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改善蛋白组学研究图像分析的新软件

对双向电泳(2DGE)等蛋白分离实验的图像进行分析不仅耗时,而且经常丢失样本或得出假阳性结果。上周在伦敦举行的AngloNordic Biotech Conference IV会议上 ,瑞典Ludesi公司CEO Ola Forsstrom-Olsson宣布这种现状将有可能得到改善,其公司已经获得了解决这些问题的办法,以便其公司的pay-per-image服务能够节约研究时间,得出有复验性的结果。 尽管双向电泳早在上世纪70年代既已出现,但目前依旧是破译复杂物质生物分子组成的最常用工具之一。然而,自动成像分析存在缺陷,手动分析耗时且需要工作经验。 蛋白组学研究人员对电子图片分类整理,利用Ludesi软件将分析结果按需要剪裁,然后Ludesi公司按客户要求进行工作。工作结果可以从网上下载,利用Ludesi公司相关软件检查结果。Forsstrom-Olsson说这比研究人员自己做要快得多, Ludesi公司只需几天,研究人员则需......阅读全文

生物标志物的简介及面临的挑战和希望

  “Biomarker” 这个词在用于生物医学领域之前,多见于地质学文献,曾被翻译成“生物标志化合物”,指的是地质材料中来自于活的生物体的一些有机化合物。上世纪六十年代,这一词汇开始出现在医学文献中。上世纪八十年代,它被正式地引入到生物医学领域。在生物医学领域,对它也曾有过不同的描述。2001年,

iTRAQ技术常见问题与答疑

1、什么是iTRAQ?    iTRAQ技术,即同位素相对标记与绝对定量技术。该技术可对复杂样本、细胞器、细胞裂解液等样本进行相对和绝对定量研究,具有较好的定量效果、较高的重复性。由于其能够同时对多达8种样品进行标记分析,故在生命科学的各个领域得到了广泛的应用。2、iT

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量

双向凝胶电泳技术应用

凝胶中蛋白的检测凝胶染色的目的是使其中的蛋白质能够被观察到。目前还没有通用的染色方法,只能在考虑多种因素如需要的灵敏度、线性范围、方便程度、费用、以及成像设备类型等基础上,结合实际进行选择。有时也可以将蛋白转膜后通过免疫印迹的方法来进行检测。图像采集和分析成像设备可以摄人图像,对凝胶图像以数字形式保

蛋白质技术——双向电泳

实验概要蛋白质组研究的发展以双向电泳技术作为核心.  双向电泳由O’Farrell’s于1975年首次建立并成功地分离约1000个E.coli蛋白,并表明蛋白质谱不是稳定的,而是随环境而变化.  双向电泳原理简明,第一向进行等电聚焦,蛋白质沿pH梯度分离,至各自的等电点;随后,再

固相化 pH 梯度双向凝胶电泳实验9

方案9 胶体考马斯亮蓝染色实验暂未评分点评实验,有机会获丁当奖励 +收藏固相化 pH 梯度双向凝胶电泳实验标签:双向凝胶电泳蛋白质 固相化pH 蛋白质与蛋白质组学实验指南 第四章双向电泳是研究蛋白质组学的一种有效方法。与单向电泳相比,它能从复杂的蛋白质混合物中分离出更多的成分。电泳时,蛋白

常规聚丙烯酰胺凝胶电泳实验——检测

实验方法原理常规聚丙烯酰胺凝胶电泳后的检测,对于不同的目的,应采用不同的检测方法。由于这种电泳方法不破坏蛋白质的生物活性,所以可选用的检测方法很多。试剂、试剂盒丙烯酰胺单体贮液Tris-甘氨酸缓冲液贮液电极缓冲液样品缓冲液过硫醆铵浓缩胶缓冲液贮液分离胶缓冲液贮液实验步骤一、早期染色方法用染料和生物大

双向电泳常见问题解答

随着人类基因组草图完成,蛋白质组研究全面展开。作为经典蛋白质组学分离技术,双向电泳越来越被科研人员所熟知。但要想得到漂亮的双向电泳谱图,却并不那么容易。我们将针对双向电泳过程中常出现的问题进行总结,希望能给您的实验带来帮助。 本期我们重点关注双向电泳图谱中常出现的水平条纹。双向电泳水平条纹

芯片分离蛋白

尽管现在所有的注意力都集中到了蛋白芯片的研究上,蛋白质组研究实验室的主流技术还是双向凝胶电泳。双向凝胶电泳在历史上由于其低通量、低重复性以及对于少量蛋白不易检出的特性,其应用受到限制,这些少量蛋白通常是人类蛋白质组中最重要的疾病相关蛋白。然而,双向凝胶电泳技术的优势又继续推动了日益进展高通量模式的细

蛋白质组实验全套流程方案-1

 蛋白质组实验流程双向电泳的样品的制备样品制备原则样品制备是双向电泳中最关键的一步,将直接影响2-DE结果好坏。目前并没有一个通用的样品制备方法,尽管处理方法多种多样,但都遵循几个基本的原则:1)尽可能的提高样品蛋白的溶解度,抽提最大量的总蛋白,减少蛋白质的损失;2)减少对蛋白质的人为修饰

蛋白质组学技术分析方法及概括

1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并首次在1995 年7月的“Elec

第二届质谱论坛:质谱在生物医药中的应用

  质谱论坛学术报告 赛默飞世尔科技色谱质谱部应用工程师 刘婷   来自赛默飞世尔科技的应用工程师刘婷 为大家作了题为《高分辨质谱提高代谢物鉴定的数量和可靠性》的报告。   代谢

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验

试剂、试剂盒尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材等电聚焦仪IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤3.1 第一向:在 IPG 胶条中进行等电聚焦( IPG-IEF)采用 IPG ( IPG

