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REALTIMEPCRWITHSYBRGREENIPROTOCOL

1、反应体系 25ulCocktail 20 ul: Primer FP 1 ul + Primer RP 1u + 2 * SYBR GREEN I MIX 12.5 + H2O 5.5 ul cDNA 5 ul2、Primer 浓度,需要摸索,从200nM到700nm等,设置不同浓度。3、每个引物浓度,从well 1到12设置4个样本,阳性cDNA 1和2,NTC以及H2O,做triplicate。4、若用ABI7000或7700,所有的PCR条件可设置成一致的,减少麻烦,当然,引物设计时就要考虑好,第一步除UNG,然后预变性,然后 PCR循环,ABI采用二步法,退火延伸均60度,循环最多40。5、结果分析: 阳性1,2曲线,NTC的Ct值需大于阳性Ct值至少5到6个循环以上,H2O基本Ct值接近40。6、做Dissociation Curve,若好的引物,可见单一峰,若见两个峰,则他们的温度差值需在2度以上。7、AGARO......阅读全文

SYBR Green Quantitative PCR Protocol

SummaryQuantitative PCR is a method used to detect relative or absolute gene expression level. All qPCR involves the use of fluorescence to detect the

基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展(四)

NGS 是一种识别和确认未知致病菌的前景广阔的技术,然而其在生物防御和公共健康应用等方面的时效性,却往往因为缺乏快速、有效、可靠的自动DNA样品制备方法而受到限制。为了突破这种限制,Kim 等设计了一种基于流体分布元件的数字微流体(DMF) 平台,使得多子系统模块能够进入自动NGS库样品

DNA转化实验指导-2

1B.  Cloning 1.     A caveat on dephosphorylation: the most common reason for failure to obtain colonies is a

ChIP-Chip E. coli

AbstractChIP-Chip stands for Chromatin Immunoprecipitation and chip in the sense of DNA microarray. It is a technique to determine the genom

DNA Electrophoresis

What is Electrophoresis?Electrophoresis is a technique used in the laboratory that results in the separation of charged molecules. DNA is a negatively

利用人工组合转录因子对人类基因组扫描-2

Figure 5: Regulation of CDH5 by TFZFs in several human cancer cell lines.Blue, cells infected with a pMX construct containing the DNA bindin

无创血压计应用论文:动物用血压计(三)

TABLE IPrimer sequences for mRNA analyses Sequences are listed 5' to 3'.Quantitative Real-time PCR by SYBR Green Detection Method-The mRNA l

DNA电泳

DNA电泳(主要内容如下)  Preparation of Agarose Gel and Electrophoresis  Extraction of DNA From Agarose Gel  Extraction of DNA fro

SYBRGreen Q-PCR in the ABI 7700

MaterialsROX Passive Reference Dye 25 µM, 50x (Invitrogen, Cat. No. 12223-012)SYBR Green I, "10,000x" concentrate (Molecular Probes,&nb

Adiponectin Replenishment Ameliorates Obesity-Related Hypertension(二)

Methods    Animal and Animal Treatment    KKAy male mice were purchased from Japan CLEA (Tokyo, Japan). This strain is

PCR实验指导与常见问题分析-7

11. All products in my multiplex reaction are weak. How can I improve the yield?Decrease annealing time in small steps (2º C)Decrease extension temper

Sauer:RNA Purification from E. coli

My Experience Purifying RNA from E. coliRegarding RNA extraction, there is a horrible tendency of people to use kits for RNA extraction with bacteria.

Multicolour 3D-FISH in vertebrate cells-6

Back to topReviewer CommentsReviewed by: Luis Antonio Parada, CIC Biogune, Derio, Spain.In my experience the primers are better preserved when kept at

ABI Prism 7000型定量PCR仪中文操作手册

1、新建文件菜单File → New,Assay选择Absolute Quantification(实时定量模式),打开一个空白的96孔板文件。  2、探针设置双击任意一个孔,打开Well Inspector窗口。该窗口也可以从菜单View → Well Inspector打开。 

如何选择荧光定量检测法之SYBR Green I

总的说来,荧光检测技术可大致分为两大类:通用型的荧光染料检测法和高特异性的荧光探针法。前者主要是利用荧光染料(如SYBR Green I)与双链DNA分子结合发光的特性来指示扩增产物的增加,优点是:无需另外设计荧光探针,无需特别优化条件,简便易行,成本较低,能适用于任何一款定量PCR仪,缺点

