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外显子捕获与扩增

实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α 试剂、试剂盒 pSPL3 多克隆位点图谱 限制性内切核酸酶 PvuⅡ T4DNA 连接酶 LB 琼脂平板 黏粒载体 TE SOC 培养基 琼脂糖凝胶 LB 肉汤培养基 PBS 胰酶-EDTA 溶液 D......阅读全文

Science:外显子组测序让“生命密码”解读更容易

        简单来说,外显子组就是遗传代码中蛋白质编码的组分,占整个基因组的1%-2%。测序仪每跑一次仅能读取一定数量的碱基,但通过测序外显子组,研究人员能更快地生成更多的碱基。与全基因组相比,它也可以用更低的成本做出更好的分

应用非标记探针法进行基因分型(三)

高分辨率熔解 在高分辨率熔解仪器HR-1(爱荷华科技,盐湖城,犹他州)上进行分析,将LightCycle毛细管加入HR-1中,0.3℃/s加热。主要的实验中,RET外显子的扩增及非标记探针熔解数据从60℃到95℃采集。主要实验分析了每个外显子的扩增子及探针数据,除了外显子14。因为所有报道的外显子1

应用非标记探针法进行基因分型(六)

外显子14:多重探针分析       主要实验的外显子14, 两个野生型的探针同时用于一个反应,用来检测所有已报道的外显子14的突变,同时消除密码子836(p.S836S)多态性(图4;a和b;表3;补充表5;http:/

基因的复制与表达

  生物的遗传物质基础是核酸(nucleic acid),它也是基因的基本结构,它们的化学组成分子结构符合遗传物质的稳定性、连续性及多样性的要求。  (一)核酸的化学组成  核酸结构的基本单位是核苷酸(nucleic acid),每个核苷酸由1个磷酸、1个五碳糖和1个碱基3部分组成。核

应用非标记探针法进行基因分型(七)

一般来说,用特定突变探针产生1/3结果。首先,当突变序列与特定突变探针互补时,突变等位基因的熔解Tm要高于野生型(△Tm为-2℃至-5℃)。第二,当突变在相同位置但是与特定突变探针序列不互补时,突变等位基因被野生型等位基因相似的Tm值及稳定性所遮蔽(野生型等位基因Tm±0.5℃)。在这种情况下,没有

朱显谟:百岁院士梦牵“黄河清”

  李振声院士曾动情地说:“朱老为了国家的需要,举家西迁杨凌小镇,献身于黄土高原土壤科学研究,深深感动了当时年轻的我,使我坚定了扎根杨凌同样可以作出世界性科研成果的信念。帮朱显谟先生搬家的经历,影响着我一生的科学事业。”  不久前,中国科学院院士朱显谟刚迎来他100岁的生日。西北农林科技大学、中科院

中国学者发表6篇Nature,在生命科学领域取得重大进展

  iNature  2019年9月4日,中国学者在Nature连续发表了6项成果,涉及生命科学,天文学,地球科学等不同的领域,iNature系统介绍这些成果:  【1】混合谱系白血病(MLL)家族的甲基转移酶  -包括MLL1,MLL2,MLL3,MLL4,SET1A和SET1B-在赖氨

Macrogen千年基因应邀赴汕头国际眼科中心进行学术交流

  12月21日,Macrogen千年基因应邀赴汕头大学•香港中文大学联合汕头国际眼科中心进行学术交流,该中心的陈建欢老师、陈浩宇主任等数十名研究人员参加了会议。会议期间,双方共同探讨了眼科疾病的研究进展及基因组学技术在该类疾病研究中的应用。基于汕头国际眼科中心在眼病基因组学领域取得的科研成果,以及

不同的施肥方法对黑土土壤水分保持的影响分析

我国东北黑土区,为雨养农业区。水为决定作物产量的关键因素之一。农田土壤水分的变化受多种因素的影响,如降雨、太阳辐射、风速、栽培作物、土壤质地及有机质含量等。除此之外,栽培措施也对土壤水分的变化起到重要的影响。增加土壤的蓄水保水能力、减少土壤蒸发为农田水分管理的重要任务之一。长期以来人们采用和尝试了多

