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非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性

南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划(SAHGP)”,顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序,证实非洲人群存在高水平的遗传多样性,研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。 该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究,旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征,全方位发掘各类人群的多样性。研究由南非金山大学实施,来自4个省份、讲4种民族语言的24名南非人作为样本采集对象,包括16名黑人以及8名混血或有色人种。金山大学研究团队利用所获得的全基因组测序数据,开展了语言群体与遗传聚类之间的相关性研究,并分析了这些个体的祖先构成。 研究显示,讲Nguni语与讲Sotho-Tswana语的人群之间虽然只有短暂的地理和文化分隔,但已出现可测量的遗传差异。这些差异部分是由于不同地区祖先造成的结果,也有遗传漂变的影响。从祖先构成来看,父系祖先几乎全是非洲裔,而母系祖先多为Khoesan族(注:Khoesan为非洲南部的土......阅读全文

华大基因与SAMRC合作建成非洲首个高通量基因组测序中心

近日,南非医学研究理事会(SAMRC)基因组学中心在开普敦正式启用,成为非洲首个高通量基因组测序中心。  南非医学研究理事会(SAMRC)成立于1969年,是南非卫生部下属机构,旨在通过研发和技术转移,改善南非人口健康,使民众能够享受到更好的生活质量。SAMRC主要研究领域包括结核病、艾滋病、心血管

南非新冠病毒变体快速传播 这些需要值得注意!

  上周,南非研究人员公布了一种正在快速传播的新冠病毒变体。该变体发现于南非对新冠病毒的日常基因监测中,先出现于沿海,后往内陆扩散,目前被命名为501Y.V2。  该变体与本月早前在英国发现的B1.1.7变体并不相同。但南非科学家将两种病毒变体的基因组序列比较后,发现二者在病毒S蛋白受体结合区域(R

中国科学报:耐药性带来的全球危机

乌干达里拉一名结核病患者的胸腔X光片。全球每年新增结核病病例的80%来自于22个国家,乌干达是其中之一。 图片来源:J. MATTHEWS/PANOS 表格为结核病近年来的病例数量趋势,以及与HIV共同感染的病例数量趋势;图为新型多重耐药性结核病病例在全球的分布情况。图片来源:WHO   在与

植物所破解优质蛋白玉米育成之谜

  2020年1月7日,《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心巫永睿研究组和上海交通大学农业与生物学院王文琴研究组合作的题为Long-read sequencing reveals genomic structural variati

非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性

  南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划(SAHGP)”,顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序,证实非洲人群存在高水平的遗传多样性,研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。   该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究,旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征,全方位发掘各类人群

速览美媒发布2019十大食品安全新闻事件

  近日,美国食品安全新闻(Food Safety News)回顾了2019年十大食品安全新闻事件。以下对这十大事件做了简短的介绍。  1. 联邦食品安全官员对疫情保密  美国食品药品管理局(FDA)对于与生菜有关的疫情保密了六个多星期,联邦政府内外的很多人都知道这次秘密爆发,但并未告知公众和媒体。

非洲受到3700万美元资助启动基因组学项目

一个主要目标是建设非洲遗传学家的能力  在人类基因组的首张草图完成10年之后,非洲希望用6月22日宣布的一项伙伴关系加入到基因组学革命中来。  由美国国立卫生研究院和英国医学慈善机构威康信托基金会资助的价值3700万美元的非洲人类、遗传与健康项目(H3Africa)将让非洲科研人员在

DNA测序揭示早期人类如何在非洲扩散

  关于古代人类DNA的研究并不是一项享有平等机会的努力。过去10年间,早期欧洲人和亚洲人的部分基因组被测序了上百次,欧亚历史也在这个过程中得以改写。然而,由于基因材料在温暖、潮湿的气候中衰变得非常迅速,因此时至今日,科学家仅测序了一种古代非洲人类的DNA。  近日,在美国得克萨斯州奥斯丁举行的分子