实时荧光定量 PCR技术原理与应用

聚合酶链式反应 ( PCR) 可对特定核苷酸片断进行指数级的扩增 。在扩增反应结束之后,我们可以通过凝胶电泳的方法对扩增产物进行定性的分析,也可以通过 放射性核素掺入标记后的光密度扫描来进行定量的分析 。无论定性还是定量分析,分析的都是 PCR 终产物。但是在许多情况下,我们所感兴趣的是未经 PCR

实时定量PCR应用中的优化方案(二)

实践中的问题实时定量PCR已广泛地运用于分子生物学的各个领域,就目前的应用情况来看,虽然取得了很好的效果,但是其在方法学上的选择、敏感性问题、重复性问题等都一直是争论不休的,本文将就这些问题做出探讨。1. 方法的选择:研究者在实验中往往想要得到目的基因的绝对量,因为绝对定量对目的基因的表达差异有直接

SYBR Green法实时定量PCR优化攻略

SYBR® Green是一种插入DNA分子的染料,具有多种分子生物学应用,其中之一就是用于实时定量PCR(qPCR)。随着PCR循环的连续进行,这种染料的荧光强度会不断增强,从而可以使人们对反应中的DNA进行定量。SYBR Green法及一些其他基于染料的qPCR方法比探针法的成本低,使用也更为方便

Protocols for LCM preparation and analysis

Protocols for LCM preparation and analysis I. Preparation, LCM and RNA/DNA extraction of Frozen Tissue SectionsA. EmbeddingB. CuttingC.

PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究(五)

3.讨论  随着近年基因芯片技术的发展,研究者逐渐认识到基于核酸杂交原理的传统基因芯片缺陷与应用的局限性。随着PCR技术的进展,特别是荧光定量PCR技术的出现PCR技术已成为生物医学领域中应用最广泛的技术。如果一种基因芯片能直接进行PCR反应,而且能够同时扩增大批可能发生变异的基因显

SYBR Green I(20×)定量PCR用

规格:1ml 保存条件:-20度,如果经常使用,可放2-8度保存一周。 产品简介:SYBR Green I与dsDNA 结合荧光信号可增强800-1000倍。在PCR反应体系中,加入过量SYBR Green I荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,荧光信号

DNA抽提

DNA抽提(主要内容如下)·   Working with DNA·   DNA Extraction from Bacteria and Other Organisms·   DNA Extraction f

常见荧光定量PCR检测方法比较

  定量PCR:以参照物为标准,对PCR终产物进行分析或对PCR过程进行监测,从而达到评估样本中靶基因的拷贝数,称为定量PCR。定量PCR的可行性定量一般是在PCR扩增的指数期进行的。  常见荧光定量PCR方法比较  SYBR Green I 检测模式  SYBR Green I 是一种能与双链 D

Competitive RT-PCR Strategy for Quantitative Evaluation -4

We have also been able to detect expression of this receptor in all studied tissues, which is consistent with the pleiotropic nature of growth hormone

基于PCR技术的染色质沉淀分析-2

METHOD Analysis of precipitated chromatin fractions (from Chromatin Immunoprecipitation on Unfixed Chromatin from Cells and Tissues to Analy

PCR实验指导与常见问题分析-4

Fig. 25. Multiplex PCR of mixtures A-D comparing PCR programs with 2 (green) and 1 (yellow) minute extension time at 54° C annealing temperature.

PCR实验指导与常见问题分析-6

Non-denaturing PAA gelsTo separate PCR products differing in only a few bp in length (for example, microsatellite markers), 6-10% PAA gels need to be

线虫总RNA提取及RT-PCR实验方法

C. elegans RNA Isolation and RT-PCRReagents Needed:M9 (common stock)Trizol (stored at 4ºC)chloroform2-propanol70% EtOHRNase-free H2OiScript cDNA Synth

Dual- and Triple-Co... (二)

主要试剂1. Blocking reagent after coating: 10% fetal calf serum (FCS) in phosphate-buffered saline (PBS), pH 7.4.2. Cells suspended in complete culture me

实时荧光定量 PCR技术原理与应用(一)

实时荧光定量 PCR技术原理与应用聚合酶链式反应 ( PCR) 可对特定核苷酸片断进行指数级的扩增 。在扩增反应结束之后,我们可以通过凝胶电泳的方法对扩增产物进行定性的分析,也可以通过 放射性核素掺入标记后的光密度扫描来进行定量的分析 。无论定性还是定量分析,分析的都是 PCR 终产物。但是