小豆F2群体的简化基因组测序构建高密度SNP遗传图谱

小豆营养丰富、医食两用,在促进健康、改善膳食结构等方面具有重要作用。然而,小豆遗传研究相对缓慢,导致新基因发掘及资源利用效率低下,难以满足生产和市场的需求。 近期,中国农业科学院作物科学研究所食用豆种质资源研究程须珍课题完成的题为“Construction of a high-density adzuki bean genetic map and evaluation of its utility based on a QTL analysis of seed size”的研究论文在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 2021年7期正式发表。 该研究基于小豆F2群体的简化基因组测序构建了高密度SNP遗传图谱,标记间距离仅0.47 cM,并基于该图谱发掘出两个与小豆籽粒大小相关的主效QTL,分别位于LG2(22.1%) 和LG9(18.8%)。此外,......阅读全文

小豆F2群体的简化基因组测序构建高密度SNP遗传图谱

  小豆营养丰富、医食两用,在促进健康、改善膳食结构等方面具有重要作用。然而,小豆遗传研究相对缓慢,导致新基因发掘及资源利用效率低下,难以满足生产和市场的需求。  近期,中国农业科学院作物科学研究所食用豆种质资源研究程须珍课题完成的题为“Construction of a high-density

Nature-Genetics-|-迄今最大规模DNA甲基化QTL图谱

分子生物学领域内的一个重要课题是个体基因组特征,如单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP),与基因调控各层级之间的因果关联以及这种关联对表现型的影响机制。换句话说即是对表观修饰和基因表达等分子特征的遗传基础的解析。在这一研究方向上,最具代表性的范式无疑

什么是QTL

QTL是quantitative trait locus的缩写,中文可以翻译成数量性状座位或者数量性状基因座,它指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。对QTL的定位必须使用遗传标记,人们通过寻找遗传标记和感兴趣的数量性状之间的联系,将一个或多个QTL定位到位于同一染色体的遗传标记旁,换句话说,标

赤小豆的介绍

  赤小豆(拉丁学名:Vigna umbellata (Thunb.) Ohwi et Ohashi,[1]别名:朱豆),豆科豇豆属一年生半缠绕草本植物。它原产亚洲热带地区,朝鲜、日本、菲律宾及其他东南亚国家亦有栽培。  其茎纤细,羽状复叶具3小叶,小叶纸质,卵形或披针形,基部宽楔形或钝,全缘或微3

赤小豆的概述

  赤小豆(拉丁学名:Vigna umbellata (Thunb.) Ohwi et Ohashi,[1]别名:朱豆),豆科豇豆属一年生半缠绕草本植物。它原产亚洲热带地区,朝鲜、日本、菲律宾及其他东南亚国家亦有栽培。  其茎纤细,羽状复叶具3小叶,小叶纸质,卵形或披针形,基部宽楔形或钝,全缘或微3

赤小豆的简介

  赤小豆(拉丁学名:Vigna umbellata (Thunb.) Ohwi et Ohashi,[1]别名:朱豆),豆科豇豆属一年生半缠绕草本植物。它原产亚洲热带地区,朝鲜、日本、菲律宾及其他东南亚国家亦有栽培。  其茎纤细,羽状复叶具3小叶,小叶纸质,卵形或披针形,基部宽楔形或钝,全缘或微3

Nature-Genetics-|-何川团队绘制淋巴母细胞样细胞系QTL图谱

  N6-甲基腺苷(m6A)在调节信使RNA加工中起重要作用。尽管在该领域取得了快速进展,但对m6A修饰的遗传决定因素及其在常见疾病中的作用了解甚少。  2020年6月29日,芝加哥大学何川等团队在Nature Genetics 在线发表题为“Genetic analyses support the

赤小豆的分布范围

  中国南部野生或栽培。原产亚洲热带地区,朝鲜、日本、菲律宾及其他东南亚国家亦有栽培。[2]

赤小豆的种类介绍

  赤小豆与赤豆  赤小豆来源有二,功效应用大致相同,赤小豆偏凉,药用力优;赤豆甘平略偏于补,多当食物。二者已混用。  赤小豆与相思子  唐朝诗人王维有首脍炙人口的咏情诗:“红豆生南国,春来发几枝,愿君多采撷,此物最相思。”借物抒情表达相思,委婉含蓄,成为千古传诵的名诗。但王维所说的“红豆”是指豆科

