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第一张人类基因组印记基因图谱出炉

来自杜克大学的研究人员创造了第一张人类基因组印记基因(imprinted genes)图谱,并且他们表示其成功的关键在于一个称为机器学习(machine learning)的人工智能形式:dern-day Rosetta stone。这项研究新发现了四倍于之前识别的印记基因,并即将公布在12月3日《基因组研究》(Genome Research)封面上。 印记基因是指存在亲本染色体上的等位基因的表达取决于它们是在父源染色体上还是在母源染色体上,来自父系、母系的印记基因有所不同,当精卵结合时,父母双方印记基因均应出现,否则发育就不正常。这种基因印记是等位基因依赖双亲性别表达的不符合孟德尔遗传定律的特殊遗传现象,基因印记异常调节可引起一些遗传性疾病。 在传统的遗传学中,子女会继承一个基因的两个拷贝,一个来自于父本,一个来自于母本,这两个拷贝的活性形式会影响子女的发育。但是当印记基因出现——这两个拷贝中一个会被来自母......阅读全文

著名华人科学家Nature:解析干细胞基因组印记

  造血干细胞是一类来源于骨髓,具有生成各种血细胞能力的成体干细胞。其以两种状态存在:一种作为预备役部队静静坐等召唤,而活跃部队则不断地增殖,每天生成数十亿的血细胞。在最新的研究中,来自Stowers医学研究所的研究人员揭示出了一种新机制,其在维持两种状态微妙平衡中发挥了至关重要的作用。研究论文发表

逆天了!中国科学家造出只有父亲,没有母亲的小鼠!

  今日,诸多科技媒体被一条突破性进展刷屏——来自中国科学院动物研究所的李伟课题组、周琪课题组、以及胡宝洋课题组联合发表的一项研究表明,利用干细胞技术与基因编辑技术,我们能造出双亲都是同一性别的小鼠!也就是说,这些小鼠要么有两名母亲,却没有父亲;要么有两名父亲,却没有母亲。  这项重磅研究,今日在线

长链非编码RNA: 从科研到临床

   长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结构

出生前的环境或会影响机体的基因组印记

  近日,一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中,来自美国、澳大利亚和丹麦的科学家们通过研究发现了出生前的环境或许会调节机体基因组印记的证据,文章中,研究者描述了他们对此前多项研究中基因组数据的分析以及相关的基因

长链非编码RNA: 从科研到临床(一)

概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调

华东师大翁杰敏JBC发表新成果

  四月二十一日,来自华东师范大学、中山大学癌症研究中心和芝加哥大学的研究人员,在国际学术期刊《Journal of Biological Chemistry》在线发表题为“Non-germline Restoration of Genomic Imprinting for a Small Subs

同性老鼠生出了鼠宝宝,人类离同性生殖还远吗?

  如果问你老鼠是如何生出小宝宝的?你肯定会说这还不简单,肯定和赵忠祥老师解说的《动物世界》一样:“春天来了,万物复苏,大草原又到了动物们交配的季节。雨季又过了,又到了交配的季节,公老鼠趴在了母老鼠的身上,发出了酣畅的声音!!!”(图源:pixabay)  但最近的一篇发表在《细胞干细胞》(Cell

大师级女科学家发现新的印记基因

  这是生物学的基石之一:所有的哺乳动物都继承每个基因的两个拷贝——一份来自母亲,另一份来自父亲,在某种程度上作为对抗遗传问题的后盾。经典孟德尔遗传学认为所有父系及母系等位基因有同等表达,但随着对遗传学研究的深入,人们发现了一种称为基因印记的非孟德尔遗传现象,它指在配子或合子的发生期间,来自亲本的等

过去1万年的社会不平等,印刻在Y染色体上

  成吉思汗的上千万直系后代?  历史上不同男性的后代数量差异巨大,而这种后代数量的差异会在基因组中留下印记。这意味着,我们可以通过观察不同男性的后代基因组印记的变化情况,而不仅仅是通过男女性后代数量的差异,来理解整个社会的不平等程度。一个典型的例子是,在成吉思汗建立的帝国中,男性后代数量的不平等现

