”（Encyclopedia of DNA Elements）从2003年启动至今整整20周年；本研
云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功
从20世纪70年代开始，云南省怒江州就开始种植草果，到2020年，种植面积已达111万亩，不仅是全国草果的核心产区，也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。 为了加快提高草果遗传改良效率，培育高产、抗病、优质、安全新品种，对从源头创新保障草果产业健康可持续发展，2019年9月，怒江州联合华南农业
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前，复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队，首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划，“DNA元件百科全书计划”（Encyclopedia of DNA Elements）从2003年启动至今整整20周年；本研
科学家破译茶枝柑基因组遗传图谱
茶枝柑属于芸香科柑橘属宽皮橘物种，是历经700多年驯化栽培的柑橘变种，其果皮制干即为中药“广陈皮”，含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是“广陈皮”中关键的药用成分，但目前对其生物合成的遗传基础及调控机制知之甚少。近日，我国科学家在“广陈皮”活性成分合成调控机制研究方面取得重要进展，他们通过多组学技术
高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制成功
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新科技创新团队联合北京相关生物企业等单位成功绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱，为我国地方猪种质资源保护和开发利用奠定了基础。相关成果发表于《分子生态资源（Molecular Ecology Reso
我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱
由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱，日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后，我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱，也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱，标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。 自1985年大黄鱼人工养殖
我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱
12月25日，由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成，这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱，也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。 藏羚羊是我国青藏高原特有的物种，其生存环境高寒、缺氧，自然条件极为严酷。在喜
蔬菜中心：绘成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国是世界第一西瓜生产与消费大国，但是人们却始终未能从外到内了解它，直到2013年1月，国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱（影响因子35.532），标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新，为高效培育兼具优质、高产、抗
中国首份个人基因组图谱将在1年内出炉
每个人的基因都能刻成盘？ 采访人：记者 余建斌 点评人：浙江大学遗传与基因组医学中心主任 祁 鸣 来源：人民网－《人民日报》 事件 人民网综合消息诺贝尔奖获得者、被人称为“ＤＮＡ之父”的吉姆·沃森得到了一份特殊奖品：一张含有组成他基因的３０亿个ＤＮＡ单位详细信息的光盘，颁奖仪式３１
海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”
近日，记者从海南大学获悉，该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系，实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域，且无
《自然—生物技术》：美教授“自绘”个人基因组图谱
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一台机器、3个人、5万美元，美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明，这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。 斯坦福大学8月10日发表声明说，夸克在两名同事的帮助下，利用一台冰箱大
首个家鸡泛三维基因组图谱构建成功
鸡是如何从野生原鸡演化为如今的高产肉鸡或蛋鸡的？其背后的基因“开关”在哪里？近日，华南农业大学动物科学学院家禽遗传育种研究团队联合国内多家单位，成功构建了首个高分辨率家鸡泛三维基因组图谱。相关成果发表于《先进科学》（Advanced Science）。“该研究成果就像是一张高精度的‘立体导航图’，将
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源
甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交，其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文，提出了甜橙起源这一新理论。 专家表示，甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架，也将在应用上为果实品质包括色
NIH－340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布，决定对八个单位（或个人）进行为期两年、总值340万美元的资助，以支持癌症基因组图谱研究计划（Cancer Genome Atlas pilot program）。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目，于2005年晚期，
首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表
2012年12月24日，由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结
找到“广陈皮”效用线索－破译茶枝柑基因组图谱
茶枝柑，主要分布于广东新会等地，其果皮制干即为中药“广陈皮”，含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是广陈皮中关键的药用成分，目前尚不清楚其生物合成的遗传基础及调控机制。5月11日，深圳华大生命科学研究院联合华南农业大学、中国药科大学、南京中医药大学，通过多组学技术破译了茶枝柑基因组的遗传图谱，揭示了多
Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱
来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了，我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究，将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件，最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。 这些变异存在于非直接负责编码基因，而是发
首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱
DNA切割酶对基因结构调节起着关键作用。研究人员发现，它在导致癌症的（如白血病和实体瘤）易位（translocations）异常重排中表现活跃。 II型拓扑异构酶（type II topoisomerase， TOP2）通过断裂DNA双链磷酸二酯键，来更正DNA连环数，使细胞DNA正常转录、复
科学家成功绘制－首幅小麦基因组物理图谱
一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱，这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传
我国学者首次绘制一串红基因组图谱
北京市园林科学研究院21日对外称，由该研究院和北京林业大学合作共同完成了一串红高质量的基因组图谱绘制项目工作，这使我国成为世界上首个绘制出一串红基因组图谱的国家。图片来源于网络 唇形科是开花植物中的第六大科，包括约236个属，6900—7200个种类。而一串红则隶属唇形科鼠尾草属，其花色艳丽
多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱
近日，来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章，绘制
荷兰科研人员首次绘出女性个人基因组图谱
荷兰科研人员5月26日说，他们首次绘出女性的个人基因组图谱，这将有助于深入研究人的遗传多样性。 荷兰莱顿大学医学中心发表的一份声明说，科研人员已测定该中心一位女性临床遗传学家的基因组序列，她是基因组被完整测序的首位女性和首位欧洲人。 基因组是指包含在生物DNA（脱氧核糖核酸）中的全部遗传信息。此前科
最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近，英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员，开发并使用了一种新的技术，将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图，需要完成才能看到整幅图片，研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来，并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
干细胞和基因编辑强强联手，绘制人类基因组图谱
胚胎干细胞是一种独特的资源，它们可以变成我们身体中任何成体细胞。它的多才多艺造就了再生医学、疾病模型和新药发现。 与人类胚胎干细胞的发现并行的另一项生物里程碑是人类基因组测序和赋予我们遗传身份的全套基因鉴定。“人类基因组计划”让我们有机会深入了解基因在基因组中的功能。如今，科学家们正在尝试将二
Cell－Res：CRISPR/Cas9瞬时表达基因组编辑体系
基因组编辑技术是最新发展起来的植物基因功能研究及定向育种的重要手段。在植物中实现基因组编辑的常规方法是将序列特异性核酸酶（如CRISPR/Cas9）的编码DNA转化植物细胞，稳定表达进而实现对目的基因的定点编辑。这种情况下，CRISPR载体整合在植物染色体中，需通过后代分离获得不含CRISPR/
深圳华大基因研究院完成大熊猫基因组序列图谱
揭开大熊猫黑眼圈的奥秘 深圳华大基因研究院十月十一日在深圳第十届“高交会”上宣布，大熊猫“晶晶”基因组框架图绘制完成，这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。 据深圳华大基因研究员王俊博士介绍，大熊猫有二十一对染色体，基因组大小与人相似，约为三十亿个碱基对，包含二到
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析，相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示，莲基因组大约有2.7万个基因，全长9.3亿个
人类基因组“primiRNA”剪切位点图谱绘制
人体的基因表达是一个复杂的过程，那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA（miRNA）是一类真核生物内源性的小分子单链RNA，它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素，30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控（主要是基因沉默调控