老鼠基因组单体型图谱出炉
美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下，即小鼠基因组单体型图谱（将染色体分隔成许多小的片段），从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月29日的《自然》杂志上，该图谱首次完整描述了小鼠基因组测序和SNP计划的分析数据。该研究计划由美国环境卫生科学研究院进行。 这些数据使研究人员能够比较一个小鼠与另外一个小鼠的遗传组成，并进行必要的遗传分析来确定出一些个体对疾病更敏感的原因。这项研究成果使人们向着了解对人类对环境毒素的个体敏感性前进了一步。研究人员还希望开放环境疾病药物的制药企业将能够利用这些数据。 这项研究详细地描述了用于确定出15个小鼠的基因组中分布的827万个高质量的SNP的方法。SNP即单核苷酸多态性是发生在DNA序列中的单个核苷酸的遗传变异。 研究人员利用......阅读全文
老鼠基因组单体型图谱出炉
美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下，即小鼠基因组单体型图谱（将染色体分隔成许多小的片段），从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2
谷子单倍体型图谱及全基因组关联分析研究出炉
由中国农科院作物所、中科院上海生科院植生生态所国家基因中心、中科院遗传发育所等8家单位合作，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和大量农艺性状的全基因组关联分析，该成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遗传学)发表，标志着我国在谷子遗传学研究领域取得了重要的突破。
《自然—生物技术》：美教授“自绘”个人基因组图谱
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一台机器、3个人、5万美元，美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明，这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。 斯坦福大学8月10日发表声明说，夸克在两名同事的帮助下，利用一台冰箱大
首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表
2012年12月24日，由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结
任兵教授Nature重要成果：首张小鼠功能基因组图谱
通常被称之为“生命之书”的人类基因组非常地难于阅读。在没有充分了解其语法和句法的情况下，基因组中29亿的腺嘌呤与胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶碱基对为了解人类的基础遗传学提供了有限的认识。 在发表于7月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇论文中，来自德维格癌症研究所和加州大学圣地亚哥医学院的
中国科学家绘就谷子基因组单倍型图谱
由中国农科院作物科学研究所、中科院上海生科院国家基因研究中心、中科院遗传与发育生物学研究所等8家单位组成的科研团队，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析。相关成果6月23日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据介绍，谷子为二倍体，基因组小、自花
小豆F2群体的简化基因组测序构建高密度SNP遗传图谱
小豆营养丰富、医食两用，在促进健康、改善膳食结构等方面具有重要作用。然而，小豆遗传研究相对缓慢，导致新基因发掘及资源利用效率低下，难以满足生产和市场的需求。 近期，中国农业科学院作物科学研究所食用豆种质资源研究程须珍课题完成的题为“Construction of a high-density
最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图 日前，由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学
科学家绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱
体细胞突变是肿瘤发生的标志，可用于癌症的无创诊断。美国约翰·霍普金斯大学医学院绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱，用于癌症无创检测。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Single-molecule genome-wide mutation profile
应用SNP芯片测基因组知起源地
欧洲的历史上充满着战争、入侵和移民，这些因素似乎可以彻底地将不同人种混合在一起。然而，美国和荷兰科学家独立进行的两项最新研究表明，一个欧洲人的基因组信息足以表明他的地理起源，欧洲人的基因地图和地理地图间存在着一种映射关系。相关论文分别发表在《自然》和《当代生物学》杂志上。 领导其中一项研究的是美国加
应用SNP芯片测基因组知起源地
欧洲的历史上充满着战争、入侵和移民，这些因素似乎可以彻底地将不同人种混合在一起。然而，美国和荷兰科学家独立进行的两项最新研究表明，一个欧洲人的基因组信息足以表明他的地理起源，欧洲人的基因地图和地理地图间存在着一种映射关系。相关论文分别发表在《自然》和《当代生物学》杂志上。 领导其中一项
南京农大棉花遗传育种研究发权威期刊
棉花是重要的经济作物，也是纺织工业的主导原料，在世界及我国国民经济中占重要地位。随着植物基因组计划的不断发展，对作物进行分子设计和基因工程改良是21世纪植物科学领域中的重要课题。目前，国内外研究人员在棉花遗传育种工作中取得了一定的进展。 五月二十四日，南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验
高分辨率人类基因变异图谱绘成
由中、美、英等多国共同发起的国际合作项目“千人基因组计划”协作组近日宣布，已成功完成高分辨率人类基因组遗传变异整合图谱。相关研究论文11月1日在《自然》杂志上在线发表。 “千人基因组计划”是由中国华大基因研究院、英国桑格研究所、美国国立人类基因组研究所等多家机构共同启动的一项大规模人类基因
《自然》发表中国人泛基因组参考图谱，26家单位联合研究
