技术和方案18染色质免疫沉淀

试剂、试剂盒甲醛甘氨酸TBS蛋白酶抑制剂裂解缓冲液免疫共沉淀洗脱液TESTE仪器、耗材超声波粉碎仪实验步骤1.培养要分析的细胞。每一个样品,需要在三角瓶中培养 50~100ml 细胞至 OD600 大约为 1。2.甲醛处理细胞交联蛋白质和 DNA。加甲醛到细胞中至终浓度为 1%(37% 的甲醛按 1:36 与细胞悬液混合),在室温维持 10~120 min,期间颠倒几次。>注意:最佳的固定时间对不同的蛋白质是不同的,对于不同的分析要加以优化。3.制备加有蛋白酶抑制剂的裂解/免疫沉淀缓冲液。使用 5~8 ml 裂解/免疫沉淀缓冲液 (用量根据需要而变化,详见程序 6 和 7) 来收集每个染色质免疫沉淀样品。lml 裂解/免疫沉淀缓冲液加 20ul 50 倍的蛋白酶抑制剂储存液。将缓冲液储存在冷室中。>注意:PMSF 最好使用时加入,因其在水相中不稳定,pH 8 时的半衰期约 35 min。每毫升反应缓冲液中加入 20 ......阅读全文

技术和方案18-染色质免疫沉淀

试剂、试剂盒甲醛甘氨酸TBS蛋白酶抑制剂裂解缓冲液免疫共沉淀洗脱液TESTE仪器、耗材超声波粉碎仪实验步骤1.培养要分析的细胞。每一个样品,需要在三角瓶中培养 50~100ml 细胞至 OD600 大约为 1。2.甲醛处理细胞交联蛋白质和 DNA。加甲醛到细胞中至终浓度为 1%(37% 的甲醛按 1

染色质免疫沉淀技术的应用

随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域,要想提供蛋白因子直接调控的证据,需要直接检测蛋白质-DNA的相互作用,而染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)就是一种研

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点

染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体的特异性反应,可以真实地反映体内蛋白分子与基因组DNA结合的状况。下面我们就最基本的实验步骤,实验中的小技巧以及需要注意的问题简单介绍一下。1.

染色质免疫沉淀分析

真核生物细胞状态是由内源和外源因素共同影响的,所有信号传递途径的终点都是DNA 。DNA 通过核蛋白复合物组成染色质,染色质是基因调控的一个重要作用位点。转录激活因子和辅助抑制因子的研究显示存在一种新的调节机制--" 组蛋白密码" ,其信息存在于组蛋白的转录后修饰等过程中。该类修饰包括组蛋白磷酸

染色质免疫沉淀DNA分析

实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法,来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性  DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布(用芯片或 DNA 测序)。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀  (X-ChIP) 实验的具

染色质免疫沉淀DNA分析

实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法,来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性  DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布(用芯片或 DNA 测序)。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀  (X-ChIP) 实验的具

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用1

序言随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学的研究逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域。研究某个蛋白因子的调控功能,可以通过对蛋白活性(激活或抑制其活性),蛋白数量(过表达Overexpression或基因缺陷型Knockout), 以及蛋白功能(功能缺陷

染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用2

3. 染色质免疫沉淀Input对照:在进行免疫沉淀前,需要取一部分断裂后的染色质做Input对照。Input是断裂后的基因组DNA,需要与沉淀后的样品DNA一起经过逆转交联,DNA 纯化,以及最后的PCR或其他方法检测。Input对照不仅可以验证染色质断裂的效果,还可以根据Input中的靶序

组织免疫沉淀中染色质的制备

实验概要此步骤描述了从组织中制备染色质,以用于后续的染色质免疫沉淀反应。每个免疫沉淀/抗体反应推荐使用肝组织 30 mg,但组织使用量可根据实际进行调整。每种组织的用量依据组织蛋白丰度、抗体亲和力和交联效率而定。每个免疫沉淀反应最适染色质的量为 5-15 μg 。每次交联免疫沉淀反应之前,需根据不同

自然染色质免疫沉淀实验设计

1. The preparation of native chromatin from cultured human cells1.1.Cultured cells (e.g. HL-60 or lymphoblastoids) are grown to a density of approxima

染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定

组织免疫沉淀中染色质的制备

实验概要此步骤描述了从组织中制备染色质,以用于后续的染色质免疫沉淀反应。每个免疫沉淀/抗体反应推荐使用肝组织 30 mg,但组织使用量可根据实际进行调整。每种组织的用量依据组织蛋白丰度、抗体亲和力和交联效率而定。每个免疫沉淀反应最适染色质的量为 5-15 μg 。每次交联免疫沉淀反应之前,需根据不同

免疫学技术专题:染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)

该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定

北京大学Cell-Res获染色质免疫沉淀测序技术突破

  生物动态光学成像中心黄岩谊课题组与汤富酬课题组合作,发展了一种基于微流控芯片的微量细胞样品处理与核酸俘获方法,成功实现了针对1000个细胞的染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq),大幅减少了这类实验中对样品起始量的要求,并利用这一方法研究了组蛋白H3第4位赖氨酸的3甲基化修饰(H3K4me3)在