我国首次成功分离出裂谷热病毒

  近日,国家质检总局成功从全国首例输入性裂谷热患者样本中分离出裂谷热病毒,与此同时,军事医学科学院也成功分离获得裂谷热病毒,这是我国首次分离得到裂谷热病毒。  我国从未有过裂谷热的病例报道,也没有相应毒株,无法开展传播机制和致病机理研究,亦无相应疫苗、药物和诊断试剂。裂谷热病毒的成功分离,将为病毒

遗传多样性缺失导致少量人种被忽略 基因组学应包容性

  一个来自被忽略人种的研究  几十年来,Néstor Ruiz Hernández一直在争取认可。他在墨西哥南部太平洋沿岸的一个小镇长大。在那里,他和其他许多人都是十六世纪被人贩子从非洲贩运到墨西哥的奴隶的后代。他们认为自己是Afromexican,但该组织并未被墨西哥政府正式承认为少数族裔群体。

Nature推翻旧观点,最古老的智人并非起源于东非

  研究人员说,我们在一个不太可能的地方发现了最古老的智人(Homo sapiens)。  关于智人最早出现的时间科学界有许多不同的推测,通常认为是在20万年前,通过化石和DNA分析,认为他们起源于东非。  两个已知的最古老的智人化石分别来自埃塞俄比亚的两颗19万6千岁和16万岁的颅骨,人们根据如今

全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染情况

  最近,发表在《PNAS》杂志上的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。  该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早

PNAS:全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染

  最近,发表在PNAS的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。  该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早期发现和遏

基因序列揭示非洲人早期历史

  人类在非洲的早期历史正日益成为人们关注的焦点。一项新的研究对源自这片大陆的十几个族群的180个基因组进行了研究,其中一些基因组之前从未被分析过。  初步研究结果表明,在4万多年前,其中两个族群(桑人和巴卡人)的规模相当于当时其他族群的两倍,并且这两个族群生活在中东部非洲或南部非洲。  研究人员在

最新Nature公布两大基因组测序结果

  6月11日的Nature杂志公布了两项重要的基因组测序结果:巨桉树基因组,以及栉水母“太平洋侧腕水母”的基因组,这些遗传信息的解析将有助于我们更深入的了解生物功能基因变异,以及相关经济产物的作用机理。  来自佛罗里达大学的研究人员发表了栉水母“太平洋侧腕水母”(Pleurobrachia bac

蝙蝠身上发现新型冠状病毒

  美国和乌干达研究人员4月4日说,他们在乌干达蝙蝠身上找到了与中东呼吸综合征病毒类似的一种新型冠状病毒,为此类病毒源自蝙蝠的观点提供进一步支持。但科学家强调,与中东呼吸综合征病毒不同,这种新病毒可能不容易传播至人身上。  研究人员当天在美国《微生物学》网络杂志上报告说,这种新型冠状病毒被命名为PD

The scientist:2013年度最热基因组

  新的一年即将来临,The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究,让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。   斑马鱼基因组   种属:Zebrafish, Danio rerio   基因组大小:~1.41 billion base pairs   斑马鱼(Da

盘点最新基因组测序成果

  the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者:  种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae)  基因组:~2.86 billion bp  人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年

2013年04月18日《自然》杂志精选

  封面故事:非洲腔棘鱼基因组已被测序  The African coelacanth genome provides insights into tetrapod evolution  本期封面照片是由Laurent Ballesta在南非的“索德瓦纳湾”拍摄的一条非洲腔棘鱼和一个潜水员。1938

美国未来五年瞄准人类健康新挑战

   日前,美国国立卫生研究院(NIH)发布《美国国立卫生研究院整体战略规划(2016~2020财年):将发现转变为健康》,新的战略规划旨在确保该机构在生命科学变革时代处于有利位置,并有效利用科学探索的新机会,以解决人类健康的新挑战。  NIH是全球最大的生物医学研发和资助机构,其使命是探索有关生命

我国首例输入性裂谷热病毒全基因组序列测定完成

  记者从国家质量监督检验检疫总局获悉:7月24日凌晨,该局和军事医学科学院微生物流行病研究所联合攻关,获得了我国首例输入性裂谷热病例的病毒全基因组序列。  “测序结果确认了该输入性病例为非洲流行的裂谷热病毒感染所致。”军事医学科学院微生物流行病研究所研究员童贻刚告诉科技日报记者,经测定,该病毒基因

