谷氨酰胺结合蛋白质GlnBP构象动力学研究获得进展
10月12日，复旦大学教授王文宁及其合作者在《德国应用化学》（Angew Chem Int Ed Engl.）发表题为Conformational Dynamics of apo-GlnBP Revealed by Experimental and Computational Analysis 的论文。 谷氨酰胺结合蛋白质GlnBP可以结合L型谷氨酰胺，并且与转运体协同配合完成谷氨酰胺的细胞摄入。晶体学研究表明GlnBP蛋白质存在“打开”和“关闭”两种结构。但是，构象变化动力学行为一直不清楚。该研究综合利用液体核磁、分子动力学模拟和单分子FRET等技术研究apo-GlnBP蛋白质的构象系综。核磁共振残余偶极耦合（RDCs）实验数据与分子动力学模拟的四个构象组成的系综模型相吻合，其中晶体结构之前发现的“打开”和“关闭”状态只是该系综的两种主要构象（如图所示）。其它两种构象状态的存在，证明了该蛋白质与配体相互作用的构象选择机制......阅读全文
谷氨酰胺结合蛋白质GlnBP构象动力学研究获得进展
10月12日，复旦大学教授王文宁及其合作者在《德国应用化学》（Angew Chem Int Ed Engl.）发表题为Conformational Dynamics of apo-GlnBP Revealed by Experimental and Computational Analysis
近物所电子原子碰撞反应动力学实验研究获得进展
中科院近代物理研究所原子物理一组科研人员利用自主研制的反应显微成像谱仪，完成了电子入射氖原子的单电离反应Ne (e, 2e)实验研究。研究人员从实验测量反冲离子Ne+的动量谱中，首次发现了在中低能电子入射情况下存在明显的大动量反冲离子的分布（如图1所示）。根据反冲离子的动量分布特
圆二色是研究溶液中蛋白质构象
圆二色是研究溶液中蛋白质构象的一种快速、简单、较准确的方法,远紫外CD 数据能快速地计算出溶液中蛋白质的二级结构;近紫外CD 光谱可灵敏地反映出芳香氨基酸残基、二硫键的微环境变化,蕴含着丰富的蛋白质三级结构信息。随着现代分析仪器的飞速发展,高压液相色谱、停流技术、电化学及荧光等附加装置与CD 光谱仪
大连化物所分子反应动力学研究获得突破性进展
近日，中科院大连化学物理研究所分子反应动力学研究工作获得突破性进展。由分子反应动力学国家重点室肖春雷、孙志刚、杨学明、张东辉等撰写的论文Dynamical Resonances Accessible Only by Reagent Vibrational Excitation in t
圆二色是研究溶液中蛋白质构象文献
圆二色是研究溶液中蛋白质构象的一种快速、简单、较准确的方法，远紫外CD数据能快速地计算出溶液中蛋白质的二级结构；近紫外CD光谱可灵敏地反映出芳香氨基酸残基、二硫键的微环境变化，蕴含着丰富的蛋白质三级结构信息。另外，CD光谱还能结合紫外、荧光等分析手段，了解蛋白质配体的相互作用，监测蛋白质分子在外界条
研究蛋白质动态构象变化的新方法
2月28日，Angewandte Chemie International Edition在线发表了中科院生物物理研究所王江云研究组、龚为民研究组及中国科技大学田长麟研究组合作题为A Genetically Encoded 19F NMR Sensor for Tyrosine Ph
非构象型抗体表位组学研究获进展
本报讯（记者黄辛）上海市计划生育科学研究所生殖免疫学课题组和复旦大学生命科学院基因功能课题组合作，用先前自主建立的肽生物合成方法，解码了致癌性人乳头瘤病毒58型（HPV58）所编码的三个不同长度关键蛋白的精确表位组，并展现了相关组学研究的可行性和意义。相关成果日前发表于《科学报告》杂志。 作
原子—光子量子操控研究获得进展
华东师大物理系系主任、精密光谱科学与技术国家重点实验室长江学者张卫平领衔的研究团队，在原子—光子量子操控领域取得重要的实验研究进展，最新成果日前发表在美国物理学会杂志《物理评论快报》（Physical Review Letters）上。 该实验研究表明，利用基于拉曼
痕量植物激素分析研究获得进展
近日，中国科学院大连化学物理研究所微型分析仪器研究组研究员关亚风、副研究员耿旭辉团队在微量样品中痕量植物激素分析检测研究中取得新进展。该团队发展了一种微型基质固相分散（microscale MSPD）萃取的前处理方法，能够有效地处理亚毫克级植物样品，方法简单、重复性好且收率高。同时，研究团队研发
