中国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目
中国科学家22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目(Earth Microbiome Project，EMP)，并承担核心工作。该项目旨在全面、系统地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性，以便更好地造福人类。 与以往的微生物研究有所不同，该项目的研究对象不仅仅集中于海洋和人体环境中微生物群落，还包括土壤、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。该项目将对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或者宏基因组测序从而建立一个全球性的基因图谱。来自华大基因的中国科学家将会负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定，并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。这些信息学分析流程将为EMP产生的海量数据提供一个分析框架。 EMP的项目负责人、芝加哥大学和阿贡国家实验室的教授Jack A. Gilbert博士说：“华大基因在测序能力、测序技术发展和信......阅读全文
我国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目
近日，深圳华大基因研究院宣布，我国科学家将参与全球最大微生物基因组研究项目，对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或宏基因组测序，从而建立一个全球性的基因图谱，并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性研究全球范围内微生物群落功能及进化多样性，以便更好地造福社会及人类。 与以往的微
中国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目
中国科学家22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目(Earth Microbiome Project，EMP)，并承担核心工作。该项目旨在全面、系统地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性，以便更好地造福人类。 与以往的微生物研究有所不同，该项目的研究对象不仅仅集中于海洋和
华大基因发布基因组测序新成果
来自深圳华大基因研究院的研究人员，对4种代表性的弹涂鱼（mudskippers）进行了基因组测序，由此阐明了两栖鱼类适应陆地生活环境的分子机制。相关研究论文发布于12月2日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 深圳华大基因研究院的石琼(Qiong Shi)研究员
华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目
华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”)，将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定，并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序，以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 EMP将对来自全球的20万个样本进
2016热门基因组测序，华大基因风头劲
大千世界无奇不有，这都是进化的功劳。大航海时代，科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今，科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，华大基因参与的两项测序研究格外引人瞩目。 种属：大西洋鲑 基因组：2.97
华大基因发表宏基因组测序新成果
人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关，但揭示其中的因果关系并不容易。 2014年七月，华南理工大学、华大基因、哥本哈根大学等单位在Nature biotechnolog
基因测序找出肠道核心微生物群
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素
华大基因测序近700种植物的基因组
近日，华大基因的研究人员对云南瑞丽植物园内部及周边近700种植物的基因组进行了测序和分析。这项工作有助于推动地球生物基因组计划（EBP）以及万种植物基因组计划（10KP）。 在华大基因研究院副院长刘心的领导下，研究团队收集了761个植物样本，并产生了54 Tb的测序数据，每个物种的平均测序深
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
华大基因Cell子刊发表宏基因组测序新成果
人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。 微生物组研究过去主要依赖16S rDNA基因测序。随着测序成本的直线下降，针对整个菌群的宏基因组测序越来越受到青睐。目前，双胞胎
中外科学家全方位分析全球微生物群落
6月14日，第一届地球环境微生物计划(EMP)会议在深圳召开。世界各国科学家将携手全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能。项目将对全球典型的环境样本进行宏基因组测序，其中包括土壤、海洋、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。 会上，来自各国的专家学者相互分享了
第一届地球环境微生物计划会议在深圳召开
6月14日，第一届地球环境微生物计划(EMP)会议在深圳召开。世界各国科学家将携手全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能。项目将对全球典型的环境样本进行宏基因组测序，其中包括土壤、海洋、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。 会上，来自各国的专家学者相互分享了微生物
深圳华大基因研究院揭示女性生殖系统中微生物群