免疫沉淀实验——基本方案

经典的免疫沉淀是可溶性抗原与其抗体产生可见沉淀反应的血清学试验。后来发展为抗原抗体结合后,用固相化的蛋白A或蛋白G小珠等来吸附分离抗原抗体复合体,达到检测微量抗原或抗体的目的。实验材料蛋白质试剂、试剂盒裂解缓冲液稀释缓冲液SDSTrisTSA仪器、耗材转子离心机实验步骤1.  表面标记或生物合成标记

染色质免疫沉淀法(Chromatin-immunoprecitation,ChIP)

染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,这些

体内甲醛交联及染色质免疫沉淀研究DNA和蛋白质作用

染色质由真核基因组包装而成,它参与了转录、复制、重组、修复等许多以DNA一蛋白质相互作用为基础的生化过程。研究者感兴趣的是这些过程涉及到哪些特异的基因或DNA序列,有哪些蛋白质参与。尽管有许多人对染色质进行分类,就像Holde将其分为转录活性或非活性位点,但染色质构本身是动态的,并且DNA与非组蛋白

Active-Motif的染色质免疫沉淀试剂盒(ChIP)

ChIP(染色质免疫沉淀)方法是研究活体“蛋白质-DNA”相互反应的一种非常强大的工具。目前,这种方法用于染色质结构的动力学研究、转录因子的调节和辅助调节因子及其他表观遗传变化的研究。ChIP的使用过程分为三个主要步骤:第一步,在甲醛固定后分离和破碎染色质;第二步,使用感兴趣的蛋白的抗体完成特定染色

植物染色质免疫沉淀试剂盒的使用说明

EpiQuik™植物染色质免疫沉淀试剂盒包括全套的试剂,允许试验者有效地在体内研究蛋白-DNA相互关系。整个过程可以在6小时内完成,产品效果远远优于任何竞争对手的试剂盒。EpiQuik™植物染色质免疫沉淀试剂盒适用于将特异性免疫沉淀与定性和定量PCR、ChIP-Seq、ChIP-on-chip结合使

植物染色质免疫沉淀试剂盒(CHIP)的使用说明

蛋白质和DNA的相互作用是调控细胞反应过程的要素之一。染色质免疫沉淀分析方法(chromatin immunoprecipitation, CHIP)是研究活体内DNA和蛋白质的相互作用的最新最有力的研究工具。CHIP技术通过三大步骤实现:第一,甲醛固定后染色质分离和断片;第二,运用特异蛋白

RNA蛋白免疫沉淀技术简介

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合

技术和方案21-EMS诱变

实验步骤1.培养酵母细胞过夜,使細胞密度达到 2X108 个/ml。2.从同一培养物中转移两份 lml 的样品至离心管中,5000 g,离心 10s 收集细胞。3.丢弃上清,用无菌蒸馏水悬浮细胞,再离心收集细胞。4.重悬细胞在 1 ml 的无菌 0.1mol/L 磷酸钠中。5.用血球记数板测定细胞密

免疫沉淀法的技术特点

免疫沉淀法(Immunoprecipitation, IP)是一种研究蛋白质间交互作用的生物技术,这种技术是将蛋白质视为抗原,并利用抗体与之进行特异性结合的特性,来进行研究。这项技术可用来将含有上千种不同蛋白质的样品中,分离和浓缩出特定蛋白质。进行免疫沉淀法时,抗体需要和一个受质结合。

RIP技术(RNA结合蛋白免疫沉淀)

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合

免疫沉淀的方法特点和应用

免疫沉淀是利用抗体特异性反应纯化富集目的蛋白的一种方法。抗体与细胞裂解液或表达上清中相应的蛋白结合后,再与蛋白A/G(ProteinA/G)或二抗偶联的珠子(agarose或Sepharose)孵育,通过离心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗体-目的蛋白复合物,沉淀经过洗涤后,重悬于电泳上样缓冲液,煮沸

免疫沉淀(Immunoprecipitation)实验材料和方法

免疫沉淀是利用特异性抗体识别并分离抗原的方法。材料:上样buffer的配方(用前现配):2ul 1.25M Tris-HCL , pH 6.835ul distilled water2.5ul 2-mercaptoethanol12.5ul 10%SDS10ul 80% glycerol2ul br

技术和方案24-挑取合子

实验步骤 传统筛选合子的方法是将接合混合物涂布在选择平板上,二倍体细胞能生长,而单倍体细胞不能生长。合子的形态学特点使我们有可能从接合的单倍体细胞群体中将它识别出来,利用显微操作平台使我们很容易从未接合的细胞中分离合子。 如果单倍体细胞都是新鲜培养物,接合效果最好,一般从 30°C 培

技术和方案25-测定铺板效率

实验步骤菌株的铺板效率是以培养基中可形成菌落的活力细胞的百分比衡量的(有时也称为克隆形成单位或 cfu)。测定铺板效率有以下两种简便的方法。间接法1.测定培养物中的细胞密度,用 Coulter 计数仪测定培养物光密度或用血球计数板统计细胞个数。2.确定要将细胞稀释至 103 个/ml 所需要的稀释系

大鼠ELISA试剂盒免疫沉淀技术

因此组织不可用甲醛固定,可用甲醛、乙醇等。PPA对组织内抗原(先与IgG结合)的定位,反应时间可以延长,大鼠ELISA试剂盒便于渗透入组织细胞内,且没发现严重的物理吸附现象。在PPA实验中稀释液常用含0.5%(v/v)Tween20的0.02mol/L Ph 7.4 Tris-HC1缓冲液(2.42