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回顾:单细胞转录组技术发展之十年历程

俗话说,十年是个风水岭,单细胞转录组技术发展至今十年间,在促进对生物学和疾病的认识上发挥出的巨大潜力有目共睹。那么,十年间单细胞转录组是如何发展至今的?又取得了哪些新的进展呢?今天,让我们跟随Sarah Aldridge和Sarah Teichmann两位大神,一起来回顾单细胞转录组学技术十年发展。一、过去十年中单细胞转录组学技术是如何发展的?单细胞转录组学技术是2009年北大汤富酬老师等人通过少数小鼠原始生殖细胞,基于高通量测序技术,实现了在单个细胞中对mRNA全基因组检测。此后,单细胞转录组学技术不断发展创新,包括标签测序方法(例如STRT-seq和CEL-seq,MARS-seq)、全长测序(例如SMART-seq / SMART-seq2)等。真正实现高通量单细胞测序技术的发展是后续开发的纳米液滴,微孔技术和原位条形码技术。这些技术的发展与完善, 使得单细胞转录组测序技术进入高通量与自动化的全新时代。图1 单......阅读全文

回顾:单细胞转录组技术发展之十年历程

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单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析

基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多个发育轨迹和

实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析

  基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。   细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多

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2002-2012,analyticaChina十年成长历程回顾

  2012年10月16-18日,全球分析、实验室技术和生化技术领域的顶级盛会德国analytica在华子展――慕尼黑上海分析生化展(analytica China)将在上海新国际博览中心N1、N2馆隆重召开。展会将云集国内外行业领军企业,集中展示最新科学仪器、尖端分析测试技术,提供全方位的实验

二十大重要知识点!回顾我国十年奋斗历程

高举中国特色社会主义伟大旗帜 为全面建设社会主义现代化国家而团结奋斗——习近平同志代表第十九届中央委员会向大会作的报告摘登新时代十年的伟大变革具有里程碑意义  新华社北京10月16日电 习近平同志在二十大报告中阐述了过去五年的工作和新时代十年的伟大变革。他指出,新时代十年的伟大变革,在党史、新中国史

空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例

单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接

单细胞转录组制备仪的功能

  fluidigm C1 单细胞自动制备仪用于 mRNA 测序 更完整的流程  -首尾相连的流程对单细胞进行全转录组分析 最高的通量  -每次运行可前所未有的平行处理 96 个单细胞 更容易的操作  -直接从单细胞开始,简化的样本制备,只需 3 小时手工操作时间,没有 片段化和纯化步骤 更节省的成

单细胞转录组重要研究文献汇总(二)

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单细胞转录组重要研究文献汇总(一)

1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature