木乃伊肺部DNA发现肺结核基因揭示古代疾病史

英国华威大学的研究人员利用宏基因组学技术,从一个215年历史的木乃伊中发现了肺结核(TB)基因组。这项成果于2013年7月18日发表在《新英格兰医学杂志》上。1994年,匈牙利发现了一个包含242具尸体的地下墓室。许多尸体被自然木乃伊化,包括Terézia Hausmann的遗体,她死于1797年12月25日,享年28岁。之前对其胸部样本的分子分析证实了肺结核的诊断,并暗示TB DNA在其体内保存得非常完好。 于是,Mark Pallen教授领导的研究小组从肺部组织中提取出DNA,并在Illumina MiSeq上对DNA进行测序,获得了550万个末端配对读取。他们发现,不到1%的读取定位到人类基因组,而8%定位到结核分枝杆菌(M.tuberculosis)参考菌株H37Rv。 由于Pallen教授所在的实验室未培养结核分枝杆菌,也没有开展相关的PCR分析,同时他们获得了深度且均一的基因组覆盖,故他们......阅读全文

PacBio助力感染菌株基因组重测序

  Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目,而他自己的研究也主要在病原体检测,药物基因组学,睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前,他曾经就职于PacBio,Sage Bionetworks和Merck。他有

我国学者揭示结核病“北京家族”菌株起源

  复旦大学基础医学院教育部、国家卫生计生委医学分子病毒学重点实验室高谦课题组与国内外研究人员合作,利用全基因组测序的方法,首次揭示了结核病“北京家族”菌株的起源和与汉族人群共同扩散的历程。该成果对于认识我国结核病流行株的致病特征、提示疾控部门监控流行菌株、防止其大规模传播具有重要意义。相关成果今天

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

成都生物所完成脱落酸高产菌株全基因组测序

  3月8日,从中科院成都生物研究所科技处获悉,在上海人类基因组研究中心的协作下,该所完成了脱落酸高产菌株灰葡萄孢霉(Botrytis cinerea) TBC-A的全基因组测序及分析工作。   B. cinereaTBC-A是成都生物所经过多年改良筛选及系统研发的、具有自主知识产权

印度绘制出结核杆菌基因组图谱

  印度科学与工业研究理事会会长布拉姆哈查里近日宣布,印度研究人员成功绘制出了结核杆菌的基因组图谱,这将有助于研发有效治疗结核病的新型药物。   综合当地媒体报道,来自印度全国的数百名研究人员参与绘制出了包含4000个基因的结核杆菌基因组图谱。   据悉,印度将在互联

新研究直击结核病基因组与耐药性

  数个独立研究团队为来自世界不同地区的结核分枝杆菌进行了全基因组测序,成果于9月2日发表在《自然—遗传学》期刊上。相关研究有望为耐药性结核病疫情的出现提供新见解,并为耐药性测试和药物开发提供新标靶。   美国马萨诸塞州总医院教授Maha Farhat领衔的研究小组,为全球123种具有代表性的

结核病如何影响人类基因组

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454759.shtm 今年3月,一项利用古人类DNA的最新研究揭示了过去2000年里结核病如何影响欧洲居民免疫系统,特别是结核病对人类基因组的影响。 该研究的重点是TYK2基因的一个变种——P11

什么是菌株

  菌株又称品系,表示任何由一个独立分离的单细胞(或单个病毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其后代。因此,一种微生物的每一个不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。根据菌株的定义,菌株实际上是某一微生物达到“遗传性纯”的标志,一旦菌株发生变异,均应标上新的菌株名称。当进行菌种保藏、筛选或科学研究时,在

菌株的分类

  菌株又称 品系,表示任何由一个独立分离的单细胞(即单个病毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其后代。因此,一 种 微生物的每一个不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。根据菌株的定义,菌株实际上是某一微生物达到“遗传性纯”的标志,一旦菌株发生 变异,均应标上新的菌株名称。当进行 菌种保藏、筛选或科学

科学家揭示基因型保守的结核分枝杆菌表型差异遗传基础

  结核病已连续两年超过HIV成为全球第一大传染病。据WHO结核年报报道,2015年全球新增结核病例1040万,死亡180万。另外,目前全球约有三分之一人口(约20亿)为结核菌携带者,感染者中约1/10的人最终会发展为活动性结核。结核分枝杆菌复合群(MTBC)是引发结核病的元凶,其成员在基因组序列上

