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一种罕见的南极微生物为揭示病毒来源提供线索

病毒是古老、简单的生命形式,还是细胞进化后出现的寄生生物?它们来源于何处,一直是令生物学家困惑的问题。 最近,澳大利亚新南威尔士大学的里卡多·卡维切奥利和他的同事在临近南极洲海岸的劳尔群岛湖泊中,发现了一种或许能为解决上述问题带来一些曙光的微生物。这是一种古生菌,看上去像细菌的单细胞生物,但实际上属于一个单独的生命领域。 研究人员在这种生物体的细胞内发现了一些意想不到的东西——质粒。质粒是存在于活体细胞的小型DNA片段,通常呈圆形。它们并不是细胞主要基因组的组成部分,但能独立地自我复制。通常,质粒携带着以某种方式对细胞有用的基因,比如,对抗生素有抗药性的基因有时会在质粒上被发现。 研究团队把这次发现的质粒命名为“pR1SE”,它携带的基因使其能产生囊泡——主要由脂质构成的气泡。通过被包裹在具有保护性的气泡中,pR1SE能离开它的宿主细胞去寻找新的宿主。换句话说,pR1SE的外表和行为很像病毒,但它携带着仅在质粒上发现的......阅读全文

Science子刊:在深海中,病毒对古生菌进行大屠杀

  根据一项新的研究,在深海沉积物的微生物群体中,古生菌(archaea, 也译作古细菌)遭受的病毒感染频率通常是细菌的两倍,尽管后者更加丰富。考虑到深海生态系统的巨大规模,这一结果表明古生菌-病毒关系可能是全球生物地球化学循环的主要促进者。相关研究结果发表在2016年10月12日那期Science

粪便移植,移植了什么?

  由美国凡德比特大学研究人员发表的论文《粪便移植,移植了什么》表明弄清楚粪便中的微生物种类及非微生物成分,或对粪便移植至关重要。研究发现粪便中含有细菌,病毒,真菌,古生菌,原生生物及食物代谢物。  人们很少会去考虑自己粪便中都含有些什么。但弄清楚粪便成分对粪便移植至关重要。粪便移植,顾名思义就是将

《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题

  它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。  Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人,但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系统的那一天。他在评估地中海嗜盐菌的基因测序数据,注意到14个不寻常的

《自然》文章盘点关于基因“剪刀”的五大谜题

原核生物利用CRISPR-Cas抵抗在细胞上形成图中结构的病毒。 它是个非常了不起的工具。我想知道这个系统从头到尾如何工作。Francisco Mojica并非第一个看见CRISPR的人,但他可能是第一个为它着迷的人。他还记得1992年当他首次瞥见可能引发一场生物技术革命的这个微生物免疫系

乙烷消失的“幕后推手”是谁

  在自然界,许多有机物的生物降解需要氧气来提供能量。  然而,自然界还普遍存在着无氧或缺氧环境,微生物如何在这样的条件下活下去,并且有效处理环境中的“疑难杂症”,其背后机制是科学家们一直想要解析的生命奥秘。  无氧或缺氧,科学上被称为厌氧。  近日,中国科学院生态环境研究中心研究员朱永官团队参与的

纳米二次离子质谱技术在 微生物生态学研究中的应用

纳米二次离子质谱技术(NanoSIMS)在 微生物生态学研究中的应用氮(N)、碳(C)、硫(S)等生命元素的生物地球化学循环过程主要由微生物所驱动。 耦合分析自然环境中 微生物遗传多样性与其代谢多样性是当今微生物生态学研究的难点和热点。 自然环境中的微生物多样性极 为丰富,每吨土壤中的微生物类

自然界神奇“偷基因”生存策略:给物种带来顽强生命力

  据国外媒体报道,世界上最顽强的生命形式是什么?科学家们在寻找这一问题答案的过程中,发现了自然界一种“偷”的生存策略。一些生物可以生存于极热、极寒、极酸、极毒的极端环境中,比如美国黄石国家公园沸腾的温泉中的一种水藻,它的生存秘密就是从其它生命形式那里偷来生存的必要基因,而不是从父辈那里遗传。这种“

