发布时间:2020-03-31 14:41 原文链接: Nature:浙大领衔在构建人类单细胞图谱方面取进展

  在一项新的研究中,来自中国浙江大学等研究机构的研究人员朝构建全面的人类单细胞图谱迈出了一大步。相关研究结果于2020年3月25日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在这篇论文中,他们描述了他们对志愿者捐赠的50多万个细胞的RNA进行测序,以及如何处理这些信息从而以一种可用于单细胞图谱的方式进行展示。

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图片来源:CC0 Public Domain。

  人体中的所有细胞都具有相同的遗传信息,但是它们在表达哪些基因方面存在着不同。表达的那些基因确定了给定细胞的功能。一段时间以来,医学研究员一直想要一种能描述哪些基因在人体各个部位的细胞中表达的图谱。这样的图谱将帮助科学家们更好地了解细胞的功能以及它们如何协同发挥作用,此外还可以为新的研究工作节省时间。人们已经为某些组织类型构建了细胞图谱,但是目前,没有单个图谱可以覆盖人体中的所有细胞类型。毕竟,由于人体拥有超过30万亿个细胞,因此构建此类图谱需要大量时间和精力。在这项新的研究中,这些研究人员朝着这一目标迈出了一大步,为人体不同部位(包括胎儿组织)的500000多个细胞(包括所有主要器官)提供了基因表达信息。

  这项研究涉及首先获取组织样本,然后对它们进行处理。为此,首先通过使用离心机和酶将细胞分离出来。一旦分离出来,就使用先前开发的一种名为Microwell-seq的特殊工具对每个细胞进行测序,该工具可对大量细胞进行快速测序。这些研究人员总共对来自60种组织的细胞进行了测序。他们随后使用他们设计的用于对细胞信息进行分类的方法构建出一种细胞图谱。该细胞图谱及其基础数据构成了一个完整、全面的单细胞数据库的基础。


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