研究蛋白质动态构象变化的新方法
2月28日，Angewandte Chemie International Edition在线发表了中科院生物物理研究所王江云研究组、龚为民研究组及中国科技大学田长麟研究组合作题为A Genetically Encoded 19F NMR Sensor for Tyrosine Phosphorylation的最新研究成果。该研究通过基因密码子扩展，实现在原核及真核酪氨酸激酶活性中心编码氟代酪氨酸，利用19F核磁(NMR)研究酪氨酸激酶活性中心的构象变化，这为基于酪氨酸激酶活性中心构象进行抗肿瘤药物的筛选提供了有力的工具。 酪氨酸磷酸化是一种重要的蛋白质翻译后修饰，其在酶活性、蛋白质构象及蛋白-蛋白相互作用的调节过程中发挥着极其关键的作用。酪氨酸激酶活性中心的酪氨酸异常磷酸化是导致许多疾病发生的主要原因，尤其与肿瘤的发生关系密切。目前，针对酪氨酸激酶活性中心设计的抑制剂已经成为肿瘤治疗的主要手段。但是随着酪......阅读全文
研究蛋白质动态构象变化的新方法
2月28日，Angewandte Chemie International Edition在线发表了中科院生物物理研究所王江云研究组、龚为民研究组及中国科技大学田长麟研究组合作题为A Genetically Encoded 19F NMR Sensor for Tyrosine Ph
圆二色是研究溶液中蛋白质构象
圆二色是研究溶液中蛋白质构象的一种快速、简单、较准确的方法,远紫外CD 数据能快速地计算出溶液中蛋白质的二级结构;近紫外CD 光谱可灵敏地反映出芳香氨基酸残基、二硫键的微环境变化,蕴含着丰富的蛋白质三级结构信息。随着现代分析仪器的飞速发展,高压液相色谱、停流技术、电化学及荧光等附加装置与CD 光谱仪
朊病毒的“蛋白质构象致病假说”介绍
1982年，普鲁宰纳提出的朊病毒致病的“蛋白质构象致病假说”，以后魏斯曼等人对其逐步完善。其要点如下： ①朊病毒蛋白有两种构象：细胞型（正常型PrPc）和搔痒型（致病型PrPsc）。两者的主要区别在于其空间构象上的差异。PrPc仅存在α螺旋，而PrPsc有多个β折叠存在，后者溶解度低，且抗蛋白
冷冻电镜三维结构的多构象性和动态分析
三维结构的多构象性和动态分析生物大分子通常具有内禀的柔性，所以生物分子的动态结构变化以及结构的不均一性一直是结构生物学的研究重点之一。在晶体状态下，生物分子的结构变化被晶格约束，一般只提供一个静态的结构和有限的动力学参数。冷冻电镜相比晶体学方法的优势在于可以捕捉生物分子在溶液中的形态，并记录下不同
圆二色是研究溶液中蛋白质构象文献
圆二色是研究溶液中蛋白质构象的一种快速、简单、较准确的方法，远紫外CD数据能快速地计算出溶液中蛋白质的二级结构；近紫外CD光谱可灵敏地反映出芳香氨基酸残基、二硫键的微环境变化，蕴含着丰富的蛋白质三级结构信息。另外，CD光谱还能结合紫外、荧光等分析手段，了解蛋白质配体的相互作用，监测蛋白质分子在外界条
构象异构体的分子链构象
晶体中的高分子链构象晶体中的分子链构象有螺旋形构象、平面锯齿形构象等。1、两个原子或基团之间距离小于范德华半径之和时，将产生排斥作用。2、分子链在晶体中的构象，取决于分子链上所带基团的相互排斥或吸引作用的情况。3、有规立构高分子链在形成晶体时，在条件许可下总是尽量形成时能最低的构象形式。4、基本结构
构象的概念
构象（conformation），有机化学的一个重要概念。最简单的构象分析建立在乙烷分子上。最重要的构象分析则是建立在环己烷上的构象分析。
什么是构象？
构象（conformation），有机化学的一个重要概念。最简单的构象分析建立在乙烷分子上。最重要的构象分析则是建立在环己烷上的构象分析。
蛋白质的四级结构空间构象和功能的关系
一、四级结构的组成 大分子蛋白质常由多条多肽链所组成，每条多肽链各具独立的三级结构。蛋白质的四级结构是指几个各具独立三级结构之多肽链的相互结集、以特定的方式接触、排列形成更高层次的大分子蛋白质的空间构象。在蛋白质四级结构中，每个各具独立三级结构的多肽链称为亚基。组成蛋白质的亚基数多为偶数，可以是同
谷氨酰胺结合蛋白质GlnBP构象动力学研究获得进展
10月12日，复旦大学教授王文宁及其合作者在《德国应用化学》（Angew Chem Int Ed Engl.）发表题为Conformational Dynamics of apo-GlnBP Revealed by Experimental and Computational Analysis
蛋白质结构分为四个结构水平是具有特定构象的
蛋白质是具有特定构象的大分子，为研究方便，将蛋白质结构分为四个结构水平，包括一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。一般将二级结构、三级结构和四级结构称为三维构象或高级结构。 一级结构指蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序。肽键是蛋白质中氨基酸之间的主要连接方式，即由一个氨基酸的α-氨基和另一个氨基酸的
我国学者提出离子通道动态双构象转换的选择性新机制
中国科学技术大学田长麟教授研究组与德国莱布尼茨分子药物所Adam Lange及孙涵课题组合作，应用固体核磁共振、单通道电生理及分子动力学模拟等方法揭示了NaK离子通道的离子选择性新机制。该研究成果以 A single NaK channel conformation is not enough
细胞化学词汇RNA构象
中文名称：RNA构象英文名称：RNA conformation定 义：RNA分子的空间结构，构象改变并不导致共价键的断裂和生成。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
顺向构象的定义
中文名称顺向构象英文名称cisoid conformation定 义有机分子中单键为顺式的构象。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），总论（二级学科）
椅型构象的概念
在环已烷中，六个碳原子不在同一个平面内,碳碳键之间的夹角为109.5°，没有环张力，因此环很稳定。环已烷由于环的翻转可以形成多种构象，其中，椅型和船型这两种典型的构象最为重要。船型构象能量高，不能稳定存在，而椅型构象能稳定存在。
