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PLoSONE:鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定

PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。 PIWI 基因最早在果蝇的生殖干细胞(Germline Stem Cells,GSCs)中被发现,因其编码的蛋白质能调节GSCs的数量与分化率而得到研究者的进一步研究。在果蝇中,PIWI亚家族包含三个成员:PIWI, AUB, AGOs。对于PIWI突变个体,雄性与雌性均表现不育。而在人类中,PIWI蛋白除了参与精子发生外,同时也与肿瘤的形成和发展相关。 在本研究中,研究者首先克隆得到PIWI基因,随后利用二代测序技术对鹌鹑的小RNA表达谱进行分析(由联川生物承担完成),并利用生物信息学方法预测了与其绑定的小RNA,再经......阅读全文

鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定

PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。PIWI 基因

PLoSONE:鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定

  PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中,PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*,研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。  P

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

多位专家指导:如何提取和研究血液DNA,RNA与蛋白

  血液是唯一与所有器官都有接触的组织,携带着有关机体的大量宝贵信息。在理论上,检测血液携带的 DNA、RNA、囊泡和细胞残骸可以帮助人们诊断和监控各种疾病。  产前基因筛查是血液检测的一个重要应用,通过分析孕妇血液中的胎儿DNA来鉴定染色体异常(比如唐氏综合症)。此外,越来越多的研究者开始关注血液

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验

差异显示聚合酶链反应(PCR) 可促进在诸多物种中与污染暴露相关的新分子标志物的鉴定。至今,已有多种差异显示方法被详细描述。这里,我们描述了一种改良的RNA 随机引物触发的 PCR 方 法(RNAarbitrarily primed PCR, RAP-PCR) , 主要涉及通过 罗 丹 明(rhod

聚合酶链反应(PCR)技术的发展和应用-2

第五节 PCR各处应用模式  一、兼并引物(Degenerate Primer)PCR  密码子具有兼并性,如表22-4,单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的,但可以设计成对兼并引物,扩增所有编码已知顺序的核酸序列。用兼并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变,但核苷酸的数量应相同。兼并度越低,

PCR各处应用模式

一、兼并引物(Degenerate Primer)PCR  密码子具有兼并性,如表22-4,单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的,但可以设计成对兼并引物,扩增所有编码已知顺序的核酸序列。用兼并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变,但核苷酸的数量应相同。兼并度越低,产物特异性越强,设计引物时应尽

PCR各处应用模式

一、兼并引物(Degenerate Primer)PCR  密码子具有兼并性,如表22-4,单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的,但可以设计成对兼并引物,扩增所有编码已知顺序的核酸序列。用兼并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变,但核苷酸的数量应相同。兼并度越低,产物特异性越强,设计引物时应尽

产研结合的典范:苦味素----从科学发现到产业转化之路

  《韩非子·外储说左上》有云 :“夫良药苦于口,而智者劝而饮之,知其入而已己疾也”,良药苦口由此而来。最近,国内研究团队揭开了这类“苦口良药”的神秘面纱,成果相继发表在Nature Genetics(2013)、Science(2014)和Nature Plants(2016)等国际知名学术期刊上

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段

  在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物质循环的

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 6

应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用,研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说,2012年,Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂(aromatase inhibitor)治疗法之间的关联。他们指出突变,后果与诊断之间的关联,同样还有

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验

实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(二)

##六、从组织或培养细胞提取 RNARNA可以从各种来源的样本包括培养的细胞(例如神经元细胞、肝细胞等)和组织中分离得到(见 注 释 1) 。 mRNA 的 纯 化 对 FRAP-PCR 方法来说并不需要,因为mRNA 仅占细胞总 R N A 的 3 % 〜5 % (13)。因而在本章所描述

一文了解12月HIV研究亮点进展

  人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV),即艾滋病(AIDS,获得性免疫缺陷综合征)病毒,是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒。1983年,HIV在美国首次发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒(lentivirus),属逆转录病毒的一种。HIV通过

液相芯片技术的原理与应用进展

   液相芯片,也称为微球体悬浮芯片(suspension array,liquid chip),是基于xMAP(flexible Multi Analyte Profiling)技术的新型生物芯片技术平台,它是在不同荧光编码的微球上进行抗原 抗体、酶 底物、配体 受体的结合

液相芯片技术的原理与应用

液相芯片,也称为微球体悬浮芯片(suspension array,liquid chip),是基于xMAP(flexible MultiAnalyte Profiling)技术的新型生物芯片技术平台,它是在不同荧光编码的微球上进行抗原抗体、酶底物、配体

如何利用人工智能来改善人类健康?

