DNA拓扑学参数介绍
1.连环数(Linking number):在双螺旋DNA中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以L 表示(或以α表示),其计数方法为处于松弛环形DNA时的螺旋周数,肯定为整数,右手螺旋为正、左手螺旋为负。2.缠绕数(Twisting number):即DNA分子中的Watson-Crick螺旋周数,以T 表示(或以β表示),其数值可直接在处于最稳定状态下的双链环形(或超螺旋形式)DNA中的实际螺旋周数计数得到,不一定是整数,右手螺旋为正,左手螺旋为负。但必须注意T仅针对于形成双螺旋区域而言,解链部分的bp数就不涉及T的计算。对于一定长度的DNA双链,一旦出现解链T值就减少。如260bp B-DNA双链自然状态下T=25,解链20%时的T=20 。3.超螺旋数 或 纽数(Writhing number):其数值有公式L=T+W 计算得到,以W表示(或以τ表示),不一定为整数。左手超螺旋为正,右手超螺旋为负(此点解释见后)。4......阅读全文
DNA拓扑学参数介绍
1.连环数(Linking number):在双螺旋DNA中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以L 表示(或以α表示),其计数方法为处于松弛环形DNA时的螺旋周数,肯定为整数,右手螺旋为正、左手螺旋为负。2.缠绕数(Twisting number):即DNA分子中的Watson-Crick螺旋
DNA拓扑学的相关参数
1.连环数(Linking number):在双螺旋DNA中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以L 表示(或以α表示),其计数方法为处于松弛环形DNA时的螺旋周数,肯定为整数,右手螺旋为正、左手螺旋为负。2.缠绕数(Twisting number):即DNA分子中的Watson-Crick螺旋
DNA拓扑学的名称来源
首先以一260 bp双链线形B-DNA为例,此DNA在松弛时,螺旋数为25(260/10.4),首尾连接成环形后,为一松弛环形DNA,并处于最稳定状态。若将此线形DNA先拧松2个连环再连成环形,则可以形成两种环形DNA,一种称为松弛解链环形DNA;另一种环形DNA称为超螺旋DNA,其螺旋周数为25,
什么是DNA拓扑学?命名来源
首先以一260 bp双链线形B-DNA为例,此DNA在松弛时,螺旋数为25(260/10.4),首尾连接成环形后,为一松弛环形DNA,并处于最稳定状态。若将此线形DNA先拧松2个连环再连成环形,则可以形成两种环形DNA,一种称为松弛解链环形DNA;另一种环形DNA称为超螺旋DNA,其螺旋周数为25,
Cell:从拓扑学角度揭示DNA复制之谜
生命分子存在缠绕的现象。但是,DNA双螺旋中那两条熟悉的链是如何在没有缠绕的情况下成功复制的,这就很难解释了。在一项新的研究中,来自美国康奈尔大学的研究人员从拓扑学角度解决了这个问题。他们研究了这种双螺旋形状对DNA复制的影响。通过使用真核生物作为模型系统,他们发现染色质(由DNA、组蛋白和非组
DNA血样采集卡性能参数/使用方法介绍
DNA血样采集卡使用方法1、用打孔器从所FTA卡上取下一小块样品。对于血液和细菌基因DNA样品,建议取1.2mm圆片。其它类型样品,取2.0mm圆片。将样品圆片放入PCR扩增管。2、加入200微升FTA纯化试剂(沃特曼产品编号:WG120204)。3、在室温下培养5分钟(如需要,可在管内进行适当的人
科学家利用拓扑学探究树叶形状影响因素
植物的故事与它们的叶子息息相关。长在湿冷环境中的树木多会有边缘带锯齿的大叶子,而长在干热地带的树木的树叶则会小而平滑。 现在科学家已经描绘了一个包含来自全世界75 个地点的141个植物家族的18.2万种树叶的地图,以便讲述植物的故事。利用这一地图,研究人员能以14.5%的准确率从树叶的形状估计
4个参数教你鉴别DNA提取磁珠
1、磁珠的概念磁珠是生物磁珠的简称,是生物化学与材料学的有效结合,磁珠兼具液体流动性和固体磁性材料的特点,在外磁场的作用下可以定向移动和集中,当外磁场撤去后,稍加振荡或抽吸即可均匀分散于液体中。随着生物学研究的深入和材料技术的进步,生物磁珠在生物技术领域的应用越来越广泛和深入。2、磁珠的结构生物磁珠
DNA序列分析电泳仪技术参数
电泳仪电源按电压分为高压1500~5000V、中压500~1500V、低压500V以下三种;按电流分为大电流500mA~2000mA、中电流100~500mA、小电流100mA以下三种;按功率分为大功率200~400W、中功率60~200W、小功率60W以下三种。基本参数外形尺寸(L×W×D):47
DNA合成(DNA-synthesis-)技术介绍
蛋白质概念提出:DNA多肽合成(DNA synthesis ):按照预定核苷酸的顺序,将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法,即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸,可自动化操作。)目前,oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,此方法具有高效
20点直播-|科学公开课——来自拓扑学的邀请
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494430.shtm 直播时间:2023年2月23日(周四)20:00 直播地址: (直播间链接) 科学网微博 科学网APP 科学网视频号 科学网B站
DNA连接酶(DNA-ligase)介绍
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外),而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较双螺旋A-DNAB-DNAZ-DNA碱基倾角/°2067碱基间距/nm0.260.340.37螺旋直径/nm2.552.371.84每轮碱基数111012大沟很狭、很深宽、较深平坦小沟很宽、浅狭、较深很狭、很深糖苷键构象反式反式C反式、G顺式螺旋方向右右左
