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DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis ， PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法，它可以从多元事物中解析出主要影响因素，揭示事物的本质，简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m 个观察值，形成一个 n ′ m 的数据矩阵， n 通常比较大。对于一个由多个变量描述的复杂事物，人们难以认识，那么是否可以抓住事物主要方面进行重点分析呢?如果事物的主要方面刚好体现在几个主要变量上，我们只需要将这几个变量分离出来，进行详细分析。但是，在一般情况下，并不能直接找出这样的关键变量。这时我们可以用原有变量的线性组合来表示事物的主要方面， PCA 就是这样一种分析方法。PCA 的目标是寻找 r ( r 降到 。 在进行基因表达数据分析时，一个重要问题是确定每个实验数据是否是独......阅读全文
GeneSpring是一款广受好评的基因组学工作人员必知软件 ，使用者可在短时间内分析运算出目的基因的序列，称得上系统生物学分析软件中的佼佼者，受到相关科研工作者的欢迎和肯定。本文对GeneSpring GX的优势做详细分析。GeneSpring生物数据分析软件GeneSpring GX是一套特别针
转移性乳腺癌(MBC)是一种极具侵袭性的三阴性肿瘤(TNBC)，其定义为梭形、鳞状或肉瘤样组织学的转移性成分。支撑MBC病理亚型和转移行为的蛋白质谱尚不清楚。本期iProteome为大家带来的是今年发表在Nature Communications上的一项关于乳腺癌的研究，本研究中，研究者采用基于
华联于 2012 年 7 月~ 9 月的科技专题中，介绍芯片实验设计时，概略介绍了一些常用的数据分析方法，有许多客户及好学的读者纷纷来信，希望我们另辟单元，仔细教学这些对他们很有帮助的分析软件；数据分析素来是华联的强项之一，我们很乐意也很兴奋地开辟这个新单元 - 数据分析教学，本期以主成份分析法
基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具，本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片，是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因
编辑推荐：Fluidigm 公司开发了一种在C1TM单细胞自动制备系统及BiomarkTM HD系统上检测单细胞miRNA表达谱的实验方案。此方案可以在小于24小时的时间内，平行处理96个单细胞，在一张GE 96.96芯片对每个单细胞分别检测多达96种miRNA。配套的SINGuLAR™ 2
以10x Genomics为代表的单细胞组学检测技术的发展，为我们从细胞层面去理解生命体的发育过程，疾病发生和发展过程提供了重要的手段。以单细胞转录组(scRNA-Seq)为例，我们可以发现，单细胞组学数据具有横向细胞数量巨大，纵向数据分布稀疏的特点。因此，针对单细胞数据，从分析的角度提出了巨大
DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题，分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构，结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题，所采用的方法包括通过可视
仪器、耗材扫描仪图像分析软件Excel 程序多元数据分析的软件实验步骤用 Progenesis、Excel 和 The Unscrambler 对 2D 凝胶进行多元分析。3.1 确定研究方案后建立蛋白的 2D 凝胶在本章节中不再阐述，但要确定染色方法以便进行凝胶的定量分析（见注释 1
仪器、耗材：扫描仪
序号项目名称联合单位301籽鹅开产节律基因的筛选、功能验证及调控机制黑龙江八一农垦大学302承载三明治式免疫激活因子的LTB-MEP-PEI纳米微球免疫活性研究黑龙江八一农垦大学303玉米移栽生物质钵育秧盘制备方法及成型机理研究黑龙江八一农垦大学304黑龙江主产区稻米有机挥发性成分分布特征及影响因子
今天跟大家分享的是Orbitrap Exploris™ 480的第1篇文献，作者是来自丹麦哥本哈根大学的Jesper V. Olsen教授，文中对Exploris 480联合FAIMS Pro的性能进行了全面测试，包括DDA与DIA鉴定，灵敏度测试，组织样品测试，磷酸化样品测试，以及TMT与DIA定
黑木耳有重要的食药用价值，是我国的传统食用菌，具有抗肿瘤、抗氧化、防止血栓和降血糖等特性，有“菌中瑰宝”的美誉。东北地区是我国黑木耳的主产区，其生产的黑木耳畅销国内外，黑木耳产业的发展对促进东北的经济和社会发展起了重要的推动作用。过去几十年，黑木耳的研究主要集中在利用ISSR（inter-sim