序列捕获之新品荟萃

  2009年,基因组定向捕获工具的出现,让外显子组的捕获成为可能。科学家们普遍认为外显子组测序比全基因组测序更有优势,特别是对罕见的单基因疾病。不仅仅是费用更低,数据的阐释也更为简单。因此,外显子组测序也在2010年被《Science》杂志评为年度十大突破。   数百篇已发表的文章,也证实了外显

通过控制饲料中脂肪含量快速养殖松浦镜鲤鱼

本研究中作者在不同水温条件下,用不同脂肪水平的饲料饲喂镜鲤,通过测定松浦镜鲤幼鱼 的免疫和抗氧化能力,观察其对免疫性能的影响,饲料中脂肪尤其是必需脂肪酸是水产动物免疫反应的重要调节因子,但当饲料中脂肪水平超过需求量时,会导致鱼 体的脂肪沉积增加,从而影响鱼体的免疫功能,严重时甚至会造成大量脂肪在鱼肝

应用非标记探针法进行基因分型(二)

材料和方法样品      此报道中用到的野生型RET基因的DNA基因组样品或有RET序列变化的样品在以前描述过。RET基因序列变化改变RET蛋白的功能引发MEN2综合症的是突变,然而RET序列改变不会引发MEN2综合症是多态。不能确定意义的

脱落细胞发现提取技术及设备(二)

使用真空镀膜可显现布料上的抓、推痕迹,不但可实现接触DNA定位,且可对于判断案件性质发挥关键作用502熏显手印技术 502熏显柜广泛在国内公安单位使用,由于502熏显显现手印的原理是熏显胶中的氰基丙烯酸乙酯( ethyl - cyanoacrylate,ECA)与手印纹线发生聚合反映后生成乳白色聚合

手印熏显柜的功能介绍

  手印熏显柜的内部都安装了湿度传感器和湿度自动控制程序;    当柜内相对湿度达到80%时,水加热器就会停止加湿。    使用者只需按说明书要求加注固定量的水和502胶,就可以开始熏显工作;    无需进行加水量的计算。    在熏显的过程中,柜内湿度可以保持在80%。    手印熏显柜

大前庭水管患者的PDS基因型分析

  近年来国外的多项研究表明大前庭水管综合征和Pendred综合征(前庭水管扩大或伴内耳畸形、神经性聋和甲状腺肿)与PDS(SLC26A4)基因突变有密切的关系。PDS基因含21个外显子,开放阅读框架2343 bp,编码780个氨基酸的蛋白质Pendrin。Pendrin主要由疏

不同品牌游离核酸保存管的比较(二)

图 4Qubit 结果显示: 三种保存管 7 天内保存效果无明显差异, 14 天时, K 组与 S 组保存管均出现明显的上升,分别是第 0 天的 15.27 倍和 10.21 倍, 21 天时,上升最为明显,分别是第 0天的 22.46 倍和 13.84 倍。 B 组保护剂保存的血液在第 0

不必凑样品 让外显子组测序立即开展

  随着新一代测序的渐渐普及,人们对外显子组测序表现出了浓厚的兴趣,因为成本更低,而数据也更容易阐释。Life Technologies公司也顺应潮流,推出新的Ion AmpliSeq™外显子组试剂盒(Ion AmpliSeq™ Exome Kit)。此试剂盒带来了出色的外显子组覆盖度和均一

外显子测序---产前诊断及儿科疾病诊断的新秀

  本周末,由美国贝勒医学院与香港中文大学联合举办的第一届贝勒医学院-香港中文大学临床遗传学大会如期在著名的威尔斯亲王医院召开。来自贝勒医学院,香港中文大学,香港大学,复旦大学,北京协和医院,马来西亚大学,墨尔本大学等数十个中美及周边国家学术与临床机构的专家学者齐聚一堂,进行了为期两天的学术报告与交

应用非标记探针法进行基因分型(四)

