定义癌症突变：破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中，DNA紧密地包裹在蛋白质周围，并以一种复杂的3D结构包装，我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤，而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组：展开呈现给细胞基因表达机器，然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中，一些区域被称为“拓扑关联域（TADs）”。这些区域包含数千到数百万个DNA碱基，它们在物理上相互作用，表明一些基因可能在一起工作。自从2012年首次被发现以来，TADs的功能还没有被完全了解，但是人们知道，破坏TADs会破坏基因调控，可能是癌细胞用来改变基因表达的一种机制。 现在，瑞士洛桑联邦理工学院的Elisa Oricchio和洛桑大学的Giovanni Ciriello合作，发现了特定基因突变导致TADs内相互作用发生改变。该基因被称为EZH2，通常参与基因转录抑制。事实上，EZH2突变对肿瘤发生起着关键作用，甚至可以用它作为几种不同类型癌症的诊断标志物。 科学......阅读全文
驱动染色质拓扑关联结构域形成关键因素获揭示
华南农业大学教授刘柏平团队与香港科技大学讲师常富杰、华南师范大学教授罗琼团队合作，首次揭示染色质物理特性中的DNA压缩密度是驱动染色质拓扑关联结构域形成的关键因素，为理解基因组三维结构形成机理提供了全新视角。近日，相关成果发表于美国《国家科学院院刊》（PNAS）。 “DNA压缩密度——染色质3
Nat－Genet：染色体结构的重排真会影响其功能吗？
长期以来，分子生物学家一直认为，基因组的3D结构域能够控制基因的表达方式，当在果蝇中研究了高度重排的染色体后，欧洲分子生物学实验室的科学家们通过研究揭示了在某些基因中发现的一些情况，研究人员阐明了3-D基因组结构（染色体拓扑学结构）和基因表达之间的解偶联机制，相关研究刊登于国际杂志Nature
任兵教授Cell子刊解读染色质结构域
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质，使DNA受到良好的保护。 所有控制基因转录的调控蛋白，都要结合在DNA上起作用。而染色质的3D结构会随着细胞生活周期而变化，调节调控因子所能接触到的基因。
北京基因组所单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近
物理所强关联拓扑绝缘体电子结构研究取得进展
拓扑绝缘体是近年来凝聚态物理的研究热点之一。这类材料不同于传统的“金属”和“绝缘体”，其体内部为有能隙的绝缘态，其表面则是无能隙的金属态。这种金属表面态是由其内在电子结构拓扑性质决定的，受时间反演不变性的保护，因而受缺陷、杂质等外界影响较小。目前，理论上预言的拓扑绝缘体都是半导体材料，电子间的关
任兵教授最新Cell文章点评CRISPR重要成果
细胞的染色质结构控制着基因的表达，决定着细胞的生理状态。在人类基因组中，结构变异是很常见的。不过，人们一直难以确定这些变异在人类疾病中起到了什么样的作用。 日前，科学家们在CRISPR技术的帮助下发现，一些结构变异会干扰染色质拓扑结构，使增强子-启动子互作发生异常，基因表达的时空模式发生改变，
科学家揭示衰老对免疫细胞三维染色质组织的影响
6月12日，美国国立卫生研究院衰老研究所研究员Ranjan Sen课题组，首次揭示了衰老对免疫细胞中三维染色质组织的影响，并将其与B细胞的发育和其前体细胞的功能联系在了一起，展示了基因组学和三维染色质研究在揭示衰老机制方面的巨大潜力，提供了一种未来开发抗衰老疗法的可能方向。相关研究发表于《自然—细胞
Genome－Biology：构建猪体细胞染色质三维结构图谱
猪不仅是重要的经济家畜，在生物医学领域也有重要应用。生猪的育种中广泛应用了辅助生殖技术，包括体外受精技术、孤雌和孤雄生殖技术等。但与体外受精胚胎相比，孤雌和孤雄胚胎的存活率级低。这一存活率差异产生的机制目前还不清楚。深入理解这一机制不仅有助于增加商业化猪育种的产仔数，也将有利于生物医学研究中转基
定义癌症突变：破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中，DNA紧密地包裹在蛋白质周围，并以一种复杂的3D结构包装，我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤，而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组：展开呈现给细胞基因表达机器，然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中，一些区域被称为“拓扑关联域（TADs）