RNA构象的结构特点
中文名称RNA构象英文名称RNA conformation定 义RNA分子的空间结构，构象改变并不导致共价键的断裂和生成。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
β－转角的特定构象特点
β－转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸，某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中，由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H)，在β－转角中能很好的调整其他残基的空间阻碍，因此是立体化学上最合适的氨基酸；而脯氨酸具有环状结构和固定的角，因此在一定程度上迫使β－转角形成，促使多肽自身回折且这些回折有助于
什么是船型构象？
船型构象（boatconformation）是环已烷能保持正常键角的一个构象。从船型的Newman式中可看出，两对碳原子2，3和5，6的构象是重叠式的，这四个碳原子几乎在同一平面内，碳原子1，4则处于该平面的同一侧，其氢原子间的距离只有0.183nm，小于范氏半径之和（0.240nm）。因此，船型构
β转角的特定构象介绍
β－转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸，某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中，由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H)，在β－转角中能很好的调整其他残基的空间阻碍，因此是立体化学上最合适的氨基酸；而脯氨酸具有环状结构和固定的角，因此在一定程度上迫使β－转角形成，促使多肽自身回折且这些回折有助于
什么是椅型构象？
椅型构象（chairconformation)是环已烷最稳定的构象，其中2，3，5，6四个碳原子在同平面内C（ 1）和C（4）分别位于该平面的上下方，C（1）像椅背，C（4）像椅脚。沿着碳碳键依次看过去，相邻两个碳原子上的键都处于邻交叉式的位置，所有的键角都接近正常的四面体角，非键原子间的距离（0.
SiLAD动态蛋白质组技术拓展到体内应用
笔者从不久前在北师大召开的国家重大研究计划“重要组织和的质组学研究”项目年度总结会上获悉，项目首席科学家、北京师范大学何大澄教授课题组自主研发的SiLAD动态组已经从体外应用成功拓展到体内应用，并建立几项相关新方法。研究者对肝再生初始化过程进行了蛋白质组研究，得到35个表达水平发生特异性变化的蛋白
RNA构象的基本信息
中文名称RNA构象英文名称RNA conformation定 义RNA分子的空间结构，构象改变并不导致共价键的断裂和生成。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
构象异构体的定义
由于高分子链的构象不同所造成的异构体，又称内旋转异构体。注：（1）小分子的稳定构象数为3（n-3） （n为分子中单键碳原子数目，n>2）（2）高分子的可实现构象数远小于3（n-3），但一个高分子的可实现构象数远多于一个小分子的稳定构象数（因高分子的n值很大）。
单链构象多态性
单链构象多态性（signle strand conformation polymorphism,SSCP）是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异，这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA电泳迁移率不同，从而可用于DNA中单个碱基的替代、微小的缺失或手稿的检测。用SSCP法检查基因突变时，通常
环己烷构象的结构特点
环己烷构象（cyclohexane conformation），可分椅式（chair）、船式（boat）、扭船式以及半椅式。若环己烷分子中碳原子在同一平面上时，其C—C键角为120度，存在较大的角张力。实际上分子自动折曲而形成非平面的构象，在一系列构象的动态平衡中，椅式构象(ch air con f
细胞化学基础β转角特定构象
β－转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸，某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中，由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H)，在β－转角中能很好的调整其他残基的空间阻碍，因此使立体化学上最合适的氨基酸；而脯氨酸具有环状结构和固定的角，因此在一定程度上迫使β－转角形成，促使多台自身回折且这些回折有助于
构象异构体的应用
在不同的构象异构体之间，由于非键合原子之间作用力的不同，使构象异构体在物化性质方面均表现一定的差异。构象分析正是以化合物适当的基态、过渡态和激发态的构象，对化合物的物化性质进行分析和解释。这方面的内容因很广泛，在此只能做一般的介绍。对于构象异构体的稳定性，前面已经以乙烷、丁烷、十氢化奈和取代环己烷为
葡萄糖构象分析
与环己烷类似，只是环中一个氧原子代替了环己烷中的一个CH2，尽管氧原子与碳原子半径不同，但是氧原子周围的电子近似四面体分布，CH3OCH3与CH3CH2CH3中CH3的旋转势能也类似，因此可以用环己烷的构象近似地表示吡喃糖分子的构象。在吡喃糖环上有多个取代基，相同的取代基占平键数目较多时，其构象也相
什么是构象异构体？
种由C—C单键绕σ键旋转而产生的叫构象异构,所形成的异构体称为构象异构体.旋转而产生的异构体称为旋转异构体或构象异构体。当C—C单键旋转时，可以有无数个构象异构体，极限构象有顺叠、顺错、反错和反叠等。在顺叠构象中，两个碳上连接的氯原子和氯原子之间相距最近，产生强排斥作用，内能最高，属该分子最不稳定的
线性烷烃构象的结构特点
线性烷烃构象（linear alkane conformation），拥有交错式（staggered）、重叠式（eclipsed）与间扭式（gauche）。乙烷是最简单的含有C-C单键的化合物，如果乙烷分子中的一个碳原子不动，另一个碳原子围绕C-C键旋转时，则一个碳原子上的三个氢原子相对另一个碳原子