smFRET检测GPCR调控下游蛋白arrestin的构象分布研究获进展
G蛋白偶联受体（GPCR）是目前已知的人类基因组中最大的膜蛋白家族，约30%的临床处方药的直接靶点是GPCR，负责80%左右的跨膜信号转导，参与调控人体中多数病理与生理过程。GPCR主要通过G蛋白及arrestin将细胞外的刺激转变为细胞内信号。近年来，结构生物学研究方法的进步为研究GPCR及其
基于生物分子构象变化的生物传感策略研究获进展
利用DNA分子构象变化发展新型生物传感策略 近日，权威化学综述杂志Accounts of Chemical Research发表了中国科学院上海应用物理研究所物理生物学实验室樊春海课题组撰写的邀请综述文章 (Target-responsive structures for nucleic acid
武汉物数所等建立蛋白质动态研究新方法
近日，中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳带领的生物大分子动态学研究团队和北京生命科学研究所董梦秋研究组合作，在《生物化学杂志》（The Journal of Biological Chemistry）发表题为Modeling protein excited-state structures
量子物理与机器学习结合研究取得进展
生成模型(Generative Model)是机器学习领域的重要课题和研究前沿，也被认为是通往人工智能的必由之路。历史上，物理学为生成型学习提供了很多新思路。比如，著名的玻尔兹曼机(Boltzmann Machine)就来自于统计物理中的伊辛模型及相关的反伊辛问题。最近，中国科学院物理研究所/北
结合蛋白质（2）
重要的结合蛋白质血红蛋白血红蛋白(hemoglobin)是主要存在于脊椎动物红细胞中的一种色蛋白，它的主要功能是在人体内运载氧气和二氧化碳。正常人体的100ml全血中，含血红蛋白质12～16g。人类血红蛋白含铁约为0．33%～0．34%，其相对分子质量约为67 000。血红蛋白由珠蛋白和辅基血红
结合蛋白质（1）
结合蛋白质的分子中除氨基酸组分之外，还含有非氨基酸物质，后者称为辅因子，二者以共价或非共价形式结合，往往作为一个整体从生物材料中被分离出来。单纯蛋白质是指分子组成中，除氨基酸构成的多肽蛋白成分外，没有任何非蛋白成分称为单纯蛋白质。自然界中的许多蛋白质属于此类。而结合蛋白质是单纯蛋白质和其他化合
太阳能薄膜电池研究获得重要进展
德国美因茨大学13日发表公报说，该校研究人员参与的太阳能薄膜电池研究项目取得重要进展，有望使太阳能薄膜电池突破目前20％光电转化率的纪录。 目前光电转化率最高的是铜铟镓硒（CIGS）太阳能薄膜电池，可达20％，但与超过30％的理论值仍相距甚远，其主要难题是材料中的
胰高血糖素受体全长构象变化与功能研究获进展
《自然-通讯》于7月31日在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和王明伟课题组与美国南加州大学Raymond C. Stevens、Scripps研究所Patrick Griffin和Bridget Carraghe、荷兰阿姆斯特丹自由大学Chris de Graaf和上海科技大学iHu
科学家揭示蛋白质折叠构象过程
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/5/523020.shtm据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究，美国科学家通过将数据转换为声音，揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象，并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程，为研究蛋白质从
科学家揭示蛋白质折叠构象过程
据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究，美国科学家通过将数据转换为声音，揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象，并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程，为研究蛋白质从未折叠状态到折叠状态时发生的氢键事件序列提供了独特视角。 为更好了解蛋白质折叠是如何进行的，科学家必须首先确定
科学家揭示蛋白质折叠构象过程
据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究，美国科学家通过将数据转换为声音，揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象，并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程，为研究蛋白质从未折叠状态到折叠状态时发生的氢键事件序列提供了独特视角。为更好了解蛋白质折叠是如何进行的，科学家必须首先确定一串氨基
关于蛋白质结构的侧链构象介绍
蛋白质结构：残基侧链上的原子根据希腊字母表的顺序（α、β、γ、δ、ε等）来命名，如Cα指的是对应残基上最接近羰基的碳原子，而Cβ则是次接近的。Cα通常被认为是主链骨架的组成原子。这些原子之间的键对应的二面角则相应以χ1、χ2、χ3等来命名，如赖氨酸侧链上第一、二个碳原子（即Cα和Cβ）之间共价键
嗅觉受体研究获得重要进展－胎牛血清助力细胞研究
由德国慕尼黑工业大学莱布尼茨食品系统生物学研究所的Dietmar Krautwurst领导的一组科学家*在嗅觉受体蛋白中发现了“地址代码”。与邮政编码类似，这些编码确保传感器蛋白质从细胞内部被定位到细胞表面，在那里它们开始作为气味探测器的工作。这项新发现有助于开发新型测试系统，通过这种系统，食品的气
青岛能源所在细胞内蛋白质折叠研究方面取得进展
蛋白质发挥功能的“原位”环境是细胞，因此在细胞内开展蛋白质的结构和动力学研究对蛋白质功能的解析至关重要。细胞内大分子的浓度可以达到300-450g/L，拥挤的细胞环境可能会影响蛋白质的折叠，进而影响其功能。但是细胞环境如何影响蛋白质折叠过程目前并不很清晰。 近日，中国科学院青岛生物能源与过程研
上海药物所蛋白质折叠计算模拟研究取得进展
在生物体系中，蛋白质通过折叠成特定的三维结构发挥功能。这种折叠过程可能受到不同因素的影响，如配体结合、聚合状态等。充分理解蛋白质折叠过程对于药物分子设计、蛋白质突变所导致致病机理的预测、深入了解细胞功能以及进化都至关重要。大规模计算机模拟有潜力从原子水平捕捉整个蛋白系统的动态过程，但是
我国科学家非构象型抗体表位组学研究获进展
上海市计划生育科学研究所生殖免疫学课题组和复旦大学生命科学院基因功能课题组合作，用先前自主建立的肽生物合成方法，解码了致癌性人乳头瘤病毒58型（HPV58）所编码三个不同长度关键蛋白的精确表位组，并展现了相关组学研究的可行性和意义，包括总体框架及其内容。相关研究成果发表于《科学报告》。 作为
科研人员在兰科植物研究方面获得进展
15日从中科院成都生物研究所获悉，中科院成都生物研究所植物多样性研究团队利用Illumina测序技术分别研究了极小种群之一的巴郎山杓兰和对叶杓兰的叶绿体基因组特征，并基于叶绿体基因组数据重建了兰科植物5个亚科中的47个物种的系统发育树，为阐明杓兰属和兰科植物的系统发育关系和分类关系作出了重要贡
蛋白质组的研究进展
2014年5月28日，英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质，这些蛋白质与哪些基因表达有关等，从而进一步揭开人体的奥秘。上世纪90年代，人类基因组计划开始成形时，有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白质归类并
蛋白质组最新研究进展
蛋白质组（Proteome）的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物，蛋白质组中蛋
结合DNA的蛋白质
结构蛋白可与DNA结合，是非专一性DNA-蛋白质交互作用的常见例子。染色体中的结构蛋白与DNA组合成复合物，使DNA组织成紧密结实的染色质构造。对真核生物来说，染色质是由脱DNA与一种称为组织蛋白的小型碱性蛋白质所组合而成；而原核生物体内的此种结构，则掺杂了多种类型的蛋白质。DNA可在组织蛋白的表面
结合蛋白质的简介
结合蛋白质的分子中除氨基酸组分之外，还含有非氨基酸物质，后者称为辅因子，二者以共价或非共价形式结合，往往作为一个整体从生物材料中被分离出来。单纯蛋白质是指分子组成中，除氨基酸构成的多肽蛋白成分外，没有任何非蛋白成分称为单纯蛋白质。自然界中的许多蛋白质属于此类。而结合蛋白质是单纯蛋白质和其他化合物