《Nature》8月最受关注的十篇论文
英国著名杂志《Nature》周刊是世界上最早的国际性科技期刊，自从1869年创刊以来，始终如一地报道和评论全球科技领域里最重要的突破。其办刊宗旨是“将科学发现的重要结果介绍给公众，让公众尽早知道全世界自然知识的每一分支中取得的所有进展”。近期《Nature》下载论文最多的十篇文章（2017年7月
首个棉花纤维高清动态3D基因组结构图谱建成
近日，华中农业大学棉花遗传改良团队首次构建了棉花纤维的高分辨率三维基因组结构图谱，揭示了亚基因组协作调控异源四倍体棉花纤维发育的拓扑结构基础，对棉花功能基因组研究具有重要推动作用。棉花纤维是纯净的植物单细胞类型，该研究为解析其他植物单细胞分化的转录调控机制提供了参考。相关研究成果在线发表于国际
Nature子刊：CRISPR发现表观遗传对染色体的影响
*本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供 染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化，对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展，科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作，他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神
Nature子刊：CRISPR发现表观遗传对染色体的影响
*本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供 染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化，对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展，科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作，他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神
Nature子刊：CRISPR发现表观遗传对染色体的影响
染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化，对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展，科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作，他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神疾病的患病风险息息相关，但这一研究领域仍存在许多未解之谜。来自西
SMARCE1基因的结构特点和作用
该基因编码的蛋白质是大的atp依赖性染色质重塑复合物swi/snf的一部分，它是染色质正常抑制的基因转录激活所必需的。编码的蛋白质，单独或当在SWI/SNF复合物中，可以结合到4位连接DNA，这被认为在进入或退出核小体时模仿DNA的拓扑结构。该蛋白含有一个dna结合的hmg结构域，但该结构域的破坏并
Nature：哺乳动物着床前胚胎染色体三维结构重编程
2017年7月13日，清华大学-北京大学生命科学联合中心颉伟研究组在《自然》杂志（Nature）上发表了题为《哺乳动物早期胚胎发育过程中染色体三维结构的亲本特异重编程》（Allelic reprogramming of 3D chromatin architecture during earl
著名学者庄小威Science发表遗传学重要成果
来自哈佛大学的研究人员开发出一种成像方法绘制出了单条染色体上多个区域的位置，研究结果揭示出了一些染色质结构域和隔间（compartment）的空间组织。这一研究成果发布在8月5日的《科学》（Science）杂志上。 著名的华人女科学家庄小威（Xiaowei Zhuang）和哈佛大学的Chao-
著名学者庄小威《Nature》发布重要表观遗传发现
来自哈佛大学及麻省理工学院的研究人员称，她们采用超分辨率成像揭示出了不同表观遗传状态的独特染色质折叠。这一重要的成果发布在1月13日的《自然》（Nature）杂志上。 论文的通讯作者是著名的华人女科学家庄小威（Xiaowei Zhuang）。庄小威早年毕业于中国科技大学少年班，34岁时成为了哈
