单细胞数据挖掘算法方面取得新进展
图 SEVtras高效识别单细胞转录组数据中的胞外小囊泡 在国家自然科学基金项目（批准号：32025009、32130020等）资助下，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在单细胞数据挖掘算法方面取得新进展，研究成果以“SEVtras识别单细胞转录组中液滴分辨率的胞外小囊泡（SEVtras delineates small extracellular vesicles at droplet resolution from single-cell transcriptomes）”为题，于2023年12月4日在《自然•方法》（Nature Methods）杂志发表。论文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-023-02117-1。 胞外小囊泡是由细胞分泌的微小囊泡，携带蛋白质、脂质和RNA等多种内容物，广泛存在于组织微环境中，充当细胞间信息交流的“信使”角色。胞外小囊泡在癌细胞转移......阅读全文
干细胞来源的小细胞外囊泡
Sci Trans Med:间充质干细胞来源的小细胞外囊泡可促进心肌梗死后的血管生成 干细胞来源的小细胞外囊泡(Small extracellular vesicles, sEV)促进心肌梗死(myocardial infarction, MI)后血管生成，但是导致这些效果的sEV成分以及工程
猪乳小细胞外囊泡研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497308.shtm
猪乳小细胞外囊泡研究获进展
近日，在华南农业大学教授张永亮与副教授陈婷的指导下，该校博士研究生梁佳琪等人首次发现了猪乳小细胞外囊泡对猪流行性腹泻病毒（PEDV）的抑制作用，并阐明了发挥作用的关键miRNA及其抑制PEDV的作用机制。相关研究发表于Antiviral Research。PEDV作为生猪养殖过程中常见的腹泻病毒，可
个性化抗癌药物运载工具：胞外囊泡
细胞释放微小的囊状结构“纳米囊泡（nanovesicles）”进行细胞间化学信息沟通，这些囊泡是天然的抗癌药物配送载体。 “目前，天然纳米囊泡可从细胞培养上清获得，然后再被填充，”宾夕法尼亚州立大学生物医学工程博后Yuan Wan说。“但是用它们治疗癌症主要存在两个问题，一是短时间内纳米囊泡的
UBL3影响蛋白质向小型胞外囊泡转化
外泌体是一种小型胞外囊泡（sEVs），来自于多泡体（MVBs），通过运输蛋白质、mRNA和miRNA介导细胞间的通信。然而，哪类蛋白质被归为sEVs的分子机制还不是完全清楚。在这里，作者报道了泛素样3（UBL3）膜锚定的Ub折叠蛋白MUB作为翻译后修饰因子PTM调节蛋白向胞外囊泡转化。作者发现U
细胞外囊泡的检测方法
外泌体具有磷脂双分子膜结构，导致其沉降系数和蛋白质聚集体有着很大的不同。而且外泌体膜表面存在特异性膜蛋白如CD9和CD81，前者被证实和肿瘤迁移有关，后者与丙型肝炎病毒的侵染有关。而因为外泌体具有这些显著的易分离的特点，我们可以通过密度梯度离心，亲和层析等方法对外泌体进行分离和纯化。细胞外囊泡的检测
间充质干细胞源性胞外囊泡调节免疫功能研究
间充质干细胞（MSCs）是在机体内广泛存在的一种具有自我更新能力和多向分化潜能的组织干细胞。它不仅能够促进损伤组织的再生修复，也能够通过调控免疫细胞的增殖、分化和功能状态，调节炎症因子水平, 调节免疫功能。近年来，MSCs和各种炎症因子的互作机制得到了越来越多的关注。同时，由于MSCs被认为是产
定细菌释放的胞外囊泡结构或能降低HIV的扩散
近日，一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自美国国立卫生研究院等机构的科学家们通过研究发现，栖息在阴道中的特定细菌或会释放纳米级别的囊泡来保护机体有效抵御HIV的感染。图片来源：NIH 胞外囊泡(Extracellular vesicles， EVs)
《J－Extracell－Vesicles》利用红细胞胞外囊泡，有望治疗乳腺癌
2022年4月22日获悉，在一项新的研究中，来自新加坡国立大学、南洋理工大学和新加坡科技研究局的研究人员证实了红细胞释放的纳米大小的囊泡是一种递送免疫治疗性RNA分子以抑制乳腺癌生长和转移的可行平台。该研究利用红细胞释放的小型的脂质膜包围颗粒，即红细胞胞外囊泡（RBCEV），成功递送了RIG-I激活
探究分泌和摄取用于细胞间通讯的外泌体和其他胞外囊泡
尽管在20世纪60年代后期首次描述了在哺乳动物组织或液体中，有囊泡在细胞周围存在，但是直到2011年才提出通用术语“胞外囊泡（extracellular vesicle, EV）”来定义所有的由脂质双层包围的胞外结构，如图1所示。在1980年代，人们描述了EV可以通过质膜向外出芽或通过细胞内内吞
细胞外囊泡（细胞微粒、外泌体）检测（一）
细胞外囊泡细胞外囊泡（Extracellular Vesicles, EVs）是指从细胞膜上脱落或者由细胞分泌的双层膜结构的囊泡状小体，直径从40nm到1000nm不等。胞外囊泡主要由微囊泡（Microvesicles, MVs）和外泌体（Exosomes, Exs）组成，微囊泡是细胞激活
细胞外囊泡（细胞微粒、外泌体）检测（二）
（2）ZL的折射率校正功能利用流式细胞仪进行细胞外囊泡检测往往需要使用标准微球（microspheres）来校正和设门（Set Gate），常用的微球材料有聚苯乙烯（Polystyrene）和二氧化硅（silica），国际血栓与止血协会和标准化委员会（ISTH SSC）推荐用于循环微粒（微囊
细胞外囊泡中磷酸化蛋白质组学研究
