代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)

案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV感染导致Bm5细胞的代谢具有显着和特定阶段的变化。比如,CrPV持续感染过程中葡萄糖和谷氨酰胺水平均显着升高,随后在致病期急剧下降。不同代谢产物的丰度和途径分析进一步确定了病毒生命周期不同阶段的特定代谢特征。为病毒感染宿主后的致病过程,疾病分期,以及药物治疗效果提供理论依据。新兴传染病往往是人畜共患疾病,可以从动物传播给人类。通过蛋白、代谢和脂质等多组学技术可以帮助研究者还原宿主-病原体相互作用关系,从而为医务人员和科研工作者提供理论依据。Orbitrap技术作为蛋白质组学的金标准,其高灵敏度、高精度,高通量等特性在代谢组学和脂质组学......阅读全文

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)

案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)

在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,

LCMS在脂质组学中的应用

  脂质组学(lipidomics)已经作为一门独立的学科与非靶代谢组学、靶向代谢组成为代谢组学中“三大主要研究领域”。为什么脂质组学会成为研究热点中的新宠?请听我一一道来。  还记得上面这张18年初风靡全生物圈的“小鼠拔罐”图吗?今年2月,陆军军医大学新桥医院李咏生团队发表在【Cellular P

【JOAT刘虎威编者按】专题:代谢组学和脂质组学

  刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。     近日,刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作,并撰写了题为“专题:代谢组学和脂质组学”的编者按。  代谢

代谢及脂质组学液质应用培训班通知

  基于质谱的代谢组学已成为疾病机理研究、临床生物标志物发现、新药靶点开发、环境暴露、食品真伪或溯源、农业和林业科学等方面的重要科研手段而被广泛应用。为了助力代谢组学领域的质谱学者更好地运用LC-MS/MS系统进行研究,SCIEX将在天津举办“代谢及脂质组学液质应用培训班”,内容主要涉及:  1)代

代谢组学在口腔医学研究中的应用现状

  代谢组是指生物体内源性代谢物质的动态整体,代谢组学是研究代谢组的一门学科,研究对象多为相对分子质量在1000以内的小分子物质。代谢组学研究目的是通过检测代谢物水平的整体和动态变化,提取相关的生物代谢标志物群体或标志物簇,在此基础上寻找所受影响的相关代谢途径,确立代谢网络调控机制。目前,代谢组学已

代谢组学在疾病诊断中的应用

代谢组学  (metabolomics)的出现是生命科学研究的必然。在20世纪90年代中期发展起来的代谢组学,是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有广泛的应用前景。 代谢产物是基因表达的最终

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

质谱在组学中的应用

质谱在组学中的应用无疑是当前最热门的,而且各种组学都广泛深入的得到了开展。这其中有一些比较有特色的应用领域,最近十分热门,它们前景如何?技术瓶颈在哪里?市场推广还有哪些问题,值得相关专业人士思考。      质谱成像技术(Imaging MS)诞生了近20年,最早主要是在二次离子质谱(SIMS)领域

代谢组学技术在临床医学中的应用

  代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的一门学科,它通过对人体内小分子代谢物(50~1,500 Da)进行精准定性定量,分析代谢物与人体生理病理变化的关系,研究疾病发生发展、寻找疾病生物标记物、预测疾病预后等。代谢组学在临床诊断上将有广阔的发展前景,主要应用方向有四个方面:在临床诊断(B

PNAS脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常潜在治疗靶

  关键词:埃博拉病毒,脂质组学,治疗靶点,脂质代谢   2014年,非洲爆发了有史以来最凶猛的一次埃博拉病毒疫情,震动全球。直到年底,疫情才终于得到控制。根据世卫组织的统计数字,截至2014年12月14日,全球范围内已有超过1.8万例感染者,近7000人死亡。因为疫情影响农业生产和贸易,西非疫区

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

综述:代谢组学在疾病中的应用

   代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起,实现一次性检测坚定上千种物质,同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点,创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测,为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。   应用代谢组学的定义事件的预测生

【网络研讨会】蛋白质组学/脂质组学研究进展

  自从精准医学概念提出以来,组学研究一直都是全球最热的研究领域,其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初,中国发起了精准医学研究专项课题,目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台,推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入国家医保目录。同时

高分辨质谱脂质轮廓谱表征用于食品组学研究中...(二)

3.2 分类与多元统计结果实验挑选 6 种最为常见的食用植物油进行深度的多元统计分析。图 5 为对 SIEVE 软件获得的脂质轮廓谱数据矩阵进行聚类分析的结果,可见, 6 种食用植物油样品按照各自的植物基源,分类明确。随后,为进一步明晰不同脂质分子在脂质整体轮廓分类中的贡献,实验又对这 6 种植物油

脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及潜在治疗靶点

  关键词:埃博拉病毒,脂质组学,治疗靶点,脂质代谢   2014年,非洲爆发了有史以来最凶猛的一次埃博拉病毒疫情,震动全球。直到年底,疫情才终于得到控制。根据世卫组织的统计数字,截至2014年12月14日,全球范围内已有超过1.8万例感染者,近7000人死亡。因为疫情影响农业生产和贸易,西非疫区

脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及潜在治疗靶点

2014年,非洲爆发了有史以来最凶猛的一次埃博拉病毒疫情,震动全球。直到年底,疫情才终于得到控制。根据世卫组织的统计数字,截至2014年12月14日,全球范围内已有超过1.8万例感染者,近7000人死亡。因为疫情影响农业生产和贸易,西非疫区国家将有百万人面临饥荒威胁。埃博拉病毒通常通过血液和其他体液

代谢组学在中药动态代谢和相互作用过程研究中的应用

贾伟教授团队近年来建立了基于代谢组学策略的药物动力学新方法,在分子水平上刻画包括复方中药和天然产物在内的多成分药物(Multi-component Agents)在体内的整体、动态的代谢和相互作用过程。最近该团队与上海中医药大学刘平教授团队合作,采用高通量代谢组学平台以及所建立的多组分药物生

代谢组学在中药动态代谢和相互作用过程研究中的应用

   贾伟教授团队近年来建立了基于代谢组学策略的药物动力学新方法,在分子水平上刻画包括复方中药和天然产物在内的多成分药物(Multi-component Agents)在体内的整体、动态的代谢和相互作用过程。最近该团队与上海中医药大学刘平教授团队合作,采用高通量代谢组学平台以及所建立的多组分药物生物

代谢组学在中药动态代谢和相互作用过程研究中的应用

   贾伟教授团队近年来建立了基于代谢组学策略的药物动力学新方法,在分子水平上刻画包括复方中药和天然产物在内的多成分药物(Multi-component Agents)在体内的整体、动态的代谢和相互作用过程。最近该团队与上海中医药大学刘平教授团队合作,采用高通量代谢组学平台以及所建立的多组分药物生物

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

做好代谢组学研究的关键

首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次

蛋白质组学在病原体学研究中的应用

  最近,《Molecular & Cellular Proteomics》期刊两篇文章分别报道了一种性传播寄生虫“阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)”和HIV相关机会肺真菌“曲霉菌(Aspergillus)”的致病机理。  文章一、脂肪酸让寄生虫如虎添翼  根据疾病控制和预防

布鲁克最新发布-|-4D代谢组学和4D脂质组学新突破

  新型VIP-HESI离子源将4D-代谢组学、4D-脂质组学和小分子定量筛选工作流程的灵敏度提高了10倍以上;  数据库全新发布包含CCS值的代谢物数据库METLIN-4D;  数据处理软件集成了代谢物CCS值预测功能CCS-Predict Pro;  新款代谢组学软件MetaboScape 20