4月5日《科学》杂志内容精选

  极端微生物可处理高氯酸盐   一项新的研究揭示,被称作闪烁古生球菌的古生菌可在极端炎热的条件下茁壮生长,并且为了生长它还会还原有毒的氯酸盐和高氯酸盐。在此之前,只有少数种类的细菌被证明会还原氯酸盐和高氯酸盐。但是Martin Liebensteiner 及其同事用闪烁古生球菌进行

2013年04月05日《科学》杂志精选

  封面故事:类似生物组织的3-D印刷材料  A Tissue-Like Printed Material  新的研究显示,一种三维材料可能在未来模仿组织中细胞的行为。由Gabriel Villar及其同事研发的组织样材料具有软橡胶的密实度,并且其质地与大脑和脂肪组织相似。研究人员的目标是最终构建可

科学家发现细胞进化缺失环节 或填补生命起源研究空白

  发表在《自然》杂志上的一项研究称,新发现的一种微生物极有可能代表着从单细胞到复杂细胞进化过程中所缺失的一环。它的发现填补了生命进化过程中一个空缺已久的“真空地带”,有望为揭示复杂生命的起源和演化带来全新见解。  细胞是地球上所有生命的基本组成部分。细菌和微生物的细胞小而简单,而包括人类在内的,所

研究发现分娩方式影响新生儿胎便微生物群落

  近日,昆明理工大学柳陈坚教授课题组在the Lancet(柳叶刀)子刊EBioMedicine最新一期(2019.11)发表高水平研究论文“Is the delivery mode a critical factor for the microbial communities in the me

人体内的微生物菌群与出生方式有关?

  近年来,人体内微生物菌群的数量及它们的重要性逐渐引起人们的关注。  人体内生存着数以万亿计的细菌及其他单细胞微生物,例如古生菌和原生生物,其中大多数位于肠道内。据估计,它们的数量甚至超过了人体自身细胞的数量。  众所周知,人体内的微生物生态系统对我们的健康有深远的影响。  人体微生物研究工程(H

盘点:Nature杂志5月亮点研究速览

  【1】合成生物学:一个用来控制转基因生物的内置毁灭开关  Nature Communications DOI:10.1038/ncomms7989  Nature Communications在线发表的一篇论文介绍了一个基于CRISPR的内置器件,它设计用来专门破坏转基因生物的特定DNA序列。控

本期《自然》《科学》精选

10月4日《Nature》   封面故事: 纪念“太空竞赛”50周年“太空竞赛”今天是50周年。1957年10月4日(星期四),前苏联发射了第一颗人造地球卫星,让世界为之震动。不管是第一颗人造地球卫星还是前苏联都没有能够穿越时间的长河维持到今天,但前苏联的精神似乎在这一古老帝国核心地区

《科学》:太平洋海底发现上千种新型微生物

美国海洋生物学家在太平洋的俄勒冈州沿海的深海热液喷口发现了上千种微生物新物种。参与该项研究的科学家来自于缅因州的伍兹霍尔海洋生物实验室以及华盛顿大学的大气和海洋联合研究所。 利用一种被称为“454标签测序法”的新型分析技术,科学家们分析了微生物和古生菌的1百万个DNA序列。这些DNA取自于

Nature突破性成果:首次证实南极冰层之下也有生命

  科学家们首次发现,西南极冰盖半英里之下也存在着生命,而且这些生命组成了活跃的生态系统。这一重大成果发表在八月二十一日的Nature杂志上。  南极位于地球的最南端,是世界上发现最晚的大陆,覆盖着厚度极高的冰层。研究显示,在庞大的南极冰盖之下,生命以微生物的形式存在。这些微生物大多是单细胞的古生菌

2月3日《科学》杂志精选

   吸毒成瘾者与他们的兄弟姐妹都有相同的脑部异常   据研究报道,吸毒成瘾者和他们的无成瘾的兄弟姐妹在控制自身冲动上的能力相对较差,他们还共有一些在其他健康人中所没有发现的、脑部特征。因此这些脑部异常可能是一种遗传的、容易对毒品成瘾的标记——尽管这是一个可以克服的问题。

7月25日 Nature 杂志生物学精选

  未培养微生物的基因组   现有基因组序列只能让我们对微生物引人注目的多样性有一个很有限的认识,因为它们中绝大部分从未被培养出纯培养物。在这项研究中,Tanja Woyke 及其同事利用单细胞基因组学方法来研究和测序来自九个多样化生境的 201 种未培养的古生菌和细菌细胞。该信息显示了无

