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中外科学家全方位分析全球微生物群落

6月14日,第一届地球环境微生物计划(EMP)会议在深圳召开。世界各国科学家将携手全方位分析全球范围内微生物群落的多样性及功能。项目将对全球典型的环境样本进行宏基因组测序,其中包括土壤、海洋、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。 会上,来自各国的专家学者相互分享了微生物学在生态、健康、医学、工业、农业等各领域中最新的学术成果以及微生物基因组学的应用。《大规模和小规模研究相结合揭示土壤微生物多样性》《第一届地球环境微生物计划:10000个样本的初步研究》《大豆结瘤的土壤宏基因组学研究》《基于主要衣壳蛋白基因g23分析基础上的T4噬菌体的全球性分布》《水生生物的环境微生物计划的研究——具有最多微生物的生态系统》等报告引起了与会者的关注。华大基因执行总裁王俊结合华大参与的德国致病性大肠杆菌项目和人类肠道宏基因组项目,介绍了人肠道微生物和环境宏基因组学之间的联系。 共有中外100多位专家学者参加了此次......阅读全文

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

第七届国际基因组学大会在香港成功召开

  2012年11月29日至12月1日,为期三天的第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港九龙成功召开。本次会议由华大基因主办,《GigaScience》杂志协办。来自全球300多名专家学者云集香港,共同探讨了基因组学、生物信息学、云计算、生物伦理等研究领域内的最新进展,并深入探

首届国际基因组学大会美洲分会在费城成功召开

  2012年9月27日至28日,为期两天的首届国际基因组学大会美洲分会(The International Conference on Genomics in the Americas,ICG Americas 2012)在美国费城儿童医院(CHOP)成功召开。本次会议由华大基因与费城儿童

如何测人体最大微生态库?下一代测序来帮忙

  在人体中最大的微生态库是生活在人体消化道微生物复合群落组成的肠道菌群,别看人体肠道所占体积不大,但是人体肠道内寄生着10万亿个细菌,它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险,还能控制人体对癌症治疗药物的反应。  人体肠道的正常微生物,如双歧杆菌,乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育

Science:宏基因组学测序技术

  宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。   长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua

宏基因组学:查明微生物身份新手段

  背景   《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以

DGGE技术在微生物生态学中的应用

  在自然界中存在大量丰富的微生物资源,但目前被人们所培养利用的仅仅占1%~10%,还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展,微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序

DGGE技术在微生物生态学中的应用

在自然界中存在大量丰富的微生物资源,但目前被人们所培养利用的仅仅占1%~10%,还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展,微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenza

2014年中国十大生物芯片企业排名

生物芯片,又称蛋白芯片或基因芯片,它们起源于DNA杂交探针技术与半导体工业技术相结合的结晶。生物芯片技术是近几年才发展起来的高通量检测技术,它利用微电子、微机械、物理化学技术、计算机技术在固体芯片表面构建的微流体分析单元和系统,将生命科学研究中不连续的分析过程(如样品制备、化学反应和分析检测)连续化

一文了解我国肠道微生物行业的产业现状

   人体是由自身细胞及共生的大量微生物细胞所共同组成的复杂共生生命体。人体肠道微生物数量庞大、种类繁多,被称为“第二基因组”。在人体微生物组学中,96-99%的微生物聚集在胃肠道,肠道微生物与机体健康有着极为密切的联系。  本文,我们整理了肠道微生物行业的产业现状,包括肠道微生物的应用场景、产业化

Cell:王俊访谈——勇气是科学之源

  为了庆祝成立40周年,《细胞》期刊(Cell)邀请了全球40位40岁以下的生物领域科学家,共同探讨科学见解、个人哲学、研究乐趣、面临的挑战和他们实验室外的生活。华大基因院长王俊也受邀分享他对科学的见解。   Q1:哪些问题在激励着你的团队?   王俊:最关键的一点是,基因组技术如何造福社会。

代谢组学与临床医学的研究进展

  人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(system

采用新一代测序法的宏基因组学研究

直到不久之前,宏基因组学研究还因为高费用、低流通量以及在应用Sanger-方法克隆步骤中出现的结果不准确而受到限制。而今借助于新一代序列测定方法即可获得宏基因组样品全面的图像。宏基因组学研究(metagenomics)是指研究一种复杂微生物群体在其生命空间的全部基因信息。研究的主要目的在于刻画

“十二五”国家计划农村领域2013年度备选项目征集

  为深入贯彻《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》和2012年中央一号文件精神,做好2013年农村领域备选项目公开征集工作,按照科技部关于《农村领域国家科技计划管理改革暂行办法》,制定本指南。   一、推荐领域与方向   专题1:生物种业   (一)研究方向:超级稻新品

组学期刊三巨头:《基因组、蛋白质组与生物信息学报》

近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄  从编委到现任执行副主编,美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics,以下简称GPB)期刊结缘已近10年。前些年,该刊编辑部不时找他约稿子,以解“缺

