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长非编码RNA调控癌基因MYC表达的综述文章

8月7日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲受邀在国际学术期刊Current Opinion in Genetics & Development 发表题为The long noncoding RNA regulation at the MYC locus 的综述论文。该文系统地总结了近年来长非编码RNA调控癌基因MYC表达的研究进展。 长非编码RNA分子可在表观遗传水平、转录水平及转录后水平等多层次调控基因表达,参与细胞分化、机体发育、疾病发生等重要生命活动的调控。MYC基因是著名的癌基因,在肿瘤发生和发展过程中扮演着十分重要的角色,MYC基因的表达更是受到十分严格且精密的调控。近年来的临床和基础研究发现了一系列与MYC基因表达调控相关的长非编码RNA。该综述论文总结和讨论了这些长非编码RNA与MYC基因调控的研究进展,并展望了该研究领域的未来发展方向。 陈玲玲于2011年1月起在......阅读全文

Science子刊专题:癌症中的非编码RNA

  非编码RNA(尤其是microRNA)是众多细胞过程的关键调控子,与发育和癌症进程密切相关。本期Science Signaling杂志通过专题“Noncoding RNAs in cancer”,介绍了这类分子的生理和病理学功能。  发现哺乳动物基因组中的非编码RNA,不仅揭示了一类新的生物学调

长链非编码RNA与淋巴瘤

  类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录,而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA(lncRNA)是一类异质性的非编码RNA,根据lncRNA的功能,可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(一)

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&...1

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微

Cell年度综述:癌症基因组入选

  Cell杂志创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。近期Cell杂志盘点了2013年度最佳综述及最佳论文,其中热门技术CRISPR也登上了榜单,相关论文描述了利用基因调控系统 CRISPR/Cas,一步

陈玲玲研究员Cell Res解析癌相关lncRNA

  报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实,人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。   论文的通讯作者是中科院上海生命科学院

一文速览丨2019年曹雪涛团队在Science,PNAS发表成果盘点

  2019年,曹雪涛团队在Science,Nature Immunology,PNAS 等杂志上发表了13篇重要研究成果,在免疫学领域取得重大进展,iNature系统盘点一下曹雪涛团队的研究成果:  【1】干扰素-γ(IFN-γ)对于细胞内细菌固有的免疫反应至关重要。 非编码RNA和RNA结合蛋白

年终盘点:2016年国内不容错过的重磅生物研究

  时间总是过得很快,2016年马上就要过去了,迎接我们的将是崭新的2017年,2016年,我国有很多优秀科研机构的科学家们都做出了意义重大、影响深远的研究成果,发表在国际顶级期刊上。本文中小编盘点了2016年我国科学家发表的一些重磅级研究,以饕读者。   --结构生物学 --  1.清华大学 施一

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

【Science特刊】RNA中的信号

  6月17日的Science出了一期关于RNA的特刊。RNA与基因表达的分子生物学紧密相关:有形成特定结构的能力;作为信号载体;对自身的调节。例如非编码小分子RNA,已知是基因表达的调控因子,和哺乳动物干细胞基因表达变化相关,而这种变化反过来和胚胎发育过程中细胞命运的决定有联系。  DNA甲基化是

上海生科院揭示长非编码RNA对MYC基因转录调控的分子机制

  5月5日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组在《细胞研究》(Cell Research)发表当期封面文章Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin

科学家揭开“垃圾”DNA的神秘角色!

  生物学家们在很长一段时间里都认为,既然几乎所有具体的生理机能都要由蛋白质来完成,那么不编码蛋白质的DNA应该是没有用的,可以称为“垃圾DNA”;而且人类基因组项目发现人的基因组中仅有1.5%的序列是给蛋白质编码的,其余的98.5%的序列是以前认为的“垃圾”DNA。  此前研究人员进行了一项名为E

m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇

一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个重要的生物学

肿瘤标志物“分列式”

癌细胞静悄悄、无休止、无秩序地增生、转移,大量消耗体内营养物质,导致身体免疫机制下降,直到出现身体症状或健康体查时才会注意到它。癌细胞发生、增殖和转移等过程中在患者身体内留下一些踪迹。捕捉到隐藏到这些悄无声息的癌症信号——肿瘤标志物,可以帮助医生癌症诊疗过程中做出更加精准的判断。返祖信号癌细胞被认为