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验

试剂、试剂盒尿素裂解溶液                                       &nbs

SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳——检测

实验方法原理在 SDS 电泳中,由于 SDS 和还原试剂使蛋白质变性而失去生物活性,所以电泳后的检测方法不如常规聚丙烯酰胺凝胶电泳和等电聚焦电泳多,一般为考马斯亮蓝染色和银染色,其次为荧光方法和转移后检测。试剂、试剂盒丙烯酰胺单体贮液磷酸缓冲液贮液咪唑缓冲液贮液过硫酸铵浓缩胶缓冲液贮液分离胶缓冲液贮

双向电泳实验

ISO-DALT 方法 IPG-DALT 方法             实验方法原理 双向电泳(two-dime

双向电泳实验——ISO-DALT 方法

实验方法原理双向电泳(two-dimensional electrophoresis)是等电聚焦电泳和SDS-PAGE的组合,即先进行等电聚焦电泳(按照pI分离),然后再进行SDS-PAGE(按照分子大小),经染色得到的电泳图是个二维分布的蛋白质图。实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒尿素去污剂仪器、耗材

蛋白质组学相关问题与解答

  1.为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到?    人血浆中的蛋白是有上万种的,而一般质谱只能检测到五六百种,也就是说只占了其中的百分之几,这是普遍现象,说明咱们的方法是不存在问题的;其次,ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样,前者具有放大效应,因为其间会用

Western Blot实验技术详解和常见问题解答

Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。一、原理与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被

Western Blot详解

  Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。   本文主要通过以下几个方面来详细地介绍一下Western Blot技术:   一、原理   二、分类

几种双向凝胶电泳蛋白质检测方法的比较

蛋白质组研究要求有高分辨率的蛋白质分离及准确、灵敏的质谱鉴定技术。凝胶电泳中蛋白质的着色不仅影响蛋白质分离的分辨率,同时也影响后续的质谱鉴定。选择适当的蛋白质染色法将有助于提高蛋白质组学研究结果的质量。蛋白质的染色常用的有4类:有机试剂染色、银染、荧光染色及同位素显色。其中有机试剂染色以考马斯亮蓝染

二维液相色谱在蛋白质组学研究中的应用

 2001年2月人类基因组的全序列测序工作完成后,生命科学研究进入了后基因组时代。后基因组时代的任务是研究基因组的功能活动,即显示生命所有遗传信息转移到整体水平上对生物功能的研究。但此类研究不能直接反应生命活动的执行体——蛋白质的种类和功能。  在20世纪90年代中期在生命科学研

蛋白质的双向电泳实验_等电聚焦法

蛋白质的双向电泳的第一向为等电聚焦( Isoelect rofocusing, IEF) , 根据蛋白质的等电点不同进行分离; 第二向为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳( SDS-PAGE ) , 按亚基分子量大小进行分离。经过电荷和分子量两次分离后, 可以得到蛋白质分子的等电点和分子量信息。本实验目的是

神经内分泌肽能系统干扰中的蛋白质组学分析实验

环境污染物可以影响许多胞内酶活性。酶抑制因子对蛋白质组的影响可以利用双向电泳来确定。在神经内分泌细胞中,前体蛋白转化酶 1 和 2 (proprotein convertase 1 和2, P C l 和 PC2 ) 介导许多蛋白质前体水解为肽激素和神经肽。这些钙离子依赖的蛋白酶的活性可以被环境中的

抑郁大鼠海马的双向凝胶电泳图谱分析

背景及目的抑郁症发病机制不清。结构影像、遗传、神经生化的研究都从不同角度阐述了抑郁症的发病机制,种种证据也显示抑郁症的发病在脑代谢层面是有其器质性基础的,但至今还无明确、统一的结论。蛋白质组学技术为抑郁症发病机制的研究提供了新的手段。本研究通过建立抑郁症的动物模型,利用双向电泳和质谱鉴定技术,分析海

盘点:31项与免疫学有关的分子生物学实验技术

  现代分子生物学和免疫学的进展加深了我们对许多疾病的了解,并且导致了免疫新策略的产生,免疫学检测方法可分为体液免疫和细胞免疫测定。本文盘点了与免疫学有关的分子生物学实验技术汇总。  一、GST pull-down实验  GST是指谷胱甘肽巯基转移酶,GST pull-down实验是一个行之有效的验

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

电泳技术

电泳法,是指带电荷的供试品(蛋白质、核苷酸等)在惰性支持介质(如纸、醋酸纤维素、琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶等)中,于电场的作用下,向其对应的电极方向按各自的速度进行泳动,使组分分离成狭窄的区带,用适宜的检测方法记录其电泳区带图谱或计算其百分含量的方法。    电泳技术的

电泳分析常用方法

(一)醋酸纤维素薄膜电泳 醋酸纤维素是提纤维素的羟基乙酰化形成的纤维素醋酸酯。由该物质制成的薄膜称为醋酸纤维素薄 膜。这种薄膜对蛋白质样品吸附性小,几乎能完全消除纸电泳中出现的“拖尾”现象,又因为膜的亲水性比较小,它所容纳的缓冲液也少,电泳时电流的大部分由样 品传导,所以分离速度快,电泳时间短,样品

揭示生命奥密的重要仪器――色谱仪

提到色谱仪对不从事化学有关问题的人来说可能还有些陌生,但是“色谱”一词的出现已经有近100年的历史了,而且从现代科学技术意义上说的商品色谱仪的使用也有近半个世纪了。色谱方法和色谱仪科学技术的发展、为国民经济的增长、为人民的健康长寿、特别是为揭示生命奥密作出了的贡献。 俄国植物学家茨维特茨维