科学家发布生物进化与多组学综合分析软件
随着二代测序成本的不断降低以及三代、四代测序技术的快速发展，越来越多生物物种的全基因组序列被解读出来，多组学数据呈现爆发性增长的态势。然而，数据的高效挖掘和深度解析却是生物学家面临的又一难题。为了解决这一难题，中国科学院上海营养与健康研究所隶属的中科院计算生物学重点实验室和中科院北京基因组研究所、中科院北京生命科学研究院、中科院生物化学与细胞生物学研究所、上海生物信息技术研究中心、中科院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心等多家单位组成联合攻关团队，开发了一个针对生物进化和多组学综合分析的免费软件eGPS 1.0 (http://www.egps-software.org)，并提供免费云计算服务。 eGPS软件包括单机软件版本eGPS Desktop和云计算eGPS Cloud，能够在不同平台下运行，且利于开发，易于应用。通过eGPS Cloud，将基因组分析、群体数据分析、进化数据分析、网络分析以及图形可视化这五部分的分析......阅读全文
科学家发布生物进化与多组学综合分析软件
随着二代测序成本的不断降低以及三代、四代测序技术的快速发展，越来越多生物物种的全基因组序列被解读出来，多组学数据呈现爆发性增长的态势。然而，数据的高效挖掘和深度解析却是生物学家面临的又一难题。为了解决这一难题，中国科学院上海营养与健康研究所隶属的中科院计算生物学重点实验室和中科院北京基因组研究所
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源，其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期，中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景，相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上，引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
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CASMS分论坛：多组学整合与大数据
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中，哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验
单细胞多组学高通量测序平台（一）
一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息，如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程，而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息（如DNA层面的基因序列），从而解读生物体运行机制，应用于疾病的诊断和治
解析肿瘤Hi-C多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
单细胞多组学高通量测序平台（二）
虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出，但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞，早期的技术代表F
多组学关联分析鉴定耐多药结核病血清标志物
肺结核（TB）的流行，特别是耐多药结核病（MDR-TB），已成为今天结核病治疗的一个重大挑战。浙江大学细胞生物学研究所李继承教授领衔的课题组采用iTRAQ标记结合2D LC-MS/MS，以及Solexa测序对MDR-TB患者，药物敏感结核病（DS-TB）患者，和健康对照组血清中的蛋白质组和miR
MassARRAY® 分析软件
MassARRAY® 分析软件是一套模块化应用程序，用于基因分型、甲基化、基因表达、拷贝数变异等多种应用的数据分析。以MassARRAY® Typer4软件为例，该软件用于MassARRAY系统的iPLEX SNP基因分型。用户可利用它进行分析结果的评估和管理，通过表格和图形格式进行数据的可视化，
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析（GWAS）是通过推断