全基因组测序的技术路线:提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行DNA簇(Cluster)制备,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。然后对测得的序列组装成Contig,通过Paired-End的距离可进一步组装成Scaffold,进而可组装成染色体等。组装效果与测序深度与覆盖度、测序质量等有关。常用的组装有:SOAPdenovo、Trimity、Abyss等。
澳大利亚默多克儿童研究所近日发布一项研究成果说,在新生儿筛查中加入基因组测序有助于额外发现数百种疾病风险,便于更早的诊断和治疗。这一研究由默多克儿童研究所与澳大利亚维多利亚州临床遗传学服务共同领衔,研......
上海交通大学联合思昆生物在国际期刊ScientificReports发表了题为“ComparativeassessmentoftheSikun2000sequencingplatformforwhol......
近日,NatureGenetics在线发表中国农业大学等团队合作的题为“Pan-genomeanalysisrevealstheevolutionanddiversityofMalus”的研究论文,该......
天麻(GastrodiaelataBI.),兰科天麻属的多年生草本植物,在中国作为传统名贵中药材已有2000多年历史。它能发挥如抗惊厥、催眠、镇静等药理作用,其主要药用成分天麻素就来自干燥后的根茎。然......
2022年8月,从纽约拉什的比绍平农场获得成熟的田间种植德国硬颈蒜鳞茎(经度:?77.6374368;纬度:43.01495449999999)。用无菌手术刀无菌切除带有花茎的大蒜植株顶部,使用带无菌......
肝癌的发病率和死亡率在癌症中位居前列,全世界每年新增病例超过90万,死亡病例超80万。在所有肝癌病例中,肝细胞癌(HCC)占比约90%,对肝细胞癌高危人群进行有效、高灵敏度的筛查显得尤为重要。目前对肝......
2023年8月8日,加利福尼亚州圣迭戈—ElementAVITI™系统(一款颠覆基因组学行业的创新DNA测序平台)的开发商ElementBiosciences,Inc.宣布扩大与安捷伦科技公司的商业合......
5月10日,国际学术刊物《自然》发表了人类泛基因组参考序列的阶段性成果,在与之相关的3篇论文当中,人类泛基因组参考联盟提出了首个人类泛基因组参考草图,以及两个以这一参考图为基础的新遗传学研究发现。自2......
雀鳝目鱼类是起源年代久远并存活至今的一个类群,其化石记录可以追溯到1.5亿年前的地层中,因此,雀鳝目鱼类的物种分化可以很好地揭示地球演化历史和水系变迁。中科院水生生物研究所研究员何舜平团队与耶鲁大学教......
中华绒螯蟹是深受国人喜爱的水产品种,其产业规模十分庞大。在养殖过程中,中华绒螯蟹受到外界刺激时容易“断手断脚”,这对其经济价值造成很大影响。近日,上海海洋大学水产与生命学院教授王成辉团队与合作伙伴一起......