microRNA芯片筛选发现血清血浆中的胃癌早期诊断标志物

胃癌是世界第四大癌症,在所有癌症致死率排行中名列第二。每年都有超过一百万的病人被确诊为胃癌,其中 75%来自亚洲。常见的胃癌相关生物标志物有癌胚抗原(carcinoembryonic antigen)和糖类抗原19-9(carbohydrate antigen 19-9),但这些生物标志物对于早期胃癌诊断的灵敏度和特异性都不高。由于缺乏明显的症状及早期诊断方法,胃癌患者通常在晚期被确诊,而此时的平均生存率只有7-9个月。因此,发现新的高灵敏度早期胃癌生物标志物相当重要。 microRNA是一类小分子非编码RNA,在调控基因表达方面发挥着重要作用。最近有研究表明,不同的肿瘤显示出特异性的microRNA表达谱,肿瘤来源的microRNA能被释放到循环系统中,进入血液组织。而在血液组织中,microRNA能避免被 RNase降解,具有良好的稳定性。因此,血清血浆中的microRNA有成为肿瘤生物标志物的潜力......阅读全文

MicroRNA-Expression-Profiling-by-Bead-Array-1

MicroRNA Expression Profiling by Bead Array Technology in Human Tumor Cell Lines Treated with Interferon-Alpha-2aMicroRNAs are positive and negative r

MicroRNA-Expression-Profiling-by-Bead-Array-2

Materials and MethodsCell Culture, Interferon Treatment, and RNA PrecipitationMelanoma cells (ME-15) were cultured in RPMI 1640 with L-Glutamine suppl

如何查找microrna的前体

在NCBI主页输入要查找的miRNA的名称,all database中选择GENE;在搜索结果中选择目的miRNA,在NCBI reference sequences(RefSeq)栏中点击目的miRNA的ID号即转到序列,还可以通过链接到UCSC、miRBase查找。

MicroRNA(miRNA)荧光定量PCR原理

一、什么是miRNA?MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。据推测,这些非编码小分子RNA(miRNAs)参与调控基

准确检测血清血浆样本中microRNA的利器与应用

大量研究表明,血液循环中的microRNA表达变化指征着疾病的发生和发展阶段。同时,血液样品在临床易于获取,且稳定不易降解,因此对于microRNA标记物筛选具有广阔研究前景。 血清/血浆样本用于microRNA研究的挑战 • 血清血浆中不包含细胞,且microRN

准确检测血清血浆样本中microRNA的利器与应用

大量研究表明,血液循环中的microRNA表达变化指征着疾病的发生和发展阶段。同时,血液样品在临床易于获取,且稳定不易降解,因此对于microRNA标记物筛选具有广阔研究前景。 血清/血浆样本用于microRNA研究的挑战• 血清血浆中不包含细胞,且microRNA含量低• microRNA高度同源

苏州纳米所等发明microRNA表达谱高通量非标记检测技术

  microRNA是近年来发现的一种单链的短链RNA,长度约22个碱基,在动植物及人类中广泛存在,与发育、分化、凋亡、脂肪代谢、病毒感染和癌症等多种重要生物学过程有密切的联系,并显示出作为癌症、心血管等重大疾病等方面的新的分子标记物的巨大潜力,是近十年来的一个研究的热点。对micr

基因芯片筛选发现大肠癌早期诊断分子标志物

  大肠癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,其发病率位居全球恶性肿瘤第三位。2006年国家卫生部的统计数据显示,我国大肠癌死亡率已位居恶性肿瘤第五位,其发病率在40岁开始上升,至60-75岁时达到高峰。发病率呈逐年上升趋势。对大肠癌的早期诊断有助于大肠癌的治疗,减少病死率。   早期诊断包括两方面含义:

Gastroenterology:microRNA调节肠道通透性

  肠易激综合征(IBS)是一组持续或间歇发作,以腹痛、腹胀、排便习惯和(或)大便性状改变为临床表现的肠道功能紊乱性疾病。一些患有腹泻型肠易激综合征(IBS-D)的病人伴随肠道通透性增高的现象,导致其出现腹泻和腹部疼痛的症状。已有的研究表明,MicroRNA -29(miR-29)能调节IBS-D病

