为深化功能代谢组学与脂质组学技术研究前沿的学术对话,推进多组学技术整合在慢性疾病领域的创新转化,中国科学院大连化学物理研究所于2025年4月25日-27日举办“功能代谢组学在慢病中的转化应用国际研讨会”。会议的第一天见报道:“多组学技术整合新进展,聚焦慢病诊疗技术突破”

会议第二天,来自国内外的顶尖学者齐聚一堂,围绕代谢组学与精准医学领域的前沿研究继续展开深入交流。以下是各位报告人的精彩分享:

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德国图宾根大学医院 Prof. Rainer Lehmann

报告题目:“Unexpected or disappointing omics findings in cohort studies of chronic diseases - could this be due to limited stability of the lipidome and metabolome in blood samples?”

Rainer Lehmann 在报告中介绍了慢性疾病队列研究中组学结果意外或令人失望的可能原因。他表示,大规模多中心队列研究的血液样本功能代谢组学和脂质组学研究,对探寻慢性病诊断生物标志物等至关重要,但临床研究人员经大量数据分析后常获意外结果,原因不明。其中一个易被忽视的因素是全血样本中各类代谢物和脂质稳定性存在差异。样本采集后偏离分析前规程,或不同地点样本处理、运输及加工过程存在差异,都可能影响最终组学结果。报告旨在探讨这些差异对数据的影响程度,并解答全血样本中代谢组和脂质组稳定性、获取高质量样本的可行程序及如何检查样本质量等问题。

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英国帝国理工学院 Prof. Manuel Mayr

报告题目:Proteomics for a New Era of Precision Medicine

Manuel Mayr 在报告中介绍了精准医学新时代的蛋白质组学相关内容。当前临床在治疗分层方面存在未满足的需求,他运用先进的蛋白质组学技术,通过识别血浆和疾病相关组织中的蛋白质特征,以满足这一临床需求,改善治疗分层。报告将重点展示结合血浆和组织蛋白质组学与基因调控及共表达网络的新方法,强调整合多组学数据的必要性。通过系统理论进行数据整合,运用网络分析和机器学习等生物信息学技术,旨在为心血管疾病研究提供新见解,探索潜在治疗靶点。

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厦门大学 林树海 教授

报告题目“Technology development of lipidomics and its application in tumor immunometabolism”

林树海教授在报告中介绍了脂质组学技术发展及其在肿瘤免疫代谢中的应用。传统基于谱图匹配的脂质组学在提高脂质谱注释准确性、覆盖度、速度和深度上挑战重重。他们引入 LipidIN,这是用于全面脂质注释和反向脂质组学的先进框架。LipidIN 有包含所有潜在链组成和碳 - 碳双键位置的 1.68 亿脂质碎片化分层文库,快速查询模块能在 1 秒内实现约 700 亿次谱图查询。还利用三个相对保留时间规则开发脂质类别智能模型,减少错误注释并预测未注释脂质,且整合广谱建模产率网络再生脂质指纹,预计将覆盖度和准确率提高 20%。LipidIN 在多项任务中的应用显示其在脂质注释和生物标志物发现中的可靠性与潜力,团队还通过 LipidIN 和生物实验开展肿瘤免疫中代谢对线粒体蛋白的调控研究。

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法国里尔大学 Prof. Francois Pattou

报告题目 “Data - driven clusters of metabolic dysfunction - associated steatotic liver disease”

Prof. Francois Pattou 在报告中介绍,代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)临床结局差异大,明确表型对靶向治疗重要。团队用围绕中心点划分聚类法,依据 6 个临床变量研究 1389 名肥胖个体中 MASLD 异质性,结果应用于多个队列及英国生物银行评估疾病发病率。 发现肝脏特异性型和心脏代谢型两种 MASLD,前者慢性肝病进展快但心血管风险低,后者心血管疾病和 2 型糖尿病风险高。样本分析显示二者分别有不同肝脏转录组和血浆代谢组特征。研究为两种 MASLD 存在提供证据,因二者生物学特征和临床轨迹不同,提示需针对性治疗。

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广州国家实验室 税光厚 研究员

报告题目“Precise and functional omics - driven decoding of metabolic dysregulation in chronic diseases”  

税光厚研究员在报告中介绍,生物样本中脂质组 / 代谢组的多样性与复杂性促使分析技术不断创新改进,以满足农业和生物医学领域研究应用需求。过去 20 年脂质组学 / 代谢组学的发展得益于相关技术(尤其是质谱技术)进步及创新方法涌现,基于质谱的脂质组学 / 代谢组学已成为生物医学研究主流工具,但在结构鉴定和定量分析上仍存在技术瓶颈。其团队多年来开发了一系列精准组学策略,用于脂质组 / 代谢组的定量分析,通过精准组学结合深度数据挖掘和生物信息学分析,成功阐明人类疾病(包括慢性病)中功能性脂质或代谢物,助力慢性病精准治疗研究。

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SCIEX 高级应用工程师 侯朋艺

报告题目 “Quantitative and Qualitative Analysis of Metabolites and Lipids Using the ZenoTOF 7600 system” 

侯朋艺工程师在报告中介绍,SCIEX ZenoTOF 7600 系统是创新的高分辨率精确质量系统。它融合 Zeno 捕获脉冲与 EAD 技术,能提升灵敏度,发现新信息,每次实验可多检测 20 倍离子,有多种碎片化技术,适用于各类分子。EAD 可提供稳定数据,与 UHPLC 兼容。仪器中二者耦合能检测低丰度离子,确定分子结构。对于结构复杂的脂质,EAD 一次实验可提供完整表征信息。Zeno 捕获脉冲可按需检测低丰度离子,重新定义定量下限,MRMHR 可实现高灵敏度靶向定量。

