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北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库

多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化在气相催化反应中的关键作用。该研究成果发表在《美国化学会志》上(J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 14650),共同第一作者是博士生柏彧、张文华副研究员和博士生张振华。 电荷转移是多相催化反应中的一个关键过程,其效率很大程度上取决于催化剂的表面电荷密度。尽管过去业界已在催化剂表面晶面调控方面取得了长足进展,理性调控此类固体材料的表面电荷状态依然是一个挑战。研究人员在先前研究中以二维体系为模型结构,发现不同材料复合带来的表面极化可有助于催化性能的提高。然而在二维模型中,有效的表面极化只能促使电荷穿过原子尺度厚度......阅读全文

表观遗传研究指南(二)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi

NCBI GenBank数据库的起源、功能和常遇问题及解答

GenBank数据库功能为一、提交获取的基因序列;二、查找已知基因的序列生物学特性信息,例如编码区,科学命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢? GenBank数据库起源 GenBank数据库是1982年由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建

NCBI使用方法之二:如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列

1、进入NCBI主页在search后面选择Gene,在for后面填写需要查找的基因的名字。点击“Go”,出现了很多基因序列,在每个序列的右边还有“Order cDNA clone” 的链接,这些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的,有些是别名(Other Aliases)与你的目的基因一致

融资频频 从华大智造大额融资解析国产测序市场

  短短一个月内,齐碳科技、华大智造、塞纳生物先后宣布完成融资。国产基因测序仪再一次冲上了医疗健康领域的热点话题。  多年来,测序仪行业一直处在少数几家国外巨头的垄断之下。华大智造近两年的频繁动作虽然吹响了国产测序仪反攻的号角,但是从目前的市场占有率上看,想要最终实现进口替代,可能还需要些时间。  

CRISPR/Cas9设计工具,让基因编辑不再高冷!

  CRISPR/Cas9已经成为最常用的基因编辑系统。CRISPR/Cas9包括2部分:Cas9核酸内切酶和sgRNA(single guide RNA),sgRNA由天然的tracrRNA (transactivating crRNA)和crRNA (CRISPR RNA)融合而来。   使用

表观基因组学研究指南(三)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal

昆明动物所等开发完成犬类SNP数据库DoGSD

  家犬作为人类生活和工作中的伙伴,其进化研究一直是遗传学研究中的一个热点。然而目前使用的家犬参考SNP数据集,不仅数量少,采样地不够广泛,而且测序覆盖度差异大,SNP数据主要只来源于两个品种的两个犬只,并不利于家犬的群体遗传研究。  目前,二代测序产生了大量高质量的家犬和其祖先物种灰狼的全基因数据

生物实验室-石墨烯基因芯片快速测出测出基因突变

  自2011年基因编辑专用工具CRISPR-Cas9专利申请至今,生物生物学家有着了精准定位编写DNA编码序列的遗传基因“剪子”。单层碳原子构成的石墨烯被称作“原材料之王”,科学研究石墨烯特性的生物学家因而喜获2010年诺贝尔物理奖。当CRISPR技术性和石墨烯融合,会撞击出哪些趣味的結果?  

未提交原始数据!“基因编辑婴儿”试验注册申请被驳回

  因未提交原始数据供审核,贺建奎“基因编辑婴儿”试验注册申请日前已被中国临床试验注册中心驳回。据该中心网站消息,因贺建奎未能在承诺的11月28日践约提供原始数据,且未回答中心关于该试验伦理审查、知情同意过程、研究设计、试验实施地、经费来源等方面的两次质询,决定驳回其补注册申请,从11月30日起将该

Nature重大成果:最全面的人类器官表观基因组图谱

  多年来,科学家们成功获得了人类基因组的工作图——编码人类生命的完整DNA序列图像。而现在他们仍然在往这一图集添加新页面——散布在DNA链上,影响了基因抑制的化学标记物——甲基的图谱。  来自Salk研究所的科学家们报告称,他们构建出了来自个体捐赠者(包括女人、男人和孩子)十多种不同人类器官最全面

sgRNA的设计与载体构建

实验概要1. CRISPR的介绍:       CRISPR的全称为Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic  Repeats(规律成簇的间隔短回文重复序列)。实际上就是一种基因编辑器,由于细

NCBI使用方法之一:Map viewer查找基因序列,RNA,启动子

下面以人的IL6(白细胞介素6)为例讲述一下具体的操作步骤 一、打开Map viewer页面,网址为 在search的下拉菜单里选择物种,for后面填写你的目的基因。   二、点击“GO”: 三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框,在Gene前

一步一步教你使用NCBI数据库资源

相关专题随着ncbi 数据库各种资源的涌现,NCBI已经成为科研工作者必不可少的资料查找,数据分析的工具。那么NCBI数据如何使用,新手入门一步一步教你认识和使用NCBI数据库。一 综合数据库NCBI数据库集美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology

巧用“基因检测”破解网站“指纹”识别难题

  “基因检测”算法可以运用于网站“指纹”的精准识别?这看似跨度很大的想法却在电子科技大学计算机科学与工程学院2013级直博生卓中流的努力下变为了现实。  由于受到生物医学领域的基因序列检测算法的启发,卓中流提出了一种高效的网站指纹检测算法,弥补了传统模型无法对多级页面跳转进行建模的缺陷,同时提高了

Nature:CRISPR浪潮席卷学界

  每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时,Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司,研究者们把自己使用的分子工具存放在这里,以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出,一篇大热的论文一发表,几分钟内他们就

CRISPR:基因编辑刚初出茅庐

  每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时,Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司,研究者们把自己使用的分子工具存放在这里,以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出,一篇大热的论文一发表,几分钟内他们就

全球共享的基因组数据库办不下去了,怎么办?

