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高通量PCR解析生物基肥料厌氧消化去除抗生素抗性基因

在发展中国家,畜禽养殖业仍广泛和大量地使用抗生素,畜禽排泄物成为环境抗生素抗性基因的重要储存库。抗生素抗性基因能在不同的宿主间水平转移的特征,加剧了其对居民生活健康的威胁。越来越多的证据表明,长期使用粪肥会增加农业土壤抗生素抗性。因此,评估和发展粪肥处理工艺对降低抗生素抗性基因环境传播风险至关重要。 厌氧消化和堆肥是目前用于处理畜禽排泄物的主要技术。其中厌氧消化不仅可以降解有机质、消灭病原微生物,还能产生清洁能源。近年来,畜禽粪污厌氧消化过程抗生素抗性基因的归驱受到越来越多的关注。但是由于这些研究只针对某些少数抗性基因,厌氧消化过程抗性基因消除的要素和机理研究未能获得统一的结论。 在国家自然科学基金和中科院知识创新工程等项目资助下,中国科学院城市环境研究所刘超翔研究团队采用高通量荧光定量PCR全面解析猪粪厌氧消化过程近300种抗性基因的动态变化过程,重点解析了厌氧消化温度和抗生素残留对抗性基因去除的影响。研究同时采用扩增......阅读全文

荧光定量PCR及高通量测序方法研究抗生素抗性基因

  抗生素自发明以来被广泛使用,曾经被认为是可以治愈任何细菌感染的灵丹妙药。然而,由于多种因素的影响,21世纪以来细菌抗生素抗性(耐药性)问题日益突出,导致抗菌药物治疗失效时有发生,因此抗生素抗性基因被认定为新兴污染物。细菌抗生素抗性虽然是环境中的自然现象,但随着环境中抗生素、重金属和杀菌剂等浓度升

高通量PCR解析生物基肥料厌氧消化去除抗生素抗性基因

  在发展中国家,畜禽养殖业仍广泛和大量地使用抗生素,畜禽排泄物成为环境抗生素抗性基因的重要储存库。抗生素抗性基因能在不同的宿主间水平转移的特征,加剧了其对居民生活健康的威胁。越来越多的证据表明,长期使用粪肥会增加农业土壤抗生素抗性。因此,评估和发展粪肥处理工艺对降低抗生素抗性基因环境传播风险至关重

高通量策略快速破译天然抗生素“密码”

  为了对抗抗生素耐药性感染, 日本东京大学的研究人员开发了一项高通量策略,为人工合成新候选药物的抗感染潜力提供了快速测试。  原以为抗生素的研制能够抵制细菌感染的威胁, 为病患带来更多生机。不幸地是,细菌对环境的适应能力超乎想象,多耐药性细菌的出现又为全球公众健康带来新一轮“恐慌”。于是,科学家又

eppendorf高通量PCR自动移液工作站简介

PCR反应样品的准备和加样过程在整个PCR反应中是非常重要的操作。手工加样操作很难保证每孔加样的准确性和精确性。只有自动化的加样工作站才能确保微量加样的可靠性。20年前,Kary Mullis 发明了聚合酶链反应(PCR),在生命科学研究和医药多个应用领域引起了重大的变革。从那时起,这种DNA复

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法

简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内

超高通量PCR-一次上万个qPCR

大家好,Fluidigm BioMark 系统通过集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit, IFC),将上万个微小管道、控制阀门集成到微板上,形成纳升(nL)量级的反应仓,不需特别移液器,就可以同时进行多达近万个常规qPCR (传统Taqman 或其他) 实验。操作简单,

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法

 简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达zui灵敏,zui可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法(三)

PCR 芯片实验体系    完整的PCR芯片实验体系包括RT2ProfilerTM PCR芯片,RT2 Real-TimeTM  SYBR Green PCR反应体系和cDNA合成试剂盒。所有这些组分均为基于SYBR  Green的实时定量PCR反应优化。精心设计的引物和优化的PCR反应体系一起,为

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(一)

摘  要:制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm,与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法(五)

重复性 实时定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重复性强。为检测重复性,2位研究者采用了同样的总RNA样品,分别进行了4次重复试验。两个人使用同种PCR芯片,但批号不同,并且每个人都分两天进行试验。比较两位研究者分别做的4张芯片的原始Ct值。图5显示了比较结果的图示和相关系数。每一组比较结果均获得理