MolecularCell：精子发生过程中染色质高级结构“重编程”模式
在真核生物中，线性DNA通过多层级地折叠以特定的三维结构存在于细胞核中。染色质三维结构对于基因调控、DNA复制和细胞分裂等过程具有重要作用，其异常会导致基因表达失调和发育畸形。哺乳动物中，新的生命由精子和卵子的产生、结合以及随后的早期胚胎发育开启。在形成配子以及全能性胚胎的过程中，染色质需要经历
减数分裂前期I的染色质动力学、着丝粒和端粒关联
理解作物中影响减数分裂早期事件空间分布的机制至关重要，匈牙利学者Adél Sepsi团队的研究利用小麦-大麦7BS.7HL重组系跟踪了两个同源大麦染色体臂的染色质组织从染色体轴的形成到完整联会的过程。在减数分裂过程中不同染色体区域特异性重组的时间差异与重组启动和联会复合体形成有关。在重组启动过程中，
SMARCE1基因编码的功能和结构描述
该基因编码的蛋白质是大的atp依赖性染色质重塑复合物swi/snf的一部分，它是染色质正常抑制的基因转录激活所必需的。编码的蛋白质，单独或当在SWI/SNF复合物中，可以结合到4位连接DNA，这被认为在进入或退出核小体时模仿DNA的拓扑结构。该蛋白含有一个dna结合的hmg结构域，但该结构域的破坏并
SMARCE1基因突变因子与药物介绍
该基因编码的蛋白质是大的atp依赖性染色质重塑复合物swi/snf的一部分，它是染色质正常抑制的基因转录激活所必需的。编码的蛋白质，单独或当在SWI/SNF复合物中，可以结合到4位连接DNA，这被认为在进入或退出核小体时模仿DNA的拓扑结构。该蛋白含有一个dna结合的hmg结构域，但该结构域的破坏并
牛！庄小威又一篇Science
7月21日，发表在Science上的一项研究中，科学家们发表了关于染色体追踪的一项重要成果。哈佛大学庄小威教授以及哈佛医学院Chao-ting Wu 教授是本文的共同通讯作者。 染色质的空间组织从很大程度上影响着基因组的功能。最近，科学家们通过染色体-构象-捕捉揭示了间期染色体大量的结构信息，
Nature子刊：癌症基因组三维结构和拷贝数变异关系
来自北京大学生命科学学院，清华-北大生命科学联合中心等处的研究人员发表了题为“3D genome of multiple myeloma reveals spatial genome disorganization associated with copy number variations”的
上海生态红线陆域占上海市域陆域面积近一半
上海市日前公示了《上海市生态保护红线划示规划方案》（以下简称《方案》），征询公众意见和建议，以便进一步完善方案。 ▶ 将4364平方公里划入生态保护红线范围 党的十八届三中全会明确提出建立生态文明制度，提出“划定生态保护红线”的要求。上海市政府积极响应，在《关于编制上海新一轮城市总体规划指导
什么是信号域？
中文名称信号域英文名称signal domain定 义信号转导蛋白中保守的、没有催化作用的结构域。能与一些蛋白质上面的特异肽段或结构域等结合。这种结合起着分子接头的作用，介导信号转导蛋白的聚集和靶向定位等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），信号转导（二级学科）
同源域的定义
最初发现的同源异形蛋白的突变可使身体的一部分结构转变成相似或相关的另一部分，即同源异形现象；产生这种现象的突变称为同源异形突变，导致同源异形突变的基因称为同源异形基因，由同源异形框编码的60个氨基酸残基称为同源域。
调节域的定义
中文名称调节域英文名称regulatory domain定 义蛋白质(酶)分子上起调节作用的结构部位。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），总论（二级学科）
什么是信号域？
中文名称信号域英文名称signal domain定 义信号转导蛋白中保守的、没有催化作用的结构域。能与一些蛋白质上面的特异肽段或结构域等结合。这种结合起着分子接头的作用，介导信号转导蛋白的聚集和靶向定位等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），信号转导（二级学科）
科学家发现小鼠通过染色体聚集辨别气味
1月9日，美国哥伦比亚大学科研人员在Nature上发表了题为“LHX2 -and LDB1-mediated trans interactions regulate olfactory receptor choice”的文章，发现在小鼠嗅觉感觉神经元中（olfactory sensory neu