近日，深圳华大基因研究院贾慧珏研究组在《自然—通讯》发表文章，报告了女性生殖系统（从阴道到输卵管）中存在特殊微生物群。这些发现挑战了人类胚胎发育在无菌环境下开展的传统观点。该研究还表明这些微生物群落中的变异与某些子宫病症相关，或许能用作某些疾病的生物标记。 已知阴道中有大量微生物，但在无感
华大基因与SAMRC合作建成非洲首个高通量基因组测序中心
近日，南非医学研究理事会（SAMRC）基因组学中心在开普敦正式启用，成为非洲首个高通量基因组测序中心。 南非医学研究理事会（SAMRC）成立于1969年，是南非卫生部下属机构，旨在通过研发和技术转移，改善南非人口健康，使民众能够享受到更好的生活质量。SAMRC主要研究领域包括结核病、艾滋病、心血管
Eppendorf参加第一届地球环境微生物计划（EMP）会议
中国 深圳(2011年7月5日) 6月13-15日，全球领先的生物技术公司Eppendorf参加了由深圳华大基因、基因组标准协会(GSC)和地球环境微生物联盟(EMP)共同举办的 “第一届地球环境微生物计划(EMP)会议”。一直以来Eppendorf公司和地球环境微生物联
华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪更全面的基因组研究服务
2015年12月24日，中国深圳--全球最大的基因组研发机构华大基因今天宣布与实时单分子测序技术（SMRT）领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司（Pacific Biosciences of California, Inc.，以下简称PacBio）再次合作，购入亚洲第一台Seque
华大基因推出桌面化测序仪
日前，华大基因推出一款桌面化的测序仪系统bgiseq-500，这是继前不久推出完全集成式的“超级测序仪”revolocitytm之后，华大基因第二款基于completegenomics技术的测序系统。与前者的大容量不同，bgiseq-500是一套小巧的集成桌面测序解决方案，可自动进行样本制备、测
解密“全球最大测序机构”华大基因
在深圳，背靠盐田青翠的北山，有这样的一家基因测序机构，基因测序规模在全球达到最大。 它是华大基因。有人说它会是下一个华为，下一个腾讯。 它的员工平均年龄不到27岁，每个月平均却有3份学术论文登上“CNNS（即《Cell(细胞)》、《Nature（自然）》、《NEJM（新英格兰医学杂志）》、《
基因测序找出肠道核心微生物群－有助于判断多种疾病
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素、
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章，介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为，单分子测序数据能降低测序费用，并带来更多完整的基因组，改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降，测序项目的数量也在不断上升。G
华大基因人类基因组测序启用27台SOLiD4系统
深圳华大基因研究院(BGI)与Life Technologies 公司近日共同发布新闻，宣布其在应用SOLiD 4系统进行人类全基因组测序中的合作关系。华大基因作为全球最大的基因组学研究中心之一，将添置27台SOLiD 4系统。该组高通量测序仪的测序能力可以在一个月内实现50个人类全基
PNAS：与珊瑚有关的微生物群的宏基因组学
对珊瑚礁相关微生物群落的一个大尺度宏基因组学调查表明，这些微生物的分类学组成最多地受到了珊瑚和水藻等深海底大生物体的影响，而它们的代谢特化随着局部海洋学状况而变化。微生物群落影响相关珊瑚礁的健康，但是支配微生物群落结构和基因流的机制在很大程度上仍然未知。 Linda Wegley Kelly
华大基因自制产品“超级测序仪”亮相
6月6日，华大基因全资子公司、总部位于美国加利福尼亚的CG在欧洲人类遗传学会议上首次推介该公司新推出的完全集成式的“超级测序仪”Revolocity，并宣布澳大利亚健康服务公司Mater和荷兰奈梅亨大学医学中心成为Revolocity测序系统的首批用户。 新面世的Revolocity系统结合了
华大基因Nature－Genetics发表重要测序成果
Nature Genetics杂志十一月十六日连发两项测序研究，揭示了一个复杂表型差异的简单遗传学基础。研究显示，流苏鹬的复杂交配策略取决于一段被称为超级基因的DNA。华大基因Xin Liu领导的研究团队参与了流苏鹬的全基因组测序。 流苏鹬（Philomachus pugnax）在北欧和亚洲的
华大基因：挖掘基因测序的“超级金矿”
日前公布的2012年度深圳市科学技术奖拟奖名单上，奖金高达100万元的“市长奖”拟颁给一个37岁的年轻人;去年底，英国《自然》杂志评选出2012年科学界年度十大人物，他又是唯一入选的中国人。这个年轻人，就是华大基因研究院院长王俊。 他所在的深圳华大基因，没有享受到任何财政拨款，却坐上了《自
Nature报道华大基因收购美国测序公司
自2009年开始基因组测序以来，总部在加州山景城（Mountain View）的DNA服务公司Complete Genomics因其技术获得了良好的口碑，但在商业方面取得的成功却微乎其微。研究人员对其以最小错误生成完整人类基因组读数的能力非常看重，然而在2011年该公司高达7230万
全球微生物模式基因组测序计划获进展
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在线发表了国家微生物科学数据中心（中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心）关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株（t
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
Nature－Methods发布宏基因组测序新工具
微生物几乎是无所不在的，它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏，因为许多微生物是无法在实验室中培养的。宏基因组学是了解这些微生物的重要途径，但宏基因组测序并不是一件容易的事儿，就像是把许多拼图拆散混在一起，然后在毫无参考的情况下拼接。 最近Nature
第七届国际基因组学大会在香港成功召开
2012年11月29日至12月1日，为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办，《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港，共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展，并深入探