外显子10和11:多重突变热点MEN2A和FMTC的主要突变位于外显子10(密码子609、611、618和620)和11(密码子630和634),且野生型半胱氨酸的密码子DNA序列“TGC”发生单核苷酸改变。外显子10和11报道的序列变化>40(表1)。RET10外显子的主要实验包括两个单独的

小白鼠骨髓细胞染色体显带(C带)技术

实验概要1、了解染色体显带技术的基本知识; 2、学习小白鼠骨髓细胞染色体显带(C带)技术。实验原理染色体显带(Banding)技术是一种用染料对染色体进行分化染色的方法。就是将染色体经酸、碱、温度等处理后,再以染料染色,或单用某些荧光染料就可以染出深浅不同或明暗各异的带纹的纵向结构。此项技

染色体 G 显带核型分析

核型分析简介染色体是细胞分裂期高度凝集的 DNA 蛋白质纤维,是间期染色质结构紧密盘绕折叠的结果。核型是指一个体细胞内的全部染色体按其大小、形态特征排列起来构成的图像。将待检细胞进行染色体数目、形态结构分析,确定其核型是否与正常核型一致,称为核型分析。染色体核型分析,是遗传学科学研究和辅助临

华大科技DNA建库起始量低至200ng

  华大基因旗下全资子公司――华大科技服务有限公司(简称“华大科技”),18日在福尔马林固定石蜡包埋组织样本测序技术上再获新突破,成功推出FFPE全基因组外显子测序(WES)技术。   目前,科研人员已成功实现外显子测序DNA建库起始量低至200ng,测序质量与正常样本相近,这将有助于更好地解读F

外显子组测序并不一定带来正确的诊断

  美国医学遗传学学会(ACMG)的临床遗传学年会于3月24-28日在美国盐湖城举行。埃默里遗传学实验室的研究人员在会议上表示,外显子组测序数据的初步分析并不一定能带来正确的诊断,需要再次检查。  埃默里大学医学院的教授、遗传实验室的主管Madhuri Hegde在她的报告中举了两个病例,说明研究人

如何对 cDNA、gDNA进行选择性引物设计?

设计策略 PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆 反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合

外显子基因为什么保守?《Nature Genetics》出新答案了!

   基因的基本结构分外显子和内含子,比较不同物种的基因发现外显子序列通常是保守的,而内含子序列则很少保守。外显子的种间差异不大,换句话说,人和老鼠、线虫的外显子基因都很相似。  这种相似性的科学解释是,外显子是生物体生存的关键区域,这部分区域的许多变异都会导致死亡表型,所以未存

小白鼠骨髓细胞染色体显带(C带)技术

实验原理染色体显带(Banding)技术是一种用染料对染色体进行分化染色的方法。就是将染色体经酸、碱、温度等处理后,再以染料染色,或单用某些荧光染料就可以染出深浅不同或明暗各异的带纹的纵向结构。此项技术发明于本上世纪六十年代末、七十年代初,发展至今已是非常成熟。1971年在巴黎召开第四次国际人类遗传

E+H电磁流量计50P25-EADA1AAOABAH陪你便宜到老

  E+H电磁流量计50P25-EADA1AAOABAH陪你便宜到老   过滤器(filter)是输送介质管道上不可缺筒体、不锈钢滤网、排污部分、传动装置及电气控制部分组成。待处理的水经过过滤器滤网的滤筒后,其杂质被阻挡,当需要清洗时,只要将可拆卸的滤筒取出,处理后重新装入即可,因此,使用维护极为

土肥仪使用说明(二)

三、仪器测定方法操作流程及屏幕显示示意图1、           测试养分操作流程及屏幕显示示意图: 按选择键或确认键氮     有机质磷钾对准空白液

如何对 cDNA、gDNA进行选择性引物设计?

设计策略PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合部退火,该点为

Proton和HiSeq测序平台比较:SNPs检测均表现良好

  美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示,在进行外显子组测序时,Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异(SNPs)检测方面均表现良好,但在准确检测插入缺失时存在某些问题