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细胞图集将革新对癌症的理解

英国癌症研究所不久前曾宣布,在未来5年,向剑桥大学的分子生物学家格雷格·汉侬领导团队提供2000万英镑(约合1.7亿人民币),资助他们研发乳腺癌的交互式虚拟现实图谱。得到的图谱将囊括一个肿瘤中的每个细胞,涵盖这些细胞内数千个基因以及数十个蛋白质表达的相关数据。研究人员期望,这些空间和功能细节能向他们揭示更多影响肿瘤治疗效果的因素,或许将开辟一条研究和诊治乳腺癌的新途径。 目前,有很多团队致力于绘制新一代细胞图集,汉侬团队只是其中一个。这些器官或肿瘤图谱,能以极其精确的细节描绘每个细胞的位置和组成。英国《自然》网站杂志在报道中指出,一大波细胞图集的到来,可能刷新我们对癌症和其他疾病的理解。 细胞成癌症研究主角 癌症作为危害人类生命的重大疾病,多年来从未获得有效治愈率,原因在于目前绝大多数治疗方法并非针对每个患者制定的个性化治疗方案,而肿瘤是一种基因突变,需要介入不同患者的细胞和基因层面进行分析,才能获得有效疗法。 汉侬......阅读全文

科学家尝试一次绘制一个细胞

  近日,伦敦慈善机构英国癌症研究宣布,由剑桥大学Greg Hannon率领的分子生物学家、天文学家和游戏设计者团队未来5年将会获得2000万英镑的资助,用于研究乳腺癌交互虚拟—现实图。  这个项目仅是旨在建造新一代细胞图集——细致入微地描述器官和肿瘤的每个细胞的位点及构成的图集——的其中一项。英国

以细胞为单位给人体“画像”

  英国癌症研究所不久前曾宣布,在未来5年,向剑桥大学的分子生物学家格雷格·汉侬领导团队提供2000万英镑(约合1.7亿人民币),资助他们研发乳腺癌的交互式虚拟现实图谱。得到的图谱将囊括一个肿瘤中的每个细胞,涵盖这些细胞内数千个基因以及数十个蛋白质表达的相关数据。研究人员期望,这些空间和功能细节能向

3月27日《自然》杂志精选

  REST 蛋白可抗神经退化   年龄是神经退化疾病的最大风险因素。但为什么有些人在衰老时认知功能没有变化,而其他人的认知功能则会下降并患阿尔茨海默氏症?在这项研究中,Bruce Yankner及同事发现,在衰老过程中,一种被称为REST (亦称为NRSF)的蛋白在人的皮层和海马体神经元

人类细胞也将拥有社交“脸谱”

  扎克伯格夫妇不久前宣布,10年内捐资30亿美元帮助科研人员攻克各种难以治愈的疾病。这一举措使他们成为继霍华德·休斯医学研究所之后第二大私人基础生物学研究投资方。据麻省理工学院《技术评论》杂志网站近日报道,这一宏伟医学目标启动了首个项目:出资6亿美元,创建一家全新的“生物中心(BioHub)”,帮

无损探测技术? 让细胞不再“受伤”

  在低分辨率(左)和高分辨率(右)下的小鼠大脑组织中,红外光谱学可将星形胶质细胞与神经元分辨开来。 图片来源:ARIS POLYZOS & LILA LOVERGNE   为了观察细胞,研究人员经常不得不“虐待”它:把它从“家”里揪出来,用有毒的固定液浸泡它,修改它的DNA,强迫它产生可能会扰乱

无损探测技术?光谱让细胞不再“受伤”

在低分辨率(左)和高分辨率(右)下的小鼠大脑组织中,红外光谱学可将星形胶质细胞与神经元分辨开来。 图片来源:ARIS POLYZOS & LILA LOVERGNE  为了观察细胞,研究人员经常不得不“虐待”它:把它从“家”里揪出来,用有毒的固定液浸泡它,修改它的DNA,强迫它产生可能会扰乱

无损探测技术? 让细胞不再“受伤”

