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蛋白质设计程序使用在体内环境中驱动蛋白质的分子力的计算机模型。为了使问题易于解决，蛋白质设计模型简化了这些作用力。尽管蛋白质设计程序相差很大，但它们必须解决四个主要的建模问题：设计的目标结构是什么，目标结构允许什么样的灵活性，搜索中包括哪些序列，以及将使用哪个力场来分数序列和结构。目标结构蛋白质功能在很大程度上取决于蛋白质结构，合理的蛋白质设计使用这种关系通过设计具有目标结构或折叠结构的蛋白质来设计功能。因此，根据定义，在合理的蛋白质设计中，必须预先知道靶标结构或结构的整体。这与其他形式的蛋白质工程（例如定向进化）形成鲜明对比，在定向进化中，可以使用多种方法来查找实现特定功能的蛋白质；在蛋白质结构预测中，已知序列但结构未知。通常，靶标结构基于另一种蛋白质的已知结构。但是，自然界中看不见的新颖褶皱变得越来越有可能。彼得·S·金（Peter S.Kim）和他的同事设计了自然界中从未见过的非自然卷曲螺旋的三聚体和四聚体。在大卫·贝克（......阅读全文
蛋白质设计程序使用在体内环境中驱动蛋白质的分子力的计算机模型。为了使问题易于解决，蛋白质设计模型简化了这些作用力。尽管蛋白质设计程序相差很大，但它们必须解决四个主要的建模问题：设计的目标结构是什么，目标结构允许什么样的灵活性，搜索中包括哪些序列，以及将使用哪个力场来分数序列和结构。目标结构蛋白质功能
蛋白质是细胞组分中含量最丰富、功能最多的高分子物质。酶、抗体、多肽激素、转运蛋白、收缩蛋白以及细胞的骨架结构均为蛋白质。几乎在所有的生物过程中起着关键作用。蛋白质的基本组成单位是氨基酸。构成天然蛋白质的氨基酸有二十种,分为非极性、疏水性氨基酸；极性、中性氨基酸；酸性氨基酸和碱性氨基酸。氨基酸借助肽键
蛋白质分子中关键活性部位氨基酸残基的改变，会影响其生理功能，甚至造成分子病（moleculardisease）。例如镰状细胞贫血，就是由于血红蛋白分子中两个β亚基第6位正常的谷氨酸变异成了缬氨酸，从酸性氨基酸换成了中性支链氨基酸，降低了血红蛋白在红细胞中的溶解度，使它在红细胞中随血流至氧分压低的外周
(二)蛋白质空间橡象与功能活性的关系 蛋白质多种多样的功能与各种蛋白质特定的空间构象密切相关，蛋白质的空间构象是其功能活性的基础，构象发生变化，其功能活性也随之改变。蛋白质变性时，由于其空间构象被破坏，故引起功能活性丧失，变性蛋白质在复性后，构象复原，活性即能恢复。 在生物体内，当某种物质
蛋白质为生物高分子物质之一，具有三维空间结构，因而执行复杂的生物学功能。蛋白质结构与功能之间的关系非常密切。在研究中，一般将蛋白质分子的结构分为一级结构与空间结构两类。 一、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(
一、四级结构的组成 大分子蛋白质常由多条多肽链所组成，每条多肽链各具独立的三级结构。蛋白质的四级结构是指几个各具独立三级结构之多肽链的相互结集、以特定的方式接触、排列形成更高层次的大分子蛋白质的空间构象。在蛋白质四级结构中，每个各具独立三级结构的多肽链称为亚基。组成蛋白质的亚基数多为偶数，可以是同
蛋白质是病毒的另一类主要成分，包括结构蛋白和非结构蛋白。非结构蛋白是指由病毒基因组编码的，在病毒复制或基因表达调控过程中具有一定功能，但不结合于病毒颗粒中的蛋白质。结构蛋白是指构成一个形态成熟的有感染性的病毒颗粒所必需的蛋白质医学|教育网搜集整理，包括壳体蛋白、包膜蛋白和毒粒酶等。壳体蛋白是构成病毒
溶酶体含有多种酶，使细胞能够分解它吞噬的各种生物分子，包括肽、核酸、碳水化合物和脂质(溶酶体脂肪酶)。负责这种水解的酶需要在酸性环境才能获得最佳活性。 溶酶体除了能够分解聚合物之外，还能够与其他细胞器融合，消化大型结构或细胞碎片；通过与吞噬体的合作，它们能够进行自噬，清除受损的结构。同样，它们
第一部分 动物模型的分类一、按产生原因分类（一）自发性动物模型（Spontaneous Animal Models）是指实验动物未经任何有意识的人工处置，在自然情况下所发生的疾病。包括突变系的遗传疾病和近交系的肿瘤疾病模型。突变系的遗传疾病很多，可分为代谢性疾病、分子疾病和特种蛋白质合成异常性疾病。
tRNA的二级结构如图1所示，其在原核生物和真核生物均相对保守。主要结构有D-loop（D环）、T（C）-loop（T环）、Anticodon-loop（反密码子环）、Accepter Arm（受体臂）、3'端CCA保守序列、Discriminator（识别碱基）、Variable-loop