发布时间:2020-01-08 13:51 原文链接: 研究团队均可加入!万种原生生物基因组计划启动!

   近日,全球首个万种原生生物基因组计划(Protist 10000 Genomes Project, 简称P10K)正式发布,旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。

图片.png

  原生生物是生物五界(植物界、真菌界、动物界、原生生物界和原核生物界)之一,主要是由单细胞真核生物组成的一大类群,包括单细胞真核藻类和原生动物等,已描述的物种数超过6万种,未知种类难以估量。

  据介绍,原生生物分布极为广泛,只要有水的地方,就有原生生物存在。原生生物是水生态系统重要组分,其中的藻类贡献了地球上近50%的光合行为,也是水产动物和人类的优良饵料和营养品,另外,部分甲藻和硅藻疯长会造成河流和海洋有毒藻华,带来严重环境问题。同时,很多原生生物是人、畜禽和水产动物的重要致病性寄生虫,如造成人疟疾的疟原虫、昏睡病的锥虫、鸡球虫病的球虫,造成鱼白点病的小瓜虫等。

  目前,在基础生物学研究方面,一些原生生物作为模式生物作出了重要贡献。例如在嗜热四膜虫中发现的核酶以及端粒和端粒酶分别获得了1989年和2009年诺贝尔奖。然而,已公开发表了基因组数据的原生生物仅400余种。

  据悉,该计划由中科院水生所联合西藏大学、河南农业大学、中国农科院兰州兽医研究所、中科院北京基因组研究所和华中科技大学等单位共同发起。中科院水生生物研究所副所长殷站介绍,万种原生生物基因组计划是国际上首次针对原生生物界大规模基因组测序计划。该计划将依托各发起单位保藏的3000多种真核藻类和原生动物种质资源,通过持续的样品采集和宏基因组数据挖掘,在未来3年完成约一万种原生生物的基因组测序和分析,将包括原生生物全部26个门/类,覆盖超过85%的纲、60%的目和30%的科属。

  开展万种原生生物基因组计划,有助于理解生物多样性形成机制、多细胞生物/有性生殖的起源与演化等重大基础生命科学问题,促进国家科技资源共享服务平台信息互联互通,推动与生态环境保护、营养健康和疾病防治相关原生生物种质传资源的挖掘与应用实践。

  值得注意的是,该计划将以开放联盟模式运行,国内外有兴趣的研究团队均可加入。


相关文章

6篇Nature齐发!癌症基因组计划成果成井喷之势

除了Nature一次性发表6篇论文外,NatureGenetics杂志发表了3篇,NatureCommunications发表9篇,NatureBiotechnology一篇,详细报道BioArt后续......

研究团队均可加入!万种原生生物基因组计划启动!

近日,全球首个万种原生生物基因组计划(Protist10000GenomesProject,简称P10K)正式发布,旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。原生生......

研究团队均可加入!万种原生生物基因组计划启动!

近日,全球首个万种原生生物基因组计划(Protist10000GenomesProject,简称P10K)正式发布,旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。原生生......

为何原生生物能够快速进行细胞间的通讯?

远距离可靠快速地传递信息对于细胞在复杂环境中的存活至关重要,多细胞生物已经进化出了能以100米/秒的速度沿神经元传递信号的方法,在单细胞世界中,当在细胞间传递信号时,有机体会依赖于其外部介质,近日,一......

科学家进行基因组测序成功破译金雕基因组

  作为一种知名度极高的猛禽,金雕经常以威猛霸气的形象出现在影视作品和小说中。现在,英国研究人员完成了对金雕的基因组测序工作,希望从基因层面深入了解这一物种,以便更好地保护它们。金......

美国农业部加入地球生物基因组计划

  美国农业部(USDA)近日宣布,将正式加入“地球生物基因组计划”(EBP)的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”,必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全......

沙特人类基因组计划旨在找出治病新途径

在沙特阿拉伯首都一家医院的会议室里,一位沙特陆军上校在讲述着一个因遗传病而导致死亡的故事。2004年,他和妻子迎来了第一个孩子,最初这个孩子看上去很健康,但6个月大时,这个女婴不能坐立,也几乎不能哭。......

Cell:微生物组的确影响免疫

麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划(HFGP)的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。人类消化道中居......

Science:新生儿测序遇冷,“基因组计划”行路难

新生儿测序是近年来比较热门的话题,中国新生儿基因组也于今年8月份正式起航,不过在此之前,美国已经开展了一项名为“BabySeq”的新生儿测序计划。10月19日,在加拿大温哥华召开的美国人类遗传学协会(......

宋微波院士:三十载光阴书写对科学研究大爱情怀

宋微波宋微波(中)在指导学生做实验。宋微波(左四)与团队成员探讨科研问题。纤毛虫,原生动物中结构最复杂、多样性最高的一个大类群,广泛分布于淡水、海水、极地、土壤中以及各类动植物宿主体内外。在那里,它们......