Antpedia LOGO WIKI资讯

罗元明副研究员:生物质谱与蛋白翻译后修饰研究方法学

2013年12月8日,由首都医科大学附属北京朝阳医院、AB SCIEX公司主办的第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办,来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动,分析测试百科网作为支持媒体对质谱沙龙活动进行长期报道。中科院微生物研究所 罗元明副研究员 来自中科院微生物研究所的罗元明副研究员为我们带来了题为《生物质谱与蛋白翻译后修饰研究方法学》的报告,在本次报告中罗研究员根据自己的研究方向向大家介绍了质谱技术在微生物领域的研究内容,罗研究员首先讲到几种常见的蛋白翻译后修饰(PTM)包括:糖基化、甲基化、乙酰化、磷酸化等等。 功能蛋白质组学的主要研究方向是蛋白相互作用、亚细胞定位以及翻译后修饰等。蛋白相互作用复合物的研究,对仪器的分子量和分辨率提出了新要求:比如分子量为几十万的蛋白复合物,其分子伴侣很......阅读全文

你必须知道的质谱鉴定中14条FAQ

   质谱技术在蛋白鉴定等实验中具有不可忽视的作用,不过,目前的应用还不是特别广泛。那么,有问题了怎么解决呢?本文收集了相关的新手对于这项技术的常见问题与解决方法。希望能更好地帮助大家了解这项技术。  问题1. 一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?  答:一级质谱鉴定的方式

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量

长春应化所设计合成新型稀土基磁性亲和材料

  蛋白质的可逆磷酸化修饰是生物体内普遍存在的信息转导调节方式,几乎参与生命活动的所有过程,在细胞的增殖、发育和分化,细胞信号转导、转录和翻译,细胞的周期调控、蛋白降解和新陈代谢,细胞生存、细胞凋亡和肿瘤发生等方面发挥着重要的作用。目前已知许多人类疾病的发生都与异常的蛋白质磷酸化修饰

质谱鉴定,常见疑问解答

问题1、一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?答:一级质谱鉴定的方式主要为胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定;二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF的

磷酸化位点分析实验-磷酸肽的分离

            实验方法原理 磷酸化分析的原理研究的最常见的磷酸化类型是丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸酯化。已知发生的磷酸化还有精氨酸、组氨酸和赖氨酸的亚酰胺化,以及天冬氨酸和谷氨酸的酰化。这些修饰中

磷酸化位点分析实验-磷酸肽的分离

实验方法原理磷酸化分析的原理研究的最常见的磷酸化类型是丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸酯化。已知发生的磷酸化还有精氨酸、组氨酸和赖氨酸的亚酰胺化,以及天冬氨酸和谷氨酸的酰化。这些修饰中的其中一些是化学不稳定的,通常观察不到,除非采取特殊的保护措施防止他们在蛋内质分离过程中消失。举例来说,组氨酸磷酸化是一

蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压

  慢性肾病病人一般会出现很多的并发症,其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一,但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术,对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面系统性的分析。   Proteomic and p

蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压

  慢性肾病病人一般会出现很多的并发症,其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一,但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术,对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面系统性的分析。   Proteomic and p

2018中国质谱大会生命科学与医学集锦

  分析测试百科网讯 2018年11月24日-26日,2018年中国质谱学术大会在广州东方宾馆盛大召开。本次大会包括一个报告主论坛,21个主题分论坛,共300余场演讲报告。在“生命科学与医学”分论坛上,数十位业内专家学者带来精彩的演讲报告,吸引参会人员驻足聆听。分析测试百科网作为本次活动的合作媒体,

蛋白质组学在植物科学研究中的应用

1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen

【分享】质谱分析蛋白的原理与方法

   质谱技术具有较好的灵敏度、准确度,能准确测定蛋白质。目前质谱主要测定蛋自质一级结构包括分子量、肽链氨基酸排序及多肽或二硫键数目和位置,在对蛋白质结构分析的研究中占据了重要的地位。[1,2]质谱有进样器、离子源、质量分析器、离子检测器、控制电脑及数据分析系统等组成。传统的质谱仅用于小分子挥发物质

我国学者解析9个参与植物胁迫应答的蛋白激酶-底物网络

  1月28日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组、王鹏程研究组、美国普渡大学教授W. Andy Tao研究组合作的题为Mapping proteome-wide targets of protein kinase

