高通量PCR解析生物基肥料厌氧消化去除抗生素抗性基因

在发展中国家,畜禽养殖业仍广泛和大量地使用抗生素,畜禽排泄物成为环境抗生素抗性基因的重要储存库。抗生素抗性基因能在不同的宿主间水平转移的特征,加剧了其对居民生活健康的威胁。越来越多的证据表明,长期使用粪肥会增加农业土壤抗生素抗性。因此,评估和发展粪肥处理工艺对降低抗生素抗性基因环境传播风险至关重要。 厌氧消化和堆肥是目前用于处理畜禽排泄物的主要技术。其中厌氧消化不仅可以降解有机质、消灭病原微生物,还能产生清洁能源。近年来,畜禽粪污厌氧消化过程抗生素抗性基因的归驱受到越来越多的关注。但是由于这些研究只针对某些少数抗性基因,厌氧消化过程抗性基因消除的要素和机理研究未能获得统一的结论。 在国家自然科学基金和中科院知识创新工程等项目资助下,中国科学院城市环境研究所刘超翔研究团队采用高通量荧光定量PCR全面解析猪粪厌氧消化过程近300种抗性基因的动态变化过程,重点解析了厌氧消化温度和抗生素残留对抗性基因去除的影响。研究同时采用扩增......阅读全文

荧光定量PCR及高通量测序方法研究抗生素抗性基因

  抗生素自发明以来被广泛使用,曾经被认为是可以治愈任何细菌感染的灵丹妙药。然而,由于多种因素的影响,21世纪以来细菌抗生素抗性(耐药性)问题日益突出,导致抗菌药物治疗失效时有发生,因此抗生素抗性基因被认定为新兴污染物。细菌抗生素抗性虽然是环境中的自然现象,但随着环境中抗生素、重金属和杀菌剂等浓度升

高通量PCR解析生物基肥料厌氧消化去除抗生素抗性基因

  在发展中国家,畜禽养殖业仍广泛和大量地使用抗生素,畜禽排泄物成为环境抗生素抗性基因的重要储存库。抗生素抗性基因能在不同的宿主间水平转移的特征,加剧了其对居民生活健康的威胁。越来越多的证据表明,长期使用粪肥会增加农业土壤抗生素抗性。因此,评估和发展粪肥处理工艺对降低抗生素抗性基因环境传播风险至关重

高通量策略快速破译天然抗生素“密码”

  为了对抗抗生素耐药性感染, 日本东京大学的研究人员开发了一项高通量策略,为人工合成新候选药物的抗感染潜力提供了快速测试。  原以为抗生素的研制能够抵制细菌感染的威胁, 为病患带来更多生机。不幸地是,细菌对环境的适应能力超乎想象,多耐药性细菌的出现又为全球公众健康带来新一轮“恐慌”。于是,科学家又

eppendorf高通量PCR自动移液工作站简介

PCR反应样品的准备和加样过程在整个PCR反应中是非常重要的操作。手工加样操作很难保证每孔加样的准确性和精确性。只有自动化的加样工作站才能确保微量加样的可靠性。20年前,Kary Mullis 发明了聚合酶链反应(PCR),在生命科学研究和医药多个应用领域引起了重大的变革。从那时起,这种DNA复

超高通量PCR-一次上万个qPCR

大家好,Fluidigm BioMark 系统通过集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit, IFC),将上万个微小管道、控制阀门集成到微板上,形成纳升(nL)量级的反应仓,不需特别移液器,就可以同时进行多达近万个常规qPCR (传统Taqman 或其他) 实验。操作简单,

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法

 简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达zui灵敏,zui可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法

简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(四)

2.3  高通量的分子标记检测 本方法制备的DNA浓度虽然低,用96针复制器加入0.5~1 µL模板进行33~35个PCR循环就可获得足够浓度的产物,并不需要加入特别多的Taq酶(甚至使用量为每45~50 µL PCR反应液1 U也能扩增分子标记)。该方法已对数万份水稻样品进行了分子标记(S

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(一)

摘  要:制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm,与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(三)

PCR 芯片实验体系    完整的PCR芯片实验体系包括RT2ProfilerTM PCR芯片,RT2 Real-TimeTM  SYBR Green PCR反应体系和cDNA合成试剂盒。所有这些组分均为基于SYBR  Green的实时定量PCR反应优化。精心设计的引物和优化的PCR反应体系一起,为

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(一)

简介:什么是PCR芯片? 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(三)

将纯化定量的水稻品种(93-11)基因组DNA标准样品(0.5~8 ng)与1.0 µL本方法制备的水稻品种(02428)基因组DNA混合作为模板,用InDel 标记引物(表1)进行PCR扩增和PAGE检测。箭头指某反应(或2个反应之间)其02428与93-11条带的信号值大致相等(即DNA

