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比较基因组杂交芯片介绍

比较基因组杂交芯片(Comparative Genomic Hybridization Array)、基于芯片的比较基因组杂交(Microarray-based comparative genomic hybridization)或者阵列比较基因组杂交技术(array comparative genomic hybridization, array CGH)能在全基因组水平、高分辨率基础上检测染色体拷贝数的变化。比较基因组杂交(CGH)是上世纪九十年代初在染色体荧光原位杂交(FISH)技术的基础上结合消减杂交技术发展起来的一种分子细胞遗传技术。它不需要对待测细胞进行培养,也不必制备特异区域探针,一次试验即可检测全部待测基因组DNA拷贝数改变。传统的CGH有两大主要缺陷,一是分辨率不高,大约是5-20Mb,二是常需要高水平的细胞遗传学专家分析杂交结果,为了克服CGH技术的不足,研究人员在芯片基础上建立了新的array CGH技术。......阅读全文

实质等同性(转录组学)实验

实验材料:小麦  试剂、试剂盒:β-巯基乙醇                                   &nb

实质等同性(转录组学)实验2

3.9 芯片数据介绍对简单的实质等同性实验来说,一个比较转基因系与对照之间基因表达的散点图就已足够了。文献 [ 5 ] 中参与两个实验的样品都标注在图15. 2中。结果用 GeneSpring 软件包显示,绘制了每组比较小麦系之间每个基因成对的平均强度,并突出显示少数感兴趣的基因(统计上显著差异表达

第一届中国分子诊断技术大会召开

  21世纪的第一个10年是生命科学及其相关技术飞速发展的10年,以生物芯片为代表的一大批分子诊断技术日渐成熟,并正在以其巨大的优势和潜力成为保障人类健康最重要的生物技术之一。中国工程院医药卫生学部、中国医师协会检验医师分会、中华医学会检验分会等6月22日~24日在北京联合主办第一届中

分子诊断技术步入快速发展新时代

  21世纪的第一个10年是生命科学及其相关技术飞速发展的10年,以生物芯片为代表的一大批分子诊断技术日渐成熟,并正在以其巨大的优势和潜力成为保障人类健康最重要的生物技术之一。中国工程院医药卫生学部、中国医师协会检验医师分会、中华医学会检验分会等6月22日~24日在北京联合主办第一届

我国生物芯片技术发展备受瞩目

  21世纪的第一个10年是生命科学技术飞速发展的10年,以生物芯片为代表的一大批分子诊断产品日渐成熟,并正在以其巨大的优势和应用潜力成为保障人类健康的重要工具。  在中国工程院医药卫生学部、中国医师协会检验医师分会、中华医学会检验分会等于6月22日~24日在北京召开的“首届中国分子诊断技

复旦大学等发现导致先天性脊柱侧凸新机理

  近日,《新英格兰医学杂志》以原创性论文形式,发表了由复旦大学与中国医学科学院北京协和医院共同牵头,联合首都儿科研究所、美国Baylor医学院等多家国内外单位合作完成的研究论文《TBX6基因无效变异联合常见亚效等位基因导致先天性脊柱侧凸》。  先天性脊柱侧凸的病因长期不明,已有研究提示DNA变异在

基因芯片的必备知识和操作流程

基因芯片  技术的诞生为生物技术工作人员打开了一道科研的便利之门,曾被评为1998年年度十大科技进展之一。本文对基因芯片的实验原理、技术基础、分类、用途、操作主要环节等内容做详细的介绍。 1.基本原理和技术基础 基因芯片以DNA杂交  为基本原理,基于A和T、G和C的

安捷伦科技:植根中国 长期发展

  2009年9月11日上午,“试验仪器发展战略研究调研小组”访问第四站:安捷伦科技(中国)有限公司,此次也是调研跨国集团的最后一站。访问团成员包括中国仪器仪表学会科学仪器学术工作委员会常务副秘书长、研究员燕泽程,质谱专家、原中科院化学所王光辉教授,质谱专家、原石化科学研究院苏焕华教授,首都师范大学

Science: 基因芯片正走向临床

  “现在差不多有上百例的症状具有可以与特定表型相关联的染色体重组。”牛津基因科技公司(Oxford Gene Techonology,英国牛津)临床和基因组对策中心副总裁James Clough指出,“取决于受测群体,传统显微镜核型检测法诊断率为5~8%,而基因芯片的诊断率则是18~25%

国际遗传和医学基因组学大会近日召开

日前,安捷伦科技有限公司作为主要赞助商参与了于6月9日至11日在香港大学举行的国际遗传和医学基因组学大会。该次国际会议由美洲华人遗传学会和香港医学遗传学会在历年分别举办的国际学术会议的基础上首次联合举办。会议吸引了国内外从事遗传学和医学基因组学研究的知名学者参与。诺贝尔奖获得者Oliver Smit