磷酸化蛋白质组鉴定技术路线及经典案例介绍

  今天,小编跟您聊聊磷酸化蛋白质组鉴定!    蛋白质翻译后修饰(PTMs)几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程,并发挥十分重要的调控作用。蛋白修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的领域,目前研究比较成熟的有磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等。    蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的

磷酸化蛋白质组鉴定技术路线及经典案例

蛋白质翻译后修饰(PTMs)几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程,并发挥十分重要的调控作用。蛋白修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的领域,目前研究比较成熟的有磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等。蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的一种蛋白质翻译后修饰方式,它可以通过激发、调节诸多信号通路进而

双剑合璧 | sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章

   随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1

双剑合璧 | sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章

   随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1

Nature:乳腺癌的第一次大规模蛋白组-基因组研究成果

  基于癌症基因组的Atlas (TCGA)计划的数据,美国的科学家联合小组已经完成乳腺癌的第一次大规模“蛋白基因组(proteogenomic)”研究,将DNA突变联系到蛋白信号并帮助确定癌症驱动基因。这项研究由美国国家癌症研究所的肿瘤临床蛋白质组学分析联盟成员进行,包括贝勒医学院、MIT和哈佛的

sumo化与磷酸化修饰联合分析

随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年10月发

分析磷酸化蛋白的新方法

  蛋白磷酸化是重要的翻译后修饰,在调控基因表达和细胞功能方面起着关键作用。检测磷酸化时一般使用磷酸化抗体。近几年,市场上也出现了一些新的技术和产品,可实现磷酸化的灵敏检测。   Phos-tag™便是其中的一种。它最初由日本广岛大学医药分子功能科学研究室开发,后由Wako公司商业化。P

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该学科的迅速发展

Cell子刊 蛋白质组标杆大牛揭示糖尿病新机制还得从这类

  关键词:磷酸化蛋白质组、蛋白质组、II型糖尿病、胰岛β细胞   原文:   Phosphoproteomics Reveals the GSK3-PDX1 Axis as a Key Pathogenic Signaling Node in Diabetic Islets   原文链接:

蛋白质组标杆大牛揭示糖尿病新机制还得从这类修饰入手

  原文:   Phosphoproteomics Reveals the GSK3-PDX1 Axis as a Key Pathogenic Signaling Node in Diabetic Islets   原文链接:   https://doi.org/10.1016/j.cmet

癌症外泌体的磷酸化蛋白质组学进展 | PNAS IF9.423

  外泌体研究是医学研究中非常重要的一个方面,生物标志物、免疫调控、干细胞等均是外泌体研究的热门方向。而基于质谱的蛋白质组学是研究外泌体不可或缺的一项技术,现已有许多利用蛋白质组学技术研究外泌体的文献发出,今天小编跟大家分享一篇关于外泌体的磷酸化蛋白质组学突破性进展的文章。   2017年2月1日

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

  蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该

癌症外泌体的磷酸化蛋白质组学进展 | PNAS IF9.423

外泌体研究是医学研究中非常重要的一个方面,生物标志物、免疫调控、干细胞等均是外泌体研究的热门方向。而基于质谱的蛋白质组学是研究外泌体不可或缺的一项技术,现已有许多利用蛋白质组学技术研究外泌体的文献发出,今天小编跟大家分享一篇关于外泌体的磷酸化蛋白质组学突破性进展的文章。2017年2月1日,国际著名学

蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并...(二)

Figure 2. Quantification and Gene Ontology analysis ofdifferentially phosphorylated peptides and proteins in (5/6Nx + NS)/(Sham + NS)and (5/6Nx +

磷酸化蛋白鉴定实验

实验材料测序级膜蛋白酶                                        

4D组学新时代!更精确的磷酸化修饰组学

离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(三)

           图1 TAP亲和层析纯化原理[14]  注:A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白,TEV 酶切分离ProteinA &nbs

张玉奎院士等专家在2012年北京色谱年会上作大会报告

  2012年12月07日,北京,2012年北京色谱年会热烈召开。促进了北京地区色谱以及色谱相关领域的技术应用与交流。围绕“色谱新技术及其应用”的主题,展开多场报告,内容包括蛋白质组学、色谱技术、色谱与质谱、色谱与核磁共振、金属组学、代谢组学、生物气味研究、环境分析等。中国科学院大连化学物理研究所张