纳米孔“ARMA”分析工作流——实时检测抗生素抗性基因
据世界卫生组织报道：“抗微生物药物耐药性(AMR) 是一种全球性的公共卫生危机，将会严重危害现代医学的发展”。纳米孔读长已作为一项独立工具或作为混合测序方法的一部分，成功应用于抗微生物药物耐药性分析，以帮助处理复杂的重复区域。除此之外，我们还开发了能够实时进行微生物鉴定和抗微生物药物耐药性分析的“ARMA”分析工作流，能够突出显示表明给定抗生素耐药性的比对，且不需要全面深入的生物信息学专业知识，容许任何研究人员在其样本中对抗生素耐药性进行分析。 开发背景： 一、抗生素抗性随着抗生素使用的增加而增强 抗生素和其他抗微生物药物的有效性会随着微生物对其产生抗性而变得越来越低。这很大程度上要归因于过去几十年间对此类药物的过度使用（图 1）。抗微生物药物耐药性被视为全球患者面临的最大安全威胁之一。 某些细菌对特定类型的抗生素具有天然抗性，然而，由于新的突变和有机体之间基因转移而产生的获得性抗性才是更严峻的问题。 二、种间基因......阅读全文
纳米孔测序技术
测序长度和准确率的快速提升使得纳米孔测序有望颠覆DNA测序市场。纽约威尔康奈尔医学院的计算生物学家Christopher Mason喜欢在会议上表演一个“绝活”：他和同事先从志愿者手机上收集DNA样本，然后就能在一个小时内现场进行谱系分析，甚至叙述志愿者一天的生活细节。“我们能从留在手机上的DNA信
纳米孔“ARMA”分析工作流——实时检测抗生素抗性基因
据世界卫生组织报道：“抗微生物药物耐药性(AMR) 是一种全球性的公共卫生危机，将会严重危害现代医学的发展”。纳米孔读长已作为一项独立工具或作为混合测序方法的一部分，成功应用于抗微生物药物耐药性分析，以帮助处理复杂的重复区域。除此之外，我们还开发了能够实时进行微生物鉴定和抗微生物药物耐药性分析的
纳米孔ZL之争落下帷幕
美国国际贸易委员会近日发布文件称，Illumina公司和英国牛津纳米孔公司的官司已经庭外和解。纳米孔公司同意不再出口或售卖包含氨基酸序列纳米孔的产品，并销毁目前库存的产品。但该文件也明确表示，这些限制不会影响牛津纳米孔对CsgG的使用。CsgG是相关诉讼开始后不就，牛津纳米孔发布的另一种新孔，基于全
详解牛津纳米孔测序仪
2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示，技术之创新，令人震惊!21日下午，牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会，讲解了纳米孔的测试结果。 尺寸 MinION的尺寸之小，大大出乎我的
详解牛津纳米孔测序仪
牛津纳米孔测序仪在美国人类遗传学学会年会上公布技术参数 2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示，技术之创新，令人震惊!21日下午，牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会，讲解了纳米孔的
纳米孔测序技术发展简介
随着对DNA结构和序列的研究，DNA测序技术不断发展，成为生命科学研究的核心领域，对生物、化学、电学、生命科学、医学等领域的技术发展起到巨大的推动作用。利用纳米孔研究出新型的快速、准确、低成本、高精度及高通量的DNA测序技术是后人类基因组计划的热点之一。 纳米孔测序技术发展简介 纳米孔检测技
Nature Methods：纳米孔测序仪潜力无限
来自英国Oxford Nanopore公司的MinION是第一台商业化的纳米孔测序仪。它在带来无限希望的同时，也承受着高错误率的质疑。英国伯明翰大学的Nicholas J. Loman和爱丁堡大学的Mick Watson在最新一期的《Nature Methods》上撰文，称新开发的工具让纳米孔测
纳米孔测序仪真机现身ASHG
英国Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了一款便携式的基因组测序仪MinION，性能强劲，价格给力，引发市场轰动。然而，大半年过去了，纳米孔测序仪却迟迟不见踪影，连更早发布的GridION也未上市。于是，生物界开始议论
石墨烯上成功制备可控纳米孔
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2017/9/387887.shtm俄罗斯国家研究型工艺大学（NUST MISIS）的专家，与其他国家物理学家组成的国际小组共同开展一系列快重离子辐照石墨烯实验。结果显示，可以通过这种方式在石墨烯上制备直径可控的纳米孔。
Oxford Nanopore：纳米孔测序仪开放试用
在上个月的美国人类遗传学协会年会上，英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次，它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动，将延续到2014年初，具体截止日期未定。 根据这项试用计划，参与者须支付1,000美
纳米孔测序的过去、现在和将来
纵观测序技术的发展历程，没有哪一个技术像纳米孔测序那样慢热，但也没有哪一个技术像纳米孔测序这么接近普罗大众。将单链DNA拉过蛋白孔，检测碱基穿过时电导的微小改变，纳米孔测序的这一基础理念已经有十几年历史了。 1996年哈佛大学的DanielBranton、加州大学的DavidDeamer及其同
纳米孔技术有望颠覆DNA测序市场
Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机上收集的化验样本获取DNA，他和同事能在1个小时内现场进行谱系分析，甚至详细描述出捐赠者一天的生活细节。“我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示
奥盛AMR-100酶标仪有哪些应用
一、蛋白质浓度测定 可见光吸收法 1.1 Lowry法 1.2 考马斯亮蓝法（Bradford） 1.3 BCA法 方法 灵敏度 原理 应用 检测波长 改良的Lowry法 灵敏度高 TCA沉淀后的蛋白定量 750
5纳米石墨烯纳米孔精确制备技术研究取得进展