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南京医科大学公共卫生学院 钱旭 教授

报告题目“Sensing fumarate for tumor progression”  

钱旭教授在报告中介绍,延胡索酸是连接多条代谢途径的肿瘤代谢物,其在肿瘤进展中的机制曾多不明确。研究发现,ASL 产生的延胡索酸抑制 KDM5C,推动胶质母细胞瘤进展;在 FH 缺陷型肾细胞癌中,延胡索酸积累致 PTEN 琥珀酰化,激活 PI3K/AKT 通路促肿瘤生长。 ongoing 项目显示,GSCs 中活跃的嘌呤合成途径为延胡索酸供能,促 PTEN 琥珀酰化,维持 GSC。用 NAC 消耗延胡索酸,可抑制该修饰,重激活 PTEN,增脑肿瘤对放化疗敏感性。综上,延胡索酸经表观遗传重编程和蛋白琥珀酰化修饰促肿瘤进展,或是癌症治疗潜在靶点。

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日本九州大学 Prof. Takeshi Bamba

报告题目“Development of advanced analytical technologies for next - generation metabolomics” 

Takeshi Bamba在报告中介绍了下一代代谢组学先进分析技术的发展情况。代谢组学作为对代谢物的综合分析方法,是高分辨率表型分析和标记物识别的有效工具,应用于多领域研发。代谢组学主要通过样品制备、仪器分析和数据挖掘三个过程进行,相关技术复杂。包括其团队在内的众多研究者,二十多年来致力于开发各类代谢组学技术,但在覆盖度、定量、通量、灵敏度、准确性和可重复性等方面仍有提升空间,需进一步技术发展。同时,多数代谢组学方法只能提供静态信息,无法反映动态变化,因此开发动态分析系统也十分必要。这就需要进一步改进分析和数据挖掘技术,以建立更通用全面的代谢组学研究方法。报告中,他将介绍现有代谢组学技术,并阐述下一代代谢组学所需的关键技术。

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中国科学技术大学 包巍

报告题目“Multimodal Cohort for Biomarker Discovery in the Era of Precision Medicine”  

包巍教授在报告中介绍了精准医学时代用于生物标志物发现的多模态队列研究。在精准医学时代,对新型、灵敏且特异的生物标志物需求日益增长,但尚未得到充分满足,而队列研究是发现和验证生物标志物的有力工具。传统队列研究主要依赖问卷数据,部分采集血样进行生化分析和生物标志物测量。多模态队列则收集血液、尿液、粪便等多种生物样本,并进行MRI、CT、超声等多种医学影像检查,能够整合血液样本的基因组、代谢组和蛋白质组数据,粪便样本的宏基因组数据以及影像数据,从而更深入地评估疾病进展。报告将介绍多模态队列研究的最新进展,涵盖英国生物银行等知名队列,以及中国庐江队列等新兴队列。

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大连医科大学 Dr. Keyu Su

报告题目“Metabolism Senses Chronic Stress to Promote Tumorigenesis” 

Keyu Su在报告中介绍了代谢感知慢性应激促进肿瘤发生的相关研究。慢性心理应激和睡眠不足与癌症患者预后不良相关,这些风险因素会引发焦虑、抑郁和生物钟紊乱等负面生理效应,进而促进肿瘤生长和肿瘤干性。然而,慢性应激和睡眠不足促进肿瘤干性的机制尚不明确。研究发现,慢性应激会重塑糖酵解过程,促进乳腺癌细胞呈现干细胞样特征,用维生素C靶向乳酸脱氢酶A可显著逆转慢性应激诱导的乳腺癌进展和干性。同时,睡眠失调会重塑脂肪酸氧化(FAO)节律,促进肿瘤生长和干细胞样特性,节律性补充与睡眠相关的激素可恢复FAO节律,缓解肺癌发展。总之,研究表明慢性应激和睡眠不足会通过重新编程代谢来加速癌症发展,并为受慢性应激和睡眠不足影响的癌症患者提供了代谢干预和时间治疗策略。

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中国科学院大连化学物理研究所 Prof. Mingliang Ye

报告题目“PELSA: A Generally Applicable Proteomics Method for the Identification of Ligand - Binding Proteins and Their BindingSites for Diverse Ligands Including Drugs and Metabolites”  

叶明亮研究员在报告中介绍了PELSA,这是一种通用蛋白质组学方法,用于鉴定配体(含药物和代谢物)结合蛋白及其位点。配体与蛋白互作研究需鉴定结合蛋白及位点,团队发现配体诱导的蛋白局部稳定性变化可特殊酶解检测,据此开发PELSA,该方法无需修饰,能在蛋白组范围鉴定靶点和结合区域。通过多场景应用展示其多功能性,对R2HG的研究揭示其靶点功能及致病过程。与LiP-Quant、TPP相比,PELSA灵敏度更高,还能提供结合位点信息。其无需修饰配体,在检测弱相互作用、鉴定代谢物靶点上优势明显,是研究配体 - 蛋白互作的多功能工具。

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中国科学院大连化学物理研究所 刘心昱研究员主持大会闭幕式

许国旺研究员和Prof. Rainer Lehmann共同颁发本届优秀墙报奖

此次功能代谢组学在慢病中的转化应用国际研讨会的成功举办,促进了代谢组学与精准医学领域的学术交流与合作,为相关领域的研究注入新的活力,推动了学科的进一步发展。



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