今年，我国“大农业”科研领域又诞生了诸多令人惊奇的发现，每一条都与我们息息相关。它们涵盖了观赏农业、林业、作物、医学等各个领域，包括睡莲、玉米、硅藻等进展。为了展现这些成就，本报特此就我国农业科学家今年发表的大部分重要论文进行梳理，以飨读者。野生玉米大刍草、SK、现代玉米自交系ZHENG58的
让研究团队没有想到的是，这些代谢变化在富氮条件下的植株中表现得更为强烈，这表明自噬即使在正常生长条件下也会对玉米代谢产生重大影响。而PCA分析结果也呈现了同样的趋势，缺氮胁迫和自噬突变对于叶片的代谢有着不同的影响。这也说明了缺氮胁迫激活了自噬之外的其他分解代谢途径，以帮助应对这一营养挑战。那么自噬对
实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试验或温室
实验材料：SIMCA - P 多变量统计软件 试剂、试剂盒：[ 1H ] - NMR 抽提剂 仪器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管
当人类基因体定序计划的重要里程碑完成之后，生命科学正式迈入了一个后基因体时代，基因芯片 (microarray) 的出现让研究人员得以宏观的视野来探讨分子机转。不过分析是相当复杂的学问，正因为基因芯片成千上万的信息使得分析数据量庞大，更需要应用到生物统计与生物信息相关软件的协助。要取得一完
居住在高海拔环境中的物种由于不利的环境条件（包括缺氧，低温和强紫外线辐射）而受到严重的选择压力。青藏高原（QTP）是世界上最高，最大的高原，平均海拔4500米。这种恶劣的高海拔环境导致人类，哺乳动物和鸟类的类似表型适应性的演变，例如，缺氧抗性，耐寒性，增强的代谢能力和增加的体重。然而，尽管在这些
常用生物软件（windows)全面介绍一、基因芯片1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0
中国科学院院士贺福初有一个比喻：基因组和蛋白质组的关系就像词典与文章、元素表与化工厂。基因组学中微小的差异，在蛋白质组学中可以被千倍甚至近万倍地放大。因此，要真正阐释生命，必须从蛋白质组中寻找答案。 北京市昌平区中关村生命科学园的主入口处，一栋由南北双楼组成的银白色建筑呈一字型展开。这里是国家
中国科学院院士贺福初有一个比喻：基因组和蛋白质组的关系就像词典与文章、元素表与化工厂。基因组学中微小的差异，在蛋白质组学中可以被千倍甚至近万倍地放大。因此，要真正阐释生命，必须从蛋白质组中寻找答案。 北京市昌平区中关村生命科学园的主入口处，一栋由南北双楼组成的银白色建筑呈一字型展开。这里是国家
2008年12月21日下午，质谱沙龙第十五期活动在第二炮兵总医院远程会诊中心会议室举行。来自发酵研究院、清华大学、二炮总医院、朝阳医院、北大医学院、北医三院、安贞医院、解放军307医院、中科院植物所、AB公司的各位专家、老师、学生20余人。
研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设
研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设
伴随着人类基因组测序技术的革新、生物医学分析技术的进步、以及大数据分析工具的应用，精准医疗的时代已经到来，将为病人提供更精准、高效、安全的诊断及治疗。“目前我国精准医疗计划已经启动实施，包含5大任务、25个方向，预计投入资金16亿元。”在近日由贝壳社等主办的第六届Bio4P精准医疗创新论坛暨20
2011年4月20日，第二届全国药品质量分析论坛的第二天，首先进行了为期半天的分会报告，从事化学药品、生化药品、中药、中药注射剂、药包材/药用辅料的专家学者继续给出了精彩的报告，每场报告后都进行了热烈的互动交流。下午，来自中国食品药品检定研究院的林瑞超教授、江苏省食品药品检验所的樊夏雷主任、国家
分析测试百科网讯 2016年10月29日，第十九届全国分子光谱学学术会议期间，举办了原子光谱及相关技术研究进展分会暨第十五期原子光谱沙龙，约50余人参与该分会和沙龙，十余位原子光谱领域的学者和专家做了精彩报告。原子光谱沙龙活动由清华大学分析中心邢志老师发起，分析测试百科网协助组织，沙龙侧重一线实
在一段生命旅程开始之初，精子细胞刺穿卵细胞，它们的遗传物质融合。然而，在之后的一段时间，所获得的DNA一直保持沉默：受精卵或早期胚胎中的基因不被转录。科学家也不清楚，是什么最终启动了这一过程。 最近发表在《Nature Genetics》上的三项研究深入探索了这一过程。研究人员报告了一个基因D
分析测试百科网讯 2015年9月17日，农产品中混合污染物风险评估技术研讨会在济南召开。中国农科院质标所的邱静研究员和李耘副研究员、中科院动物所的伍一军研究员和沃特世科技与赛默飞世尔科技的两位工程师在代谢组学等新技术、新方法方面带来了精彩的主题报告。中国农科院质标所研究员 邱静 来自
1. 前言食品组学（Foodomics）是食品科学中的一门新兴学科，它通过运用或整合各种先进组学技术（-Omics）来研究食品与营养学中的相关科学问题，从而改善消费者的福祉与健康 [1]。按照研究目的与对象体系的不同，食品组学能从基因组学、蛋白组学与代谢组学等不同组学角度实施，可广泛应用于食品产地溯