定义癌症突变：破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中，DNA紧密地包裹在蛋白质周围，并以一种复杂的3D结构包装，我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤，而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组：展开呈现给细胞基因表达机器，然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中，一些区域被称为“拓扑关联域（TADs）”。这些区域包含数千到数百万个DNA碱基，它们在物理上相互作用，表明一些基因可能在一起工作。自从2012年首次被发现以来，TADs的功能还没有被完全了解，但是人们知道，破坏TADs会破坏基因调控，可能是癌细胞用来改变基因表达的一种机制。 现在，瑞士洛桑联邦理工学院的Elisa Oricchio和洛桑大学的Giovanni Ciriello合作，发现了特定基因突变导致TADs内相互作用发生改变。该基因被称为EZH2，通常参与基因转录抑制。事实上，EZH2突变对肿瘤发生起着关键作用，甚至可以用它作为几种不同类型癌症的诊断标志物。 科学......阅读全文
Nat Genet：染色体结构的重排真会影响其功能吗？
长期以来，分子生物学家一直认为，基因组的3D结构域能够控制基因的表达方式，当在果蝇中研究了高度重排的染色体后，欧洲分子生物学实验室的科学家们通过研究揭示了在某些基因中发现的一些情况，研究人员阐明了3-D基因组结构（染色体拓扑学结构）和基因表达之间的解偶联机制，相关研究刊登于国际杂志Nature
任兵教授Cell子刊解读染色质结构域
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质，使DNA受到良好的保护。 所有控制基因转录的调控蛋白，都要结合在DNA上起作用。而染色质的3D结构会随着细胞生活周期而变化，调节调控因子所能接触到的基因。
北京基因组所--单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近
物理所强关联拓扑绝缘体电子结构研究取得进展
拓扑绝缘体是近年来凝聚态物理的研究热点之一。这类材料不同于传统的“金属”和“绝缘体”，其体内部为有能隙的绝缘态，其表面则是无能隙的金属态。这种金属表面态是由其内在电子结构拓扑性质决定的，受时间反演不变性的保护，因而受缺陷、杂质等外界影响较小。目前，理论上预言的拓扑绝缘体都是半导体材料，电子间的关
任兵教授最新Cell文章点评CRISPR重要成果
细胞的染色质结构控制着基因的表达，决定着细胞的生理状态。在人类基因组中，结构变异是很常见的。不过，人们一直难以确定这些变异在人类疾病中起到了什么样的作用。 日前，科学家们在CRISPR技术的帮助下发现，一些结构变异会干扰染色质拓扑结构，使增强子-启动子互作发生异常，基因表达的时空模式发生改变，
《Nature》8月最受关注的十篇论文
英国著名杂志《Nature》周刊是世界上最早的国际性科技期刊，自从1869年创刊以来，始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。其办刊宗旨是“将科学发现的重要结果介绍给公众，让公众尽早知道全世界自然知识的每一分支中取得的所有进展”。近期《Nature》下载论文最多的十篇文章（2017年7月
Genome Biology：构建猪体细胞染色质三维结构图谱
猪不仅是重要的经济家畜，在生物医学领域也有重要应用。生猪的育种中广泛应用了辅助生殖技术，包括体外受精技术、孤雌和孤雄生殖技术等。但与体外受精胚胎相比，孤雌和孤雄胚胎的存活率级低。这一存活率差异产生的机制目前还不清楚。深入理解这一机制不仅有助于增加商业化猪育种的产仔数，也将有利于生物医学研究中转基
定义癌症突变：破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中，DNA紧密地包裹在蛋白质周围，并以一种复杂的3D结构包装，我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤，而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组：展开呈现给细胞基因表达机器，然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中，一些区域被称为“拓扑关联域（TADs）
首个棉花纤维高清动态3D基因组结构图谱建成
近日，华中农业大学棉花遗传改良团队首次构建了棉花纤维的高分辨率三维基因组结构图谱，揭示了亚基因组协作调控异源四倍体棉花纤维发育的拓扑结构基础，对棉花功能基因组研究具有重要推动作用。棉花纤维是纯净的植物单细胞类型，该研究为解析其他植物单细胞分化的转录调控机制提供了参考。相关研究成果在线发表于国际
Nature子刊：CRISPR发现表观遗传对染色体的影响
*本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供 染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化，对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展，科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作，他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神