  1资金困境  作为世界上最具权威性的人类疾病相关的基因目录第五十个生日时,它面临着令人不安的变化。在接下来的几年里,美国国家人类基因组研究所(NHGRI)预计退出作为基因组数据库的始祖——称为在线人类孟德尔遗传(OMIM)唯一的资助者。谁将继承标签尚未明确。当美国国家卫生研究院(NIH)评估其数

手把手教你设计shRNA

  一、认识shRNA:   在研究基因功能中,RNAi由于可以特异性地使基因沉默或表达量降低而成为生物实验中的有力工具。其中,shRNA是可以克隆至表达载体并表达siRNA双链的DNA分子。今天给大家分享两种能快速设计shRNA的方法。   二、shRNA的设计:   1. Si

2017年3月Cell期刊不得不看的亮点研究

  3月份即将结束了,3月份Cell期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Cell:长生不老药有望即将来临  doi:10.1016/j.cell.2017.02.031  在一项新的研究中,研究人员发现一种肽能够选择性地寻找和破坏阻止组织正常更新的衰老细胞,并且证

2012中国医学科学院蛋白质组学研讨会大会报告

  中国医学科学院药物研究所 再帕尔研究员  来自中国医学科学院药物研究所的再帕尔·阿不力孜教授带来了题为《基于LC-MS/MS技术的代谢组学分析方法研究与应用进展》的报告。   再帕尔教授首先对比了NMR、LC-NMR与LC-MS、GC-MS在代谢组学分析当中的优缺点,发现在代谢组学复杂样本体系的

一步步教你利用Blast分析验证引物序列

引物设计完成之后,需要用软件 进行分析,找到最佳的引物对,采用Blast分析验证引物,可以知道序列的正确性,也能知道引物的特异性状况、引物的具体位置以及PCR产物的大小。先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列,可以通过全文(如最先发现该基因的文章),全文中有时可以找到大鼠c-jun

STR鉴定报告看不懂,希尔博士来解忧

  STR是什么意思?   STR(Short Tandem Repeats,短串联重复序列)分析已被国际细胞系鉴定协会(ICLAC:International Cell Line Authentication Committee )、ATCC、NIST(美国国家标准局)等权威机构作为金标准应用于

小学生研究基因获奖受质疑 网友称科研水平与博士相当

  7月12日,一则云南省昆明市盘龙小学六年级学生陈某石通过研究突变基因“在结直肠癌发生发展中的功能与机制”,获得全国青少年科技创新大奖的信息,在社交媒体中广为传播。有网友指出,这样的科研水平,远远超出一个小学六年级学生的认知范围,“背后肯定存在严重的学术腐败,呼吁严查。”  7月13日,云南省科协

基因疗法浪潮汹涌而来 谁会是下一个“明星”?

  2018年开始,基因疗法领域持续升温。诺华(Novartis)以87亿美元的金额收购基因疗法公司AveXis,并推动Zolgensma获批上市,也堪称是这一时代最具代表性的事件之一。转眼间,2019年即将过去,不得不说,这一年基因疗法的火热程度相比去年似乎又上了一个台阶。就在今年的最后一个月里,

表观基因组学研究指南(一)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi

科学家转而寻求DNA技术来寻找尼斯湖水怪

  一个由科学家组成的国际团队计划在下个月对苏格兰的尼斯湖进行疏浚-寻求的不是神秘的怪物,而是像之前做过的那么多,而是它的DNA足迹。图片来源于网络  也许。不要期待你的希望。即使是该项目的领导者,新西兰奥塔哥大学的尼尔杰梅尔也怀疑尼斯湖怪兽确实存在。进化遗传学教授一直非常坦率地表示,他将这个传说当

惊人!香蕉的DNA与人类DNA相似度竟达60%

  人体由30亿个遗传碱基对组成,而在这30亿个碱基对中,每个人特有的成分其实是很少的,这使得人类在遗传上与后代的相似度达到99.9%。图片来源于网络  最近,物理学家和企业家Riccardo Sabatini的TED演讲表明:如果把人的整个遗传密码打印出来将占约262,000页,相当于175本大书

如何利用BankIt向NCBI在线提交序列

向NCBI提交序列常用的方法有两种,其一是在线提交的BankIt,其二是用软件Sequin。在此结合网络牛人实际操作经验来总结下如何通过BankIt在线提交DNA 或RNA序列,供参考。1.整理序列信息:包括病原采集地、病原的寄主、寄主症状、采集人等基本信息;还有序列分析结果,包括序列全长

NCBI使用方法之一:Map viewer查找基因序列,RNA,启动子

下面以人的IL6(白细胞介素6)为例讲述一下具体的操作步骤一、打开Map viewer页面,网址为在search的下拉菜单里选择物种,for后面填写你的目的基因。二、点击“GO”:三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框,在Gene前面的小方框里打勾,然后点

分析细胞鉴定金标准-STR(Short TandemRepeat)短串联重复...

分析细胞鉴定金标准-STR(Short TandemRepeat)短串联重复序列STR(Short TandemRepeat,短串联重复序列)分析已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。由于目前使用错误细胞情况非常严重,越来越多的杂志要求在投稿时提供细胞STR分析数据。经常有小伙