线粒体microRNA成像研究取得重要进展

  近日,国家纳米科学中心研究员李乐乐课题组在线粒体microRNA成像研究中取得重要进展。相关研究成果以Spatially Selective Imaging of Mitochondrial MicroRNAs via Optically Programmable Strand Displace

Detection-of-MicroRNA-Heterogeneity-in-Single-Cells-Using-an-Automated

Introduction  MicroRNA  (miRNAs) are short (18–24 nucleotides), non-coding RNAs that regulate  gene expression by both disrupting messenger RNA (mRNA

MicroRNA是牛皮癣背后原因?

瑞典卡罗琳斯卡医科大学的一个研究组首次证实microRNA、小RNA分子可能在皮肤炎症如牛皮癣和异位性皮炎(atopic-eczema)发生过程中起到关键作用。该研究组由Mona Ståhle教授领导。 MicroRNA是一种能够调节基因表达的小RNA分子,并且通过作用于不同蛋白质和皮肤和免疫细胞

microRNA-RTPCR实验方法

Stem-loop实时定量RT PCR传统实时定量RT PCR只能检测到miRNA前体,而Stem-loop实时定量RT PCR技术可以解决这一问题。Stem loop实时定量RT PCR是一项高特异度、敏感度的检测miRNA表达的实验技术,包括设计具有茎环(stem loop)结构的反

JCI:应用FISH技术检测肿瘤microRNA

  霍华德•休斯医学研究所(HHMI)的研究人员通过微调荧光探针的设计以及RNA固定技术,开发出一种检测和定量肿瘤活检样本中microRNA分子的方法。这种新的荧光原位杂交(FISH)技术实现了肿瘤类型的鉴定。《The Journal of Clinical Investigation》杂志近日

基因芯片筛选发现大肠癌早期诊断分子标志物

  大肠癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,其发病率位居全球恶性肿瘤第三位。2006年国家卫生部的统计数据显示,我国大肠癌死亡率已位居恶性肿瘤第五位,其发病率在40岁开始上升,至60-75岁时达到高峰。发病率呈逐年上升趋势。对大肠癌的早期诊断有助于大肠癌的治疗,减少病死率。   早期诊断包括两方面含

系统化生物芯片技术在功能基因组研究中的应用简介

 三、生物芯片技术研究应用点滴     人类基因组计划推动了各种生物基因组测序工作的进展,越来越多的生物全基因组序列被测定并公布,可是这才是解读“天书”的开始。掌握了基因组序列,却不知道基因序列背后所隐藏的秘密——即基因组的功能,就不能真正理解“天书”更谈不上服务于人类。如何从海量的基因序列数

准确检测血清血浆样本中microRNA的利器与应用

  大量研究表明,血液循环中的microRNA表达变化指征着疾病的发生和发展阶段。同时,血液样品在临床易于获取,且稳定不易降解,因此对于microRNA标记物筛选具有广阔研究前景。   血清/血浆样本用于microRNA研究的挑战   • 血清血浆中不包含细胞,且

基因芯片筛选发现大肠癌早期诊断分子标志物

大肠癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,其发病率位居全球恶性肿瘤第三位。2006年国家卫生部的统计数据显示,我国大肠癌死亡率已位居恶性肿瘤第五位,其发病率在40岁开始上升,至60-75岁时达到高峰。发病率呈逐年上升趋势。对大肠癌的早期诊断有助于大肠癌的治疗,减少病死率。早期诊断包括两方面含义:早期发现和早

二军医大:miRNA200家族调控结膜MALT淋巴瘤的发生

  结膜黏膜相关淋巴组织(Mucosa-associated Lymphoid Tissue, MALT)淋巴瘤是一种较为常见的发生于眼眶软组织中的肿瘤,是非霍奇金淋巴瘤中边缘带淋巴瘤的一种。该类肿瘤除了胃肠道多发外,眼眶软组织也是它的好发部位,绝大多数患者起病隐匿,临床经过较缓慢,病程长,预后