木乃伊肺部DNA发现肺结核基因-揭示古代疾病史

  英国华威大学的研究人员利用宏基因组学技术,从一个215年历史的木乃伊中发现了肺结核(TB)基因组。这项成果于2013年7月18日发表在《新英格兰医学杂志》上。1994年,匈牙利发现了一个包含242具尸体的地下墓室。许多尸体被自然木乃伊化,包括Terézia Hausmann的遗体,她死于17

Nat-Genet:-四项研究同时解码结核病

  至今为止,人们都没有找到一个好的时机彻底消灭肺结核,不仅如此,肺结核病菌变得更加猖獗。   结核病是一种由结核分枝杆菌引起的慢性呼吸道传染病,严重危害人类健康。我国的结核发病率位于世界第二,每年有130万新发结核病患者。其中,多耐药结核病人有10万人。耐多药(MDR)和广泛耐药(XDR)结核分

Nature解析病毒如何从动物传染给人类

  结核病(Tuberculosis)是世界上最持久、最致命的传染性疾病之一。每年都有一到两百万人因此而丧生。  研究结核病的科学家们一直在争论它的起源。最新一项研究表明结核病很可能是由非洲人类传染给海豹和海狮,然后这些动物将这种细菌带到南美洲,并传染给当地的原住民,此后欧洲登上了这片大陆,也传染上

将菌株反复冻存,到底对菌株有什么影响?

低温会使菌株细胞内的水分形成冰晶,从而引起细胞结构尤其是细胞膜的损伤。细胞体积大者一般要比较小者对低温更为敏感,而无细胞壁者则比有细胞壁者敏感。如果放到低温(不是一般冰箱)进行冷冻时,会产生冰晶,冰晶呈针状,极易导致细菌的严重损伤。用电镜观察,可见细菌的核膜上有大量针尖样小孔,当从低温下移出并开始升

复旦大学PNAS发表全基因组测序新发现

  复旦大学上海医学院高谦(Qian Gao)教授课题组的研究人员与来自中国、西班牙、瑞士等国的科学家们展开合作,在新研究中采用全基因组测序结合大规模基因分型揭示出了结核分枝杆菌北京家族菌株的起源、进化及其与现代人类迁移的联系。这项研究发布在6月15日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。  

标准菌株怎样保存

可使用冻干保藏、利用多孔小珠(磁珠)在-70℃保藏或使用液氮保藏等方法。菌株不同保藏方法也不尽相同,应根据文献资料选择最佳保藏方法。对于从标准菌种冷藏中心或经ISO9000 质量管理体系认证或其它有效的认证的商业机构获得原包装的质控菌株,复苏和使用应按照制造商提供的使用说明进行。

菌株的保存使用

  1、新引进的 菌种经形态、染色、培养性状、生化特性等的鉴别确定后作记录,并进行保存。  2、长期保存的储存菌株以 冷冻干燥保藏为主, 特殊要求的菌种可用其它方法进行保存,保存期可长达几年至几十年。  3、半储存菌株以含20%甘油的肉汤或液体 石腊封存的半固体琼脂为主,在0℃以下保存,保存期为3-

菌株的保藏方法

1、传代保存法:有些微生物当遇到冷冻或干燥等处理时,会很快死亡,因此在这种情况下,只能求助于传代培养保存法。传代培养就是要定期地进行菌种转接、培养后再保存,它是最基本的微生物保存法,例如酸奶等常用生产菌种的保存。传代保存时,培养基的浓度不宜过高,营养成分不宜过于丰富,尤其是碳水化合物的浓度应在可能的

什么是标准菌株?

亦称模式菌株 。在给某细菌定名,分类作记载和发表时,为了使定名准确和作为分类概念的准则,以纯粹活菌(可繁殖)状态所保存的菌种。相当于动植物分类中的模式标本。在进行细菌等的分类和鉴定时,生理学和生物化学特性十分重要,但若就这些性质进行试验,就必须应用许多纯分离的新细胞。因此,作为分类标准的菌种,也有必

怎样做好质控菌株

一.建立信心:首先要自信,渊博的知识和丰富的经验是必需的,但如果是初次操作,也不要惊慌失措,就把质控当作一份普通的标本对待,鉴定可严格按照科-属-种的思路,药敏严格按照新的CLSI/NCCLS进行.(这就要求大家平常就要重视专业知识的学习和经验的积累.)做错了没关系,谁都有第一次,谁都不能保证永远正

