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9102,《NatureMethods》上scRNAseq“天天”见

《Nature Methods》是专门用来对生命科学研究领域具有显著性意义的新方法和研究技术改进的经典杂志。单细胞转录组测序是2019年不折不扣的热点领域,截至2019年9月,Nature Methods总共发表了10篇关于单细胞转录组测序相关的研究报道。本期,小编和大家一起分享这些重要的研究成果。 1.用于评估单细胞RNA-seq数据批次效应的工具 来自德国计算生物学研究所的研究人员发表了“A test metric for assessing single-cell RNA-seq batch correction”的研究报道。该研究开发了一个强大、灵敏度高的基于k-nearest-neighbor批次效应评价工具(kBET; https://github.com/theislab/kBET )。研究人员使用kBET来评估常用的批次回归和标准化方法,并量化其在保留生物变异性的同时去除批次效应的程度。这对未来的......阅读全文

9102,《Nature Methods》上scRNA-seq“天天”见

  《Nature Methods》是专门用来对生命科学研究领域具有显著性意义的新方法和研究技术改进的经典杂志。单细胞转录组测序是2019年不折不扣的热点领域,截至2019年9月,Nature Methods总共发表了10篇关于单细胞转录组测序相关的研究报道。本期,小编和大家一起分享这些重要的研究成

9102,《Nature Methods》上scRNA-seq“天天”见

  《Nature Methods》是专门用来对生命科学研究领域具有显著性意义的新方法和研究技术改进的经典杂志。单细胞转录组测序是2019年不折不扣的热点领域,截至2019年9月,Nature Methods总共发表了10篇关于单细胞转录组测序相关的研究报道。本期,小编和大家一起分享这些重要的研究成

食用油天天见,食品安全更重要

食用油作为一种最常见的油脂,可以为人体提供充分的营养,而且很多食品的基础原料也是食油。随着社会的发展,人们对于食物的安全问题越来越重视,因此要不断提高食用油的质量安全,只有使用科学的检测方法,才能在很大程度上保证食用油的安全。  食用油包括植物油和动物油脂,其中最为常见的就是植物油,作为人们生活的必

《Nature Methods》大脑地图图解

  多年来,出现了多种“大脑地图”,每一种都关注不同的大脑过程,从新陈代谢到认知功能。虽然这些地图很重要,但单独使用它们会限制研究人员从中得出的发现。  现在,来自蒙特利尔神经学研究所的一个团队和其他研究人员在一个地方汇集了40多张现有的大脑地图。这个被称为神经图谱的数据库有望帮助科学家发现不同大脑

Nature Methods揭示AIDS的惊人动态

  Emory大学的科学家们利用一种新成像技术,首次在活体动物(恒河猴)中获得了全身性的艾滋病毒复制实时图谱,揭示了猴艾滋病毒SIV出人意料的藏身处。这项发表在Nature Methods杂志上的研究显示,当猴子接受抗逆转录病毒(ARV)药物治疗时,机体不同位置残留的病毒量并不相同。研究人员开发的新

Nature Methods发布新RNA测序技术

  Santa Cruz公司和Rochester大学的研究人员开发了一种新的RNA测序技术。他们通过这一技术发现了许多此前未被检测到的调控性小RNA。这一成果发表在八月三日的Nature Methods杂志上。  这个新技术可以在细胞中灵敏检测到带有化学修饰(甲基化)的小RNA。“tRNA是生物体内

Nature Methods新年展望:高多重成像

  今年第一期《Nature Methods》评出了2015的年度技术——单颗粒冷冻电镜(cryo-EM)。除此之外,该杂志还对一些热门技术进行了一番展望,包括细胞内蛋白标记、精准光遗传学、高多重成像、亚细胞图谱分析等等。  荧光团之间的光谱重叠,是成像复杂生物学结构的一个主要障碍。这种限制让绝大多

Nature Methods:预测干细胞的命运

  多伦多大学的研究人员开发出了一种方法,可以快速地筛选人类干细胞以及更好地控制它们的转化。这一技术有潜力应用于再生医学和药物研发。研究结果发表在本周的《自然方法》(Nature Methods)杂志上。   这项研究工作是由多伦多大学加拿大生物工程学首席科学家Peter Zandstra

Nature Methods:抗体验证指南首次出炉

  据估计,因抗体质量不佳,生命科学领域每年的损失达到8亿美元。同时,这也造成了无数的实验失败,浪费了宝贵的样本和科学家的青春。尽管科学界已经意识到这个问题,但目前仍然缺乏抗体验证的整体框架。  为了刺激研究界实现更高标准的抗体重复性,国际抗体验证工作组(IWGAV)近日出台了一套指南。这些指南发表

Nature Methods新年展望:细胞核结构

  今年第一期《Nature Methods》评出了2015的年度技术——单颗粒冷冻电镜(cryo-EM)。除此之外,该杂志还对一些热门技术进行了一番展望,包括细胞内蛋白标记、精准光遗传学、高多重成像、亚细胞图谱分析等等。  “位置高于一切”是房地产的金科玉律,这句话也同样适应于哺乳动物基因组。基因