  近年来,越来越多的科学家们开始使用人工智能技术加速多项领域的研究,当然了他们也取得了很多研究成果,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,与大家一起学习!  【1】Com Biol Med:人工智能帮助治疗糖尿病引发的眼疾  doi:10.1016/j.compbiomed.2018.10.0

BMC Plant Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

  野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通

二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测

中科院李劲松团队等筛选小鼠骨发育中的关键基因

  大规模隐性遗传筛查是一种用于鉴定生物过程基因的有效方法。这种策略在低等生物中已经成功,如酵母(酿酒酵母)和线虫(秀丽隐杆线虫)。在哺乳动物生物中,由于它们的二倍体基因组,这种功能筛选具有挑战性。RNA干扰(RNAi)目前用于通过靶向mRNA在哺乳动物细胞中进行基因组规模的功能丧失筛选;然而,这种

狙击艾滋病毒――“引蛇出洞”还是“关门打狗”?

  曾庆平   有很多非专业或跨专业人士对于人类为何数十年攻克不了艾滋病难题感到迷惑不解,那是因为他们不太了解艾滋病毒致病的“特洛伊木马”机制。   艾滋病毒之所以能“摧毁”人类的免疫系统,是因为它们专门感染并杀死免疫细胞。不过,只要它们在免疫细胞内复制并产生新的病毒,人体都能立即识别它们并设法

知识分享:维真腺病毒系统产品手册

  产品说明书   本产品仅限用于研究,严禁用于疾病诊断。   本产品仅供购买方内部研究使用,未经Vigenebio公司书面许可,严禁转售。   产品有限责任担保   Vigenebio保证您收到的产品符合产品目录上的规格。本担保规定了Vigenebio更换产品的责任。Vigenebio不提

荧光素酶基因标记肿瘤细胞的实验步骤

哺乳动物生物发光,一般是将Firefly luciferase基因(由554个氨基酸构成,约50KD)即荧光素酶基因整合到预期观察的细胞染色体DNA上以表达荧光素酶,培养出能稳定表达荧光素酶的细胞株,当细胞分裂、转移、分化时, 荧光素酶也会得到持续稳定的表达。将标记好的细胞接种到实验动物

超级耐药菌接踵而至!科学家们如何正面刚?

  随着关于“超级细菌”的新闻的不断出现,人们对耐药细菌和超级细菌的担心和恐慌也与日俱增。诚然,耐药基因的出现成为了压垮抗生素的最后一根的稻草,而超级细菌的出现则给人类的生命健康带来了红果果的威胁。那么在这些威胁面前,科学家们如何应用最新知识和技术来创造对抗这些细菌的新技术和新方法呢?本文就为大家盘

《科学家》期刊:2018 top 10创新产品

随着大数据和全基因组测序的发展成熟和大量研究的广泛开展,有时不免让人觉得研究人员将他们的显微镜(microscope)更换为宏观镜(macroscope)。但是,《科学家》杂志举办的2018年十大创新竞赛讲述了一个不同的故事:单个细胞。在《科学家》杂志的独立评审团评选出的2018年十大创新产品中,它

Biotechniques盘点癌症中的microRNA

  microRNA是癌症个性化医疗的希望,人们一直希望能够解析它们的确切作用机理,并将其应用于临床。然而事实证明,这是一项充满挑战性的工作。   MicroRNA是可以沉默基因表达的非编码单链短RNA分子。尽管越来越多的证据表明,microRNA在癌症中的作用很重要,但人们依然对其知之甚少。康奈

核仁小RNA(snoRNAs)的功能及其在癌症研究中的作用介绍

  核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加工处理形成成熟的核仁小RNA[2]

吸烟到底有多少危害?你知道吗?

  【1】PLoS ONE:可怕!吸烟男性所生儿子的精子数量或会下降一半  doi:10.1371/journal.pone.0207221  有研究表明,孕妇在孕期吸烟会降低男性后代机体的精子数量,近日,一项刊登在国际杂志PLOS ONE上的研究报告中,来自瑞典隆德大学的科学家们通过研究发现,相比

2017年5月HIV研究亮点进展

  人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV),即艾滋病(AIDS,获得性免疫缺陷综合征)病毒,是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒。1983年,HIV在美国首次发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒(lentivirus),属逆转录病毒的一种。  IV通