代谢组鉴定质控标准正式建立

蛋白质组和代谢组技术都基于质谱,但相比于蓬勃发展的蛋白质组学技术,代谢组虽然技术流程更简单,但其应用却一直十分缓慢。究其原因,是因为蛋白质组学却很早就基于Target-Decoy策略建立了FDR(假发现率)质控策略,可以保证鉴定结果的可靠性;而代谢组全谱鉴定一直缺乏有效的质控手段对鉴定结果进行质控,导致鉴定结果十分不可靠。 不同的平台、流程和分析软件对于代谢组鉴定结果的质量评估方法参差不齐,甚至没有任何质量控制可言,假阳性鉴定比例相当高。有人曾借鉴蛋白质组学质控的Target-Decoy策略,对代谢组鉴定结果进行质控,但由于难以获得可靠的代谢物的诱饵库,该策略长期以来不被认可。 2020年3月26日,暨南大学生命科学技术学院张弓教授团队和深圳市数字生命研究院人工智能实验室在Analytical Chemistry(化学一区)上发表论文,对全谱(即非靶向)代谢组鉴定建立了一个可靠的FDR质控方案。该方案最主要的贡献是建立......阅读全文

代谢组鉴定质控标准正式建立

   蛋白质组和代谢组技术都基于质谱,但相比于蓬勃发展的蛋白质组学技术,代谢组虽然技术流程更简单,但其应用却一直十分缓慢。究其原因,是因为蛋白质组学却很早就基于Target-Decoy策略建立了FDR(假发现率)质控策略,可以保证鉴定结果的可靠性;而代谢组全谱鉴定一直缺乏有效的质控手段对鉴定结果进行

质控品-标准品-校准品

     校准品、标准品、质控品三者同为参考物质。参考物质是一种材料或者物质,某一种或多种特性值只够均匀并被良好确定,用于校准测量系统,评价测量程序或为材料赋值。但三者并非用一个概念,他们有各自不同的应用场合。临床上常常有很多错误的应用,例如将不同厂商的校准品应用于检测系统;使用给定值的质控品评

质控概念的标准化

从1949年美国College of American Pathologists(简称CAP)首先开始研究临床实验室室内质量控制(简称质控)问题,美国学者Levery和Jenning于1950年发表第一篇关于使用质控图的实验室室内质控,临床检验实验室的室内质控工作正式拉序幕。到70年代,实验室质

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组服务介绍​​

  代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层面探寻生命的活动,而实际上细胞内许多生命活动是与代谢物相关的,如细胞信号(cell signaling)、能量传递等都是受代谢物调控的。代谢组学正是研究代谢物——在某一

暨南大学最新文章:制定蛋白质组“开放式搜索”质控标准

生物质谱具有高通量、高灵敏度的分析特点,是蛋白质组学研究的核心技术之一。基于数据库搜索的肽段质谱图谱鉴定方法是目前最有效和最广泛使用的蛋白质鉴定方法,然而仅有25%的图谱能被该方法识别。生物质谱具有高通量、高灵敏度的分析特点,是蛋白质组学研究的核心技术之一。基于数据库搜索的肽段质谱图谱鉴定方法是目前

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

  随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇1

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

   随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇

长寿的代谢特征代谢组学研究的启示

  长生不老是人类自古以来的夙愿。  中国古代神话故事中,有菩提老祖的大品天仙诀,王母娘娘盛会上的蟠桃,太上老祖炼丹炉里的不老丹,还有妖怪们梦寐以求的唐僧肉都可以实现长生不老。在史学瀚海中,《史记》记载秦始皇东巡碣石,携童男童女入海求仙,寻求长生不老药;在现代科学中,衰老仍然是生物医学领域热门主题之

猪肉和鸡肉肌苷酸检测质控标准品发布

图片来源:中国农业科学院 猪肉和鸡肉是我国生产和消费的主要畜禽肉种类,随着生活水平的提高,人们对畜禽肉风味口感提出更高的要求。肌苷酸是畜禽肉中重要呈味核苷酸,是衡量畜禽肉特征风味的重要指标之一。 近日,中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所(以下简称质标所)农产品品质评价与控制创新团队主

校准品,标准品和质控品的区别

  1. 质控品:IFCC的定义是专门用于质量控制目的的标本或溶液,不能用于校准。对稳定性、瓶间差要求高。分定值和不定值两种。在选择控制品时,应该选择有几个浓度的、浓度范围分布较宽的、最好是医学决定水平的、有可报告范围范围是上下限值的质控品。  2. 标准品:用于定标即标准曲线的绘制。  3. 校准

血细胞分析仪的标准与质控

随着血细胞分析仪越来越多的选择,同一实验室可能存在不同品牌的血细胞分析仪,由于各厂家采用的技术及标准均有一定的差异,因此为保证实验内部不同品牌的血细胞分析仪具有统一性,建立一套完善的校准与室内质控系统是一个重要的手段。 1.材料与方法 1.1 仪器和试剂 ①美国贝克曼库尔特LH750全

按USP标准质控“纯水”和“注射用水”

《美国药典》中关于“医药用水”的章节是这样开头的:“水是在生产、处理及形成化合物的过程中用途最广的物质、原料或成分。”(1232)    相比日常生活中不胜枚举的应用,根据USP 要求,饮用水只适合在化学合成或清洗药物生产设备的初期阶段使用。同时,该药典指定饮用水作为生产各种药物用水的水源。这些药物

代谢组学科学哲学思路

  代谢组学突出的是一种整体性的研究思路。它通过现代超高效液相色谱/高分辨质谱联用仪等技术分析体液中的代谢物组成谱,并利用多变量统计分析技术,把所有代谢物的组成信息都整合到一起,为在系统和整体的层面上比较和分析生物的代谢特性。  众所周知,西方医学的哲学基础是从分析开始的,如魏尔啸的细胞论。随着分析

代谢物组的定义

中文名称代谢物组英文名称metabolome定  义细胞内在某一特定生理和发育阶段的所有小分子量的代谢物质。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

代谢组学新工具:METLIN

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   超过上万个代谢物   目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

GCMS-HRAM-代谢组学数据库-探索代谢组学的奥秘

  盐城4公分厚外墙岩棉板报价    岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后,采用的四辊离心制棉工序,将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维,再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂,经过沉降、固化、切割等工艺,根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。

中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案

  中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。  赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和

代谢组学-|-肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢

  能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下,肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解,将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ~ 30倍,为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此,靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研

非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?

据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些

校准品、标准品和质控品的区别解读

一、定义上的区别1、校准品: 用于定量检测时对检测项目的校准,是具有在校准函数中用作独立变量值的参考物质。一般包含2个到多个浓度水平。2、质控品:用于检查分析仪器或方法的性能,是一种稳定的物质,用于验证分析仪器或方法的性能。3、标准品:具有确定特性量值,用于评价测定方法的物质。包括国家参考品和企业内

IVD里面的校准品、标准品和质控品

校准品、标准品、质控品三者同为参考物质。参考物质是一种材料或者物质,某一种或多种特性值只够均匀并被良好确定,用于校准测量系统,评价测量程序或为材料赋值。但三者并非同一个概念,他们有各自不同的应用场合。临床上常常有很多错误的应用,例如将不同厂商的校准品应用于检测系统;使用给定值的质控品评价检测系统;使

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

进入前景光明的代谢组学

内容概要: 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法,而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作