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实验方法原理它需要一种编码诱饵蛋白的基因和用噬菌体表达载体，如 λgt 11 构建的适当的表达文库。编码诱饵蛋白的基因常用于在中合成重组融合蛋白。重组融合蛋白使用具放射性的 [32P] 作标记。由于 cAMP 依赖蛋白质激酶（蛋白质激酶 A，PKA）的识别位点被引入重组融合蛋白质，从而可通过 PKA 和 [γ-32P]ATP 使它酶促磷酸化。此标记蛋白质可作为探针筛选源于 λ 噬菌体的 cDNA 表达文库，这种文库读框表达 β-半乳糖苷酶融合蛋白。噬菌体裂解细胞形成噬斑并释放融合蛋白，融合蛋白吸附到硝酸纤维滤膜上，用过量的非特异性蛋白封闭滤膜来排除非特异性结合，再用放射性标记的诱饵蛋白检测。实验材料cAMP依赖型蛋白质激酶纯化的GST-诱饵蛋白质融合体（带有 PKA 识别位点）E.coli Y1090 r- 或其他适当的宿主菌试剂、试剂盒DTTPKA缓冲液[γ-32P] ATPZ'-KClSephadex G-50LB培......阅读全文
一、引言 在许多的细胞生命活动中，例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。 重组DNA技术的发展，人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要： a、鉴定分析
一、引言在许多的细胞生命活动中，例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展，人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要：a、鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件
Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆实验实验材料 寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片
Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆
在生命科学领域，没有一本书比它更红，几乎每个实验室都有，几乎每个人都翻过。它就是《分子克隆实验指南》。30年前，这本书诞生于冷泉港实验室出版社，它的前身是1980年冷泉港真核基因分子克隆讲习班实验方案的汇编。7年后，该书又出了第二版。当时的人们也许未曾料到，这部著作在20年的时间里竟成为指导生命
酵母三杂交系统（yeast three-hybrid system）可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中，RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录，可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方
实验材料寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材琼脂糖凝胶实验步骤3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片段的三维朝向对于 PCA 报告蛋白是否能正确折叠至关重要，它取决于形成复合体的目的蛋白 N 端或 C 端的朝向（图 15.1
相互作用克隆 实验方法原理 它需要一种编码诱饵蛋白的基因和用噬菌体表达载体，如 λgt 11 构建
实验材料 载体和酵母菌 试剂、试剂盒 缓冲液和溶液 SD
实验方法原理 它需要一种编码诱饵蛋白的基因和用噬菌体表达载体，如 λgt 11 构建的适当的表达文库。编码诱饵蛋白的基因常用于在中合成重组融合蛋白。重组融合蛋白使用具放射性的 [32P] 作标记。由于 cAMP 依赖蛋白质激酶（蛋白质激酶 A，PKA）的识别位点被引入重组融合蛋白质，从而可通
大量的物种相互作用研究，特别是胁迫梯度假设研究表明，随着胁迫程度的增加，群落中植物间的相互作用将从负的（竞争）向正的相互作用（互促）偏移。因此，胁迫生境中物种间的净相互作用通常表现为互促作用。然而，由于这些研究忽略了一个事实：胁迫生境中植物群落的优势种通常是克隆植物，从而未能揭示出植物的克隆性对
GST 融合蛋白作为在细菌中表达的重组蛋白，从它们被介绍以来，已用于成千上万个研究项目中（Smith and johnson 1988)。它们常常被用于制备抗体，这些抗体可用于研究蛋白质-蛋白质相互作用以及分析生化反应。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W
实验方法原理 捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中，并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用，是否需要修饰，或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为
当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间结合保持下来。这一亊实可被用于检测和确定生理条件下相关的蛋白质-蛋白质间相互作用。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料培养基中生长的适宜细胞株试剂、试剂盒乙腈考马斯亮蓝
GST 沉降实验与 far western(方案 2) 相比有—个优点：探针蛋白是在更自然的环境下与可能的搭档蛋白孵育，因而增强了相互作用的有效性。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料细胞裂解液其中蛋白质 35S 用标记试剂、试剂盒裂解
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science，预示着m6A等RNA修饰
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science，预示着m6A等RNA修饰
鉴定诱饵蛋白（半乳糖苷酶） 鉴定诱饵蛋白（LacZ 的活性分析） 相互作用蛋白捕获 实验方法原理
可利用合成双链寡核苷酸筛选构建于λ噬菌体的 cDNA 表达文库，以鉴定与特异 DNA 结合蛋白质相对应的克隆（Singhetal.1988,Vinsonetal.1988)。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒ATP结合缓冲液变性溶
用克隆化基因在体外合成的蛋白质分析DNA-蛋白质相互作用实验实验方法原理 实验材料 含有所需结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒 35S标记的蛋白5×结合缓冲液10 mg mL poly (dl-dC) • poly (dl-dC)或其他的大分子载体 DNA加样缓冲液45%甲醇 10%乙酸EN3HANC
凝胶阻滞试验分析 DNA 结合蛋白的方法是 Fried 和 Crothers(1981) 发明的，它是第一次为大肠杆菌乳糖阻抑物与其 DNA 结合位点的相互作用提供了动态的分析方法。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料作为对照的核提取物
2019年9月17日，美国科学院院刊PNAS杂志在线发表了南开大学药学院杨娜课题组与中科院生物物理所许瑞明课题组、范祖森课题组的合作研究成果，题为“A higher-orderconfiguration of the heterodimeric DOT1L-AF10 coiled-coil do
方法转化文库1. 挑选一个在第一阶段的原始对照试验中状态最好的表达诱饵蛋白和 lexAop-lacZ 报道子的酵母菌落，接种于 20 ml CM(Glu)-Ura-His 液体培养基中，30°C 摇动过夜培养。重要：应该在用文库重新转化之前 7~10d 内，将诱饵蛋白和 lexAop-lacZ 报道
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：R
作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相层析, 经典的蛋白质鉴定方法如氨
作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相
实验方法原理 酵母三杂交系统（yeast three-hybrid system）可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中，RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录，可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。试剂、试剂盒 YPD 和 SD 培养基鲑
BRET融合结构的生产构成编码BRET融合蛋白包括以下内容：1. 表达Rluc-EYFP融合蛋白的BRET融合结构的阳性对照（见注2）。2. BRET结构的阴性对照：如：单独表达Rluc和EYFP的pRluc, pEYFP，GPCRs对照（非感兴趣的GPCR）和其他融合了Rluc