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DNA拓扑学参数介绍

1.连环数(Linking number):在双螺旋DNA中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以L 表示(或以α表示),其计数方法为处于松弛环形DNA时的螺旋周数,肯定为整数,右手螺旋为正、左手螺旋为负。2.缠绕数(Twisting number):即DNA分子中的Watson-Crick螺旋周数,以T 表示(或以β表示),其数值可直接在处于最稳定状态下的双链环形(或超螺旋形式)DNA中的实际螺旋周数计数得到,不一定是整数,右手螺旋为正,左手螺旋为负。但必须注意T仅针对于形成双螺旋区域而言,解链部分的bp数就不涉及T的计算。对于一定长度的DNA双链,一旦出现解链T值就减少。如260bp B-DNA双链自然状态下T=25,解链20%时的T=20 。3.超螺旋数 或 纽数(Writhing number):其数值有公式L=T+W 计算得到,以W表示(或以τ表示),不一定为整数。左手超螺旋为正,右手超螺旋为负(此点解释见后)。4......阅读全文

DNA拓扑学参数介绍

1.连环数(Linking number):在双螺旋DNA中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以L 表示(或以α表示),其计数方法为处于松弛环形DNA时的螺旋周数,肯定为整数,右手螺旋为正、左手螺旋为负。2.缠绕数(Twisting number):即DNA分子中的Watson-Crick螺旋

什么是DNA拓扑学?命名来源

首先以一260 bp双链线形B-DNA为例,此DNA在松弛时,螺旋数为25(260/10.4),首尾连接成环形后,为一松弛环形DNA,并处于最稳定状态。若将此线形DNA先拧松2个连环再连成环形,则可以形成两种环形DNA,一种称为松弛解链环形DNA;另一种环形DNA称为超螺旋DNA,其螺旋周数为25,

Cell:从拓扑学角度揭示DNA复制之谜

  生命分子存在缠绕的现象。但是,DNA双螺旋中那两条熟悉的链是如何在没有缠绕的情况下成功复制的,这就很难解释了。在一项新的研究中,来自美国康奈尔大学的研究人员从拓扑学角度解决了这个问题。他们研究了这种双螺旋形状对DNA复制的影响。通过使用真核生物作为模型系统,他们发现染色质(由DNA、组蛋白和非组

DNA血样采集卡性能参数/使用方法介绍

DNA血样采集卡使用方法1、用打孔器从所FTA卡上取下一小块样品。对于血液和细菌基因DNA样品,建议取1.2mm圆片。其它类型样品,取2.0mm圆片。将样品圆片放入PCR扩增管。2、加入200微升FTA纯化试剂(沃特曼产品编号:WG120204)。3、在室温下培养5分钟(如需要,可在管内进行适当的人

DNA合成(DNA synthesis )技术介绍

蛋白质概念提出:DNA多肽合成(DNA synthesis ):按照预定核苷酸的顺序,将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法,即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸,可自动化操作。)目前,oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,此方法具有高效

DNA连接酶(DNA ligase)介绍

DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外),而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA

DNA提取方法介绍

DNA提取主要是CTAB方法,其他的方法还有物理方式如玻璃珠法、超声波法、研磨法、冻融法。化学方式如异硫氰酸胍法、碱裂解法。 生物方式:酶法。根据核酸分离纯化方式的不同有硅质材料、阴离子交换树脂等。

DNA测序用水介绍

  DNA测序可以看作是三种技术或步骤的组合:  步骤1:通常通过基于PCR的技术生成DNA片段  步骤2:通过毛细管或常规琼脂糖凝胶电泳分离片段  步骤3:检测步骤,最常见的是荧光检测。  水质对每个步骤的影响将在单独的部分中介绍。  这里简要介绍了水质的影响。用于操作DNA测序仪的水质应符合某些

科学家利用拓扑学探究树叶形状影响因素

  植物的故事与它们的叶子息息相关。长在湿冷环境中的树木多会有边缘带锯齿的大叶子,而长在干热地带的树木的树叶则会小而平滑。  现在科学家已经描绘了一个包含来自全世界75 个地点的141个植物家族的18.2万种树叶的地图,以便讲述植物的故事。利用这一地图,研究人员能以14.5%的准确率从树叶的形状估计

DNA测序技术的介绍

  DNA测序(DNA sequencing,或译DNA定序)是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。  在基础生物学研究中,和在众多的应用领域,如诊断,生物技术,法医