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

2012中国医学科学院蛋白质组学研讨会大会报告

  2012中国医学科学院蛋白质组学研讨会于2012年11月28日在北京召开,来自相关领域的专家学者300余人出席了本次研讨会。会议邀请了强伯勤院士、何大澄教授等8位从事蛋白质组学及疾病研究领域的著名学者,作了关于蛋白质组学和基因组学、代谢组学等相关的精彩报告

《自然》:中美科学家联合绘出番木瓜基因组草图

记者从南开大学了解到,中美科学家在世界上首次绘制完成一株转基因经济作物的全基因组图谱。这篇名为《转基因热带水果植物——番木瓜的基因组草图》的成果发表在4月24日出版的国际权威科学杂志《自然》上。 这项转基因经济作物的全基因组图谱研究成果,对农作物育种、农业生产和人类对转基因植物的认识具有极

基因检测:NGS在病原微生物检测中的应用

文章导读  感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病。目前,全球感染性疾病的发病率有所上升,病原体呈现多样化和复杂化的发展趋势。近年来快速发展的NGS技术因其不依赖于已知核酸序列,无需特殊探针设计,可直接对未知病原微生物进行检测,打破了传统微生物检验的局限性,在临床微生物领域展现了广阔的前景。

微生物在生物技术时代捷足先登

  从DNA重组到细菌基因组计划,从微生物代谢工程到酶工业,从微生物肥料到土壤修复。可以说,现代生物技术的高速发展,离不开微生物。   “凭借着生长速度快、结构简单、易操作等特点,微生物学成为生物技术的基础学科,微生物也是生物产业中不可替代的基本材料。”在接受《中国科学报》记者采访时,中

2016(第四届)分子诊断产业高峰论坛

  自2010年起,易贸医疗连续七年举办体外诊断产业高峰论坛,打造中国体外诊断行业第一高端首脑峰会;自2013年起,易贸医疗聚焦分子诊断细分市场,开创分子诊断产业高峰论坛,立足新技术研发和临床转化,促进新兴细分市场的跨界交流与合作。   2015年,基因检测行业在政策、技术、临床监管层面,获得突破

媒体误读 雾霾中的耐药基因其实并不那么可怕

  瑞典研究人员在日前的一篇论文中提到,从北京一次雾霾天的14份空气样本中检测出抗生素耐药性基因。国内有媒体在报道中就此推论出呼吸这样的空气会导致药物失去作用的结论。消息一出,引发舆论广泛关注,有人甚至担心呼吸这样的空气会被感染致病。那么,真会如此吗?本报带你一起探究真相。  疑问:空气中的耐药基因

科学家发现奇异基因序列或来自全新生物域

沃斯的“三域说”是目前生物分类界的主流学说。  “科学坏小子”文特尔(左)参与了这次的研究项目。  在过去的近300年中,生物分类法从两界、三界一直被扩充到六界三域,分类系统不断被改写。然而,演化树的改写可能还会继续下去。美国加州大学基因中心和文特尔研究所对海洋水样本中的DNA序列分

为什么代谢组学会成为最炙手可热的课题之一?

  代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”,自1999年以来,每年发表的代谢组学研究的文章数量都在不断增加。代谢组学在新药的安全性评价,毒理学,生理学,重大疾病的早期诊断,个性化治疗,功能基因组学,中医药现代化,环境评价,营养学等科学领域中都有着极其广泛和重要的应用前景,是一

中美携手合作“十万食源性病原微生物基因组计划”

  5月28日,北京诺赛基因组研究中心(国家人类基因组北方研究中心)、北京师范大学、中国科学院微生物研究所与美国加州大学戴维斯分校在北京师范大学就“十万食源性病原微生物基因组计划”达成合作协议。据悉,中美双方将共同参与十万食源性病原微生物基因组计划的研发,建立重要的食源性致病微生物基因序列综合数据库

利用现有技术,如何鉴定一个全新的病毒

80年代的技术很经典,但那时分子生物学不够发达,现在方法有无进步呢?如何利用现在的技术来鉴定全新的病毒呢?有此想法很久了,可一直未搞清楚。这也跟如何发现一个新基因的道理是相通的。这是真正创新的基础。网友alishang:我先来最简单的:      1

中科院-阿德莱德大学基因组学研讨会在京召开

  6月8日,在中科院国际合作局和生命科学与生物技术局的支持下,中科院-阿德莱德大学基因组学研讨会(CAS-Adelaide Seminar on Plant/Animal/Human Genomics)在中科院北京基因组研究所(下称:基因组所)召开。阿德莱德大学、阿德莱德癌症生物学

2018人体微生态与健康论坛圆满闭幕

  11月11日,精彩纷呈的中国生物工程学会第十二届学术年会在一片掌声中落下了帷幕。作为此次年会的重要分论坛之一,由中国生物工程学会微生物组学与技术专业委员会(筹)与商图信息BMAP共同主办的2018人体微生态与健康论坛聚焦近年来大热的微生物研究与产业转化,开展了12场精彩的专题讲演。中国科学院微生

口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析

  2015年7月28日,北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎(RA)口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节,并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。  RA是一种致