  在低分辨率(左)和高分辨率(右)下的小鼠大脑组织中,红外光谱学可将星形胶质细胞与神经元分辨开来。 图片来源:ARIS POLYZOS & LILA LOVERGNE   为了观察细胞,研究人员经常不得不“虐待”它:把它从“家”里揪出来,用有毒的固定液浸泡它,修改它的DNA,强迫它产生可能会扰乱

Nature报道第三个大型蛋白质组项目

  在2003年,也就是人类基因组计划(Human Genome Project)公布第一张人类基因组序列(包含大约两万个基因)后的第三年,瑞典的一组研究人员发起了人类蛋白质图集(Human Protein Atlas,HPA)项目,这是一个大规模蛋白质研究项目,主要目的是绘制人体组织和细胞中表达基

2020年世界科技发展回顾·生物技术

以色列 研究抗癌、抗衰老疑难杂症 超高分辨率显微镜看到活细胞 本报驻以色列记者 毛黎 特拉维夫大学率先证明,通过CRISPR基因编辑技术能有效地破坏动物癌细胞DNA,同时保持周围其他细胞组织完好无损;舍巴医学中心在全球首次试验性采用“逆向个性化药物”(RPM)治疗癌症患者;特拉维夫大学研

科学家将分类和测序人体所有细胞

  计算生物学家Aviv Regev 喜欢挑战一些看似不可能完成的任务。2011年,她与分子遗传学家Joshua Levin合作,测试了RNA测序的几种方法。科学家希望找到这几种技术的极限,以查看哪种方法表现最佳。最终,Levin指出,一些技术的灵敏度非常高,能检测含量低于单细胞中含有的RNA量的样

Nature发布单细胞基因组研究重要成果

  在第一个基因组范围的这类实验中,研究人员获得了对于小鼠胚胎如何首先从一个结构松散的细胞球开始转变为小的结构化实体的新认识。这项由欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和维康信托基金会-MRC剑桥干细胞研究所领导的单细胞基因组学研究发布在《自然》(Nature)杂志上。  原肠胚形成(Gastr

9102,《Nature Methods》上scRNA-seq“天天”见

  《Nature Methods》是专门用来对生命科学研究领域具有显著性意义的新方法和研究技术改进的经典杂志。单细胞转录组测序是2019年不折不扣的热点领域,截至2019年9月,Nature Methods总共发表了10篇关于单细胞转录组测序相关的研究报道。本期,小编和大家一起分享这些重要的研究成

9102,《Nature Methods》上scRNA-seq“天天”见

  《Nature Methods》是专门用来对生命科学研究领域具有显著性意义的新方法和研究技术改进的经典杂志。单细胞转录组测序是2019年不折不扣的热点领域,截至2019年9月,Nature Methods总共发表了10篇关于单细胞转录组测序相关的研究报道。本期,小编和大家一起分享这些重要的研究成

两篇Cell分析17万人血细胞遗传差异与疾病关系

  11月18日在Cell上,2篇 BLUEPRINT 和 IHEC consortia项目支持的里程碑式研究文章显示血细胞与三大免疫细胞的特性和数量如何变化以至于影响一个人出现复杂疾病如心脏病,类风湿性关节炎、哮喘、腹腔疾病和1型糖尿病这些自身免疫性疾病的风险。  连同其它发表在别的高影响力期刊的

科学家完成人类脑白质微观结构图集

  最近,一由欧洲多个国家研究人员组成的联合研究小组宣称,他们利用其开发的新型核磁共振成像技术,历时三年,完成了人类大脑白质微观结构图集。该图集的完成,将大大推动科学家对人类大脑白质的研究,对于未来神经科学和医学的研究发展具有重要意义。   白质是神经系统的三个重要组成元

十年大型项目,绘制人类蛋白质组图谱

  由瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén领导的一项长达十年之久的研究项目——人类蛋白质图集(Human Protein Atlas,HPA)项目,在本周发布了1300万张全身人类蛋白质“图像”。通过制备出荧光标记抗体,将其应用于保存组织的薄切片,观察组织的颜色以及附着在组织上的抗体,研究人

高精度人体大脑三维图问世

经过十年的艰苦研究,科学家终于把一位女性遗体捐赠者的大脑通过加工、制作和研究,完成了第一个揭示了人脑微观细节的三维数字图集   2013年6月20日,据美国科学新闻报道,经过十年的艰苦研究,科学家终于把一位女性遗体捐赠者的大脑通过加工、制作和研究,完成了第一个揭示了人脑微观细节的三维数字