测序首次鉴定鲨鱼肝脏microRNA组

  条纹斑竹鲨(Chiloscyllium plagiosum),是主要栖息于沿海礁砂混合且海藻繁生的海床中的一种鱼类,卵生,对其生活习性我们还不甚了解,可能以底栖无嵴椎动物及小鱼为食。条纹斑竹鲨具有一定的经济价值,可在水族馆中展示,食用可治疗佝偻病、外痔、 水火烫伤、夜盲症等。microR

如何预测microRNA的作用靶点蛋白

很多软件都可以预测miRNA作用靶点,如miRBase,PicTar,TargetScan,也可以做miRNA芯片

专访:肝癌诊断的生力军——MicroRNA

  肝癌早期比较隐匿,患者确诊的时候往往已经到了中晚期。这个时候进行治疗效果当然不会很理想。正因如此,肝癌素有“癌王”之称。不过我们也不必过于害怕,因为越来越多的临床和基础研究证实肝癌“癌王”的地位也并非牢不可破。早发现、早诊断、早治疗可以有效改善肝癌治疗的效果,延长肝癌患者的生命。  第二军医大学

microRNA-RTPCR实验方法介绍

  Stem-loop实时定量RT PCR   传统实时定量RT PCR只能检测到miRNA前体,而Stem-loop实时定量RT PCR技术可以解决这一问题。Stem loop实时定量RT PCR是一项高特异度、敏感度的检测miRNA表达的实验技术,包括设计具有茎环(stem loop)结构的

生物芯片技术芯片分类

根据芯片上的固定的探针不同,生物芯片包括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片,另外根据原理还有元件型微阵列芯。表达谱基因芯片是用于基因功能研究的一种基因芯片。是目前技术比较成熟,应用最广泛的一种基因芯片。

生物芯片是纳米芯片么

生物芯片和纳米这百个概念貌似扯不上边,唯一有点关系的是,它上面点制的核酸或蛋白等探针大小是以纳米级度别的。生物芯片目前主要做科研用,成熟的临床应用的芯片应该博奥生物做过不少工作但基本被埋没了,虽然是很实用的产品问,但一方面是找不到对应的市场或者说根本答就没人去推广,另一方面是生物芯片是新生事物专,国

简述Lifespan组织芯片生物芯片

Lifespan组织芯片是生物芯片技术的一个重要分支,与基因芯片、蛋白质芯片及细胞芯片等一样,属于一种特殊、新型的生物芯片,是一种新型的高通量、多样本的研究的工具。组织芯片组织芯片,也称组织微阵列(tissue microarrays),是将数十个甚至上千个不同个体组织标本以规则阵列方式排布于同一固

生物芯片的芯片制备方法

包括原位合成和预合成后点样。原位合成:适用于寡核苷酸,通过光引导蚀刻技术。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突变的基因芯片。预合成后点样:是将提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因组DAN等通过特定的高速点样机器人直接点在芯片上。该技术优点在于相对简易低廉,被国内外广泛

生物芯片中芯片制备方法

包括原位合成和预合成后点样。原位合成:适用于寡核苷酸,通过光引导蚀刻技术。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突变的基因芯片。预合成后点样:是将提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因组DAN等通过特定的高速点样机器人直接点在芯片上。该技术优点在于相对简易低廉,被国内外广泛

生物芯片技术的芯片分类

  根据芯片上的固定的探针不同,生物芯片包括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片,另外根据原理还有元件型微阵列芯。表达谱基因芯片是用于基因功能研究的一种基因芯片。是目前技术比较成熟,应用最广泛的一种基因芯片。

生物芯片的芯片制备方法

包括原位合成和预合成后点样。原位合成:适用于寡核苷酸,通过光引导蚀刻技术。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突变的基因芯片。预合成后点样:是将提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因组DAN等通过特定的高速点样机器人直接点在芯片上。该技术优点在于相对简易低廉,被国内外广泛