454高通量测序-研究土壤微生物的新手段

在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段

  在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环的

细菌的概述

细菌的概述:细菌(英文:germs;学名:bacteria)是生物的主要类群之一,属于细菌域。广义的细菌即为原核生物, 是指一大类细胞核无核膜包裹,只存在拟核区(nuclear region)(或拟核)的裸露DNA的原始单细胞生物,包括真细菌(eubacteria)和古生菌(archaea)两大类群

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段(二)

二、高通量测序在土壤微生物研究中的应用 1.1 研究土壤微生物的物种多样性 微生物物种多样性主要从对微生物类群即细菌、真菌和放线菌这三大类群的数量及其比例组成来描述微生物多样性,或者按照微生物在生态系统中的作用将其划分成不同的功能群(function group),通过某

弥补原核与真核生物进化上的裂隙

  沿北冰洋大洋中脊(Arctic Mid-Ocean Ridge)的沉积物中发现了一组新的古菌(archaea),一种新的生命形式可能有助于解决困惑现代生物界最持久的一个谜团。  地球上的生物皆可以被分成原核生物和真核生物两大类,前者结构简单,后者常更加复杂。这两类生物细胞间存在差别的显著,对于如

巨型病毒点燃进化树之争

  进化生物学家从来都不知道是什么制造了病毒,对它们的起源争论了十几年。但一组叫作Klosneuviruses的巨型病毒的新发现可能是“缺失的环节”,有助于解决争论——或者引发更多的争论。  2003年,研究人员报道发现了巨型病毒,并将其命名为Mimiviruses。其携带的基因表明,它们的原型可以

加州大学研究显示:微生物占据人类身体过半区域

  据英国广播公司(BBC)报道,科学家表示,微生物占据人类身体的过半区域,人体细胞仅占全身细胞总数的43%。图片来源于网络  基于对人类身体中鲜为人知的部分,即微生物群的了解,人们对过敏和帕金森病的认识也有迅速的转变。同时,该研究领域甚至提出了“人类”意味着什么的问题,以及由此可能产生的创新疗法。

年终盘点:2018肠道微生物重要研究盘点

  在人体肠道内的微生物中,超过99%都是细菌。人体正常的肠道细菌种类有500~1000 种。人肠道中的细菌细胞数达100万亿个,占人体总微生物量的 78 %,然而人体细胞总数也不过10万亿个,这意味着胃肠道内的细菌总数比人体细胞总数还多10倍。  肠道细菌不仅数量庞大,种类也繁多。占主要地位的是厚

你还在“谈菌色变”吗?

  生活中很多人“谈菌色变”,觉得细菌就是肮脏的代名词,是传播疾病的媒介。事实上,细菌也分为有益的和有害的,不仅我们生存的环境中到处都是细菌,而且我们的身体上就居住着无数的细菌。  我们生活的环境离不开细菌。从我们呼吸的空气,到辽阔的大海,都充满了细菌。  大约在30亿年前,地球本是无氧的环境。而地

共享“甜蜜” 2020年全国糖生物学会议无锡召开

  分析测试百科网讯 2020年9月20日-21日,2020年全国糖生物学会议在无锡君来世尊酒店召开。本届糖生物学会议由中国生物化学与分子生物学会糖复合物专业委员会主办,江南大学生物工程学院、糖化学与生物技术教育部重点实验室承办,分析测试百科网协办。大会主持人:江南大学糖化学与生物技术教育部重点实验

基因编辑器:编出新生命

          细菌也有敌人,其最大的敌人之一是噬菌体,因为后者可以进攻和吞食细菌。面对攻击,细菌最有效的还击是,“祭”出一种武器CRISPR,以保护自身。CRISPR有些拗口,称为规律成簇间隔短回文重复,实际上就是一种基因编

南极罕见微生物或可揭示病毒起源

  英国《自然·微生物学》杂志近日发表的一篇论文称,科学家在南极发现一种独特且罕见的微生物,对该微生物的分析能为进化中最大的奥秘——病毒的起源提供极其重要线索,有助于解决病毒如何首次出现的谜团。  病毒不同于其他生命形式。所有其他的生命形式是由细胞构成的,细胞是复杂的机器,可以独立生存和繁殖。病毒却