近日，复旦大学、西安交大、中国医学科学院等26家单位联合发布了中国人群泛基因组联盟（CPC）一期研究进展。6月14日，相关成果以《基于36个族群的中国人泛基因组参考图谱》为题发表于《自然》（Nature）主刊。这是我国学者领导的人群基因组研究首次发表在《自然》主刊。这项研究初步构建了我国人群的泛基因
科学家筛选出易患脓毒症关键靶点
第三军医大学大坪医院野战外科研究所第四研究室创伤基础研究课题组助理研究员曾灵、副研究员顾玮等在973科学家蒋建新的带领下，发现并筛选出易患脓毒症的关键靶点，为脓毒症易患性创伤患者早期预测、预警和干预提供了重要的临床依据。相关研究论文日前发表在国际外科领域权威期刊美国《外科学年鉴》上
首款鲶鱼高密度SNP芯片的开发
为了破译鲶鱼抗病性状的遗传机制，改善鲶鱼的养殖，美国奥本大学(Auburn University)的研究人员利用Affymetrix公司的Axiom基因分型技术，开发出第一款高密度的鲶鱼SNP芯片——Catfish 250K SNP array。这项研究成果于近日发表在《BMC Rese
9月2日《自然》杂志精选
封面故事：细菌产生抗药性的机制 对抗菌素有抗药性的细菌菌种的出现，是临床环境中一个越来越大的威胁，但人们对它们出现的过程却不是很了解。利用暴露于浓度不断增大的氟喹诺酮抗菌药“诺氟沙星”的一个大肠杆菌连续培养物所做实验表明，少数自然出现的抗药变体能保护其种群的绝大部分。这些具有高
北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库
DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记，在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用，不同物种所采用的机制亦各不相同。因而，整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析，可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异，并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。
Nature公布大麦基因组图谱
大麦是世界上最重要的粮食作物之一，17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程，在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下，历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值
基于低深度测序的关联分析方法
由于缺少非人类生物的单倍型参考panel，研究人员很难对这类生物进行全基因组关联分析（GWAS）。为了解决这个问题，牛津大学、威康信托人类遗传学中心和加州大学洛杉矶分校的研究人员开发了一种生物信息学方法，利用低覆盖度的全基因组测序数据填充基因型。该项研究近期发表在《Nature Genetics》上
刘伯宁：后基因组时代10年间生命科学的发展与挑战
8月2日，我国科学家利用“全基因组关联分析”的方法，在人类1号染色体上发现了肝癌的易感基因区域。这将为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗提供理论依据。 事实上，自2000年人类基因组草图绘制完成迄今，科学家已经相继发现70余种疾病的易感基因，基于此的基因诊断产业已经初现端倪，但10
基于SNPs－研究的单倍型图谱计划
寻找标记SNPs 的国际遗传变异图谱计划，即国际单倍型图谱计划(Haplotype Map Project)已于2002年10月正式启动，2003 年中国承担了“国际单倍型图谱计划”10% 的任务，这表明我国基因科学研究能力的提高和在国际生命科学领域学术地位的提升。该计划的启动将为人类致病基
首个小鼠大脑代谢物图谱发表
来自小鼠大脑代谢组学图谱的数据截图显示了大脑区域中腺苷随年龄的分布。 据最新一期《自然·通讯》杂志报道，美国加州大学戴维斯分校研究团队发表了首个小鼠大脑代谢物图谱。该数据集涵盖雄性和雌性小鼠从青春期、成年再到老年的10个大脑区域的1547种不同分子。 论文的资深作者、加州大学戴维斯分校基因组中心
小鼠大脑皮层基因活性图谱问世
一国际研究小组最新发表在《神经细胞》杂志上的论文称，他们使用一种最新测序技术，首次成功描绘出小鼠大脑基因活性的完整图谱。该图谱覆盖了整个基因组的所有基因，十分详细地显示了小鼠大脑皮层各层次的基因活性情况。研究人员指出，该研究成果不仅有助于科学家进一步理解哺乳动物大脑的组织结构情况，
《自然》发布重要单细胞RNA图谱：首张小肠细胞图谱
我们肠道上皮是人体内多样性最高，最具活力的组织之一, 作为机体与外界的主要界面之一，组成了一个细胞的生态系统。为了更好地理解这些复杂的组织及其功能，还有影响它的疾病，麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院研究人员领导的一个研究团队通过分析从小鼠肠道或肠道类器官中取样的5.3万多个单独的细胞，完成了一
国际上首个橡胶草高密度SNP遗传图谱构建
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495561.shtm
补全中国人“拼图”－《自然》发表中国人群泛基因组参考图谱
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502872.shtm6月14日，《自然》期刊在线发表了西安交通大学、复旦大学、中国医学科学院等26家单位联合发布的中国人泛基因组联盟（CPC）一期研究进展——《基于36个族群的中国人泛基因组参考图谱》。人
Neogen农业基因组学解决方案（三）
猪的基因组学解决方案GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口，包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片该微珠芯片提供约 10,000个 SNP，包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SN
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中，制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中，制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。