《细胞》子刊11篇文章重磅回顾,这些年兴起的大牛技术

  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。  Cell出版社旗下Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术

2017年不能错过的长非编码RNA研究推荐

  2017年即将过去,这一年的非编码RNA研究取得了很多重磅级成果。与早先的主要是在不同类型的疾病(癌症)中大规模鉴定非编码RNA,今年的研究是对非编码RNA机制的更深入探索,给我们展现了作用方式更丰富多彩的非编码RNA世界。图片来源于网络  一 长非编码RNA(lncRNA)  长非编码RNA是

Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

  近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27

四川大学最新综述:非编码RNA与代谢的研究进展

  生物通报道:非编码RNA是指不编码蛋白质的调节性RNA分子. 近年来的研究发现,非编码RNA,尤其是微小RNA和长非编码RNA,可以在基因转录、 RNA成熟和蛋白质翻译等水平调控基因表达,参与发育、分化和新陈代谢等几乎所有重要的生理生命过程,在人类疾病中发挥重要作用.肿瘤和糖尿病等代谢性疾病是人

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

癌症研究大师Cell惊人发现:致癌的假基因

   假基因(Pseudogenes),这一由基因组的2万个蛋白质编码基因衍生而来,现在丧失了蛋白质生成能力的一个长链非编码RNA(lncRNA)子类,长期以来都被视为是基因组的“垃圾”。然而这些在进化过程中保留下的2万个神秘的残余物表明,它们实际上有可能具有一些生物学功能,促进了疾病的形成。  现

曹雪涛院士团队重要研究成果汇总

  【1】Science:南开大学曹雪涛团队揭示hnRNPA2B1识别病毒DNA并促进IFN-α/β产生  doi:10.1126/science.aav0758  通过模式识别受体(pattern recognition receptor, PRR)识别病毒核酸可触发宿主对病毒的先天免疫应答。这导

南京大学、第二军医大Nature揭示支持肿瘤起始细胞的lncRNA

肾肿瘤起始细胞(T-IC)推动了肾细胞癌(RCC)的发生、发展和药物抵抗。南京大学和第二军医大学的研究人员在Nature Communications杂志上发表文章,揭示了肾肿瘤起始细胞的一个增殖机制。文章通讯作者是第二军医大学的王林辉(Linhui Wang) 和南京大学医学院的张征宇(Zheng

南京医科大学最新文章:癌细胞中的RNA表达模式

  系统生物学认为, 生命体是一个复杂的动态变化网络, 对于生命的研究需要从整体出发, 研究生命网络中的这些复杂的相互作用和调控关系, 而不是仅孤立地研究各个网络中的节点。近期针对非编码RNA,来自南京医科大学的研究人员进行了深入探索,旨在构建全基因组水平编码-非编码 RNA调控网络, 探讨 ncR

仁济医院房静远:从lncRNA入手,寻找胃癌的生物标志物

  上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何

全转录组测序文章

研究背景       长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因

lncRNA反向遗传学研究的典型案例

研究背景长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因此此类RNA也主要由其碱基序列形成的高级结构来执行生物

华人学者全面解读癌症中的ceRNA

  过去几年人们逐渐发现,竞争性内源RNA(ceRNA)是一类重要的转录后调控子。这些RNA通过miRNA介导的机制改变基因表达,进而影响细胞的功能。  德州大学MD安德森癌症中心的研究人员最近在Cell旗下的Trends in Genetics杂志上发表文章,全面介绍了癌症ceRNA研究的新进展,

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  【51/52】2019年4月4日,清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章,完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析,揭示了NLR作用的关键分子机制,是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是: "Li

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

唾液中白细胞介素与口腔癌的关系

  人类唾液中富含多种成分,如免疫球蛋白、激素、游离氨基酸、无机离子等,这些成分很好地反映了机体生物学功能及状态。除此之外,经口服或注射的药物亦可发现于其中。然而,这些成分并非是一成不变的,机体在受到疾病的侵扰下,体内免疫水平发生改变,分泌到唾液中的物质种类和含量发生相应改变,唾液用于疾病的诊断越来