蛋白磷酸化水平的变化可指针疾病的变化，但却鲜有磷酸化蛋白被开发成为疾病诊断标记物。细胞外囊泡是由膜封闭的微环境，不受外界蛋白酶和其他酶的影响。这使得细胞外囊泡在体液中高度稳定，为开发磷酸化蛋白应用于医学诊断提供了契机。今天为大家介绍一篇细胞外囊泡中磷酸化蛋白相关的文章：Phosphoproteins
细胞外囊泡（细胞微粒、外泌体）检测新趋势
细胞外囊泡细胞外囊泡（Extracellular Vesicles, EVs）是指从细胞膜上脱落或者由细胞分泌的双层膜结构的囊泡状小体，直径从40nm到1000nm不等。胞外囊泡主要由微囊泡（Microvesicles, MVs）和外泌体（Exosomes, Exs）组成，微囊泡是细胞激活、损伤或凋
细胞外囊泡中富含lncRNA编码多肽/小蛋白且有疾病特异性
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来，越来越多实验证据表明，许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框（small open reading frame，smORFs）可以编码多肽/小蛋白（smORF encoded polypeptides or micr
细胞外泌体/微囊泡解析专题（三）
B、D图： 显示两组样本外泌体CD47表达异常，乳腺癌组CD47明显表达减少，统计学差异P值=0.004说明巨噬细胞启动吞噬效力。E图：在B、D图个选取N=60人份血液标本。 未配对t检验，P值
细胞外泌体/微囊泡解析专题（二）
培养细胞图A：Apogee A50- MicroZL光散射器， 小角度光散射（SALS），中角光散射（MALS）和大角度光散射（LALS）全方位检测细胞内部颗粒，图D，E F：Apogee Mix ZL微珠微珠作为内参，设置阈值。图G：设置样本空白、同型对照可以观察到MDA-MW-231 MCF-
细胞外泌体/微囊泡解析专题（一）
外泌体是细胞分泌的纳米囊泡（EV），其直径大小为30-150nm之间，具有闭合的脂质双分子层结构。 它几乎存在于所有体液中，并在其表面以及胞内中携带各种分子（蛋白质，脂质和RNA等物质外泌体携带大量特异性的蛋白质（如细胞因子、生长因子）以及功能性的mRNAs、miRNAs等生物活性物质，在体
空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例
单细胞转录组测序技术的如火如荼，伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展，可以看到，在现有的高通量检测技术领域，这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展，到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展，相信在接
癌症囊泡标记物纳米流式分析方法
近年来，胞外囊泡 EVs研究领域的迅速发展, 已经吸引了大量科学家和临床工作者的关注, 特别是那些癌症生物学研究学者更是希望能深入研究探索胞外囊泡EVs在癌症诊疗方面的潜在价值。空白日前，加拿大科学家Paproski R J等人首次研究证实，通过使用超灵敏纳米流式对胞外囊泡EVs的释放量进行
美国绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱
美国麻省理工学院和布罗德研究所的科研人员绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱，为深入理解大脑结构与功能提供了重要基础。该团队基于109万个高质量空间分辨单细胞基因表达定义出小鼠大脑更精细的组织区域，绘制出的大规模分子空间图谱囊括了超100万个细胞及其基因表达特征、空间坐标、分子细胞类型、分
单细胞转录组制备仪的功能
fluidigm C1 单细胞自动制备仪用于 mRNA 测序 更完整的流程 -首尾相连的流程对单细胞进行全转录组分析 最高的通量 -每次运行可前所未有的平行处理 96 个单细胞 更容易的操作 -直接从单细胞开始，简化的样本制备，只需 3 小时手工操作时间，没有 片段化和纯化步骤 更节省的成
没有最多，只有更多细胞外囊泡中磷酸化蛋白质组学研究
蛋白磷酸化水平的变化可指针疾病的变化，但却鲜有磷酸化蛋白被开发成为疾病诊断标记物。细胞外囊泡是由膜封闭的微环境，不受外界蛋白酶和其他酶的影响。这使得细胞外囊泡在体液中高度稳定，为开发磷酸化蛋白应用于医学诊断提供了契机。 今天为大家介绍一篇细胞外囊泡中磷酸化蛋白相关的文章： Phosp
微流控芯片技术助力细胞外囊泡产量提高
2022年12月24日，中国科学院深圳先进技术研究院杨慧课题组的最新研究成果发表在生物医学工程领域TOP期刊Materials Today Bio上。研究团队研发了一种微流控芯片技术，实现了细胞的工程化改造，并显著提高了细胞外囊泡的分泌量。 深圳先进院客座博士生郝锐、博士生胡师为该论文的共同第
液滴微流控：单细胞高通量液滴测序（Dropseq）
细胞是生物结构与功能的基本单位，形态类型千差万别。通过细胞基因组学，可以描述细胞特性及功能，本文所介绍的单细胞（single-cell）高通量液滴测序（Drop-seq）技术，是一种快速分析成千上万个单细胞的方法，通过将每个细胞包裹在纳升级微滴中，进行RNA杂交并生成mRNA转录物，制作细胞基因表达
单细胞转录组重要研究文献汇总（二）
4.单细胞转录组测序在植物领域崭露头角相比动物的单细胞研究，由于植物具有细胞壁的特点，使得植物的单细胞研究相比较难，但是继2月份的拟南芥根组织单细胞转录组学研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又发表了一篇基于拟南芥根组织的单细胞转录组学研究报道[9]。来自德国图宾根大学植
单细胞转录组重要研究文献汇总（一）
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。