赤小豆的药用价值

  【性味与归经】 甘、酸,平。归心、小肠经。  【功能与主治】 利水消肿,解毒排脓。用于水肿胀满,脚气浮肿,黄疸尿赤,风湿热痹,痈肿疮毒,肠痈腹痛。  【用法与用量】 9-30g。外用适量,研末调敷。  《神农本草经》言其“消热毒痈肿,散恶血不尽,烦满,治水肿及肌胀满”。《食疗本草》言其“甚治脚气

QTL定位的作图方法介绍

QTL 定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL 定位在遗传图谱上,确定QTL 与遗传标记间的距离(以重组率表示)。根据标记数目的不同,可分为单标记、双标记和多标记几种方法。根据统计分析方法的不同,可分为方差与均值分析法、回归及相关分析法、矩估计及最大似然法等。根据标记区间数可分为零区间作图、单区间

QTL定位的作图方法功能介绍

QTL 定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL 定位在遗传图谱上,确定QTL 与遗传标记间的距离(以重组率表示)。根据标记数目的不同,可分为单标记、双标记和多标记几种方法。根据统计分析方法的不同,可分为方差与均值分析法、回归及相关分析法、矩估计及最大似然法等。根据标记区间数可分为零区间作图、单区间

小豆制品废水处理设备

小豆制品废水处理设备工厂联系人:刘工183+5366+6893豆制品企业的废水主要来源于原料黄豆的浸豆、泡豆及压榨废水和冲洗废水,废水有机物含量高,可生化性强,是污染环境的高浓度废水。废水的污染物大都为可降解有机物,可生化性达到0.6—0.7,废水的C∶N∶P平均为100∶4.7∶0.7,适合微生物

Cell:通过QTL分析发现基因调控变异

  在高等生物中,许多重要生理性状及复杂疾病都是数量性状,如农作物的产量和人类的高血压、糖尿病等,这些复杂性状受到多个基因和环境因素的控制。为了有效地研究多基因控制的复杂性状,数量性状基因座(QTL)分析技术在20世纪90年代应运而生,有效地将控制数量性状的众多主效基因定位在相应的染色体上。  表达

QTL定位的作图方法分类及介绍

区间作图法(interval mapping,IM)Lander 和Botstein(1989) 等提出,建立在个体数量性状观测值与双侧标记基因型变量的线性模型的基础上,利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL 进行似然比检测,进而获得其效应的极大似然估计。其遗传假设是,数量性状

烟草所填补烤烟烘烤特性遗传分析研究空白

  近日,中国农业科学院烟草研究所和山东省烟草公司共同承担的中国烟草总公司科技重点项目“烤烟烘烤特性遗传分析及QTL定位研究”通过了由国家烟草专卖局科技司组织的项目鉴定。  鉴定委员会认为,该项目在烤烟烘烤特性遗传效应、高密度分子遗传连锁图谱构建、QTL定位及分子标记的挖掘与验证等方面取得了创新性成

小麦容重器在小麦QTL定位分析中应用

     小麦的容重是一个常见的使用标准在质量评价中,是指在一定的单位体积中小麦所具有的重量。因为小麦含有的胚乳在的比例比较大因此对于胚乳高的其容重值比较大,这样表皮层的含量少处分率比较高。通过小麦容重器的应用在相关的试验中发现容重值与食品烘焙的品质有很大的相关关系,并且是正相关,这也间接的反应了小

利用高通量3D模型分析叶片伸长的遗传控制(二)

试验结果表明,对于小麦和大麦,叶长的手动和数字测量之间高度相关(R2在0.97和0.99之间)。此外,Ward B等还检测到了特定于叶片伸长的QTL位点,而不是幼苗生长的QTL位点。尤其重要的是,在3H染色体上检测到一个特定于叶片伸长对盐胁迫早期反应的QTL位点,这是一个使用本研究开发的计算

重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位

连锁分析寻找QTL位点,是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前,构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记,过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序,区别在于标记数量的多

SSR分析技术介绍

微卫星标记(microsatellite),又称为短串联重复序列(short tandem repeats,STR)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成。由于重复单位的重复次数

你会选择QTL6021A液压油滤芯吗?