两个爸爸也能生孩子?!科学家实现哺乳动物孤雄生殖

  距离下一个光棍节还有一个月,两只公老鼠喜获结晶的消息就在朋友圈里炸了锅。孤雄生殖小鼠首次降临人世  中科院动物研究所的李伟课题组、周琪课题组和胡宝洋课题组联合在《细胞—干细胞》上发表论文,宣布首次实现了哺乳动物的孤雄生殖。由两只雄性小鼠基因结合产生的后代,第一次有机会呼吸这个世界的空气——虽然只

Nature:印记基因的重要影响

  我们基因组中的所有基因都有两个拷贝,一个来自父亲一个来自于母亲。大多数基因的两个拷贝均能表达,但有一小部分基因带有“印记”。这些印记基因(imprinted gene)的活性取决于它源自父亲还是母亲。  基因组印记主要发生在哺乳动物中,是一种复杂的表观遗传学现象,它使基因呈现出亲本依赖性的差异表

科学家发现大鼠干细胞多能性调控新规律

  胚胎干细胞(ESCs)和诱导多能性干细胞(iPSCs)具有多潜能分化能力,能够分化形成各种类型和功能的细胞,因而在发育生物学研究和再生医学中具有重要的应用价值。通过四倍体补偿实验让ESCs和iPSCs独立发育成健康的个体,是评估细胞多能性的最严格的标准,迄今只有小鼠的ESCs和ipsCs具有这种

动物所发现大鼠干细胞多能性调控新规律

  胚胎干细胞(ESCs)和诱导多能性干细胞(iPSCs)具有多潜能分化能力,能够分化形成各种类型和功能的细胞,因而在发育生物学研究和再生医学中具有重要的应用价值。通过四倍体补偿实验让ESCs和iPSCs独立发育成健康的个体,是评估细胞多能性的最严格的标准,迄今只有小鼠的ESCs和iPSCs具有这种

PNAS:大鼠干细胞多能性调控新规律

  中国科学院动物研究所周琪研究组首次报道了除小鼠之外,大鼠胚胎干细胞也具有通过四倍体补偿实验产生健康个体的能力,证实最高等级的多能性可以在不同物种的干细胞上建立,并发现多能性维持的新规律,为研究干细胞多能性的物种进化差异和调控机制提供了新基础。  胚胎干细胞(ESCs)和诱导多能性干细胞(iPSC

我国完成桑蚕大规模基因组重测序和遗传变异图谱构建

  北京时间8月28日凌晨2时,由深圳华大基因研究院与西南大学合作的研究成果“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”在国际权威学术刊物《科学》上发表,这是科学家继2003年在家蚕基因组研究领域取得进展后的又一重要成果。   据悉,科学家共获得了40个家蚕突变品系和中国野桑蚕的全基因

表观遗传学关于DNA甲基化

表观遗传学是研究表观遗传变异的遗传学分支学科从目前的研究来看,X 染色体剂量补偿、DNA 甲基化、组蛋白密码、基因组印记、表观基因组学和人类表观基因组计划等问题都是表观遗传学研究的内容。其中甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。在脊椎动物中,CpG二核

DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制

  9月28日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting

DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制

  国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DO

清华大学颉伟课题组12月接连发表Molecular Cell、PLOS Genet

  生物通报道:来自清华大学生命科学学院的颉伟研究员,早年毕业于北京大学,2008年获美国加州大学洛杉矶分校博士学位,曾在加州大学洛杉矶分校、圣地亚哥Ludwig肿瘤研究所和加州大学圣地亚哥分校从事博士后研究,2013年起任清华大学生命科学学院研究员,主要科研领域与方向包括表观遗传学、基因组学和生物

孕期科学 | 那些或可影响孩子一生的研究!