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较双螺旋A-DNAB-DNAZ-DNA碱基倾角/°2067碱基间距/nm0.260.340.37螺旋直径/nm2.552.371.84每轮碱基数111012大沟很狭、很深宽、较深平坦小沟很宽、浅狭、较深很狭、很深糖苷键构象反式反式C反式、G顺式螺旋方向右右左
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较双螺旋A-DNAB-DNAZ-DNA碱基倾角/°2067碱基间距/nm0.260.340.37螺旋直径/nm2.552.371.84每轮碱基数111012大沟很狭、很深宽、较深平坦小沟很宽、浅狭、较深很狭、很深糖苷键构象反式反式C反式、G顺式螺旋方向右右左
如何根据NaNoDrop测出的参数估计DNA浓度值
比色皿用的都是新的石英比色皿,应该不是比色皿的原因,比色皿中差不多要有3ml的量,这样稀释200倍就需要15微升的DNA,我是直接从活性污泥里提取DNA,提取量不是很大,所以想能不能把稀释倍数提高,但上次测定是负 ...比色皿新不新和有没有问题没有任何关系质量差的比色皿,两只之间有个0.0几的吸光值
重组-DNA-技术介绍
中文名称重组 DNA 技术英文名称recombinant DNA technique定 义在体外将两个或多个不同的DNA片段全部或部分构建成一个DNA分子的方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
DNA提取方法介绍
DNA提取主要是CTAB方法,其他的方法还有物理方式如玻璃珠法、超声波法、研磨法、冻融法。化学方式如异硫氰酸胍法、碱裂解法。生物方式:酶法。根据核酸分离纯化方式的不同有硅质材料、阴离子交换树脂等。
DNA测序用水介绍
DNA测序可以看作是三种技术或步骤的组合: 步骤1:通常通过基于PCR的技术生成DNA片段 步骤2:通过毛细管或常规琼脂糖凝胶电泳分离片段 步骤3:检测步骤,最常见的是荧光检测。 水质对每个步骤的影响将在单独的部分中介绍。 这里简要介绍了水质的影响。用于操作DNA测序仪的水质应符合某些
DNA发卡结构介绍
发卡结构(hairpin structure):这些结构是由于DNA单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,形成氢键结合而成的,称为发卡结构。又译:发夹结构。
DNA足迹法介绍
DNA足迹法,中文名称:DNA足迹法英文名称:DNA footprinting定义:检测DNA序列中DNA结合蛋白识别部位的一种方法。
光子拓扑自旋态研究新成果拓展光的拓扑学研究范畴
拓扑缺陷在物理学上通常指场分布无法连续形变、物理量无法定义的特殊点,也称为奇点,在涡旋或拓扑结构中普遍存在。拓扑缺陷在宇宙学、流体动力学、空气动力学、声学以及生物学等领域也十分常见,并在某些应用中起着重要作用。 近年来,探索拓扑结构的电磁类比在光学和光子学中引起了极大兴趣。在集成光子学领域,微
DNA拓扑异构酶的基本信息
DNA拓扑异构酶为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状DNA为底物。
DNA拓扑异构酶的功能介绍
中文名DNA拓扑异构酶外文名DNA topoisomerase性 质生物类 别酶功 能实现DNA超螺旋的转型定义DNA拓扑异构酶为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状DNA为底物。
DNA拓扑异构酶(DNA-topoisomerase)的相关介绍
为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状DNA为底物。在闭环状双链DNA的拓扑学转变中,要暂时的将DNA的一个链或两个链切断,根据异构体化的方式而分为二个型。切断一个链而改变拓扑结构的称为Ⅰ型拓扑异构酶(top -oisomera
B型DNA和Z型DNA的要点介绍
1.两条反向平行的互补双螺旋链,一条方向为5‘→3’,另一条方向为3‘→5’,围绕同一中心纵轴,从右向上盘旋。 2.双螺旋磷酸-脱氧核糖主链在外,位于内的碱基平面与中心轴垂直。 3.每个碱基相聚0.34nm,同条链相邻碱基夹角36度,每10个碱基形成螺旋1周,螺距3.54nm。 4.露于螺
关于DNA解旋酶的介绍
通常为流体蛋白环,通过ATP水解产生的能量由解旋酶装载器装载到DNA单链上(单链穿过环中央),有3‘--5’或5‘--3’方向极性,该极性就是它结合的单链的极性。它像DNA聚合酶一样具有延伸性。 与解旋酶装载器结合,装载到单链DNA上之前,DNA解旋酶是没有活性的,只有解旋酶装载器将它装载到单
DNA探针的来源介绍
DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNA探针(cDNA probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不
反义DNA的技术介绍
随着分子生物学和遗传工程的发展,基因治疗应运而生,反义技术是其中一种,它的基础是根据核酸杂交原理设计针对特定靶序列的反义核酸,从而抑制特定基因的表达,包括反义RNA、反义DNA及核酶(Ribozyme),它们通过人工合成和生物合成获得。反义DNA是指一段能与特定的DNA或RNA以碱基互补配对的方式结
抗DNA抗体的介绍
可分为单链(变性)和双链(天然)DNA抗体: (1)抗单链DNA(ssDNA)抗体:在多种疾病中及正常人血清中存在,无特异性,临床价值不大。 (2)抗双链DNA(dsDNA抗体):对诊断SLE有较高的特异性,且与SLE的活动相平行,并可作为治疗的估价。随着疾病活动的控制,抗dsDNA抗体滴度