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我国发布首个柑桔全基因组变异数据库

近日,《园艺研究》(Horticulture Research)在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD(http://citgvd.cric.cn/home),这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。 柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前,柑桔类物种的大量基因组重测序数据涌现,可被用来评估种质遗传关系和开发分子标记,以期服务于柑桔分子育种和全基因组选择辅助育种。为方便访问、利用和分享这些数据,国家柑桔品种改良中心研究员陈善春团队开发了一个基于Web的数据库,即柑桔基因组变异数据库。 据悉,这是第一个针对柑桔且专用于全基因组变异数据和分析的专业数据库,其中变异数据包括单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(INDEL)。CitGVD V1.0包含了来自内部测序项目和公共资源的346个种质的1493258964个高质量基因组变异位点和84个表型数据。 CitGVD集成了基因组变异位......阅读全文

我国发布首个柑桔全基因组变异数据库

  近日,《园艺研究》(Horticulture Research)在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD(http://citgvd.cric.cn/home),这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。  柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前,柑桔类物

研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库

  10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul

全基因组测序确定脑瘤的基因变异

  日前,圣犹达儿童研究医院(St. Jude Children's Research Hospital)的研究人员在新研究中鉴别出了一种儿童脑瘤亚型一半以上患者的致病性突变。此外他们还证实这些肿瘤对已经在研发中的一些药物敏感。这项研究论文刊登在了近期出版的《自然-遗传学》(Nature Genet

北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库

  多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化

黄瓜变异组研究奠定全基因组设计育种基础

  中国农业科学院蔬菜花卉研究所领导的国际黄瓜变异组研究团队,对115个黄瓜品系进行深度重测序,构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础。相关成果10月20日在线发表于《自然·遗传学》杂志。   据国际黄瓜基因组计划首

全基因组测序可识别癌症相关变异 有助预防护理

  美国德州大学(UT)西南医学中心研究人员证明,全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险,有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组,提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。   “全基因组测序是一种新

PNAS:外显子变异检测——全基因组测序比全外显子测序更强大

  目前,全外显子测序和全基因组测序技术在遗传分析和发现导致疾病发生的潜在基因突变方面应用越来越广泛,随着测序技术的不断迭代更新,越来越成熟,昂贵的价格会逐渐降低,那么在排除价格因素之后,全外显子测序和全基因组测序在检测外显子突变方面究竟谁更加强大呢?来自美国的科学家对这一问题进行了相关研究,其研究

北京本起疫情病例病毒全基因组测序完成,均系Delta变异

  2021年11月10日我市接报1例在京存在活动轨迹的外省协查病例后,立即响应、迅速行动、严格落实各项防控措施、坚决阻断病毒传播链条。  截至11月11日24时,全市共发现7例与外省协查病例存在关联的新冠病毒感染者,其中朝阳区2例、海淀区5例。目前北京市疾控中心实验室已完成5例确诊病例病毒全基因组

新研究构建出小麦属全基因组遗传变异图谱

  小麦是人类历史上最成功的作物之一,它起源于新月沃地一个狭小的核心区域,一万年间,从地区性的野生植物迅速转变成为全球种植面积最广的作物之一,在多种多样的环境下为人类提供大量的碳水化合物和蛋白质。然而,小麦对自然环境和人类粮食需求两方面同时适应的遗传机制尚不清楚,理解小麦适应性进化对气候变化条件下小

中国学者解析甜瓜全基因组变异图谱及进化机制

   近日,Nature Genetics线发表了中国农科院与其它机构合作完成的两篇重量级文章,文章分别构建了甜瓜全基因组变异图谱和解析了西瓜果实品质性状进化分子机制。  鉴于该两项研究的重要性,Nature Genetics杂志还同期发表了题为“Sweet genes in melon and w