  孕育是人类繁衍中最重要的过程。一个小生命从受精卵开始,从无到有,从小到大,逐渐发育成熟,经过十月怀胎,最终来到人世间。在短短的10个月时间里,这个幼小的生命受到的每一种影响都可能使他夭折。事实上,这十个月里,母亲对孩子的影响十分深远,孩子顺利出生并不意味着母亲的影响告一段落,可能是影响才刚刚开始

8月15日《自然》杂志精选

  极端气候造成二氧化碳浓度升高   最新研究表明,极端气候事件(如热浪、干旱和风暴)能部分抵消碳汇,甚至造成碳库的净损失。这篇观点文章研究极端气候在全球尺度上对陆地生态系统的碳循环的影响。它得出的结论是:极端气候具有压倒逐渐变暖的“碳汇效应”的潜力,促使碳从积累的碳库中迅速丢失,并在不远的将来增

动物所突破哺乳动物同性生殖障碍

  同性生殖的现象在动物中并不罕见,例如在爬行类的蜥蜴、两栖类的蛙,以及多种鱼类中,都有“孤雌生殖”现象:即不经过与雄性的交配,雌性个体即可生下后代。作为有性生殖的补充,孤雌生殖能在缺乏雄性的情况下,维持个体的繁衍与种群的更新。与孤雌生殖对应的孤雄生殖则极其罕见,迄今只在一种斑马鱼中发现孤雄生殖。然

1月6日《自然》杂志内容精选

  封面故事:2011年“国际化学年”特辑  国际纯化学与应用化学协会(IUPAC)和联合国教科文组织(UNESCO)将2011年定为“国际化学年”,所以Nature杂志新年第一期便是以化学为主,该学科从很多方面来讲都是中心学科,是物理学家和生物学家的一个至关重要的资源。在本期的评论

1月6日《自然》杂志精选

封面故事:2011年“国际化学年”特辑   国际纯化学与应用化学协会(IUPAC)和联合国教科文组织(UNESCO)将2011年定为“国际化学年”,所以Nature杂志新年第一期便是以化学为主,该学科从很多方面来讲都是中心学科,是物理学家和生物学家的一个至关重要的资源。在本期的评论文章中,Ge

超大规模遗传:尼安德特人与现代人有多次“基因交流”

  英国《自然·生态与演化》杂志26日发表了一项最新成果:科学家利用大型现代人基因组数据,对当今东亚人和欧洲人携带的尼安德特人DNA片段进行了研究。这项,尼安德特人与解剖学意义上的现代人的祖先,曾在多个时间点发生过“基因交流”。   解剖学上的现代人从非洲向外扩散时,曾在欧亚大陆西部遇到尼安德特人。

单基因病的遗传方式分析(六)

   五、不同于孟德尔遗传规律的遗传现象  1.母系遗传 母系遗传(maternal inheritance)是指核外染色体所控制的遗传现象。例如Leber遗传性视神经病(Leber’s heredi tary optic neuropathy,LHON),也称Leber

徐国良院士Nature发表表观遗传学重要成果

  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,而且这种修饰会受到环境因素的影响。DNA甲基转移酶(DNMT)介导的胞嘧啶甲基化是哺乳动物基因组最常见的一种表观遗传学修饰,在基因组印记、X染色体失活等重要过程中起到了关键性作用。TET家族的双加氧酶能够逐步氧化5-甲基胞嘧啶,由此实现

NIBS何新建连发Plant Cell、PLOS Genetics

  北京生命科学研究所的何新建博士带领的课题组,主要利用模式植物拟南芥为研究材料,运用遗传学研究方法,结合蛋白、生化和分子生物学手段,研究DNA甲基化和组蛋白修饰的分子机理,并研究它们在基因表达调控和生长发育等方面的作用。近期,何新建博士带领的两项重要学术成果,分别发表在国际权威学术期刊《Plant

遗传发育所在肥胖的进化机制研究中取得新进展

  对人类祖先来说,储存脂肪的基因在饥荒时期可能是有用的,但这些基因是否让后代更易发胖还存在争议。尽管目前流行的“节俭基因”假说(Thrifty Gene Hypothesis)饱受质疑,但是并没有直接的证据能推翻该假说。9月22日《细胞代谢》(Cell Metabolism)杂志报道了中国科学院遗

肥胖的进化机制研究取得新进展

  对人类祖先来说,储存脂肪的基因在饥荒时期可能是有用的,但这些基因是否让后代更易发胖还存在争议。尽管目前流行的“节俭基因”假说( Thrifty Gene Hypothesis )饱受质疑,但是并没有直接的证据能推翻该假说。9月22日《细胞代谢》( Cell Metabolism )杂志报道了中国