纳米金颗粒芯片:十几分钟识别单位点基因突变

  韩国近日一项研究成果实现了十几分钟内完成基因检测:通过使用纳米尺度的金颗粒制作的生物芯片来识别癌细胞DNA特征,能够迅速完成对特定癌症标志物的检测,无需测序,可以识别单个位点基因突变。该技术能够完成实时和低成本诊断,有望应用于癌症早期筛查领域,具有重要的临床医学意义。  研究人员开发的诊断基因突

2018年新技术:空间转录组学技术

  ——也许不久的将来,定位组织中的基因表达就会成为一种常规技术了。  对于基因表达研究来说,空间一直都是具有挑战性的前沿研究领域。但是随着越来越多的研究人员获得了技术进展,这已经不再是令人望而生畏的领域了。这些方法的多样性和创造性使其成为一个值得关注的技术方向。  空间基因表达对于理解组织中细胞的

新算法比较分析可搜索癌症基因突变

  桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成

GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组

多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-

Genome Medicine: 提高癌症治疗效果的新方法

  通过挖掘大量的遗传数据,弗吉尼亚大学医学院的研究人员有望促进医生治疗癌症,预测患者预后并确定哪种治疗方法最适合某类患者的能力。  研究人员已经确定了我们基因的遗传变异,这些变异影响患者在诊断后和治疗过程中的表现。有了这些信息,医生将能够检查患者的基因组成,从而提供真正个性化的药物。  “肿瘤学家

美科学家绘制人脑3D透视图涵盖所有基因组

  网易探索9月24日报道 科学家们已经制作出了显示整个大脑部位基因活动的完整的成人大脑地图集。   这一地图集是通过对两个临床上不显著的大脑和来自于第三个人的半个大脑的900个具体部位的基因分析制作而成的。这两个大脑分别属于一位24岁和39岁的人。   西雅图的艾伦脑科研究所的研究人员称该图集

中国精准医疗方向—投入600亿,产业规模达万亿

  3月13日《经济参考报》刊发题为《中国精准医疗确立"自己的方向"》的报道。根据前期部署的中国精准医疗计划,将于2030年前在精准医疗领域投入600亿元。据多家券商研报测算,精准医疗涉及的产业规模达上万亿元,直接相关的产业规模超过100亿元。  多方推进中国版精准医疗  2016年3月,科技部召开

Inscopix在猕猴大脑的背外侧实现头戴式显微钙成像

  Inscopix系列的大脑超微钙成像系统一般用在啮齿类动物身上的居多,因为设备体积小,重量轻,且在实验时动物可以自由活动而成像质量不受影响,因此受到了很多神经科学研究者的青睐。   但在最近的一篇来自Inscopix公司和美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员在bioRxiv上发表的文章则描

《自然》:人类癌症的致癌全景图

  用于新型癌症治疗方法的临床试验设计,一般来说都是集中在肿瘤起源所在的组织,然而近期由纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究人员完成的一项研究则发现了一种新的方法:基于基因组标记进行研究,而不是针对机体器官组织进行研究。   这一研究成果公布在9月26日的Nature Genetics杂志上,同时还

Cancer Cell公布重大成果:28种癌症类型治疗评估

  虽然只有很少的癌症病患能根据目前的临床治疗指南得到完全治疗,但是在大多数案例里,病患都能得到一些药物治疗和控制。近期来自西班牙庞培法布拉大学等处的研究人员通过癌症基因组图集TCGA和国际癌症基因组协会ICGC近年来获得的癌症数据,评测了已经应用到临床,以及正处于治疗发展阶段的针对28种癌症类型的

表观基因组学研究指南(一)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi

Science:科学家首次公布大脑3D图谱

  2012年年底《科学》(Science)杂志预测了2013年六大值得关注的科学领域,其中之一就是连接组(Connectome),这是在大科学项目清单中重点强调的一个项目,也就是找到人类大脑的“布线图”。为了了解这个神奇的大脑网络,此前美国国立卫生研究院已经推出了人类连接组项目(Human Con

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完