日前，中国科学院重庆绿色智能技术研究院精准医疗单分子诊断技术研究中心在5纳米石墨烯纳米孔精确制备技术研究方面取得进展，研究成果以Precise fabrication of a 5nm graphene nanopore with a helium ion microscope forbiomo
纳米孔可成为DNA快速阅读器
据《每日科学》近日报道，由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术，可在纳米孔内对DNA进行快速测序，而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图，提供更加高效的个体医疗。 论文主要作者、华盛顿大学物理教授简斯·冈德拉克表示，
纳米孔测序搞定超级难搞的基因
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定，通量也不高，但Graveley和他的同事决定立刻就试试。 对于MinION，众多讨论
纳米孔测序搞定超级难搞的基因
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定，通量也不高，但Graveley和他的同事决定立刻就试试。 对于MinION，众多讨论
纳米孔测序技术有望颠覆DNA测序市场？
Scott Tighe（左）等研究人员利用MinION设备在南极泰勒谷测序微生物DNA。 “我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示。你们相信吗？Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机
武汉大学研发纳米孔靶向测序检测方法
记者从武汉大学获悉：该校组建的联合团队创新性开发的纳米孔靶向测序检测方法，能够大幅提升病毒阳性检出率，并能实现当天同时检测新冠病毒和其他10类40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变，有助于破解临床疑似病例难以确诊的问题。 据介绍，既往新冠病毒诊断依赖于qPCR核酸检测，但是该方法显示出较高的假阴性
纳米孔测序发现DNA损伤的新策略
最近，美国犹他大学的化学家们，设计了一种新的方法来检测DNA化学损伤，DNA损伤有时会导致基因突变，引发许多疾病，包括各种癌症和神经系统疾病。相关研究结果发表在十一月六日的《NatureCommunications》。 本文通讯作者、化学教授CynthiaBurrows说：“我们更进一步了解了
纳米孔测序仪为何迟迟不见踪影？
今年2月，英国Oxford Nanopore Technologies公司(以下简称Oxford)宣布推出一款便携式的基因组测序仪MinION，约摸只有U盘大小，价格低于900美元，立即引发市场轰动。同时，该公司另一测序平台GridION有望在15分钟内完成人类基因组测序，费用约为1,500
2013值得关注的技术：纳米孔测序仪
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时，杂志还介绍了2013年值得关注的技术，包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func
纳米孔尺度对DNA输运速度的影响
图一：实验示意图 图二：分子动力学仿真模型示意图 基于纳米孔单分子传感器的第三代DNA测序技术，因其低成本，高通量等优势很有可能成为人类测序史上的创举。最近的一项研究发现，DNA在穿过10.8纳米的纳米孔道时的速度比穿过4.8纳米的纳米孔的速度降低了一倍，这对于实现DNA减速及单碱基精准测序
纳米孔测序发现DNA损伤的新策略
最近，美国犹他大学的化学家们，设计了一种新的方法来检测DNA化学损伤，DNA损伤有时会导至基因突变，引发许多疾病，包括各种癌症和神经系统疾病。相关研究结果发表在十一月六日的《Nature Communications》。延伸阅读：科学家解开DNA修复的谜团。本文通讯作者、化学教授Cynthia
纳米孔测序的最低DNA量是多少
第三代测序技术则是基于纳米孔的单分子读取技术，全基因组的测序以及RNA-seq测序有DNA测序和RNA测序，之前比较早的测序是以芯片为基础,这种方法读取数据更快，现在常用的是二代测序。随之而来的是第三代测序技术、有望大大降低测序成本。望满意，目前比较高级的还有单细胞测序
小小纳米孔破解蛋白质测序难题
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503589.shtm
介孔纳米材料构建的方法有哪些
构建方法有：一般来说，介孔分子筛材料是构成分子筛骨架的无机物种在溶剂相中，在表面活性剂的模板作用下通过超分子自组装而形成的一类有序多孔材料。最常用的合成方法为水热合成法，其他的如室温合成、微波合成、湿胶焙烧法、相转变法及在非水体系中的合成也可以。选择无机物种的主要理论依据是sol-gel化学，即
养殖场耐药基因逸散传播研究获进展
近日，北京市农林科学院生物所环境微生物课题组与瑞士苏黎世联邦理工学院环境工程研究所合作，揭示了养殖场逸散的抗生素耐药基因对城市空气污染的贡献和人体暴露，为评估养殖场空气的生态健康风险提供理论和数据依据。相关论文发表于Journal of Hazardous Materials（《危险材料杂志》）
AMR-100全自动酶标分析仪特点
一、AMR-100全自动酶标分析仪简介AMR-100全自动酶标分析仪是一款基于滤光片的高品质光吸收酶标仪，波长范围400nm-750nm，适合临床检验、科研实验室、农药残留、食品安全等领域应用。适用96孔板，可满足不同通量的要求。仪器启动时，系统会对载板位置、光源和滤光片在内的各种相关参数进行全面的
用纳米孔检测蛋白质获重要突破
对通过纳米孔的DNA进行测序，可提供长的读长，单分子的读数，并且能够避免昂贵的荧光标记和费时的扩增步骤。那么，纳米孔方法能为蛋白质研究做什么呢？ 虽然肉眼看不见，但是这种最新的分子生物学技术是强大的。纳米孔的直径约4纳米，是一层人造膜上产生的一个纳米孔，使研究人员能够收集一系列测量，对通过这些