最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近，英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员，开发并使用了一种新的技术，将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图，需要完成才能看到整幅图片，研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来，并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确定人类基因组中启动子和增强子之间的相互作用，这种能力就有很大潜力让我们了解疾病的遗传基础。 一个胚胎的发育以及体内不同细胞类型的建立，都依赖于一系列的基因组调控元件，在不同地点和不同时间安排基因的正确表达。为了对“在健康和疾病状况下基因如何被调控”有一个完整的了解，就必须对“有助于基因控制的调控因子”有一份全面的目录表。 Babraham研究所的研究人员完善了现有的一项技术，来研究小鼠基因组中一百万个调控元件，并将其与基因启动子联系起来，以理解基因是如何被打开和关闭的。同时，这项技术也被用来研究人类的血细胞类型。如果基因组被认为是......阅读全文
最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近，英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员，开发并使用了一种新的技术，将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图，需要完成才能看到整幅图片，研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来，并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
启动子分类介绍
①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下，结构基因的表达大体恒定在一定水平上，在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子，
启动子是什么？
启动子 (promoter),是位于基因5'端上游紧靠转录起点的一段非编码序列，其功能是引导RNA 聚合酶与基因相应部位的正确结合，启动基因的转录。一般来说， 原核基因的启动子比较简单，只有数十个碱基组成，而真核基因的启动子较大，可能涉及数千个碱基。启动子有方向性， 位于结构基因转录起始点的
启动子分类介绍
①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下,结构基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子,
Cell：新技术揭开基因远距离调控与疾病关系
来自英国Babraham研究所的科学家发现了我们基因组中的结构与常见疾病的内在联系。利用Babraham研究所开创性的技术，研究结果能够解释大量遗传数据的生物学意义，将DNA序列的微小变化和疾病风险连接起来。发现这些未知的联系，将为设计新的药物和未来治疗包括类风湿关节炎和其他类型的自身免疫性疾病
启动子封堵的定义
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子元件的功能
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
双向启动子的定义
双向启动子( bidirectional promoter)位于两个相邻且转录方向相反的基因之间 的一段DNA序列。
翻滚启动子的定义
中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定 义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象，即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离，此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录，但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二
启动子封堵的概念
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
启动子的基本结构
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物，故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明，对许多启动子来说
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展，常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大，是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法，对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止，国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道，国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
启动子清除的定义
聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
启动子清除的概念
聚合酶转录时，首先结合到启动子上，找到特异结合位点，激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶－启动子复合物连接紧密，如果转录要延长需要聚合酶的前进，只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
启动子的功能介绍
一个启动子是一组DNA序列能使一个基因进行转录。启动子是由RNA聚合酶所确认，并且引发转录。在RNA的合成中，启动子是一种方法区分哪一个基因用作制造mRNA，及进而控制细胞制造哪一种蛋白质。
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展，常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大，是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法，对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止，国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道，国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
杂合启动子的定义
中文名称杂合启动子英文名称hybrid promoter定 义由两种或两种以上不同启动子元件融合构成的一个新的启动子。如tac启动子就是将色氨酸启动子Ptrp-35区域与突变的乳糖启动子PlacUV5的-10区域融合构成的杂合启动子，兼具Ptac强启动能力和乳糖启动子可操控特性(受lacI产物的阻
高清3D基因组相互作用图生成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500236.shtm
－Nature：人成纤维细胞中的染色质相互作用
Hi-C是基于“染色体构形捕捉”(称之为3C，因为三个单词的首字母都是C)的一项基因组技术，能以没有偏颇的方式在整个基因组中识别长距离成环相互作用。 Bing Ren及同事为Hi-C数据集建立了一个新颖的分析流程，其分辨率大大提高，使得顺式调控元素如增强子和启动子之间的相互作用可以被确定。
双向启动子的转录机制
双向启动子的双向转录机制可能是两个RNA聚合酶同时聚集在无核小体区的边界,然后在两个方向上起始转录.双向启动子在真核生物基因组中广泛分布 ,大多数的双向启动子缺少TATA盒,而具有较高的GC含量和丰富的CpG岛。
基因内启动子的定义
中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定 义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
概述启动子的基本结构
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子
核心启动子元件的定义
中文名称核心启动子元件英文名称core promoter element定 义真核生物基因启动子中介导基因转录起始的最小的一段连续DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列,大小约为40个核苷酸。含有TATA框,起始子(Inr),TFⅡB识别元件(
Yeast基因文库的分类和选择
自1995 年成立以来，Dharmacon 提供各种用于批量研究基因功能的工具，支持最多从全基因组范围到信号通路、基因家族方面研究基因与疾病、表型、分子机理对应的关系。近年来随着高端酶标仪、高通量显微镜、自动化流式细胞仪、高内涵等设备的普及和技术更新，Dharmacon 文库在各个领域中
E.coli基因文库的分类和选择
自 1995 年成立以来，Dharmacon 在生物信息学，RNA 生物学和合成化学方面的专长 , 使我们能够开发出一整套研究基因功能的产品。作为 RNA 定制合成的leader，Dharmacon 公司是 RNA 干扰新发现领域的早期参与者，并且在若干重要的科学发现中，以及确保沉默效率的
Yeast基因文库的分类和选择
文库种类Dharmacon酵母资源包括多个酵母基因组文库，包括ORF文库、基因敲除（Knock Out）菌株、蛋白质相互作用文库、突变菌株和各种筛选文库等。除此之外，Dharmacon 针对Saccharomyces cerevisiae 研究领域提供了Zoonome siRNA 文库。酵母