QTL-6021A是过滤清洁液压油的产品,同样液压油是液压系统的重要组成部分,不仅传递动力,还能润滑清洗液压元件,保养好液压油很关键,但选择液压油滤芯更不能大意。那么,如何为您的系统选择合适的QTL-6021A液压油滤芯呢?1、液压油滤芯的材料滤芯的材料,用于制造液压油滤芯,根据成本有所不同。金属材

组培培养室对小豆遗传性的研究分析

小豆在现代种植过程中出现了一些问题,其品质多样化的程度比较低,康生物和非生 物的胁迫能力比较弱,这极大的限制了相关产业的发展。所以利用现有的种质资源,选育优质品种是当前比较迫切的问题。对于小豆作物来说,目前还没有建立有效 的离体培养植株再生与遗传转化体系,限制了转基因技术在小豆作物遗传改良中的应用

中外科学家绘出小豆基因组草图

  中外科学家12日在美国《国家科学院学报》上报告说,他们已经绘制出小豆的基因组草图。这将有助于从基因水平上分析小豆性状,培育更多小豆新品种。   北京农学院和国际半干旱热带作物研究所等机构的研究人员利用第二代测序技术完成了小豆全基因组的测序,组装出了高质量的小豆基因组框架图,结果显示小豆有3.4万

麻黄连翘赤小豆汤治疗慢性荨麻疹体会

  麻黄连翘赤小豆汤治疗慢性荨麻疹体会    麻黄连翘赤小豆汤出自张仲景的《伤寒论·辨阳明病脉证并治》,可以解表散邪,清热除湿退黄,主治兼有表邪的湿热黄疸病证,原文记载有“伤寒瘀热在里,身必发黄,麻黄连翘赤小豆汤主之。麻黄连翘赤小豆汤方:麻黄二两(去节),连翘二两,杏仁四十个(去皮、尖),赤小豆

RFLP技术在作物育种上的应用与展望(二)

四、RFLP在作物遗传育种上的应用   1、分子水平上选择目的性状  RFLP图本身对植物育种并没有直接的用处,只有当它与经典标记即原已定位的基因结合起来 才有用,当确定哪一个RFLP标记与目的性状表现协同分离,即目的基因与RFLP的连锁,使得 对期望基因重组型的选择容易进行,在分子水

不容错过的SSR分析技术

  微卫星标记(microsatellite),又称为短串联重复序列(short tandem repeats,STR)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成。由于重复单位的重复次数在个

农科院构建首张苎麻分子标记遗传图谱

  中国农业科学院麻类研究所刘头明博士及其团队在苎麻产量性状的遗传研究方面取得新进展,构建了苎麻的首张分子标记遗传连锁图谱,并完成了苎麻纤维产量相关性状的数量性状位点(QTL)定位。图谱中的QTL将可以直接应用于苎麻的分子标记辅助选择育种。  苎麻是我国特色的天然纤维作物,其产量、品质等重要农艺性状

叶面积测量仪研究玉米穗三叶与QTL定位

高产是玉米育种永恒追求的目标,这也说明对于其产量的影响是有多重因素构成的。果穗产量性状是其直接表现。叶片是玉米光合作用的主要器官,叶面积是决定光 合产物的一个重要指标,对于产量形成具有重要的作用。通过叶面积测量仪研究表明,玉米穗三叶面积与玉米单株产量呈显著的正相关,其中穗位叶面积与产量关系最为密切。

杏果实性状遗传和QTL定位方面研究取得新进展

  近日,辽宁果树所李杏团队在国际植物学前沿期刊《植物科学前沿》(Frontiers in Plant Science)上发表研究论文。该研究对杏果实大小、可溶性固形物和果肉硬度进行了QTL定位,对培育优质耐贮新品种提供了理论基础。  杏主要种植在我国西北、华北、东北地区的干旱丘陵山区地带,近年来其

转录图谱的转录图谱的意义

在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D