高通量植物(转)基因检测的利器植物材料直接PCR技术

  高通量植物(转)基因检测的利器---植物材料直接PCR技术   摘要: 北京百泰克生物技术有限公司暨推出通用植物总RNA提取试剂盒(RP3301)成功解决了各种难提植物RNA的问题后,新近又针对高通量植物DNA的提取扩增推出了最新产品——植物直接PCR试剂盒(PR7501),该试剂盒不需要

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(二)

PCR芯片的设计和所包含的基因 96孔模式的每种RT2Profiler PCR芯片,含有基因特异性引物,可用于研究84个与某种信号通路或者疾病相关的基因。此外,芯片中还有设置了3个检测实验质量的对照。图2为PCR芯片模式图。由于每种芯片都是根据特别的信号通路或者特定的应用范围设计的,研究者可以用它来

高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(二)

1.2  植物材料  1.2.1 水稻秧苗。将1.6-mL 96方孔板底部用6 mm电钻头打穿,或将旧96孔PCR板的底部剪去约4 mm。使用时将方孔板压入少量泥巴。每孔放入1粒萌动的水稻种子,在自然日光下(或人工气候箱)生长至3~4片叶。其他植物小苗也可用类似方法种植。 1.2.2 水稻大植株的鲜

高通量植物(转)基因检测的利器——植物材料直接PCR技术

摘要:  北京百泰克生物技术有限公司暨推出通用植物总RNA提取试剂盒(RP3301)成功解决了各种难提植物RNA的问题后,新近又针对高通量植物DNA的提取扩增推出了最新产品——植物直接PCR试剂盒(PR7501),该试剂盒不需要液氮和研磨杵研磨,也不需要钢珠破碎,更不借助任何特殊的仪器设备,方法及其

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(四)

RT2ProfilerTM PCR芯片特点灵敏度 研究者总是希望能检测到表达量相当低的基因,有时候,研究者得到的起始总RNA量也很少,但仍希望能进行实时定量PCR检测。为了满足研究者的这些需要,Superarray严格检测了PCR芯片系统的灵敏度。例如,Superarray使用PCR芯片检测了一系列

高通量植物(转)基因检测的利器植物材料直接PCR技术

  摘要: 北京百泰克生物技术有限公司暨推出通用植物总RNA提取试剂盒(RP3301)成功解决了各种难提植物RNA的问题后,新近又针对高通量植物DNA的提取扩增推出了最新产品——植物直接PCR试剂盒(PR7501),该试剂盒不需要液氮和研磨杵研磨,也不需要钢珠破碎,更不借助任何特殊的仪器设备,方法及

PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(五)

重复性 实时定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重复性强。为检测重复性,2位研究者采用了同样的总RNA样品,分别进行了4次重复试验。两个人使用同种PCR芯片,但批号不同,并且每个人都分两天进行试验。比较两位研究者分别做的4张芯片的原始Ct值。图5显示了比较结果的图示和相关系数。每一组比较结果均获得理

BioDigital.青数字PCR:实现更高通量的核酸绝对定量

  ——上海小海龟科技有限公司总裁吴东平博士专访  分析测试百科网讯 2021年3月28日,第十八届中国国际检验医学暨输血仪器试剂博览会(简称“CACLP”)在“山城”重庆悦来国际博览中心召开。在本次展会上,上海小海龟科技有限公司(简称小海龟科技)为观众带来了全自动化数字PCR解决方案。分析测试百科

质谱高通量检测蜂蜜和蜂王浆抗生素残留新方法

  近日,中国农业科学院蜜蜂研究所蜜粉源植物产地识别与控制创新团队建立了一种能够同时分析蜂蜜和蜂王浆中涉及的42种抗生素的高通量技术方法。相关研究成果近期发表在著名学术期刊《食品化学(Food Chemistry)》上。  我国现有的蜂蜜和蜂王浆国家标准中抗生素残留检测标准方法众多,每个产品中每种或

高通量测序

  高通量测序技术又称“下一代”测序技术,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括:大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。  高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DN

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序技术

没有测序的癌症诊断是不完整的,完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说,NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者,大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序技术-中的“高通量”-是什么意思

高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后,高通

高通量组织研磨机低温以及高通量研磨工艺

 高通量组织研磨机是一种特殊的、快速的、率的、多试管的一致系统。在水平方向上进行振动的,研磨球的惯性带动它们以高能量撞击位于弧形内表面的样品材料,从而达到粉碎研磨的效果。它能将任何来源(包括土壤、植物和动物的组织/器官、细菌、酵母、真菌、孢子、古生物标本等)的原始DNA、RNA和蛋白质进行提取和纯化

高通量基因点样仪

  高通量基因点样仪是一种用于基础医学领域的医学科研仪器,于2016年11月17日启用。  技术指标  1.X 轴移动速度:50-250mm/s;Y 轴移动速度:100mm/s;Z 轴移动速度:100mm/s;X,Y,Z轴移动精度:± 0.2mm;划线头定位精度:± 0.2mm。2.划头最小间距:

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu