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SoilBiology&Biochemistry:土壤微生物群落定量研究优化策略

近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出土壤微生物群落定量研究优化策略。相关成果发表在《土壤生物学与生物化学(Soil Biology & Biochemistry)》上。 微生物群落的组成和功能在人类健康、全球元素循环、作物生长和植物抗病中发挥关键作用。随着高通量测序等技术的革命性突破,极大地增加了我们对微生物多样性、群落结构和物种组成的认识。然而,测序数据仅提供微生物群落的相对丰度变化,忽略了微生物绝对数量的变化规律。针对高通量测序数据的这一缺陷,研究人员已经开发出多种微生物绝对丰度定量方法,例如,内参法(spike-AMP)、 荧光定量法与高通量测序结合(qPCR-AMP)、 流式细胞仪与高通量测序结合(FCM-AMP)等。然而,这些定量方法的普遍适用性和精确度尚不清楚。 研究团队利用采自黑龙江海伦和海南三亚的两类差异较大的土壤样品,评估了土壤微生物研究中最常用的两种绝对定量方法内参......阅读全文

土壤的分子生物学特性

在我们的实验室里,最难搞的样品类型之一就是土壤。在开发提取土壤中微生物DNA、RNA的试剂盒和构思提取方法的过程中,我们需要收集记录大量各种类型土壤的有机物含量、质地、pH以及采集地。这些因素与土壤微生物含量息息相关,同样地也影响着提取DNA、RNA的得率。 下文,我将介绍一些影响土壤DNA、R

土壤的分子生物学特性介绍

在我们的实验室里,zui难搞的样品类型之一就是土壤。在开发提取土壤中微生物DNA、RNA的试剂盒和构思提取方法的过程中,我们需要收集记录大量各种类型土壤的有机物含量、质地、pH以及采集地。这些因素与土壤微生物含量息息相关,同样地也影响着提取DNA、RNA的得率。下文,我将介绍一些影响土壤DNA、RN

DNA提取 I:土壤的分子生物学特性

在前面的文章(Soil molecular biology),围绕提取土壤样品DNA、RNA相关问题做了简单的引导介绍,比如PCR抑制因子、裂解注意事项等。今天将详细介绍土壤微生物DNA提取的细节,以及如何使用MO BIO PowerSoil® DNA Isolation Kit获得更好的提取效果。

华南植物园参加土壤与土壤生物学发展战略研讨会

  11月3日至7日,中国科学院地学部联合国家自然科学基金委在南京召开土壤与土壤生物学发展战略研讨会,来自中国科学院、清华大学、浙江大学、中国农业大学、南京农业大学等多家科研院所和高校从事土壤生物学研究的专家学者40余人应邀参加会议。会议在上一次研讨会的基础上围绕“土壤科学发展现状、

“土壤与土壤生物学发展战略研讨会”第一次会议召开

研讨会会场   6月1日至4日,“土壤与土壤生物学发展战略研究”专题组在福建武夷山组织召开了第一次研讨会,会议由中国科学院生态环境研究中心和城市环境研究所共同承办,邀请了20余位来自中国科学院、清华大学、中国农业大学等院校从事土壤和土壤生物学的专家对相关领域的前沿进展、存在问

《太空生物学》:火星土壤或存生命 由氢氧和水构成

据国外媒体报道,科学家对外太空探索的一个焦点是除地球生命之外是否存在着其他生命迹象。德国科学家表示,30年前美国宇航局“海盗”号火星探测器所采取的土壤样本分析显示,火星土壤中可能存在有机生命体。 火星土壤中可能存在由氢氧混合物和水构成的微生物 德国吉森大学乔普·霍特库伯说,“一直处于干燥冷冻状态的火

土壤有机碳形成的微生物学机制研究取得进展

  微生物是土壤碳循环的重要驱动者,一方面微生物通过分解土壤有机质获得自身生长所需要的养分和能量,另一方面微生物死亡后,其残留物是土壤有机碳的重要组成部分。近年来,关于微生物死亡残留物与土壤有机碳关系的研究逐渐增多,但是,对微生物自身的生理属性是否影响微生物死亡残留物量,如何构建活体微生物、微生物死

南京土壤研究所揭示了生物炭负激发效应的生物学机制

  土壤是全球碳循环的重要碳库,土壤有机碳封存可以缓解大气中CO2浓度的升高并提高土壤肥力。生物炭应用已被广泛证实是一种有效促进土壤有机碳封存和提高产量的方法(Woolf et al., Sustainable biochar to mitigate global climate change, N

全国土壤微生物学术研讨会:让农业回归自然

   “让农业回归自然,是时候了”。11月12日在武汉闭幕的第十二届全国土壤微生物学术研讨会暨第五届全国微生物肥料生产技术研讨会,再一次聚焦我国农业长期以来化肥、农药用量过大,导致土壤板结退化、水体富营养化、温室气体排放严重等生态、环境问题,并在“农业回归自然”上达成高度共识,即“我国农业迫切需要

发育生物学

In Vitro Production of Bovine Embryos (P.J. Hansen Lab, Dept. of Animal Sciences, University of Florida) This protocol describe procedures for in v