非洲基因组学研究有助制定精准公共卫生政策

  过去5年,国际基金组织已经投资了超过1亿美元的项目来推动非洲基因遗传学研究,有望借此改善对非洲人以及在欧洲和美洲的非洲人后裔的治疗手段。现在,第一轮7000万美元资助发放完毕后,英美两国共同发起的“非洲人类遗传与健康计划项目”第二轮6400万美元项目资金正在接受申请。  虽然有人认为,这笔钱应该

如何将基因检测推向大众

  15年前,J.CraigVenter“教唆”政府花费1亿美元来测序一个人的全基因组(实际上是他自己的基因组)。18个月前,他在加利福尼亚州成立了人类长寿公司(Human Longevity Inc,HLI),现在该公司正在运营号称世界上最大的DNA测序实验室。该公司已与南非DiscoveryHe

盘点:新冠与中国科学的2020

  2020年,没有人猜到开头就是一场大疫,生命以未曾预料的方式消逝,世界陷入前所未有的混乱。  疫情犹如战场,需要科学家们的强力支援。医生们在一线抢救危重病人,病毒学家解析病毒序列,公共卫生学者为疫情防控建言献策,免疫学家们攻坚疫苗研发,探索在保证安全性的前提下加速进度。随着多款新冠疫苗研发成功,

埃博拉病毒感染:密切接触是主要途径

  据英国《金融时报》8月3日报道,世界卫生组织公布的最新数据显示,最近在西非肆虐的埃博拉病毒已导致826人死亡。报道称,最新数据似乎表明疫情正在失控。尽管埃博拉出血热疫情肆虐,但由于埃博拉病毒的感染途径主要是以密切接触传播为主,因此,中国民众暂时无需恐慌。  埃博拉病毒分四种亚型  埃博拉出血热是

基因检测结果能做什么?DNAfit用来“定制”个性化健身方案

近年来,随着医疗技术的不断发展和人们健康意识的不断增强,基因检测逐渐成为大众生活的一部分。其中,基因检测在医疗场景的应用(癌症早筛、产前诊断等)效果已得到初步认可,在消费场景下的应用,包括个性化运动减重、精准营养健康、肌肤美容等也在不断发展,UNISKIN优时颜、柒个盒子、久久基因、基钥科技等都是其

2020年世界科技发展回顾·生物技术

以色列 研究抗癌、抗衰老疑难杂症 超高分辨率显微镜看到活细胞 本报驻以色列记者 毛黎 特拉维夫大学率先证明,通过CRISPR基因编辑技术能有效地破坏动物癌细胞DNA,同时保持周围其他细胞组织完好无损;舍巴医学中心在全球首次试验性采用“逆向个性化药物”(RPM)治疗癌症患者;特拉维夫大学研

科学家分享基因测序技术研发成果

  临床类   杜克大学分子遗传学教授David Goldstein   David Goldstein提出运用精准医学治疗神经系统疾病。Goldstein专注于几个癫痫患者大规模研究的课题,其中包括一项对超过350个患病的儿童及其父母进行测序来发现新突变的项目。尽管许多发现的突变属罕见突变,但是它

2020年12月28日疫情通报:新冠病毒变异 多国严防死守

  12月27日0—24时,31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例21例,其中境外输入病例15例(内蒙古6例,浙江3例,上海2例,北京1例,天津1例,广东1例,四川1例),本土病例6例(均在辽宁);无新增死亡病例;新增疑似病例1例,为境外输入病例(在上海)。  当日新增治愈出院

Nat Genet: 四项研究同时解码结核病

  至今为止,人们都没有找到一个好的时机彻底消灭肺结核,不仅如此,肺结核病菌变得更加猖獗。   结核病是一种由结核分枝杆菌引起的慢性呼吸道传染病,严重危害人类健康。我国的结核发病率位于世界第二,每年有130万新发结核病患者。其中,多耐药结核病人有10万人。耐多药(MDR)和广泛耐药(XDR)结核分