菌株的保藏方法

1、传代保存法:有些微生物当遇到冷冻或干燥等处理时,会很快死亡,因此在这种情况下,只能求助于传代培养保存法。传代培养就是要定期地进行菌种转接、培养后再保存,它是最基本的微生物保存法,例如酸奶等常用生产菌种的保存。传代保存时,培养基的浓度不宜过高,营养成分不宜过于丰富,尤其是碳水化合物的浓度应在可能的

中国科学家Nature子刊基因组测序新成果

  感染结核病永远都不会有一个最合适的时间,近年来形势变得更加的糟糕。   尽管已经开展了数十年的抗生素研究,随着结核耐药菌株的增长,当前的治疗方案仍然非常的有限。在2010年,至少有65万结核病例对两种最有效的一线抗生素耐药。在2012年,在印度发现了完全耐药和无法有效治疗的结核分枝杆菌。  

生物物理所揭示结核分枝杆菌耐药性相关的新遗传变异

  结核病是一种由结核分枝杆菌作为病原菌引起的慢性呼吸道传染病,严重危害人类健康。我国的结核发病率位于世界第二,每年有130万新发结核病患者。其中,多耐药结核病人有10万人。耐多药(MDR)和广泛耐药(XDR)结核分枝杆菌的广泛出现使结核病越来越难以治愈。结核病耐药机制的是当前全球结核病研究竞争中最

取用菌株时操作原则

菌种保存复苏的原则,要求慢冻快融,之所以要求快速,是因为在菌种复苏的过程中, 长时间的溶解过程会对所保存的菌种造成损伤,建议遵循菌种的保存复苏原则,保证所复苏菌种的复苏率。

简述菌株的保存使用

  1、新引进的菌种经形态、染色、培养性状、生化特性等的鉴别确定后作记录,并进行保存。  2、长期保存的储存菌株以冷冻干燥保藏为主,特殊要求的菌种可用其它方法进行保存,保存期可长达几年至几十年。  3、半储存菌株以含20%甘油的肉汤或液体石腊封存的半固体琼脂为主,在0℃以下保存,保存期为3-6个月。

关于益生菌菌株的不同

  益生菌产品都是以菌株为主,一些益生菌产品选用一种菌株,而更多益生菌产品则会添加几种菌株混合,以叠加产品功效。  益生菌菌株,多来自动物体内,如两歧双岐杆菌、鼠李糖杆菌,瑞士乳杆菌、植物乳杆菌等等。  两歧双歧杆菌,是人体自出生就产生的,具有较高稳定性,有助提高钙铁磷的利用率,舒缓腹泻便秘,抑制有

菌株原理及保存方法

菌株原理:耐药菌株是指在长期的抗生素选择之后出现的对相应抗生素产生耐受能力的菌株。细菌的耐药性,是指细菌多次与药物接触后,对药物的敏感性减小甚至消失,致使药物对耐药菌的疗效降低甚至无效。耐药菌株的出现增加了感染性疾病治愈的难度,并迫使人类寻找新的对抗微生物感染的方法。菌株保存使用:1、新引进的菌种经

标准储备菌株的制备

  标准储备菌株是标准菌株经过一次传代后制备的多份相同的菌株。  将检查完纯度的复活后的培养物制备成菌悬液,液体选用TSB、兔血或脱脂牛奶,加入甘油,使甘油终浓度10%~15%。将菌悬液分装到多个无菌、带螺旋盖的塑料小管中。标准储备菌株要制备多份,然后先在0℃~4℃冰箱中预冷30min,再在-25℃

小菌株酝酿大产业

  近年来,一家英国公司和一家中国公司频繁到访中国科学院遗传与发育生物学研究所(以下简称遗传发育所),他们有一个共同的目标——枯草芽胞杆菌HF1。  日前,枯草芽胞杆菌HF1成果研发及转化项目负责人、遗传发育所分子农业中心研究员胡赞民和高级工程师陈宇红在接受《中国科学报》记者采访时,解释了被两家企业

常用微生物菌株

常用微生物菌株 /质控菌株/对照菌株  菌种编号菌种名称菌种编号菌种名称ATCC 16404黑曲霉CMCC(B) 51105痢疾志贺氏菌CMCC(F) 98003黑曲霉CMCC(B) 51572福氏志贺氏菌As 3.2788桔青霉CMCC(B) 51592宋氏志贺氏菌MIG3.104绳状青霉ATCC