DNA microarray相关的基因表达数据处理攻略

基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因

流式荧光-液芯技术的原理及其应用

   曾经在2000年前后经历过辉煌发展的传统生物芯片,经过10年左右的应用,科学家们终于有了些更客观和更清醒的认识,同时产业界也衍生出了更专业更具特点的新型生物芯片。传统基于玻璃片、硅片、膜片的所谓“固态芯片”是生命科学研究领域中非常优秀的科研工具,它们的共同特点是在固态基材上

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt

Agilent eArray定制芯片应用案例

在生命科学的不同研究中,需要观察的基因并不完全相同,因此许多研究者往往需要针对自己感兴趣的一些基因进行表达分析。定制芯片服务的目的,就在于满足不同研究者的需要。另外,有些物种尚没有商品化的基因芯片可以提供,也需要通过定制芯片来制备。   上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中

PerkinElmer成功收购上海浩源生物 扩展中国分子诊断市场

  2012年11月22日,专注于人类与环境健康和安全的全球领导者珀金埃尔默公司在上海新世界丽笙大酒店召开“珀金埃尔默战略收购上海浩源生物技术有限公司”媒体见面会。珀金埃尔默诊断事业部副总裁、亚太地区诊断部总经理张晟先生,上海浩源生物技术有限公司技术总监杨国翠女士,上海

高通量测序技术SOLiD简介

目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat

常用的分子生物学基本技术

核酸分子杂交技术由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的

生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用

随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能

生物芯片实验信号检测及数据处理

芯片实验完成后,芯片就可以放人商品化的生物芯片扫描仪中进行扫描、识别、提取和分析(扫描仪的操作根据商家提供的具体操作执行)。扫描仪得到图像后,必须对数据进行提取,才能进行后续的数据分析。图像处理和数据分析是基因芯片研究的核心技术之一。对于SNP实验结果分析较简单,而对于基因表达谱研究、CGH分析及高

浙江大学最新评述:深度测序技术发掘植物病毒资源

  科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少 DNA 甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析 (methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性 PCR (MS-PCR)

PerkinElmer成功收购上海浩源生物 扩展中国分子诊断市场

  发布会最后安排了媒体问答环节,珀金埃尔默诊断事业部副总裁、亚太地区诊断部总经理张晟先生,上海浩源生物技术有限公司技术总监杨国翠女士共同回答了各家媒体的问题,并一一进行了解答。以下为媒体问答实录:  收购完成后对浩源技术、产品的整合  问:PerkinElmer并购浩源生物主要是基于哪些

他们用基因组技术为中国奶牛“挤奶”

   奶业是农业乃至国民经济的重要组成部分。   新中国成立以来,我国奶业得到了快速发展,尤其是培育了我国自己的奶牛品种——中国荷斯坦牛,也就是我们俗称的“黑白花牛”。在目前我国饲养的近1400万头奶牛中,80%以上是中国荷斯坦牛。   然而,与国外奶业发达国家相比,我国的奶牛生产水平有较大差距。据

染色质免疫沉淀技术的应用

随着人类基因组测序工作的基本完成,功能基因组学逐渐成为研究的热点。而基因表达的调控又是功能基因组学的一个重要研究领域,要想提供蛋白因子直接调控的证据,需要直接检测蛋白质-DNA的相互作用,而染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)就是一种研

Cell特辑:免疫沉淀

  “Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册,主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文,评论性文章以及snapshots,涉及了同一领域的方方面面,更为重要的是这些文章由赞助商赞助,可以免费获取。  蛋白与DNA之间

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

个性化给药!基因芯片了解一下

  临床上同病同治不同疗效的现象比比皆是,面对一些格外棘手的患者,以往医生只能无奈地解释为个体化差异。如今,以药物基因组学理论和基因检测为基础的“个体化药物治疗”可以实现量体裁衣式的个体化给药,它可以帮助医生解决患者的用药问题。  1.介绍  基因芯片,是把大量已知序列探针集成在同一个基片(如玻片、

【盘点】单细胞测序研究进展一览

  细胞是生物学的基本单位,近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术,该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始

培育让啤酒更美味的酵母菌

  研究人员根据香气、口味以及啤酒花的新鲜程度等指标给新品啤酒打分,满分为6分。   韦斯特里彭实验室的冷库里保存着3万多种酵母菌,其中包括野生菌株、工业用菌株和其他创新品种。   炎炎夏日,你是否想在下班之后喝上一杯冰啤酒呢?   在比利时鲁汶大学的一个实验室,